MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016945	CCCG	2	8	59914	59921	0 %	0 %	25 %	75 %	379743505
1002	NC_016945	ACG	2	6	59932	59937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743505
1003	NC_016945	TGA	2	6	59946	59951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743505
1004	NC_016945	TGC	2	6	60039	60044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743505
1005	NC_016945	CTTTGG	2	12	60063	60074	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379743505
1006	NC_016945	CCA	2	6	60106	60111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743505
1007	NC_016945	TGCC	2	8	60151	60158	0 %	25 %	25 %	50 %	379743505
1008	NC_016945	CGC	2	6	60229	60234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743505
1009	NC_016945	AGG	2	6	60321	60326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743505
1010	NC_016945	GGC	2	6	60332	60337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743505
1011	NC_016945	AGT	2	6	60570	60575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743505
1012	NC_016945	TG	3	6	60645	60650	0 %	50 %	50 %	0 %	379743505
1013	NC_016945	ATCA	2	8	60712	60719	50 %	25 %	0 %	25 %	379743505
1014	NC_016945	CGA	2	6	60731	60736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743505
1015	NC_016945	GATT	2	8	60780	60787	25 %	50 %	25 %	0 %	379743505
1016	NC_016945	GTTC	2	8	61056	61063	0 %	50 %	25 %	25 %	379743505
1017	NC_016945	TTA	2	6	61076	61081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743505
1018	NC_016945	G	7	7	61087	61093	0 %	0 %	100 %	0 %	379743505
1019	NC_016945	AGTTG	2	10	61206	61215	20 %	40 %	40 %	0 %	379743505
1020	NC_016945	GGT	2	6	61232	61237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743505
1021	NC_016945	AGAT	2	8	61312	61319	50 %	25 %	25 %	0 %	379743506
1022	NC_016945	TCA	2	6	61351	61356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743506
1023	NC_016945	TCT	2	6	61380	61385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743506
1024	NC_016945	CGC	2	6	61478	61483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743506
1025	NC_016945	T	6	6	61511	61516	0 %	100 %	0 %	0 %	379743506
1026	NC_016945	CCG	2	6	61615	61620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743506
1027	NC_016945	CAC	2	6	61715	61720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743506
1028	NC_016945	TCA	2	6	61737	61742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743506
1029	NC_016945	CAC	2	6	61750	61755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743506
1030	NC_016945	ATG	2	6	61770	61775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743506
1031	NC_016945	CAAT	2	8	61795	61802	50 %	25 %	0 %	25 %	379743506
1032	NC_016945	TGC	2	6	61816	61821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743506
1033	NC_016945	AAG	2	6	61822	61827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743506
1034	NC_016945	CCATG	2	10	61834	61843	20 %	20 %	20 %	40 %	379743506
1035	NC_016945	T	6	6	61859	61864	0 %	100 %	0 %	0 %	379743506
1036	NC_016945	TAC	2	6	61894	61899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743506
1037	NC_016945	CTTG	2	8	61912	61919	0 %	50 %	25 %	25 %	379743506
1038	NC_016945	AAG	2	6	61929	61934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743506
1039	NC_016945	TG	3	6	62014	62019	0 %	50 %	50 %	0 %	379743506
1040	NC_016945	GTTT	2	8	62470	62477	0 %	75 %	25 %	0 %	379743507
1041	NC_016945	AATGGG	2	12	62491	62502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379743507
1042	NC_016945	TGG	2	6	62559	62564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743507
1043	NC_016945	AG	3	6	62602	62607	50 %	0 %	50 %	0 %	379743507
1044	NC_016945	CAG	2	6	62615	62620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743507
1045	NC_016945	ACA	2	6	62635	62640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743507
1046	NC_016945	TG	3	6	62649	62654	0 %	50 %	50 %	0 %	379743507
1047	NC_016945	A	6	6	62766	62771	100 %	0 %	0 %	0 %	379743507
1048	NC_016945	GAA	2	6	62789	62794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743507
1049	NC_016945	A	7	7	62894	62900	100 %	0 %	0 %	0 %	379743507
1050	NC_016945	TCG	2	6	62901	62906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743507
1051	NC_016945	CG	3	6	62960	62965	0 %	0 %	50 %	50 %	379743507
1052	NC_016945	GGGT	2	8	63168	63175	0 %	25 %	75 %	0 %	379743507
1053	NC_016945	CAG	2	6	63248	63253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743507
1054	NC_016945	TGA	2	6	63302	63307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743507
1055	NC_016945	CGTG	2	8	63366	63373	0 %	25 %	50 %	25 %	379743508
1056	NC_016945	GAT	2	6	63449	63454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743508
1057	NC_016945	GTTG	2	8	63469	63476	0 %	50 %	50 %	0 %	379743508
1058	NC_016945	TAC	2	6	63511	63516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743508
1059	NC_016945	GAGT	2	8	63533	63540	25 %	25 %	50 %	0 %	379743508
1060	NC_016945	CTT	2	6	63582	63587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743508
1061	NC_016945	ATT	2	6	63627	63632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743508
1062	NC_016945	GCG	2	6	63801	63806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743508
1063	NC_016945	GAT	2	6	63921	63926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743508
1064	NC_016945	CAG	2	6	64035	64040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743508
1065	NC_016945	GT	3	6	64052	64057	0 %	50 %	50 %	0 %	379743508
1066	NC_016945	ACA	2	6	64073	64078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743508
1067	NC_016945	TGGTT	2	10	64108	64117	0 %	60 %	40 %	0 %	379743509
1068	NC_016945	TCG	2	6	64118	64123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743509
1069	NC_016945	ATA	2	6	64141	64146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743509
1070	NC_016945	CCG	2	6	64156	64161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743509
1071	NC_016945	GCG	2	6	64185	64190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743509
1072	NC_016945	GATTT	2	10	64248	64257	20 %	60 %	20 %	0 %	379743509
1073	NC_016945	CAA	2	6	64278	64283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743509
1074	NC_016945	TGC	2	6	64289	64294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743509
1075	NC_016945	T	6	6	64309	64314	0 %	100 %	0 %	0 %	379743509
1076	NC_016945	GCG	2	6	64338	64343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379743509
1077	NC_016945	CA	3	6	64382	64387	50 %	0 %	0 %	50 %	379743509
1078	NC_016945	AGC	2	6	64420	64425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743509
1079	NC_016945	ATA	2	6	64467	64472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743509
1080	NC_016945	TGA	2	6	64484	64489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743509
1081	NC_016945	T	6	6	64536	64541	0 %	100 %	0 %	0 %	379743509
1082	NC_016945	GC	3	6	64562	64567	0 %	0 %	50 %	50 %	379743509
1083	NC_016945	GCC	2	6	64586	64591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743509
1084	NC_016945	A	6	6	64601	64606	100 %	0 %	0 %	0 %	379743509
1085	NC_016945	GC	3	6	64727	64732	0 %	0 %	50 %	50 %	379743509
1086	NC_016945	GT	3	6	64837	64842	0 %	50 %	50 %	0 %	379743509
1087	NC_016945	TCA	2	6	64881	64886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743509
1088	NC_016945	G	6	6	65005	65010	0 %	0 %	100 %	0 %	379743509
1089	NC_016945	GTG	2	6	65021	65026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743509
1090	NC_016945	TCG	2	6	65080	65085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743509
1091	NC_016945	GGAT	2	8	65115	65122	25 %	25 %	50 %	0 %	379743509
1092	NC_016945	GAT	2	6	65138	65143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743509
1093	NC_016945	TGAT	2	8	65215	65222	25 %	50 %	25 %	0 %	379743509
1094	NC_016945	CAA	2	6	65237	65242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743509
1095	NC_016945	TGG	2	6	65243	65248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743509
1096	NC_016945	GTG	2	6	65255	65260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743509
1097	NC_016945	GTCA	2	8	65310	65317	25 %	25 %	25 %	25 %	379743509
1098	NC_016945	CCG	2	6	65351	65356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743509
1099	NC_016945	TTC	2	6	65381	65386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743509
1100	NC_016945	TGG	2	6	65522	65527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743510
1101	NC_016945	GCC	2	6	65576	65581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743510
1102	NC_016945	A	7	7	65671	65677	100 %	0 %	0 %	0 %	379743510
1103	NC_016945	AAG	2	6	65739	65744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743510
1104	NC_016945	CAG	2	6	65923	65928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743510
1105	NC_016945	CGC	2	6	65952	65957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743510
1106	NC_016945	GATT	2	8	65992	65999	25 %	50 %	25 %	0 %	379743510
1107	NC_016945	GCC	2	6	66001	66006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379743510
1108	NC_016945	CAA	2	6	66094	66099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743510
1109	NC_016945	CAA	2	6	66173	66178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743510
1110	NC_016945	GT	3	6	66246	66251	0 %	50 %	50 %	0 %	379743510
1111	NC_016945	GCA	2	6	66279	66284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743510
1112	NC_016945	GAA	2	6	66292	66297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743510
1113	NC_016945	TGG	2	6	66303	66308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743510
1114	NC_016945	AGA	2	6	66313	66318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743510
1115	NC_016945	TGG	2	6	66326	66331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743510
1116	NC_016945	GC	4	8	66362	66369	0 %	0 %	50 %	50 %	379743510
1117	NC_016945	CCA	2	6	66410	66415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743510
1118	NC_016945	CGTT	2	8	66559	66566	0 %	50 %	25 %	25 %	379743511
1119	NC_016945	CTT	3	9	66578	66586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743511
1120	NC_016945	GCT	2	6	66598	66603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743511
1121	NC_016945	CAG	2	6	66605	66610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743511
1122	NC_016945	GCA	2	6	66634	66639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743511
1123	NC_016945	TCA	2	6	66700	66705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743511
1124	NC_016945	TAG	2	6	66726	66731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743511
1125	NC_016945	GCT	3	9	66745	66753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743511
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1127	NC_016945	TTG	2	6	67435	67440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743512
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