MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016945	GTGA	2	8	242550	242557	25 %	25 %	50 %	0 %	379743656
4002	NC_016945	TGG	2	6	242587	242592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743656
4003	NC_016945	TGAT	2	8	242596	242603	25 %	50 %	25 %	0 %	379743656
4004	NC_016945	CT	3	6	242607	242612	0 %	50 %	0 %	50 %	379743656
4005	NC_016945	GGC	2	6	242651	242656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743656
4006	NC_016945	CAC	2	6	242660	242665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743656
4007	NC_016945	TAT	2	6	242691	242696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743656
4008	NC_016945	TAC	2	6	242757	242762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743656
4009	NC_016945	ATG	2	6	242851	242856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743656
4010	NC_016945	TGA	2	6	242900	242905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743656
4011	NC_016945	A	7	7	243039	243045	100 %	0 %	0 %	0 %	379743657
4012	NC_016945	CG	3	6	243175	243180	0 %	0 %	50 %	50 %	379743657
4013	NC_016945	TC	3	6	243197	243202	0 %	50 %	0 %	50 %	379743657
4014	NC_016945	CAG	2	6	243234	243239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4015	NC_016945	GCG	2	6	243318	243323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743657
4016	NC_016945	G	6	6	243354	243359	0 %	0 %	100 %	0 %	379743657
4017	NC_016945	GTG	2	6	243374	243379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743657
4018	NC_016945	CTG	2	6	243424	243429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4019	NC_016945	AGC	2	6	243430	243435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4020	NC_016945	GCA	2	6	243632	243637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4021	NC_016945	TGG	2	6	243661	243666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743657
4022	NC_016945	GAT	2	6	243699	243704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743657
4023	NC_016945	CAG	2	6	243723	243728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4024	NC_016945	TAT	2	6	243738	243743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743657
4025	NC_016945	AGC	2	6	243790	243795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4026	NC_016945	CAG	2	6	243807	243812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4027	NC_016945	AGC	2	6	243820	243825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743657
4028	NC_016945	GGC	2	6	243844	243849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743657
4029	NC_016945	TGATGG	2	12	243980	243991	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379743658
4030	NC_016945	CATC	2	8	244010	244017	25 %	25 %	0 %	50 %	379743658
4031	NC_016945	CAT	2	6	244031	244036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4032	NC_016945	GT	3	6	244211	244216	0 %	50 %	50 %	0 %	379743658
4033	NC_016945	TGA	2	6	244234	244239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743658
4034	NC_016945	TATCGC	2	12	244241	244252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379743658
4035	NC_016945	CTGC	2	8	244288	244295	0 %	25 %	25 %	50 %	379743658
4036	NC_016945	ACT	2	6	244386	244391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4037	NC_016945	AG	3	6	244410	244415	50 %	0 %	50 %	0 %	379743658
4038	NC_016945	GTG	2	6	244462	244467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743658
4039	NC_016945	AAC	2	6	244482	244487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743658
4040	NC_016945	GCG	2	6	244664	244669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743658
4041	NC_016945	GACCA	2	10	244738	244747	40 %	0 %	20 %	40 %	379743658
4042	NC_016945	AGCC	2	8	244777	244784	25 %	0 %	25 %	50 %	379743658
4043	NC_016945	GCA	2	6	244928	244933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4044	NC_016945	AG	3	6	245136	245141	50 %	0 %	50 %	0 %	379743658
4045	NC_016945	ATC	2	6	245211	245216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4046	NC_016945	TCG	2	6	245219	245224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4047	NC_016945	CG	3	6	245263	245268	0 %	0 %	50 %	50 %	379743658
4048	NC_016945	TGGCT	2	10	245315	245324	0 %	40 %	40 %	20 %	379743658
4049	NC_016945	CTG	2	6	245327	245332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4050	NC_016945	ATC	2	6	245367	245372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4051	NC_016945	CG	3	6	245498	245503	0 %	0 %	50 %	50 %	379743658
4052	NC_016945	GCT	2	6	245531	245536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4053	NC_016945	GCCC	2	8	245625	245632	0 %	0 %	25 %	75 %	379743658
4054	NC_016945	CA	3	6	245738	245743	50 %	0 %	0 %	50 %	379743658
4055	NC_016945	AC	3	6	245891	245896	50 %	0 %	0 %	50 %	379743658
4056	NC_016945	CTT	2	6	245906	245911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743658
4057	NC_016945	ATC	2	6	245932	245937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4058	NC_016945	TTACCG	2	12	245971	245982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379743658
4059	NC_016945	CG	3	6	246035	246040	0 %	0 %	50 %	50 %	379743658
4060	NC_016945	TTG	2	6	246088	246093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743658
4061	NC_016945	TAA	2	6	246115	246120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743658
4062	NC_016945	T	6	6	246127	246132	0 %	100 %	0 %	0 %	379743658
4063	NC_016945	CTG	2	6	246149	246154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4064	NC_016945	ATC	2	6	246330	246335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743658
4065	NC_016945	GCT	2	6	246467	246472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4066	NC_016945	TCC	2	6	246526	246531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379743658
4067	NC_016945	AATT	2	8	246609	246616	50 %	50 %	0 %	0 %	379743658
4068	NC_016945	CAC	2	6	246627	246632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743658
4069	NC_016945	CTG	2	6	246667	246672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743658
4070	NC_016945	A	6	6	246673	246678	100 %	0 %	0 %	0 %	379743658
4071	NC_016945	GGC	2	6	246687	246692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743658
4072	NC_016945	T	7	7	246704	246710	0 %	100 %	0 %	0 %	379743658
4073	NC_016945	TTA	3	9	246898	246906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743659
4074	NC_016945	TGC	2	6	246943	246948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743659
4075	NC_016945	TCAA	2	8	246982	246989	50 %	25 %	0 %	25 %	379743659
4076	NC_016945	ACTA	2	8	246993	247000	50 %	25 %	0 %	25 %	379743659
4077	NC_016945	TCA	2	6	247006	247011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743659
4078	NC_016945	ATA	2	6	247031	247036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743659
4079	NC_016945	GCTG	2	8	247679	247686	0 %	25 %	50 %	25 %	379743660
4080	NC_016945	GCA	2	6	247826	247831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743660
4081	NC_016945	CGTT	2	8	247926	247933	0 %	50 %	25 %	25 %	379743660
4082	NC_016945	ACG	2	6	248089	248094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743660
4083	NC_016945	CGT	2	6	248205	248210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743660
4084	NC_016945	TC	3	6	248235	248240	0 %	50 %	0 %	50 %	379743660
4085	NC_016945	CCG	2	6	248287	248292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743660
4086	NC_016945	ATC	2	6	248323	248328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743660
4087	NC_016945	GTCA	2	8	248411	248418	25 %	25 %	25 %	25 %	379743660
4088	NC_016945	ATT	2	6	248868	248873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743661
4089	NC_016945	TGC	2	6	248883	248888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743661
4090	NC_016945	ACC	2	6	248929	248934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743661
4091	NC_016945	GTT	2	6	249090	249095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743661
4092	NC_016945	TGATTG	2	12	249137	249148	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379743661
4093	NC_016945	ACG	2	6	249170	249175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743661
4094	NC_016945	TGC	2	6	249207	249212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743661
4095	NC_016945	CAG	2	6	249247	249252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743661
4096	NC_016945	CAT	2	6	249333	249338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743661
4097	NC_016945	CAAC	2	8	249345	249352	50 %	0 %	0 %	50 %	379743661
4098	NC_016945	GGC	2	6	249388	249393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743661
4099	NC_016945	GAC	2	6	249399	249404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743661
4100	NC_016945	AG	3	6	249477	249482	50 %	0 %	50 %	0 %	379743661
4101	NC_016945	TGATC	2	10	249492	249501	20 %	40 %	20 %	20 %	379743661
4102	NC_016945	TGG	2	6	249542	249547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743661
4103	NC_016945	GTG	2	6	249562	249567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743661
4104	NC_016945	CCA	2	6	249620	249625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743661
4105	NC_016945	GTT	2	6	249824	249829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743662
4106	NC_016945	TGTT	2	8	249846	249853	0 %	75 %	25 %	0 %	379743662
4107	NC_016945	TGA	2	6	249892	249897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743662
4108	NC_016945	CTG	2	6	249914	249919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743662
4109	NC_016945	ATT	2	6	249937	249942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743662
4110	NC_016945	GCA	2	6	249991	249996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743662
4111	NC_016945	TTCA	2	8	250151	250158	25 %	50 %	0 %	25 %	379743662
4112	NC_016945	CAT	2	6	250201	250206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743662
4113	NC_016945	ATG	2	6	250254	250259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743662
4114	NC_016945	CGC	2	6	250369	250374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743662
4115	NC_016945	ATC	2	6	250445	250450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743662
4116	NC_016945	CAT	2	6	250468	250473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743662
4117	NC_016945	GTT	2	6	250609	250614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743662
4118	NC_016945	TCA	2	6	250635	250640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743662
4119	NC_016945	ATC	2	6	250670	250675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743662
4120	NC_016945	GGT	2	6	250685	250690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743662
4121	NC_016945	CTG	3	9	250749	250757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
4122	NC_016945	CTG	2	6	250770	250775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
4123	NC_016945	GCG	2	6	250779	250784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743663
4124	NC_016945	T	6	6	250826	250831	0 %	100 %	0 %	0 %	379743663
4125	NC_016945	CGT	2	6	250836	250841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
4126	NC_016945	ATTGCG	2	12	250875	250886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379743663
4127	NC_016945	GTC	2	6	250889	250894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
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4133	NC_016945	CTTT	2	8	251173	251180	0 %	75 %	0 %	25 %	379743663
4134	NC_016945	TAA	2	6	251240	251245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743663
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4141	NC_016945	GCT	2	6	251465	251470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
4142	NC_016945	TGC	2	6	251521	251526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743663
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4153	NC_016945	TCAGTA	2	12	252064	252075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379743664
4154	NC_016945	GTG	2	6	252090	252095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743664
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4159	NC_016945	GTGAT	2	10	252342	252351	20 %	40 %	40 %	0 %	379743664
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4231	NC_016945	TTAC	2	8	257128	257135	25 %	50 %	0 %	25 %	379743668
4232	NC_016945	ATC	2	6	257176	257181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743668
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4364	NC_016945	CATCG	2	10	264535	264544	20 %	20 %	20 %	40 %	379743678
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4374	NC_016945	GGGCA	2	10	265002	265011	20 %	0 %	60 %	20 %	379743679
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4479	NC_016945	TAAGCG	2	12	270566	270577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379743684
4480	NC_016945	CAT	2	6	270618	270623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743684
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4482	NC_016945	TG	3	6	270776	270781	0 %	50 %	50 %	0 %	379743684
4483	NC_016945	CAT	2	6	270810	270815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743684
4484	NC_016945	CATG	2	8	270861	270868	25 %	25 %	25 %	25 %	379743684
4485	NC_016945	AAT	2	6	270874	270879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743684
4486	NC_016945	TTGA	2	8	270988	270995	25 %	50 %	25 %	0 %	379743684
4487	NC_016945	AGA	2	6	271125	271130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743684
4488	NC_016945	TGT	2	6	271160	271165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743684
4489	NC_016945	TAA	2	6	271172	271177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743684
4490	NC_016945	TTG	2	6	271331	271336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743684
4491	NC_016945	CATT	2	8	271388	271395	25 %	50 %	0 %	25 %	379743684
4492	NC_016945	T	6	6	271429	271434	0 %	100 %	0 %	0 %	379743684
4493	NC_016945	GCG	3	9	271442	271450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743684
4494	NC_016945	TGC	2	6	271456	271461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743684
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4497	NC_016945	AAC	2	6	271561	271566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743684
4498	NC_016945	GAT	2	6	271571	271576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743684
4499	NC_016945	CTG	2	6	271992	271997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743685
4500	NC_016945	AGT	2	6	272003	272008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743685

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