MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017269	GAC	2	6	66160	66165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422587
1002	NC_017269	GAA	2	6	68468	68473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422588
1003	NC_017269	GTG	3	9	68474	68482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422588
1004	NC_017269	AGC	2	6	68499	68504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422588
1005	NC_017269	GCAAG	2	10	68560	68569	40 %	0 %	40 %	20 %	384422588
1006	NC_017269	TGG	2	6	68617	68622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422588
1007	NC_017269	GTG	2	6	68783	68788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422588
1008	NC_017269	TGG	2	6	68827	68832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422588
1009	NC_017269	CGT	2	6	68833	68838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422588
1010	NC_017269	ATC	2	6	68840	68845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422588
1011	NC_017269	ACC	2	6	68874	68879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422588
1012	NC_017269	ATT	2	6	68883	68888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422588
1013	NC_017269	GCT	2	6	68977	68982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422588
1014	NC_017269	ACT	2	6	68991	68996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422588
1015	NC_017269	CAT	2	6	69074	69079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422588
1016	NC_017269	TGA	2	6	69127	69132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422588
1017	NC_017269	TGGA	2	8	69266	69273	25 %	25 %	50 %	0 %	384422588
1018	NC_017269	CA	3	6	69316	69321	50 %	0 %	0 %	50 %	384422588
1019	NC_017269	TCG	2	6	69373	69378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422588
1020	NC_017269	TGA	2	6	69388	69393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422588
1021	NC_017269	ATG	2	6	69402	69407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422588
1022	NC_017269	CAA	2	6	69446	69451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422588
1023	NC_017269	GACAA	2	10	69606	69615	60 %	0 %	20 %	20 %	384422588
1024	NC_017269	GCTG	2	8	69637	69644	0 %	25 %	50 %	25 %	384422588
1025	NC_017269	GTG	2	6	69710	69715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422588
1026	NC_017269	AGTG	2	8	69728	69735	25 %	25 %	50 %	0 %	384422588
1027	NC_017269	TAT	2	6	69874	69879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422588
1028	NC_017269	CAA	2	6	69886	69891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422588
1029	NC_017269	GCA	2	6	69930	69935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422588
1030	NC_017269	GAT	2	6	70112	70117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422588
1031	NC_017269	GCC	2	6	70248	70253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422588
1032	NC_017269	CAC	2	6	70291	70296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422588
1033	NC_017269	TCGA	2	8	70413	70420	25 %	25 %	25 %	25 %	384422588
1034	NC_017269	GCG	2	6	70589	70594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422589
1035	NC_017269	CCA	2	6	70611	70616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422589
1036	NC_017269	GCCA	2	8	70680	70687	25 %	0 %	25 %	50 %	384422589
1037	NC_017269	TTGAC	2	10	70734	70743	20 %	40 %	20 %	20 %	384422589
1038	NC_017269	A	6	6	70767	70772	100 %	0 %	0 %	0 %	384422589
1039	NC_017269	GGT	2	6	70774	70779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422589
1040	NC_017269	CGC	2	6	70864	70869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422589
1041	NC_017269	ACG	2	6	70919	70924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1042	NC_017269	ATGG	2	8	70976	70983	25 %	25 %	50 %	0 %	384422589
1043	NC_017269	GGC	2	6	70987	70992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422589
1044	NC_017269	CAC	2	6	71034	71039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422589
1045	NC_017269	TGG	2	6	71112	71117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422589
1046	NC_017269	AAG	2	6	71139	71144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422589
1047	NC_017269	GTG	2	6	71169	71174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422589
1048	NC_017269	CTG	2	6	71187	71192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1049	NC_017269	TCA	2	6	71199	71204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422589
1050	NC_017269	CGCTA	2	10	71295	71304	20 %	20 %	20 %	40 %	384422589
1051	NC_017269	GCC	2	6	71375	71380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422589
1052	NC_017269	CTC	2	6	71398	71403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422589
1053	NC_017269	ATC	2	6	71471	71476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422589
1054	NC_017269	TTA	2	6	71701	71706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422589
1055	NC_017269	TGA	2	6	71755	71760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422589
1056	NC_017269	TGA	2	6	71827	71832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422589
1057	NC_017269	GCA	2	6	71971	71976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1058	NC_017269	ACG	2	6	72080	72085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1059	NC_017269	GGT	2	6	72094	72099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422589
1060	NC_017269	TGTGG	2	10	72145	72154	0 %	40 %	60 %	0 %	384422589
1061	NC_017269	CTT	2	6	72232	72237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422589
1062	NC_017269	CTT	2	6	72382	72387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422589
1063	NC_017269	CG	3	6	72400	72405	0 %	0 %	50 %	50 %	384422589
1064	NC_017269	GAT	2	6	72416	72421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422589
1065	NC_017269	TGCGC	2	10	72424	72433	0 %	20 %	40 %	40 %	384422589
1066	NC_017269	AACCA	2	10	72515	72524	60 %	0 %	0 %	40 %	384422589
1067	NC_017269	AAG	2	6	72702	72707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422589
1068	NC_017269	GAA	2	6	72737	72742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422589
1069	NC_017269	CGG	2	6	72750	72755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422589
1070	NC_017269	TC	3	6	72764	72769	0 %	50 %	0 %	50 %	384422589
1071	NC_017269	TGC	2	6	72780	72785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1072	NC_017269	CTG	2	6	72788	72793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422589
1073	NC_017269	TC	3	6	72801	72806	0 %	50 %	0 %	50 %	384422589
1074	NC_017269	GTC	2	6	72807	72812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422589
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1081	NC_017269	GC	3	6	73126	73131	0 %	0 %	50 %	50 %	384422590
1082	NC_017269	TCA	2	6	73199	73204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422590
1083	NC_017269	GCG	2	6	73225	73230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422590
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1085	NC_017269	GCC	2	6	73417	73422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422590
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1097	NC_017269	TTA	2	6	74144	74149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422590
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1099	NC_017269	TGC	2	6	74231	74236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422590
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1101	NC_017269	CA	3	6	74415	74420	50 %	0 %	0 %	50 %	384422591
1102	NC_017269	ACAGG	2	10	74481	74490	40 %	0 %	40 %	20 %	384422591
1103	NC_017269	AAG	2	6	74521	74526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422591
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1105	NC_017269	GCG	2	6	74649	74654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422591
1106	NC_017269	TTAT	2	8	74708	74715	25 %	75 %	0 %	0 %	384422591
1107	NC_017269	GAA	2	6	74742	74747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422591
1108	NC_017269	GCT	2	6	74991	74996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422592
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1110	NC_017269	TGC	3	9	75034	75042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422592
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1112	NC_017269	TGAT	2	8	75185	75192	25 %	50 %	25 %	0 %	384422592
1113	NC_017269	GA	3	6	75199	75204	50 %	0 %	50 %	0 %	384422592
1114	NC_017269	CTA	2	6	75219	75224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422592
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1119	NC_017269	CG	3	6	75341	75346	0 %	0 %	50 %	50 %	384422592
1120	NC_017269	CTA	2	6	75369	75374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422592
1121	NC_017269	CG	3	6	75400	75405	0 %	0 %	50 %	50 %	384422592
1122	NC_017269	TAC	2	6	75456	75461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422592
1123	NC_017269	TTGA	2	8	75508	75515	25 %	50 %	25 %	0 %	384422592
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1125	NC_017269	GTTG	2	8	75603	75610	0 %	50 %	50 %	0 %	384422592
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