MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 9520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
2	NC_017269	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
3	NC_017269	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
4	NC_017269	AGC	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
5	NC_017269	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422538
6	NC_017269	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
7	NC_017269	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
8	NC_017269	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
9	NC_017269	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
10	NC_017269	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
11	NC_017269	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
12	NC_017269	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
13	NC_017269	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422538
14	NC_017269	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422538
15	NC_017269	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
16	NC_017269	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
17	NC_017269	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
18	NC_017269	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422538
19	NC_017269	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422538
20	NC_017269	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
21	NC_017269	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
22	NC_017269	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
23	NC_017269	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
24	NC_017269	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
25	NC_017269	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422538
26	NC_017269	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
27	NC_017269	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422539
28	NC_017269	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
29	NC_017269	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
30	NC_017269	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
31	NC_017269	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
32	NC_017269	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422540
33	NC_017269	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
34	NC_017269	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422540
35	NC_017269	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
36	NC_017269	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422540
37	NC_017269	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422541
38	NC_017269	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
39	NC_017269	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422542
40	NC_017269	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422542
41	NC_017269	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
42	NC_017269	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
43	NC_017269	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
44	NC_017269	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422542
45	NC_017269	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422542
46	NC_017269	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422542
47	NC_017269	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422542
48	NC_017269	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
49	NC_017269	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
50	NC_017269	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422543
51	NC_017269	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
52	NC_017269	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422543
53	NC_017269	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
54	NC_017269	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422543
55	NC_017269	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
56	NC_017269	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
57	NC_017269	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
58	NC_017269	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
59	NC_017269	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422544
60	NC_017269	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
61	NC_017269	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
62	NC_017269	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
63	NC_017269	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422544
64	NC_017269	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
65	NC_017269	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
66	NC_017269	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
67	NC_017269	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
68	NC_017269	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422544
69	NC_017269	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
70	NC_017269	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
71	NC_017269	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
72	NC_017269	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
73	NC_017269	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
74	NC_017269	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
75	NC_017269	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422545
76	NC_017269	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
77	NC_017269	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
78	NC_017269	GCC	2	6	8614	8619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422545
79	NC_017269	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422545
80	NC_017269	TGA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422545
81	NC_017269	AAG	2	6	12298	12303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
82	NC_017269	ACG	2	6	12415	12420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422546
83	NC_017269	CAA	2	6	12516	12521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
84	NC_017269	GAA	2	6	12598	12603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
85	NC_017269	CAT	2	6	12614	12619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
86	NC_017269	GGT	2	6	12628	12633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422546
87	NC_017269	GCC	2	6	12638	12643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422546
88	NC_017269	GCC	2	6	12646	12651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422546
89	NC_017269	GCG	2	6	12670	12675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
90	NC_017269	GAA	2	6	12739	12744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
91	NC_017269	AAG	2	6	12755	12760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
92	NC_017269	GTC	2	6	12853	12858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
93	NC_017269	CGT	3	9	12877	12885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
94	NC_017269	ACT	2	6	13025	13030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
95	NC_017269	GCA	2	6	13038	13043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422546
96	NC_017269	GCA	2	6	13125	13130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422546
97	NC_017269	GGC	2	6	13179	13184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
98	NC_017269	GCG	2	6	13306	13311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
99	NC_017269	CTG	2	6	13354	13359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
100	NC_017269	CTG	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
101	NC_017269	ACC	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422546
102	NC_017269	CAA	2	6	13453	13458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
103	NC_017269	ATC	2	6	13507	13512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
104	NC_017269	GAA	2	6	13513	13518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
105	NC_017269	GCG	2	6	13585	13590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
106	NC_017269	TTG	2	6	13631	13636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422546
107	NC_017269	AGA	2	6	13733	13738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
108	NC_017269	CAA	2	6	13839	13844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
109	NC_017269	TGC	2	6	13958	13963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
110	NC_017269	TCA	2	6	13988	13993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
111	NC_017269	GTG	2	6	14023	14028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422546
112	NC_017269	GCG	2	6	14044	14049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
113	NC_017269	ATC	2	6	14074	14079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
114	NC_017269	CAA	2	6	14130	14135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
115	NC_017269	ATC	2	6	14182	14187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422546
116	NC_017269	CGG	3	9	14192	14200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
117	NC_017269	AAG	2	6	14231	14236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
118	NC_017269	GAA	2	6	14320	14325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422546
119	NC_017269	ACA	2	6	14336	14341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
120	NC_017269	CTC	2	6	14428	14433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422546
121	NC_017269	CTG	2	6	14449	14454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
122	NC_017269	AAC	2	6	14686	14691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422546
123	NC_017269	GAC	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422547
124	NC_017269	CGT	2	6	14912	14917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422547
125	NC_017269	TGC	2	6	14961	14966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422547
126	NC_017269	AGA	2	6	14976	14981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422547
127	NC_017269	TGA	2	6	15148	15153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422547
128	NC_017269	GGC	2	6	15164	15169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422547
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252	NC_017269	GTG	2	6	25738	25743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422555
253	NC_017269	GTG	2	6	25773	25778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422555
254	NC_017269	TCA	3	9	25846	25854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422555
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498	NC_017269	CAC	2	6	52647	52652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422575
499	NC_017269	CCG	2	6	52985	52990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422575
500	NC_017269	GGC	2	6	53047	53052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422575

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