MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016945	GCC	2	6	89708	89713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743528
1502	NC_016945	CTG	2	6	89735	89740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743528
1503	NC_016945	AATT	2	8	89749	89756	50 %	50 %	0 %	0 %	379743528
1504	NC_016945	CGT	2	6	89771	89776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743528
1505	NC_016945	TCG	2	6	89811	89816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743528
1506	NC_016945	TCA	2	6	89981	89986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743528
1507	NC_016945	CGTG	2	8	90292	90299	0 %	25 %	50 %	25 %	379743528
1508	NC_016945	GTC	2	6	90300	90305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743528
1509	NC_016945	GAA	2	6	90352	90357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743528
1510	NC_016945	AGC	2	6	90427	90432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743528
1511	NC_016945	TTTCT	2	10	90571	90580	0 %	80 %	0 %	20 %	379743529
1512	NC_016945	ATC	2	6	90591	90596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743529
1513	NC_016945	TTG	2	6	90674	90679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743529
1514	NC_016945	CGA	2	6	90697	90702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1515	NC_016945	AAT	2	6	90731	90736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743529
1516	NC_016945	TGGT	2	8	90762	90769	0 %	50 %	50 %	0 %	379743529
1517	NC_016945	GCA	2	6	90789	90794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1518	NC_016945	CAAT	2	8	90807	90814	50 %	25 %	0 %	25 %	379743529
1519	NC_016945	ATC	2	6	90860	90865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743529
1520	NC_016945	AG	3	6	90929	90934	50 %	0 %	50 %	0 %	379743529
1521	NC_016945	TCG	2	6	90966	90971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1522	NC_016945	CGG	2	6	91042	91047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743529
1523	NC_016945	T	6	6	91069	91074	0 %	100 %	0 %	0 %	379743529
1524	NC_016945	CTG	2	6	91162	91167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1525	NC_016945	T	6	6	91256	91261	0 %	100 %	0 %	0 %	379743529
1526	NC_016945	GAT	2	6	91334	91339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743529
1527	NC_016945	ATTG	2	8	91357	91364	25 %	50 %	25 %	0 %	379743529
1528	NC_016945	GT	3	6	91393	91398	0 %	50 %	50 %	0 %	379743529
1529	NC_016945	CAC	2	6	91468	91473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743529
1530	NC_016945	CGA	2	6	91512	91517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1531	NC_016945	TTG	2	6	91545	91550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743529
1532	NC_016945	A	6	6	91593	91598	100 %	0 %	0 %	0 %	379743529
1533	NC_016945	TCA	2	6	91605	91610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743529
1534	NC_016945	GCG	2	6	91611	91616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743529
1535	NC_016945	CTT	2	6	91633	91638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743529
1536	NC_016945	CGAA	2	8	91718	91725	50 %	0 %	25 %	25 %	379743529
1537	NC_016945	TCA	2	6	91728	91733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743529
1538	NC_016945	ATG	2	6	91757	91762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743529
1539	NC_016945	TCT	2	6	91767	91772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743529
1540	NC_016945	ATTG	2	8	91855	91862	25 %	50 %	25 %	0 %	379743529
1541	NC_016945	ATC	2	6	91914	91919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743529
1542	NC_016945	GTC	2	6	91958	91963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1543	NC_016945	AAAT	2	8	92016	92023	75 %	25 %	0 %	0 %	379743529
1544	NC_016945	TTGC	2	8	92094	92101	0 %	50 %	25 %	25 %	379743529
1545	NC_016945	CTG	2	6	92178	92183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743529
1546	NC_016945	C	7	7	92309	92315	0 %	0 %	0 %	100 %	379743529
1547	NC_016945	CTGA	2	8	92318	92325	25 %	25 %	25 %	25 %	379743529
1548	NC_016945	CAGC	2	8	92620	92627	25 %	0 %	25 %	50 %	379743530
1549	NC_016945	CTT	2	6	92761	92766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743530
1550	NC_016945	ATA	2	6	92772	92777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743530
1551	NC_016945	AAT	2	6	92789	92794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743530
1552	NC_016945	TGG	3	9	92836	92844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743530
1553	NC_016945	C	6	6	92908	92913	0 %	0 %	0 %	100 %	379743530
1554	NC_016945	AGCAC	2	10	92914	92923	40 %	0 %	20 %	40 %	379743530
1555	NC_016945	CGC	2	6	92996	93001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743530
1556	NC_016945	GCT	2	6	93046	93051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743530
1557	NC_016945	TGA	2	6	93064	93069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743530
1558	NC_016945	GTG	3	9	93105	93113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743530
1559	NC_016945	GCA	2	6	93208	93213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743530
1560	NC_016945	A	6	6	93295	93300	100 %	0 %	0 %	0 %	379743530
1561	NC_016945	CAG	2	6	93344	93349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743530
1562	NC_016945	CTC	2	6	93365	93370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379743530
1563	NC_016945	CCG	2	6	93394	93399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743530
1564	NC_016945	TGG	2	6	93403	93408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743530
1565	NC_016945	TGC	2	6	93422	93427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743530
1566	NC_016945	CTT	2	6	93442	93447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743530
1567	NC_016945	CGC	2	6	93607	93612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743531
1568	NC_016945	GAT	3	9	93630	93638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743531
1569	NC_016945	ATTT	2	8	93667	93674	25 %	75 %	0 %	0 %	379743531
1570	NC_016945	TGG	2	6	93759	93764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743531
1571	NC_016945	TGA	2	6	93863	93868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743531
1572	NC_016945	GGGC	2	8	93920	93927	0 %	0 %	75 %	25 %	379743531
1573	NC_016945	GT	3	6	93950	93955	0 %	50 %	50 %	0 %	379743531
1574	NC_016945	ATG	2	6	93968	93973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743531
1575	NC_016945	CT	3	6	93992	93997	0 %	50 %	0 %	50 %	379743531
1576	NC_016945	TC	3	6	94002	94007	0 %	50 %	0 %	50 %	379743531
1577	NC_016945	ATT	2	6	94030	94035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743531
1578	NC_016945	TGGC	2	8	94054	94061	0 %	25 %	50 %	25 %	379743531
1579	NC_016945	TGC	2	6	94097	94102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743531
1580	NC_016945	TGA	2	6	94133	94138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743531
1581	NC_016945	CAA	2	6	94222	94227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743531
1582	NC_016945	AGT	2	6	94234	94239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743531
1583	NC_016945	TTA	2	6	94349	94354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743531
1584	NC_016945	TAT	2	6	94370	94375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743531
1585	NC_016945	GCT	3	9	94470	94478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743531
1586	NC_016945	GGA	2	6	94648	94653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743531
1587	NC_016945	TGG	2	6	94658	94663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743531
1588	NC_016945	GT	3	6	94694	94699	0 %	50 %	50 %	0 %	379743531
1589	NC_016945	GT	3	6	94730	94735	0 %	50 %	50 %	0 %	379743531
1590	NC_016945	A	6	6	94747	94752	100 %	0 %	0 %	0 %	379743531
1591	NC_016945	GTAA	2	8	94788	94795	50 %	25 %	25 %	0 %	379743531
1592	NC_016945	TTG	2	6	94983	94988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743532
1593	NC_016945	GAT	2	6	94994	94999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743532
1594	NC_016945	TGC	2	6	95029	95034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743532
1595	NC_016945	TCT	2	6	95092	95097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743532
1596	NC_016945	A	7	7	95462	95468	100 %	0 %	0 %	0 %	379743533
1597	NC_016945	TAC	2	6	95488	95493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743533
1598	NC_016945	T	6	6	95506	95511	0 %	100 %	0 %	0 %	379743533
1599	NC_016945	ATG	2	6	95536	95541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743533
1600	NC_016945	GAT	2	6	95553	95558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743533
1601	NC_016945	CT	3	6	95617	95622	0 %	50 %	0 %	50 %	379743533
1602	NC_016945	TCT	2	6	95625	95630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743533
1603	NC_016945	GTG	2	6	95719	95724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743533
1604	NC_016945	ATT	2	6	95760	95765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743533
1605	NC_016945	AGC	2	6	95766	95771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743533
1606	NC_016945	AAG	2	6	95879	95884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743533
1607	NC_016945	TTG	2	6	96007	96012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743533
1608	NC_016945	TCG	2	6	96021	96026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743533
1609	NC_016945	ACTC	2	8	96040	96047	25 %	25 %	0 %	50 %	379743533
1610	NC_016945	T	6	6	96054	96059	0 %	100 %	0 %	0 %	379743533
1611	NC_016945	AG	3	6	96072	96077	50 %	0 %	50 %	0 %	379743533
1612	NC_016945	ATC	3	9	96301	96309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743533
1613	NC_016945	ATTG	2	8	96336	96343	25 %	50 %	25 %	0 %	379743533
1614	NC_016945	CGC	2	6	96362	96367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743533
1615	NC_016945	T	6	6	96387	96392	0 %	100 %	0 %	0 %	379743533
1616	NC_016945	TGG	2	6	96480	96485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743533
1617	NC_016945	GGC	2	6	96579	96584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743533
1618	NC_016945	GATGGT	2	12	96585	96596	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379743533
1619	NC_016945	TGC	2	6	96597	96602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743533
1620	NC_016945	ATG	2	6	96610	96615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743533
1621	NC_016945	CTAAG	2	10	96657	96666	40 %	20 %	20 %	20 %	379743533
1622	NC_016945	CAT	2	6	96787	96792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743534
1623	NC_016945	TTAA	2	8	96815	96822	50 %	50 %	0 %	0 %	379743534
1624	NC_016945	AGC	2	6	96872	96877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743534
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1626	NC_016945	GAA	2	6	96992	96997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743534
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2000	NC_016945	GATT	2	8	121420	121427	25 %	50 %	25 %	0 %	379743557

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