MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017269	TGG	2	6	192934	192939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422690
3002	NC_017269	TCA	2	6	192967	192972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422690
3003	NC_017269	A	6	6	192972	192977	100 %	0 %	0 %	0 %	384422690
3004	NC_017269	CGT	2	6	192995	193000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422690
3005	NC_017269	TCAG	2	8	193009	193016	25 %	25 %	25 %	25 %	384422690
3006	NC_017269	TGCT	2	8	193026	193033	0 %	50 %	25 %	25 %	384422690
3007	NC_017269	T	6	6	193059	193064	0 %	100 %	0 %	0 %	384422690
3008	NC_017269	TC	3	6	193085	193090	0 %	50 %	0 %	50 %	384422690
3009	NC_017269	GTTCA	2	10	193110	193119	20 %	40 %	20 %	20 %	384422690
3010	NC_017269	CGAG	2	8	193159	193166	25 %	0 %	50 %	25 %	384422690
3011	NC_017269	ATC	2	6	193913	193918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422691
3012	NC_017269	CT	3	6	193952	193957	0 %	50 %	0 %	50 %	384422691
3013	NC_017269	TTG	3	9	194000	194008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422691
3014	NC_017269	AGC	2	6	194063	194068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422691
3015	NC_017269	ATC	3	9	194177	194185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422691
3016	NC_017269	TTC	2	6	194186	194191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422691
3017	NC_017269	TTA	2	6	194212	194217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422691
3018	NC_017269	CGG	2	6	194251	194256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422691
3019	NC_017269	CTT	2	6	194269	194274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422691
3020	NC_017269	CCTT	2	8	194355	194362	0 %	50 %	0 %	50 %	384422691
3021	NC_017269	GGT	2	6	194435	194440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422691
3022	NC_017269	GGC	2	6	194491	194496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422691
3023	NC_017269	ATG	2	6	194510	194515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422691
3024	NC_017269	GTG	2	6	194538	194543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422691
3025	NC_017269	TTGA	2	8	194594	194601	25 %	50 %	25 %	0 %	384422691
3026	NC_017269	GGC	2	6	194815	194820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422691
3027	NC_017269	GTG	2	6	194843	194848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422691
3028	NC_017269	TTG	2	6	194877	194882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422691
3029	NC_017269	GCT	2	6	194893	194898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422691
3030	NC_017269	TCA	3	9	194916	194924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422691
3031	NC_017269	TG	3	6	194934	194939	0 %	50 %	50 %	0 %	384422691
3032	NC_017269	GCTT	2	8	195071	195078	0 %	50 %	25 %	25 %	384422691
3033	NC_017269	GTT	2	6	195187	195192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422692
3034	NC_017269	AAC	2	6	195244	195249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422692
3035	NC_017269	GTA	2	6	195269	195274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422692
3036	NC_017269	TTG	2	6	195364	195369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422693
3037	NC_017269	GAT	2	6	195510	195515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422693
3038	NC_017269	GGT	2	6	195651	195656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422693
3039	NC_017269	CTG	2	6	195717	195722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422693
3040	NC_017269	TCA	2	6	195736	195741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422693
3041	NC_017269	ATC	2	6	195795	195800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422693
3042	NC_017269	CTTG	2	8	195815	195822	0 %	50 %	25 %	25 %	384422693
3043	NC_017269	GCG	2	6	195918	195923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422693
3044	NC_017269	GGC	2	6	195945	195950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422693
3045	NC_017269	CGC	2	6	195983	195988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422693
3046	NC_017269	GTT	2	6	195999	196004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422693
3047	NC_017269	TGA	2	6	196084	196089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422693
3048	NC_017269	AAACG	2	10	196097	196106	60 %	0 %	20 %	20 %	384422693
3049	NC_017269	CAG	2	6	196263	196268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422693
3050	NC_017269	A	6	6	196272	196277	100 %	0 %	0 %	0 %	384422693
3051	NC_017269	ATT	2	6	196347	196352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422693
3052	NC_017269	TGG	2	6	196372	196377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422693
3053	NC_017269	GTG	2	6	196411	196416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422693
3054	NC_017269	TGG	2	6	196472	196477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422693
3055	NC_017269	TCA	2	6	196504	196509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422693
3056	NC_017269	GCG	2	6	196726	196731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422694
3057	NC_017269	GTA	2	6	196741	196746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422694
3058	NC_017269	T	6	6	196783	196788	0 %	100 %	0 %	0 %	384422694
3059	NC_017269	GC	3	6	197317	197322	0 %	0 %	50 %	50 %	384422695
3060	NC_017269	TTTGC	2	10	197328	197337	0 %	60 %	20 %	20 %	384422695
3061	NC_017269	GCC	2	6	197379	197384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422695
3062	NC_017269	CG	4	8	197410	197417	0 %	0 %	50 %	50 %	384422695
3063	NC_017269	CAG	2	6	197466	197471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422695
3064	NC_017269	GCG	2	6	197485	197490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422695
3065	NC_017269	AAT	2	6	197658	197663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422695
3066	NC_017269	CTT	2	6	197687	197692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422695
3067	NC_017269	TGC	2	6	197772	197777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422695
3068	NC_017269	GA	3	6	197812	197817	50 %	0 %	50 %	0 %	384422695
3069	NC_017269	AGC	2	6	197935	197940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422695
3070	NC_017269	CCG	2	6	197969	197974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422695
3071	NC_017269	ACGG	2	8	197979	197986	25 %	0 %	50 %	25 %	384422695
3072	NC_017269	CGG	2	6	198040	198045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422695
3073	NC_017269	ACG	2	6	198115	198120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422695
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3078	NC_017269	CAT	2	6	198731	198736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422696
3079	NC_017269	CTG	2	6	198737	198742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422696
3080	NC_017269	CCG	2	6	198801	198806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422696
3081	NC_017269	CA	3	6	198865	198870	50 %	0 %	0 %	50 %	384422696
3082	NC_017269	TGT	2	6	198904	198909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422696
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3084	NC_017269	GCAT	2	8	199066	199073	25 %	25 %	25 %	25 %	384422696
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3086	NC_017269	CCG	2	6	199197	199202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422696
3087	NC_017269	T	6	6	199207	199212	0 %	100 %	0 %	0 %	384422696
3088	NC_017269	TGAGCG	2	12	199219	199230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384422696
3089	NC_017269	GATG	2	8	199395	199402	25 %	25 %	50 %	0 %	384422696
3090	NC_017269	GAT	2	6	199433	199438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422696
3091	NC_017269	TG	3	6	199503	199508	0 %	50 %	50 %	0 %	384422696
3092	NC_017269	GCG	2	6	199610	199615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422696
3093	NC_017269	CTTG	2	8	199902	199909	0 %	50 %	25 %	25 %	384422697
3094	NC_017269	ATA	2	6	199970	199975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422697
3095	NC_017269	A	9	9	200333	200341	100 %	0 %	0 %	0 %	384422698
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3098	NC_017269	A	6	6	200468	200473	100 %	0 %	0 %	0 %	384422698
3099	NC_017269	TTGCGT	2	12	200544	200555	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384422698
3100	NC_017269	CAT	2	6	200941	200946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422699
3101	NC_017269	GCATC	2	10	200985	200994	20 %	20 %	20 %	40 %	384422699
3102	NC_017269	CTT	2	6	201036	201041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422699
3103	NC_017269	GTA	2	6	201075	201080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422699
3104	NC_017269	TG	3	6	201114	201119	0 %	50 %	50 %	0 %	384422699
3105	NC_017269	CGT	2	6	201145	201150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422699
3106	NC_017269	TGA	2	6	201180	201185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422699
3107	NC_017269	TCT	3	9	201216	201224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422699
3108	NC_017269	CAA	2	6	201267	201272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422699
3109	NC_017269	TGGCT	2	10	201460	201469	0 %	40 %	40 %	20 %	384422700
3110	NC_017269	GTG	2	6	201706	201711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422701
3111	NC_017269	GAGT	2	8	201770	201777	25 %	25 %	50 %	0 %	384422701
3112	NC_017269	TGA	2	6	201947	201952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422702
3113	NC_017269	CG	3	6	201962	201967	0 %	0 %	50 %	50 %	384422702
3114	NC_017269	A	6	6	202134	202139	100 %	0 %	0 %	0 %	384422702
3115	NC_017269	ACG	2	6	202146	202151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422702
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3117	NC_017269	TTCA	2	8	202224	202231	25 %	50 %	0 %	25 %	384422702
3118	NC_017269	ATG	2	6	202258	202263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422702
3119	NC_017269	TGG	2	6	202276	202281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422702
3120	NC_017269	CCAC	2	8	202284	202291	25 %	0 %	0 %	75 %	384422702
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3122	NC_017269	TGTT	2	8	202417	202424	0 %	75 %	25 %	0 %	384422702
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3124	NC_017269	GT	3	6	202515	202520	0 %	50 %	50 %	0 %	384422702
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3243	NC_017269	ATC	2	6	208119	208124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422707
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3245	NC_017269	CGA	2	6	208157	208162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422707
3246	NC_017269	AAT	2	6	208357	208362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422708
3247	NC_017269	GTA	2	6	208376	208381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422708
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3249	NC_017269	A	6	6	208575	208580	100 %	0 %	0 %	0 %	384422708
3250	NC_017269	TCT	2	6	208615	208620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422708
3251	NC_017269	TCA	2	6	208734	208739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422708
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3253	NC_017269	A	6	6	208831	208836	100 %	0 %	0 %	0 %	384422708
3254	NC_017269	GTC	2	6	209643	209648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422709
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3258	NC_017269	TGA	2	6	209881	209886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422709
3259	NC_017269	TTG	2	6	209934	209939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422709
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3264	NC_017269	TGC	2	6	210142	210147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422709
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3274	NC_017269	GAT	2	6	211174	211179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422710
3275	NC_017269	GAA	2	6	211198	211203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422710
3276	NC_017269	T	6	6	211227	211232	0 %	100 %	0 %	0 %	384422710
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3279	NC_017269	GTTT	2	8	211307	211314	0 %	75 %	25 %	0 %	384422710
3280	NC_017269	GCTGC	2	10	211318	211327	0 %	20 %	40 %	40 %	384422710
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3282	NC_017269	AAT	2	6	211486	211491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422710
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3284	NC_017269	GCA	2	6	211642	211647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422710
3285	NC_017269	GTGC	2	8	211705	211712	0 %	25 %	50 %	25 %	384422710
3286	NC_017269	TTG	2	6	211818	211823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422710
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3290	NC_017269	CAC	2	6	212222	212227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422710
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3293	NC_017269	CAGA	2	8	212525	212532	50 %	0 %	25 %	25 %	384422710
3294	NC_017269	CGAG	2	8	212534	212541	25 %	0 %	50 %	25 %	384422710
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3301	NC_017269	CAC	3	9	213015	213023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422711
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3304	NC_017269	TGG	2	6	213215	213220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422711
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3333	NC_017269	TGA	2	6	214734	214739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422713
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3335	NC_017269	GCA	2	6	214799	214804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422713
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3337	NC_017269	CTTCAT	2	12	214881	214892	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384422713
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3342	NC_017269	GATC	2	8	215103	215110	25 %	25 %	25 %	25 %	384422713
3343	NC_017269	TTC	2	6	215128	215133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422713
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3346	NC_017269	TGATT	2	10	215337	215346	20 %	60 %	20 %	0 %	384422714
3347	NC_017269	TGG	2	6	215414	215419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422714
3348	NC_017269	TAC	2	6	215502	215507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422714
3349	NC_017269	CAG	3	9	215749	215757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422714
3350	NC_017269	CGC	2	6	216006	216011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422715
3351	NC_017269	GAT	3	9	216070	216078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422715
3352	NC_017269	ATTCCA	2	12	216117	216128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422715
3353	NC_017269	TTCT	2	8	216155	216162	0 %	75 %	0 %	25 %	384422715
3354	NC_017269	AAG	2	6	216167	216172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422715
3355	NC_017269	GGT	2	6	216177	216182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422715
3356	NC_017269	TGAT	2	8	216215	216222	25 %	50 %	25 %	0 %	384422715
3357	NC_017269	GTG	2	6	216223	216228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422715
3358	NC_017269	GAG	2	6	216274	216279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422715
3359	NC_017269	GGCA	2	8	216326	216333	25 %	0 %	50 %	25 %	384422715
3360	NC_017269	TCA	2	6	216347	216352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422715
3361	NC_017269	TGA	2	6	216366	216371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422715
3362	NC_017269	A	6	6	216380	216385	100 %	0 %	0 %	0 %	384422715
3363	NC_017269	GAC	2	6	216393	216398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422715
3364	NC_017269	TGC	2	6	216428	216433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422715
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3366	NC_017269	TTGA	2	8	216454	216461	25 %	50 %	25 %	0 %	384422715
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3488	NC_017269	TGT	2	6	224267	224272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422720
3489	NC_017269	TTAAA	2	10	224312	224321	60 %	40 %	0 %	0 %	384422720
3490	NC_017269	GTT	2	6	224334	224339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422720
3491	NC_017269	GGCT	2	8	224371	224378	0 %	25 %	50 %	25 %	384422720
3492	NC_017269	TGG	2	6	224405	224410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422720
3493	NC_017269	CAA	2	6	224441	224446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422720
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3495	NC_017269	TTG	2	6	224488	224493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422720
3496	NC_017269	T	7	7	224621	224627	0 %	100 %	0 %	0 %	384422721
3497	NC_017269	AG	3	6	224636	224641	50 %	0 %	50 %	0 %	384422721
3498	NC_017269	ATC	2	6	224673	224678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422721
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3500	NC_017269	TCA	2	6	224768	224773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422721

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