MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017269	CTCAAG	2	12	100382	100393	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384422616
1502	NC_017269	CAT	2	6	100470	100475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422616
1503	NC_017269	TTA	2	6	100640	100645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422617
1504	NC_017269	GCA	2	6	100785	100790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422617
1505	NC_017269	AAG	2	6	100862	100867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422617
1506	NC_017269	AC	3	6	100877	100882	50 %	0 %	0 %	50 %	384422617
1507	NC_017269	GAA	2	6	100893	100898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422617
1508	NC_017269	TGC	2	6	100920	100925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422617
1509	NC_017269	CAA	2	6	100978	100983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422617
1510	NC_017269	TGG	2	6	100997	101002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422617
1511	NC_017269	TC	3	6	101049	101054	0 %	50 %	0 %	50 %	384422617
1512	NC_017269	TGG	2	6	101058	101063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422617
1513	NC_017269	CCA	2	6	101324	101329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422617
1514	NC_017269	CTG	2	6	101389	101394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422617
1515	NC_017269	TG	3	6	101393	101398	0 %	50 %	50 %	0 %	384422617
1516	NC_017269	GAG	2	6	101402	101407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422617
1517	NC_017269	TCC	2	6	101496	101501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422617
1518	NC_017269	TGA	2	6	101505	101510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422617
1519	NC_017269	GACA	2	8	101535	101542	50 %	0 %	25 %	25 %	384422617
1520	NC_017269	AAGC	2	8	101728	101735	50 %	0 %	25 %	25 %	384422617
1521	NC_017269	CTG	3	9	101798	101806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422617
1522	NC_017269	T	6	6	101898	101903	0 %	100 %	0 %	0 %	384422618
1523	NC_017269	GCAA	2	8	101910	101917	50 %	0 %	25 %	25 %	384422618
1524	NC_017269	GCC	2	6	101971	101976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422618
1525	NC_017269	GGC	2	6	101992	101997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422618
1526	NC_017269	TTA	2	6	102002	102007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422618
1527	NC_017269	AAT	2	6	102091	102096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422618
1528	NC_017269	CCA	2	6	102102	102107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422618
1529	NC_017269	GC	3	6	102158	102163	0 %	0 %	50 %	50 %	384422618
1530	NC_017269	T	6	6	102166	102171	0 %	100 %	0 %	0 %	384422618
1531	NC_017269	CATG	2	8	102173	102180	25 %	25 %	25 %	25 %	384422618
1532	NC_017269	ATCC	2	8	102265	102272	25 %	25 %	0 %	50 %	384422618
1533	NC_017269	TGA	2	6	102369	102374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422618
1534	NC_017269	GGC	2	6	102399	102404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422618
1535	NC_017269	TCA	2	6	102470	102475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422618
1536	NC_017269	ACC	2	6	102484	102489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422618
1537	NC_017269	TGC	2	6	102528	102533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422618
1538	NC_017269	CAA	2	6	102541	102546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422618
1539	NC_017269	CAT	2	6	102913	102918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422619
1540	NC_017269	ATG	2	6	102956	102961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422619
1541	NC_017269	ATTG	2	8	103006	103013	25 %	50 %	25 %	0 %	384422619
1542	NC_017269	CTT	2	6	103040	103045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422619
1543	NC_017269	ATT	2	6	103107	103112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422619
1544	NC_017269	CTT	2	6	103144	103149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422619
1545	NC_017269	CTG	2	6	103335	103340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422619
1546	NC_017269	CGT	2	6	103397	103402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422619
1547	NC_017269	CAA	2	6	103408	103413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422619
1548	NC_017269	CGC	3	9	103439	103447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422619
1549	NC_017269	TCGC	2	8	103533	103540	0 %	25 %	25 %	50 %	384422619
1550	NC_017269	CAA	2	6	103622	103627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422619
1551	NC_017269	CCGA	2	8	103679	103686	25 %	0 %	25 %	50 %	384422619
1552	NC_017269	CTT	2	6	103705	103710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422619
1553	NC_017269	ATG	2	6	103743	103748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422619
1554	NC_017269	G	6	6	103782	103787	0 %	0 %	100 %	0 %	384422619
1555	NC_017269	CAG	2	6	103808	103813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422619
1556	NC_017269	CAC	2	6	103828	103833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422619
1557	NC_017269	GGCA	2	8	103869	103876	25 %	0 %	50 %	25 %	384422619
1558	NC_017269	TG	3	6	103884	103889	0 %	50 %	50 %	0 %	384422619
1559	NC_017269	TTTC	2	8	103914	103921	0 %	75 %	0 %	25 %	384422619
1560	NC_017269	GCG	2	6	103967	103972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422619
1561	NC_017269	TG	3	6	104067	104072	0 %	50 %	50 %	0 %	384422619
1562	NC_017269	TGGATG	2	12	104121	104132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384422619
1563	NC_017269	TCA	2	6	104152	104157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422619
1564	NC_017269	CAC	2	6	104166	104171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422619
1565	NC_017269	CAG	2	6	104342	104347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422620
1566	NC_017269	TCA	2	6	104403	104408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422620
1567	NC_017269	ATG	2	6	104448	104453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422620
1568	NC_017269	TTGA	2	8	104546	104553	25 %	50 %	25 %	0 %	384422620
1569	NC_017269	GCA	2	6	104563	104568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422620
1570	NC_017269	TCG	2	6	104596	104601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422620
1571	NC_017269	T	6	6	104614	104619	0 %	100 %	0 %	0 %	384422620
1572	NC_017269	AAG	2	6	104730	104735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422620
1573	NC_017269	GGC	2	6	104738	104743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422620
1574	NC_017269	TTTG	2	8	104746	104753	0 %	75 %	25 %	0 %	384422620
1575	NC_017269	GTT	2	6	104788	104793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422620
1576	NC_017269	GAT	2	6	104827	104832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422620
1577	NC_017269	CCA	2	6	104844	104849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422620
1578	NC_017269	TCA	2	6	105096	105101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422620
1579	NC_017269	G	6	6	105110	105115	0 %	0 %	100 %	0 %	384422620
1580	NC_017269	CA	3	6	105130	105135	50 %	0 %	0 %	50 %	384422620
1581	NC_017269	CT	3	6	105258	105263	0 %	50 %	0 %	50 %	384422620
1582	NC_017269	GCT	2	6	105312	105317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422621
1583	NC_017269	TTC	2	6	105326	105331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422621
1584	NC_017269	ACC	3	9	105335	105343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422621
1585	NC_017269	TCAA	2	8	105369	105376	50 %	25 %	0 %	25 %	384422621
1586	NC_017269	TTC	2	6	105515	105520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422621
1587	NC_017269	ATCA	2	8	105533	105540	50 %	25 %	0 %	25 %	384422621
1588	NC_017269	GC	3	6	105579	105584	0 %	0 %	50 %	50 %	384422621
1589	NC_017269	ATT	2	6	107550	107555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422622
1590	NC_017269	CTG	2	6	107577	107582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422622
1591	NC_017269	GTG	2	6	107659	107664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422622
1592	NC_017269	CTT	2	6	107717	107722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422622
1593	NC_017269	AAG	2	6	107775	107780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422622
1594	NC_017269	CATG	2	8	107813	107820	25 %	25 %	25 %	25 %	384422622
1595	NC_017269	GCC	2	6	107840	107845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422622
1596	NC_017269	GA	3	6	107929	107934	50 %	0 %	50 %	0 %	384422622
1597	NC_017269	CTT	2	6	107975	107980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422622
1598	NC_017269	AGT	2	6	108013	108018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422622
1599	NC_017269	CCAT	2	8	108022	108029	25 %	25 %	0 %	50 %	384422622
1600	NC_017269	GAT	2	6	108330	108335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422623
1601	NC_017269	GCC	2	6	108342	108347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422623
1602	NC_017269	TGT	2	6	108353	108358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422623
1603	NC_017269	GT	3	6	108431	108436	0 %	50 %	50 %	0 %	384422623
1604	NC_017269	ATTG	2	8	108479	108486	25 %	50 %	25 %	0 %	384422623
1605	NC_017269	GCC	2	6	108498	108503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422623
1606	NC_017269	GTG	2	6	108525	108530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1607	NC_017269	GCC	2	6	108540	108545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422623
1608	NC_017269	ACC	2	6	108552	108557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422623
1609	NC_017269	TGA	2	6	108574	108579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422623
1610	NC_017269	TC	3	6	108650	108655	0 %	50 %	0 %	50 %	384422623
1611	NC_017269	ATT	2	6	108699	108704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422623
1612	NC_017269	TTG	2	6	108766	108771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422623
1613	NC_017269	GCT	2	6	108782	108787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422623
1614	NC_017269	GCG	2	6	108876	108881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422623
1615	NC_017269	GTG	2	6	108948	108953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1616	NC_017269	ATG	2	6	109065	109070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422623
1617	NC_017269	GCC	2	6	109158	109163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422623
1618	NC_017269	GTG	2	6	109186	109191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1619	NC_017269	TGG	2	6	109223	109228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1620	NC_017269	TGG	2	6	109273	109278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1621	NC_017269	GTG	2	6	109329	109334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422623
1622	NC_017269	ATC	2	6	109338	109343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422623
1623	NC_017269	TCA	2	6	109420	109425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422623
1624	NC_017269	CTG	2	6	109479	109484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422623
1625	NC_017269	ATG	2	6	109530	109535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422623
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1627	NC_017269	GCG	2	6	109658	109663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422623
1628	NC_017269	TG	3	6	109704	109709	0 %	50 %	50 %	0 %	384422623
1629	NC_017269	GCTG	2	8	109763	109770	0 %	25 %	50 %	25 %	384422623
1630	NC_017269	A	6	6	109788	109793	100 %	0 %	0 %	0 %	384422623
1631	NC_017269	TGC	2	6	109885	109890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422623
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1635	NC_017269	GCT	2	6	110098	110103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422624
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1638	NC_017269	GAT	2	6	110206	110211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422624
1639	NC_017269	TGAG	2	8	110304	110311	25 %	25 %	50 %	0 %	384422624
1640	NC_017269	TGC	2	6	110325	110330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422624
1641	NC_017269	ATC	2	6	110354	110359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422624
1642	NC_017269	CA	3	6	110368	110373	50 %	0 %	0 %	50 %	384422624
1643	NC_017269	TGTT	2	8	110472	110479	0 %	75 %	25 %	0 %	384422624
1644	NC_017269	CATGCA	2	12	110596	110607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384422624
1645	NC_017269	AG	3	6	110618	110623	50 %	0 %	50 %	0 %	384422624
1646	NC_017269	CAG	2	6	110629	110634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422624
1647	NC_017269	ACC	2	6	110643	110648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422624
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1651	NC_017269	T	6	6	111008	111013	0 %	100 %	0 %	0 %	384422624
1652	NC_017269	TTG	2	6	111146	111151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422624
1653	NC_017269	TTC	2	6	111158	111163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422624
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1655	NC_017269	TTTTCT	2	12	111189	111200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384422624
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1659	NC_017269	TTG	2	6	111359	111364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422624
1660	NC_017269	A	6	6	111399	111404	100 %	0 %	0 %	0 %	384422624
1661	NC_017269	AGG	2	6	111431	111436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422624
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1663	NC_017269	TGC	2	6	111513	111518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422624
1664	NC_017269	TGAG	2	8	111597	111604	25 %	25 %	50 %	0 %	384422624
1665	NC_017269	TCA	2	6	111621	111626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422624
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1676	NC_017269	GCA	2	6	112871	112876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422626
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1748	NC_017269	A	6	6	117260	117265	100 %	0 %	0 %	0 %	384422630
1749	NC_017269	CTGC	2	8	117298	117305	0 %	25 %	25 %	50 %	384422630
1750	NC_017269	TGC	2	6	117347	117352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422630
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1752	NC_017269	CTG	2	6	117512	117517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422630
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1757	NC_017269	CGTCC	2	10	117630	117639	0 %	20 %	20 %	60 %	384422630
1758	NC_017269	TGGT	2	8	117683	117690	0 %	50 %	50 %	0 %	384422630
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1777	NC_017269	GATT	2	8	118807	118814	25 %	50 %	25 %	0 %	384422631
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1782	NC_017269	TAT	2	6	119186	119191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422631
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1851	NC_017269	TGC	2	6	123475	123480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422635
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1853	NC_017269	TCAA	2	8	123511	123518	50 %	25 %	0 %	25 %	384422635
1854	NC_017269	CT	3	6	123700	123705	0 %	50 %	0 %	50 %	384422636
1855	NC_017269	CAAG	2	8	123723	123730	50 %	0 %	25 %	25 %	384422636
1856	NC_017269	CTG	2	6	123820	123825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
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1859	NC_017269	GTTT	2	8	123953	123960	0 %	75 %	25 %	0 %	384422636
1860	NC_017269	A	6	6	123985	123990	100 %	0 %	0 %	0 %	384422636
1861	NC_017269	GAT	2	6	123999	124004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422636
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1863	NC_017269	TCCTG	2	10	124140	124149	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
1864	NC_017269	TGG	2	6	124175	124180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
1865	NC_017269	CGC	2	6	124195	124200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422636
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1867	NC_017269	TGG	2	6	124217	124222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
1868	NC_017269	TGGC	2	8	124277	124284	0 %	25 %	50 %	25 %	384422636
1869	NC_017269	CCCA	2	8	124291	124298	25 %	0 %	0 %	75 %	384422636
1870	NC_017269	TGAT	2	8	124391	124398	25 %	50 %	25 %	0 %	384422636
1871	NC_017269	AAG	2	6	124472	124477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422636
1872	NC_017269	GTG	2	6	124520	124525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
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1877	NC_017269	TCA	2	6	124697	124702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422636
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1895	NC_017269	GGT	2	6	125601	125606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
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1901	NC_017269	CTGCT	2	10	125831	125840	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
1902	NC_017269	TACC	2	8	125863	125870	25 %	25 %	0 %	50 %	384422636
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