MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	384422538
2	NC_017269	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	384422538
3	NC_017269	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	384422538
4	NC_017269	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	384422539
5	NC_017269	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	384422543
6	NC_017269	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	384422544
7	NC_017269	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	384422544
8	NC_017269	GTGGC	2	10	16688	16697	0 %	20 %	60 %	20 %	384422547
9	NC_017269	TGGTG	2	10	18191	18200	0 %	40 %	60 %	0 %	384422548
10	NC_017269	GGTTT	2	10	18628	18637	0 %	60 %	40 %	0 %	384422548
11	NC_017269	ACCAC	2	10	19627	19636	40 %	0 %	0 %	60 %	384422549
12	NC_017269	GATCC	2	10	21985	21994	20 %	20 %	20 %	40 %	384422552
13	NC_017269	TTGGC	2	10	24524	24533	0 %	40 %	40 %	20 %	384422553
14	NC_017269	CCAAT	2	10	27473	27482	40 %	20 %	0 %	40 %	384422556
15	NC_017269	CGCGA	2	10	27697	27706	20 %	0 %	40 %	40 %	384422556
16	NC_017269	AAGCG	2	10	31551	31560	40 %	0 %	40 %	20 %	384422559
17	NC_017269	AATGC	2	10	32432	32441	40 %	20 %	20 %	20 %	384422559
18	NC_017269	GCTTA	2	10	34350	34359	20 %	40 %	20 %	20 %	384422561
19	NC_017269	AAGCT	2	10	34787	34796	40 %	20 %	20 %	20 %	384422561
20	NC_017269	ACTCA	2	10	34906	34915	40 %	20 %	0 %	40 %	384422561
21	NC_017269	GCGGA	2	10	35345	35354	20 %	0 %	60 %	20 %	384422562
22	NC_017269	TGCAC	2	10	35477	35486	20 %	20 %	20 %	40 %	384422562
23	NC_017269	GAGTT	2	10	35629	35638	20 %	40 %	40 %	0 %	384422562
24	NC_017269	GAGCT	2	10	35911	35920	20 %	20 %	40 %	20 %	384422562
25	NC_017269	CCACT	2	10	38161	38170	20 %	20 %	0 %	60 %	384422564
26	NC_017269	GGTTG	2	10	38796	38805	0 %	40 %	60 %	0 %	384422564
27	NC_017269	AGGTG	2	10	39602	39611	20 %	20 %	60 %	0 %	384422564
28	NC_017269	GCTGA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	40 %	20 %	384422565
29	NC_017269	TGGGT	2	10	41130	41139	0 %	40 %	60 %	0 %	384422566
30	NC_017269	CTTGG	2	10	41199	41208	0 %	40 %	40 %	20 %	384422566
31	NC_017269	ACTGA	2	10	41262	41271	40 %	20 %	20 %	20 %	384422566
32	NC_017269	GTTGC	2	10	45079	45088	0 %	40 %	40 %	20 %	384422571
33	NC_017269	CAATC	2	10	45250	45259	40 %	20 %	0 %	40 %	384422571
34	NC_017269	CATTT	2	10	47632	47641	20 %	60 %	0 %	20 %	384422572
35	NC_017269	TACCT	2	10	52711	52720	20 %	40 %	0 %	40 %	384422575
36	NC_017269	GAACA	2	10	53296	53305	60 %	0 %	20 %	20 %	384422575
37	NC_017269	TGGTT	2	10	53324	53333	0 %	60 %	40 %	0 %	384422575
38	NC_017269	GCTTG	2	10	55045	55054	0 %	40 %	40 %	20 %	384422577
39	NC_017269	CATGC	2	10	55325	55334	20 %	20 %	20 %	40 %	384422577
40	NC_017269	AGTTG	2	10	58719	58728	20 %	40 %	40 %	0 %	384422579
41	NC_017269	CCATG	2	10	59347	59356	20 %	20 %	20 %	40 %	384422580
42	NC_017269	TGGTT	2	10	61621	61630	0 %	60 %	40 %	0 %	384422583
43	NC_017269	GATTT	2	10	61761	61770	20 %	60 %	20 %	0 %	384422583
44	NC_017269	GCAAG	2	10	68560	68569	40 %	0 %	40 %	20 %	384422588
45	NC_017269	GACAA	2	10	69606	69615	60 %	0 %	20 %	20 %	384422588
46	NC_017269	TTGAC	2	10	70734	70743	20 %	40 %	20 %	20 %	384422589
47	NC_017269	CGCTA	2	10	71295	71304	20 %	20 %	20 %	40 %	384422589
48	NC_017269	TGTGG	2	10	72145	72154	0 %	40 %	60 %	0 %	384422589
49	NC_017269	TGCGC	2	10	72424	72433	0 %	20 %	40 %	40 %	384422589
50	NC_017269	AACCA	2	10	72515	72524	60 %	0 %	0 %	40 %	384422589
51	NC_017269	ACAGG	2	10	74481	74490	40 %	0 %	40 %	20 %	384422591
52	NC_017269	ATTGG	2	10	75280	75289	20 %	40 %	40 %	0 %	384422592
53	NC_017269	ACCCA	2	10	79980	79989	40 %	0 %	0 %	60 %	384422596
54	NC_017269	ATTTC	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	384422597
55	NC_017269	TAAAA	2	10	81005	81014	80 %	20 %	0 %	0 %	384422597
56	NC_017269	GATCA	2	10	81314	81323	40 %	20 %	20 %	20 %	384422597
57	NC_017269	CTTCA	2	10	84576	84585	20 %	40 %	0 %	40 %	384422601
58	NC_017269	AGCAC	2	10	90398	90407	40 %	0 %	20 %	40 %	384422605
59	NC_017269	CTAAG	2	10	94141	94150	40 %	20 %	20 %	20 %	384422608
60	NC_017269	TACCA	2	10	96240	96249	40 %	20 %	0 %	40 %	384422611
61	NC_017269	GCTTG	2	10	97822	97831	0 %	40 %	40 %	20 %	384422613
62	NC_017269	ATCCA	2	10	97946	97955	40 %	20 %	0 %	40 %	384422613
63	NC_017269	CAATG	2	10	110843	110852	40 %	20 %	20 %	20 %	384422624
64	NC_017269	GCTCA	2	10	111272	111281	20 %	20 %	20 %	40 %	384422624
65	NC_017269	CGGCT	2	10	112623	112632	0 %	20 %	40 %	40 %	384422625
66	NC_017269	ACTCA	2	10	114649	114658	40 %	20 %	0 %	40 %	384422627
67	NC_017269	TTTCA	2	10	115331	115340	20 %	60 %	0 %	20 %	384422628
68	NC_017269	TGAAC	2	10	116030	116039	40 %	20 %	20 %	20 %	384422628
69	NC_017269	CCGAT	2	10	117587	117596	20 %	20 %	20 %	40 %	384422630
70	NC_017269	CGTCC	2	10	117630	117639	0 %	20 %	20 %	60 %	384422630
71	NC_017269	TGGGG	2	10	117954	117963	0 %	20 %	80 %	0 %	384422630
72	NC_017269	GGTAC	2	10	118330	118339	20 %	20 %	40 %	20 %	384422630
73	NC_017269	GTGAT	2	10	118639	118648	20 %	40 %	40 %	0 %	384422631
74	NC_017269	TCCTG	2	10	124140	124149	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
75	NC_017269	GCTGA	2	10	125044	125053	20 %	20 %	40 %	20 %	384422636
76	NC_017269	CTGCT	2	10	125831	125840	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
77	NC_017269	CAATC	2	10	126432	126441	40 %	20 %	0 %	40 %	384422637
78	NC_017269	TTGCT	2	10	127463	127472	0 %	60 %	20 %	20 %	384422637
79	NC_017269	ACCCT	2	10	127485	127494	20 %	20 %	0 %	60 %	384422637
80	NC_017269	AGCTG	2	10	127852	127861	20 %	20 %	40 %	20 %	384422638
81	NC_017269	GGGTT	2	10	128014	128023	0 %	40 %	60 %	0 %	384422638
82	NC_017269	CAGTG	2	10	128559	128568	20 %	20 %	40 %	20 %	384422639
83	NC_017269	AGCAC	2	10	128580	128589	40 %	0 %	20 %	40 %	384422639
84	NC_017269	CGATG	2	10	129712	129721	20 %	20 %	40 %	20 %	384422639
85	NC_017269	GCGTC	2	10	132885	132894	0 %	20 %	40 %	40 %	384422640
86	NC_017269	GATCA	2	10	132935	132944	40 %	20 %	20 %	20 %	384422640
87	NC_017269	TGATC	2	10	134229	134238	20 %	40 %	20 %	20 %	384422641
88	NC_017269	AGCCA	2	10	135531	135540	40 %	0 %	20 %	40 %	384422642
89	NC_017269	TGCTT	2	10	135807	135816	0 %	60 %	20 %	20 %	384422642
90	NC_017269	CGGAG	2	10	136716	136725	20 %	0 %	60 %	20 %	384422642
91	NC_017269	GGCGC	2	10	136933	136942	0 %	0 %	60 %	40 %	384422642
92	NC_017269	GAGCT	2	10	140177	140186	20 %	20 %	40 %	20 %	384422645
93	NC_017269	ACTGA	2	10	140630	140639	40 %	20 %	20 %	20 %	384422645
94	NC_017269	GCGTG	2	10	140671	140680	0 %	20 %	60 %	20 %	384422645
95	NC_017269	TCGGT	2	10	141515	141524	0 %	40 %	40 %	20 %	384422646
96	NC_017269	GATTG	2	10	144900	144909	20 %	40 %	40 %	0 %	384422649
97	NC_017269	GTTTG	2	10	145433	145442	0 %	60 %	40 %	0 %	384422650
98	NC_017269	TTCTT	2	10	145728	145737	0 %	80 %	0 %	20 %	384422650
99	NC_017269	TTGCC	2	10	152274	152283	0 %	40 %	20 %	40 %	384422656
100	NC_017269	GCGCT	2	10	154696	154705	0 %	20 %	40 %	40 %	384422657
101	NC_017269	CGGTG	2	10	155638	155647	0 %	20 %	60 %	20 %	384422658
102	NC_017269	AGTGA	2	10	156221	156230	40 %	20 %	40 %	0 %	384422658
103	NC_017269	GTTTG	2	10	156280	156289	0 %	60 %	40 %	0 %	384422658
104	NC_017269	TGCTG	2	10	158500	158509	0 %	40 %	40 %	20 %	384422661
105	NC_017269	TTTCC	2	10	158761	158770	0 %	60 %	0 %	40 %	384422661
106	NC_017269	AAACG	2	10	162093	162102	60 %	0 %	20 %	20 %	384422663
107	NC_017269	TGGTG	2	10	162903	162912	0 %	40 %	60 %	0 %	384422663
108	NC_017269	AACCA	2	10	169771	169780	60 %	0 %	0 %	40 %	384422669
109	NC_017269	ACGTG	2	10	171245	171254	20 %	20 %	40 %	20 %	384422671
110	NC_017269	CAGCA	2	10	171473	171482	40 %	0 %	20 %	40 %	384422671
111	NC_017269	AATCC	2	10	171692	171701	40 %	20 %	0 %	40 %	384422671
112	NC_017269	ATGGA	2	10	172430	172439	40 %	20 %	40 %	0 %	384422671
113	NC_017269	TGGCT	2	10	173991	174000	0 %	40 %	40 %	20 %	384422673
114	NC_017269	CTGAA	2	10	174922	174931	40 %	20 %	20 %	20 %	384422674
115	NC_017269	TCTGC	2	10	177029	177038	0 %	40 %	20 %	40 %	384422675
116	NC_017269	CGCTT	2	10	178080	178089	0 %	40 %	20 %	40 %	384422677
117	NC_017269	AGAGA	2	10	182654	182663	60 %	0 %	40 %	0 %	384422682
118	NC_017269	GATTG	2	10	186606	186615	20 %	40 %	40 %	0 %	384422684
119	NC_017269	CGGCA	2	10	192699	192708	20 %	0 %	40 %	40 %	384422690
120	NC_017269	GTTCA	2	10	193110	193119	20 %	40 %	20 %	20 %	384422690
121	NC_017269	AAACG	2	10	196097	196106	60 %	0 %	20 %	20 %	384422693
122	NC_017269	TTTGC	2	10	197328	197337	0 %	60 %	20 %	20 %	384422695
123	NC_017269	GCATC	2	10	200985	200994	20 %	20 %	20 %	40 %	384422699
124	NC_017269	TGGCT	2	10	201460	201469	0 %	40 %	40 %	20 %	384422700
125	NC_017269	AAACC	2	10	203142	203151	60 %	0 %	0 %	40 %	384422703
126	NC_017269	ATCAC	2	10	205276	205285	40 %	20 %	0 %	40 %	384422705
127	NC_017269	GCTGC	2	10	211318	211327	0 %	20 %	40 %	40 %	384422710
128	NC_017269	GGCTG	2	10	211920	211929	0 %	20 %	60 %	20 %	384422710
129	NC_017269	ACACC	2	10	213179	213188	40 %	0 %	0 %	60 %	384422711
130	NC_017269	AACCA	2	10	213972	213981	60 %	0 %	0 %	40 %	384422711
131	NC_017269	CAAGC	2	10	214277	214286	40 %	0 %	20 %	40 %	384422712
132	NC_017269	GGCTT	2	10	214291	214300	0 %	40 %	40 %	20 %	384422712
133	NC_017269	TGATT	2	10	215337	215346	20 %	60 %	20 %	0 %	384422714
134	NC_017269	GCAGT	2	10	216627	216636	20 %	20 %	40 %	20 %	384422715
135	NC_017269	CATCT	2	10	222823	222832	20 %	40 %	0 %	40 %	384422719
136	NC_017269	TTAAA	2	10	224312	224321	60 %	40 %	0 %	0 %	384422720
137	NC_017269	TCTGC	2	10	225758	225767	0 %	40 %	20 %	40 %	384422722
138	NC_017269	AGCTG	2	10	228141	228150	20 %	20 %	40 %	20 %	384422724
139	NC_017269	ATTTG	2	10	230157	230166	20 %	60 %	20 %	0 %	384422724
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141	NC_017269	TCACT	2	10	231104	231113	20 %	40 %	0 %	40 %	384422725
142	NC_017269	GACCA	2	10	235117	235126	40 %	0 %	20 %	40 %	384422728
143	NC_017269	TGGCT	2	10	235694	235703	0 %	40 %	40 %	20 %	384422728
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150	NC_017269	GCTGC	2	10	253889	253898	0 %	20 %	40 %	40 %	384422745
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153	NC_017269	CGTTG	2	10	256210	256219	0 %	40 %	40 %	20 %	384422748
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165	NC_017269	CTTTT	2	10	294764	294773	0 %	80 %	0 %	20 %	384422786
166	NC_017269	ATCTC	2	10	295059	295068	20 %	40 %	0 %	40 %	384422786
167	NC_017269	GATTG	2	10	304232	304241	20 %	40 %	40 %	0 %	384422797
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173	NC_017269	AGCTC	2	10	318551	318560	20 %	20 %	20 %	40 %	384422814
174	NC_017269	CGTGT	2	10	323107	323116	0 %	40 %	40 %	20 %	384422822
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187	NC_017269	TCGGG	2	10	354989	354998	0 %	20 %	60 %	20 %	384422847
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247	NC_017269	AGTCC	2	10	447194	447203	20 %	20 %	20 %	40 %	384422932
248	NC_017269	TCACA	2	10	448912	448921	40 %	20 %	0 %	40 %	384422933
249	NC_017269	ATTGG	2	10	457195	457204	20 %	40 %	40 %	0 %	384422937
250	NC_017269	GCACA	2	10	459479	459488	40 %	0 %	20 %	40 %	384422939
251	NC_017269	CCACC	2	10	461410	461419	20 %	0 %	0 %	80 %	384422942
252	NC_017269	AGATC	2	10	462899	462908	40 %	20 %	20 %	20 %	384422944
253	NC_017269	AAAAT	2	10	464397	464406	80 %	20 %	0 %	0 %	384422946
254	NC_017269	GCGCT	2	10	465903	465912	0 %	20 %	40 %	40 %	384422947
255	NC_017269	GGCTT	2	10	469272	469281	0 %	40 %	40 %	20 %	384422949
256	NC_017269	TTCAT	2	10	470204	470213	20 %	60 %	0 %	20 %	384422951
257	NC_017269	CAAAC	2	10	472464	472473	60 %	0 %	0 %	40 %	384422954
258	NC_017269	AAACC	2	10	475114	475123	60 %	0 %	0 %	40 %	384422956
259	NC_017269	GCAGC	2	10	476006	476015	20 %	0 %	40 %	40 %	384422958
260	NC_017269	GCGCA	2	10	476228	476237	20 %	0 %	40 %	40 %	384422958
261	NC_017269	CAAAC	2	10	478516	478525	60 %	0 %	0 %	40 %	384422960
262	NC_017269	GCATC	2	10	482824	482833	20 %	20 %	20 %	40 %	384422963
263	NC_017269	CCTTT	2	10	486225	486234	0 %	60 %	0 %	40 %	384422965
264	NC_017269	CATTG	2	10	488859	488868	20 %	40 %	20 %	20 %	384422967
265	NC_017269	GCTGA	2	10	492394	492403	20 %	20 %	40 %	20 %	384422970
266	NC_017269	CCATG	2	10	492477	492486	20 %	20 %	20 %	40 %	384422970
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268	NC_017269	GCGCT	2	10	502499	502508	0 %	20 %	40 %	40 %	384422978
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271	NC_017269	CCGCA	2	10	504143	504152	20 %	0 %	20 %	60 %	384422979
272	NC_017269	TGATG	2	10	504975	504984	20 %	40 %	40 %	0 %	384422981
273	NC_017269	TGCAG	2	10	505983	505992	20 %	20 %	40 %	20 %	384422981
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277	NC_017269	GCTTT	2	10	510429	510438	0 %	60 %	20 %	20 %	384422986
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280	NC_017269	GCTCG	2	10	515847	515856	0 %	20 %	40 %	40 %	384422989
281	NC_017269	GTTAC	2	10	516897	516906	20 %	40 %	20 %	20 %	384422990
282	NC_017269	AAGCC	2	10	517667	517676	40 %	0 %	20 %	40 %	384422990
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293	NC_017269	CCATG	2	10	537542	537551	20 %	20 %	20 %	40 %	384423004
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297	NC_017269	AGCCA	2	10	544333	544342	40 %	0 %	20 %	40 %	384423009
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299	NC_017269	CCACA	2	10	546618	546627	40 %	0 %	0 %	60 %	384423010
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301	NC_017269	CAACC	2	10	551014	551023	40 %	0 %	0 %	60 %	384423016
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374	NC_017269	CCTTT	2	10	661400	661409	0 %	60 %	0 %	40 %	384423121
375	NC_017269	CCGAT	2	10	664259	664268	20 %	20 %	20 %	40 %	384423124
376	NC_017269	TTACC	2	10	664558	664567	20 %	40 %	0 %	40 %	384423124
377	NC_017269	ACTCG	2	10	664685	664694	20 %	20 %	20 %	40 %	384423125
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380	NC_017269	GCCGC	2	10	667592	667601	0 %	0 %	40 %	60 %	384423128
381	NC_017269	AGAAA	2	10	667623	667632	80 %	0 %	20 %	0 %	384423128
382	NC_017269	ATTCG	2	10	671467	671476	20 %	40 %	20 %	20 %	384423132
383	NC_017269	TTCAA	2	10	672250	672259	40 %	40 %	0 %	20 %	384423133
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386	NC_017269	TCACT	2	10	680765	680774	20 %	40 %	0 %	40 %	384423137
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389	NC_017269	CGCCA	2	10	682866	682875	20 %	0 %	20 %	60 %	384423137
390	NC_017269	CGCCA	2	10	683298	683307	20 %	0 %	20 %	60 %	384423137
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