MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016945	GTAA	2	8	178539	178546	50 %	25 %	25 %	0 %	379743604
3003	NC_016945	GAT	2	6	178599	178604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743604
3004	NC_016945	CG	3	6	178632	178637	0 %	0 %	50 %	50 %	379743604
3005	NC_016945	TAG	2	6	178704	178709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743604
3006	NC_016945	CTG	2	6	178787	178792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743604
3007	NC_016945	GCA	2	6	178802	178807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743604
3008	NC_016945	GCA	2	6	178828	178833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743604
3009	NC_016945	GCC	2	6	178836	178841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743604
3010	NC_016945	TTG	2	6	178845	178850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743604
3011	NC_016945	CTT	2	6	179000	179005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743604
3012	NC_016945	CAC	2	6	179007	179012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743604
3013	NC_016945	AC	3	6	179011	179016	50 %	0 %	0 %	50 %	379743604
3014	NC_016945	AAG	2	6	179044	179049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743604
3015	NC_016945	GCC	2	6	179073	179078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743604
3016	NC_016945	CTGG	2	8	179294	179301	0 %	25 %	50 %	25 %	379743604
3017	NC_016945	AT	3	6	179335	179340	50 %	50 %	0 %	0 %	379743604
3018	NC_016945	CAG	2	6	179464	179469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743604
3019	NC_016945	AGT	2	6	179504	179509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743604
3020	NC_016945	TCTGC	2	10	179585	179594	0 %	40 %	20 %	40 %	379743604
3021	NC_016945	TGG	2	6	179605	179610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743604
3022	NC_016945	TCA	2	6	179692	179697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743604
3023	NC_016945	AATA	2	8	179763	179770	75 %	25 %	0 %	0 %	379743604
3024	NC_016945	GTG	2	6	179839	179844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743604
3025	NC_016945	TGAT	2	8	180761	180768	25 %	50 %	25 %	0 %	379743605
3026	NC_016945	CT	4	8	181087	181094	0 %	50 %	0 %	50 %	379743606
3027	NC_016945	T	6	6	181103	181108	0 %	100 %	0 %	0 %	379743606
3028	NC_016945	CAC	2	6	181128	181133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743606
3029	NC_016945	CGC	2	6	181143	181148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743606
3030	NC_016945	GAGC	2	8	181155	181162	25 %	0 %	50 %	25 %	379743606
3031	NC_016945	AAT	2	6	181222	181227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743606
3032	NC_016945	CTT	2	6	181269	181274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743606
3033	NC_016945	GCT	2	6	181275	181280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743606
3034	NC_016945	GAT	2	6	181324	181329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743606
3035	NC_016945	AGTA	2	8	181343	181350	50 %	25 %	25 %	0 %	379743606
3036	NC_016945	CAG	2	6	181426	181431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743606
3037	NC_016945	TAT	2	6	181952	181957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743607
3038	NC_016945	CAG	2	6	181964	181969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743607
3039	NC_016945	CT	3	6	182014	182019	0 %	50 %	0 %	50 %	379743607
3040	NC_016945	CGC	2	6	182033	182038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743607
3041	NC_016945	ATC	2	6	182180	182185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743607
3042	NC_016945	T	6	6	182265	182270	0 %	100 %	0 %	0 %	379743607
3043	NC_016945	ACA	2	6	182396	182401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743607
3044	NC_016945	TGA	2	6	182451	182456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743607
3045	NC_016945	GATC	2	8	182503	182510	25 %	25 %	25 %	25 %	379743607
3046	NC_016945	TTG	2	6	182518	182523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743607
3047	NC_016945	TGA	2	6	182586	182591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743607
3048	NC_016945	TGG	3	9	182669	182677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743607
3049	NC_016945	ACGT	2	8	182885	182892	25 %	25 %	25 %	25 %	379743607
3050	NC_016945	TGC	2	6	182894	182899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743607
3051	NC_016945	CAGT	2	8	182933	182940	25 %	25 %	25 %	25 %	379743607
3052	NC_016945	GT	3	6	182944	182949	0 %	50 %	50 %	0 %	379743607
3053	NC_016945	GTG	2	6	183145	183150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743607
3054	NC_016945	AG	3	6	183156	183161	50 %	0 %	50 %	0 %	379743607
3055	NC_016945	GCG	2	6	183253	183258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743607
3056	NC_016945	AAG	2	6	183359	183364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743607
3057	NC_016945	GGT	2	6	183540	183545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743607
3058	NC_016945	CTTG	2	8	183561	183568	0 %	50 %	25 %	25 %	379743607
3059	NC_016945	CAA	2	6	183591	183596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743607
3060	NC_016945	TGG	2	6	183693	183698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743607
3061	NC_016945	GAG	2	6	183736	183741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743607
3062	NC_016945	GTG	2	6	183812	183817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743607
3063	NC_016945	TGC	2	6	183843	183848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743607
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3065	NC_016945	TTG	2	6	183956	183961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743607
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3067	NC_016945	CGG	2	6	184313	184318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743608
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3069	NC_016945	GCT	2	6	184428	184433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743608
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3071	NC_016945	TCG	2	6	184910	184915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743609
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3082	NC_016945	GCTGC	2	10	185644	185653	0 %	20 %	40 %	40 %	379743610
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3088	NC_016945	AT	3	6	186005	186010	50 %	50 %	0 %	0 %	379743610
3089	NC_016945	CGA	2	6	186027	186032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743610
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3092	NC_016945	TGCC	2	8	186114	186121	0 %	25 %	25 %	50 %	379743610
3093	NC_016945	CCA	2	6	186157	186162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743610
3094	NC_016945	GCCT	2	8	186193	186200	0 %	25 %	25 %	50 %	379743610
3095	NC_016945	CTTG	2	8	186216	186223	0 %	50 %	25 %	25 %	379743610
3096	NC_016945	CT	3	6	186290	186295	0 %	50 %	0 %	50 %	379743610
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3103	NC_016945	GCTC	2	8	186699	186706	0 %	25 %	25 %	50 %	379743610
3104	NC_016945	CGA	2	6	186764	186769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743610
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3106	NC_016945	CTT	2	6	186864	186869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743610
3107	NC_016945	AGT	2	6	187005	187010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743610
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3112	NC_016945	TGAC	2	8	187112	187119	25 %	25 %	25 %	25 %	379743610
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3123	NC_016945	TTTG	2	8	187639	187646	0 %	75 %	25 %	0 %	379743611
3124	NC_016945	TGA	2	6	187689	187694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743611
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3127	NC_016945	TGA	2	6	187725	187730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743611
3128	NC_016945	CTG	2	6	187737	187742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743611
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3130	NC_016945	TGA	2	6	187912	187917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743611
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3241	NC_016945	TC	3	6	193818	193823	0 %	50 %	0 %	50 %	379743616
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3366	NC_016945	TGC	2	6	201440	201445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743623
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3471	NC_016945	AATT	2	8	208556	208563	50 %	50 %	0 %	0 %	379743632
3472	NC_016945	A	6	6	208586	208591	100 %	0 %	0 %	0 %	379743633
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3477	NC_016945	TGC	2	6	208814	208819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743633
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3482	NC_016945	GCG	2	6	209186	209191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743633
3483	NC_016945	CAT	2	6	209204	209209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743633
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3487	NC_016945	TGGG	2	8	209472	209479	0 %	25 %	75 %	0 %	379743633
3488	NC_016945	A	8	8	209525	209532	100 %	0 %	0 %	0 %	379743633
3489	NC_016945	TGCA	2	8	209725	209732	25 %	25 %	25 %	25 %	379743634
3490	NC_016945	CAA	2	6	209755	209760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743634
3491	NC_016945	GTG	2	6	209954	209959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743634
3492	NC_016945	CAT	2	6	209988	209993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743634
3493	NC_016945	GCC	2	6	210016	210021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743634
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3495	NC_016945	CTG	2	6	210073	210078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743634
3496	NC_016945	TGTT	2	8	210104	210111	0 %	75 %	25 %	0 %	379743634
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3500	NC_016945	ACC	2	6	210280	210285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743634

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