MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 2286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	379743461
2	NC_016945	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
3	NC_016945	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	379743461
4	NC_016945	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	379743461
5	NC_016945	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	379743461
6	NC_016945	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	379743461
7	NC_016945	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	379743461
8	NC_016945	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
9	NC_016945	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	379743461
10	NC_016945	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	379743462
11	NC_016945	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	379743462
12	NC_016945	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	379743464
13	NC_016945	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	379743464
14	NC_016945	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
15	NC_016945	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	379743465
16	NC_016945	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	379743465
17	NC_016945	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	379743466
18	NC_016945	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	379743466
19	NC_016945	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	379743466
20	NC_016945	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	379743467
21	NC_016945	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
22	NC_016945	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	379743467
23	NC_016945	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
24	NC_016945	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	379743467
25	NC_016945	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	379743467
26	NC_016945	AGCA	2	8	8716	8723	50 %	0 %	25 %	25 %	379743468
27	NC_016945	AATG	2	8	9249	9256	50 %	25 %	25 %	0 %	379743469
28	NC_016945	TGGT	2	8	9407	9414	0 %	50 %	50 %	0 %	379743469
29	NC_016945	TCAA	2	8	10010	10017	50 %	25 %	0 %	25 %	379743469
30	NC_016945	GCCA	2	8	10439	10446	25 %	0 %	25 %	50 %	379743469
31	NC_016945	TTGA	2	8	10498	10505	25 %	50 %	25 %	0 %	379743469
32	NC_016945	AGTT	2	8	10746	10753	25 %	50 %	25 %	0 %	379743469
33	NC_016945	GTTG	2	8	11103	11110	0 %	50 %	50 %	0 %	379743469
34	NC_016945	CACG	2	8	11175	11182	25 %	0 %	25 %	50 %	379743469
35	NC_016945	GTTT	2	8	12722	12729	0 %	75 %	25 %	0 %	379743470
36	NC_016945	ACCA	2	8	13345	13352	50 %	0 %	0 %	50 %	379743470
37	NC_016945	GAGT	2	8	13383	13390	25 %	25 %	50 %	0 %	379743470
38	NC_016945	GTGC	2	8	13462	13469	0 %	25 %	50 %	25 %	379743470
39	NC_016945	GCTG	2	8	13691	13698	0 %	25 %	50 %	25 %	379743470
40	NC_016945	GATG	2	8	14295	14302	25 %	25 %	50 %	0 %	379743470
41	NC_016945	CGAT	2	8	14860	14867	25 %	25 %	25 %	25 %	379743471
42	NC_016945	ATTG	2	8	15223	15230	25 %	50 %	25 %	0 %	379743471
43	NC_016945	TATG	2	8	18872	18879	25 %	50 %	25 %	0 %	379743472
44	NC_016945	GGAT	2	8	19126	19133	25 %	25 %	50 %	0 %	379743472
45	NC_016945	ATTC	2	8	19865	19872	25 %	50 %	0 %	25 %	379743473
46	NC_016945	TGCC	2	8	20733	20740	0 %	25 %	25 %	50 %	379743474
47	NC_016945	GCGG	2	8	21047	21054	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
48	NC_016945	CGGG	2	8	21604	21611	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
49	NC_016945	GGGC	2	8	21690	21697	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
50	NC_016945	TTTC	2	8	21747	21754	0 %	75 %	0 %	25 %	379743474
51	NC_016945	TTGA	2	8	21959	21966	25 %	50 %	25 %	0 %	379743474
52	NC_016945	CAAC	2	8	22042	22049	50 %	0 %	0 %	50 %	379743474
53	NC_016945	GCAG	2	8	22307	22314	25 %	0 %	50 %	25 %	379743474
54	NC_016945	TGGC	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	379743476
55	NC_016945	ATTG	2	8	23700	23707	25 %	50 %	25 %	0 %	379743476
56	NC_016945	CAAA	2	8	23722	23729	75 %	0 %	0 %	25 %	379743476
57	NC_016945	ATTT	2	8	24178	24185	25 %	75 %	0 %	0 %	379743476
58	NC_016945	ATGA	2	8	25302	25309	50 %	25 %	25 %	0 %	379743476
59	NC_016945	ATCG	2	8	25826	25833	25 %	25 %	25 %	25 %	379743476
60	NC_016945	ATGG	2	8	26270	26277	25 %	25 %	50 %	0 %	379743476
61	NC_016945	TTAT	2	8	26710	26717	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
62	NC_016945	ATTT	2	8	26807	26814	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
63	NC_016945	TGGG	2	8	27009	27016	0 %	25 %	75 %	0 %	379743477
64	NC_016945	TGTT	2	8	27027	27034	0 %	75 %	25 %	0 %	379743477
65	NC_016945	GCGG	2	8	27072	27079	0 %	0 %	75 %	25 %	379743477
66	NC_016945	AAGA	2	8	27129	27136	75 %	0 %	25 %	0 %	379743477
67	NC_016945	ATTG	2	8	27155	27162	25 %	50 %	25 %	0 %	379743477
68	NC_016945	ATTT	2	8	27525	27532	25 %	75 %	0 %	0 %	379743478
69	NC_016945	AATG	2	8	27677	27684	50 %	25 %	25 %	0 %	379743478
70	NC_016945	TGAC	2	8	28214	28221	25 %	25 %	25 %	25 %	379743479
71	NC_016945	ACAA	2	8	28481	28488	75 %	0 %	0 %	25 %	379743479
72	NC_016945	TTGA	2	8	28762	28769	25 %	50 %	25 %	0 %	379743479
73	NC_016945	TAAA	2	8	28947	28954	75 %	25 %	0 %	0 %	379743479
74	NC_016945	TGGT	2	8	31072	31079	0 %	50 %	50 %	0 %	379743481
75	NC_016945	ACTG	2	8	31125	31132	25 %	25 %	25 %	25 %	379743481
76	NC_016945	ATTG	2	8	31697	31704	25 %	50 %	25 %	0 %	379743481
77	NC_016945	TATT	2	8	31964	31971	25 %	75 %	0 %	0 %	379743482
78	NC_016945	TTGG	2	8	32321	32328	0 %	50 %	50 %	0 %	379743482
79	NC_016945	GCAA	2	8	32568	32575	50 %	0 %	25 %	25 %	379743482
80	NC_016945	ATCG	2	8	33843	33850	25 %	25 %	25 %	25 %	379743483
81	NC_016945	TATG	2	8	34410	34417	25 %	50 %	25 %	0 %	379743483
82	NC_016945	TACG	2	8	34705	34712	25 %	25 %	25 %	25 %	379743483
83	NC_016945	GACA	2	8	35049	35056	50 %	0 %	25 %	25 %	379743483
84	NC_016945	GTGA	2	8	35338	35345	25 %	25 %	50 %	0 %	379743483
85	NC_016945	TTGA	2	8	36117	36124	25 %	50 %	25 %	0 %	379743485
86	NC_016945	AATC	2	8	36933	36940	50 %	25 %	0 %	25 %	379743486
87	NC_016945	GTCA	2	8	37215	37222	25 %	25 %	25 %	25 %	379743486
88	NC_016945	GTTG	2	8	37427	37434	0 %	50 %	50 %	0 %	379743486
89	NC_016945	TGCA	2	8	37513	37520	25 %	25 %	25 %	25 %	379743486
90	NC_016945	TGGT	2	8	37831	37838	0 %	50 %	50 %	0 %	379743487
91	NC_016945	GGTT	2	8	38114	38121	0 %	50 %	50 %	0 %	379743487
92	NC_016945	TATG	2	8	38396	38403	25 %	50 %	25 %	0 %	379743487
93	NC_016945	AACG	2	8	39032	39039	50 %	0 %	25 %	25 %	379743487
94	NC_016945	TGAG	2	8	39794	39801	25 %	25 %	50 %	0 %	379743488
95	NC_016945	AGTG	2	8	40368	40375	25 %	25 %	50 %	0 %	379743489
96	NC_016945	GCAA	2	8	40568	40575	50 %	0 %	25 %	25 %	379743489
97	NC_016945	ACGT	2	8	40730	40737	25 %	25 %	25 %	25 %	379743489
98	NC_016945	TGGA	2	8	41425	41432	25 %	25 %	50 %	0 %	379743489
99	NC_016945	TCGT	2	8	41678	41685	0 %	50 %	25 %	25 %	379743489
100	NC_016945	TGTT	2	8	42026	42033	0 %	75 %	25 %	0 %	379743489
101	NC_016945	CAAG	2	8	43671	43678	50 %	0 %	25 %	25 %	379743491
102	NC_016945	TTTC	2	8	43751	43758	0 %	75 %	0 %	25 %	379743491
103	NC_016945	GTCG	2	8	44130	44137	0 %	25 %	50 %	25 %	379743492
104	NC_016945	CAAA	2	8	44228	44235	75 %	0 %	0 %	25 %	379743492
105	NC_016945	CCGC	2	8	44266	44273	0 %	0 %	25 %	75 %	379743492
106	NC_016945	AGTA	2	8	44441	44448	50 %	25 %	25 %	0 %	379743492
107	NC_016945	AGAA	2	8	46063	46070	75 %	0 %	25 %	0 %	379743493
108	NC_016945	CTTT	2	8	46114	46121	0 %	75 %	0 %	25 %	379743494
109	NC_016945	TGGT	2	8	46287	46294	0 %	50 %	50 %	0 %	379743494
110	NC_016945	TGGG	2	8	46921	46928	0 %	25 %	75 %	0 %	379743495
111	NC_016945	TTTC	2	8	47478	47485	0 %	75 %	0 %	25 %	379743496
112	NC_016945	CATA	2	8	47670	47677	50 %	25 %	0 %	25 %	379743496
113	NC_016945	CAGG	2	8	47712	47719	25 %	0 %	50 %	25 %	379743496
114	NC_016945	TGGG	2	8	48894	48901	0 %	25 %	75 %	0 %	379743497
115	NC_016945	GTTG	2	8	49518	49525	0 %	50 %	50 %	0 %	379743497
116	NC_016945	CTTT	2	8	49932	49939	0 %	75 %	0 %	25 %	379743497
117	NC_016945	ATCG	2	8	51751	51758	25 %	25 %	25 %	25 %	379743500
118	NC_016945	TCTG	2	8	52228	52235	0 %	50 %	25 %	25 %	379743500
119	NC_016945	AAGC	2	8	52400	52407	50 %	0 %	25 %	25 %	379743500
120	NC_016945	CTCA	2	8	53320	53327	25 %	25 %	0 %	50 %	379743500
121	NC_016945	AATC	2	8	53410	53417	50 %	25 %	0 %	25 %	379743500
122	NC_016945	GCGT	2	8	53877	53884	0 %	25 %	50 %	25 %	379743500
123	NC_016945	GAAA	2	8	53968	53975	75 %	0 %	25 %	0 %	379743500
124	NC_016945	GATG	2	8	54199	54206	25 %	25 %	50 %	0 %	379743500
125	NC_016945	GATT	2	8	54555	54562	25 %	50 %	25 %	0 %	379743500
126	NC_016945	GACA	2	8	55339	55346	50 %	0 %	25 %	25 %	379743501
127	NC_016945	GCAC	2	8	55394	55401	25 %	0 %	25 %	50 %	379743501
128	NC_016945	AATG	2	8	56312	56319	50 %	25 %	25 %	0 %	379743502
129	NC_016945	ACGT	2	8	56650	56657	25 %	25 %	25 %	25 %	379743503
130	NC_016945	GCAT	2	8	56769	56776	25 %	25 %	25 %	25 %	379743503
131	NC_016945	CCAA	2	8	57013	57020	50 %	0 %	0 %	50 %	379743503
132	NC_016945	CTTT	2	8	57241	57248	0 %	75 %	0 %	25 %	379743503
133	NC_016945	GAAT	2	8	57333	57340	50 %	25 %	25 %	0 %	379743503
134	NC_016945	CTCA	2	8	57893	57900	25 %	25 %	0 %	50 %	379743503
135	NC_016945	AGTG	2	8	58399	58406	25 %	25 %	50 %	0 %	379743504
136	NC_016945	AGCC	2	8	58983	58990	25 %	0 %	25 %	50 %	379743504
137	NC_016945	CAAT	2	8	59140	59147	50 %	25 %	0 %	25 %	379743504
138	NC_016945	GTGG	2	8	59181	59188	0 %	25 %	75 %	0 %	379743504
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