MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 11386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
2	NC_016945	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743461
3	NC_016945	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
4	NC_016945	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
5	NC_016945	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
6	NC_016945	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743461
7	NC_016945	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
8	NC_016945	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
9	NC_016945	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
10	NC_016945	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743461
11	NC_016945	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743461
12	NC_016945	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
13	NC_016945	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
14	NC_016945	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
15	NC_016945	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
16	NC_016945	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743461
17	NC_016945	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743461
18	NC_016945	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
19	NC_016945	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743461
20	NC_016945	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743461
21	NC_016945	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743461
22	NC_016945	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743461
23	NC_016945	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743461
24	NC_016945	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
25	NC_016945	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743462
26	NC_016945	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
27	NC_016945	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743462
28	NC_016945	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743462
29	NC_016945	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743462
30	NC_016945	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743463
31	NC_016945	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
32	NC_016945	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743463
33	NC_016945	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743463
34	NC_016945	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743463
35	NC_016945	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743464
36	NC_016945	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
37	NC_016945	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743465
38	NC_016945	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743465
39	NC_016945	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
40	NC_016945	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743465
41	NC_016945	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743465
42	NC_016945	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743465
43	NC_016945	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743465
44	NC_016945	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743465
45	NC_016945	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743465
46	NC_016945	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
47	NC_016945	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743466
48	NC_016945	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743466
49	NC_016945	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
50	NC_016945	CAT	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743466
51	NC_016945	GTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
52	NC_016945	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743466
53	NC_016945	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743466
54	NC_016945	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743466
55	NC_016945	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743467
56	NC_016945	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
57	NC_016945	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
58	NC_016945	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743467
59	NC_016945	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
60	NC_016945	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743467
61	NC_016945	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743467
62	NC_016945	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743467
63	NC_016945	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
64	NC_016945	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
65	NC_016945	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743467
66	NC_016945	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743467
67	NC_016945	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743467
68	NC_016945	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
69	NC_016945	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
70	NC_016945	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743467
71	NC_016945	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743467
72	NC_016945	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
73	NC_016945	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
74	NC_016945	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743467
75	NC_016945	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743468
76	NC_016945	CAA	2	6	8584	8589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743468
77	NC_016945	CAA	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743468
78	NC_016945	GCC	2	6	8612	8617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743468
79	NC_016945	ACC	2	6	8854	8859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743468
80	NC_016945	TGA	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743468
81	NC_016945	TAG	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743469
82	NC_016945	CTT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743469
83	NC_016945	TGG	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743469
84	NC_016945	TCA	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
85	NC_016945	GTG	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743469
86	NC_016945	AGC	2	6	9290	9295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
87	NC_016945	CAG	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
88	NC_016945	TGC	2	6	9369	9374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
89	NC_016945	ATC	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
90	NC_016945	CAG	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
91	NC_016945	CAG	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
92	NC_016945	GCA	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
93	NC_016945	TGC	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
94	NC_016945	AGT	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743469
95	NC_016945	CTG	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
96	NC_016945	CAT	2	6	10153	10158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
97	NC_016945	TGG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743469
98	NC_016945	CGC	2	6	10387	10392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743469
99	NC_016945	CAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
100	NC_016945	GCA	2	6	10452	10457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
101	NC_016945	GCG	2	6	10488	10493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743469
102	NC_016945	CGC	2	6	10507	10512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743469
103	NC_016945	CAG	2	6	10576	10581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
104	NC_016945	TGA	2	6	10619	10624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743469
105	NC_016945	GGC	3	9	10651	10659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743469
106	NC_016945	CAT	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
107	NC_016945	GCT	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
108	NC_016945	TCG	2	6	10901	10906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
109	NC_016945	CTT	2	6	10920	10925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743469
110	NC_016945	TGC	2	6	11003	11008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
111	NC_016945	GTC	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
112	NC_016945	ACC	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743469
113	NC_016945	TCA	2	6	11288	11293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
114	NC_016945	GGT	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743469
115	NC_016945	CAC	2	6	11317	11322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743469
116	NC_016945	TTA	2	6	11444	11449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743469
117	NC_016945	GCA	2	6	11457	11462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743469
118	NC_016945	ATC	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743469
119	NC_016945	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743469
120	NC_016945	TGG	2	6	11553	11558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743469
121	NC_016945	CGG	2	6	11571	11576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743469
122	NC_016945	TGC	2	6	11612	11617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743469
123	NC_016945	TCT	2	6	11694	11699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743469
124	NC_016945	AAG	2	6	12301	12306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743470
125	NC_016945	ACG	2	6	12418	12423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743470
126	NC_016945	CAA	2	6	12519	12524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743470
127	NC_016945	GAA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743470
128	NC_016945	CAT	2	6	12617	12622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743470
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496	NC_016945	GCA	2	6	44365	44370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743492
497	NC_016945	TGC	2	6	44394	44399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743492
498	NC_016945	GCA	2	6	44500	44505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743492
499	NC_016945	GTA	2	6	44586	44591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743492
500	NC_016945	GAC	2	6	44607	44612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743492

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