MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_016944	TGA	2	6	124493	124498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740025
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2006	NC_016944	GGA	2	6	124545	124550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379740025
2007	NC_016944	TTTTG	2	10	124600	124609	0 %	80 %	20 %	0 %	379740025
2008	NC_016944	GCA	2	6	124650	124655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740025
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2011	NC_016944	CATG	2	8	124716	124723	25 %	25 %	25 %	25 %	379740025
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2122	NC_016944	GTC	2	6	131863	131868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740031
2123	NC_016944	TCA	2	6	131909	131914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740031
2124	NC_016944	CTT	2	6	131936	131941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740031
2125	NC_016944	T	6	6	131951	131956	0 %	100 %	0 %	0 %	379740031
2126	NC_016944	GCT	2	6	132101	132106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740031
2127	NC_016944	TCGGA	2	10	132126	132135	20 %	20 %	40 %	20 %	379740031
2128	NC_016944	GGACA	2	10	132180	132189	40 %	0 %	40 %	20 %	379740031
2129	NC_016944	TCC	2	6	132231	132236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740031
2130	NC_016944	TGG	2	6	132394	132399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740031
2131	NC_016944	GAT	2	6	132417	132422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740031
2132	NC_016944	AGC	2	6	132514	132519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740031
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2134	NC_016944	TCA	2	6	132850	132855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740032
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2140	NC_016944	AATG	2	8	133514	133521	50 %	25 %	25 %	0 %	379740033
2141	NC_016944	GCTT	2	8	133621	133628	0 %	50 %	25 %	25 %	379740033
2142	NC_016944	GGC	2	6	133682	133687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740033
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2144	NC_016944	AAT	2	6	133719	133724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740033
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2150	NC_016944	GAT	2	6	134163	134168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740034
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2152	NC_016944	TG	3	6	134234	134239	0 %	50 %	50 %	0 %	379740034
2153	NC_016944	TGA	2	6	134257	134262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740034
2154	NC_016944	TGA	2	6	134266	134271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740034
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2158	NC_016944	T	6	6	134917	134922	0 %	100 %	0 %	0 %	379740036
2159	NC_016944	T	7	7	134925	134931	0 %	100 %	0 %	0 %	379740036
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2199	NC_016944	TTG	2	6	136978	136983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740040
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2206	NC_016944	TGA	3	9	137301	137309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740040
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2209	NC_016944	ATC	2	6	137374	137379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740040
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2217	NC_016944	GCAAG	2	10	137592	137601	40 %	0 %	40 %	20 %	379740040
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2219	NC_016944	ATG	2	6	137729	137734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740040
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2223	NC_016944	CAAAA	2	10	137797	137806	80 %	0 %	0 %	20 %	379740040
2224	NC_016944	TGA	2	6	137843	137848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740040
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2226	NC_016944	TGA	2	6	137856	137861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740040
2227	NC_016944	TCAG	2	8	137918	137925	25 %	25 %	25 %	25 %	379740040
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2230	NC_016944	GAC	2	6	138218	138223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740041
2231	NC_016944	GCG	2	6	138252	138257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740041
2232	NC_016944	GGC	2	6	138277	138282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740041
2233	NC_016944	CGC	2	6	138409	138414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740041
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2236	NC_016944	CGG	2	6	138533	138538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740041
2237	NC_016944	GCT	2	6	138572	138577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740041
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2239	NC_016944	CAG	2	6	138604	138609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740041
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2241	NC_016944	GTG	2	6	138631	138636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740041
2242	NC_016944	CTG	2	6	138652	138657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740041
2243	NC_016944	TGA	2	6	138660	138665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740041
2244	NC_016944	CTG	2	6	138748	138753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740041
2245	NC_016944	T	6	6	138819	138824	0 %	100 %	0 %	0 %	379740041
2246	NC_016944	A	6	6	138864	138869	100 %	0 %	0 %	0 %	379740042
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2357	NC_016944	AG	3	6	145957	145962	50 %	0 %	50 %	0 %	379740048
2358	NC_016944	ATG	2	6	146001	146006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740048
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2363	NC_016944	CTTT	2	8	146168	146175	0 %	75 %	0 %	25 %	379740048
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2486	NC_016944	TCA	2	6	159447	159452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740055
2487	NC_016944	CAA	2	6	159484	159489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740055
2488	NC_016944	CCAGA	2	10	159571	159580	40 %	0 %	20 %	40 %	379740055
2489	NC_016944	TGC	2	6	159662	159667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055
2490	NC_016944	GCAT	2	8	159705	159712	25 %	25 %	25 %	25 %	379740055
2491	NC_016944	TGT	2	6	159736	159741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740055
2492	NC_016944	CTC	2	6	159749	159754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379740055
2493	NC_016944	CAC	2	6	159871	159876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740055
2494	NC_016944	GA	3	6	159920	159925	50 %	0 %	50 %	0 %	379740055
2495	NC_016944	AAG	2	6	159948	159953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740055
2496	NC_016944	GC	3	6	159988	159993	0 %	0 %	50 %	50 %	379740055
2497	NC_016944	TGC	2	6	160057	160062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055
2498	NC_016944	GCACC	2	10	160117	160126	20 %	0 %	20 %	60 %	379740055
2499	NC_016944	AGCG	2	8	160161	160168	25 %	0 %	50 %	25 %	379740055
2500	NC_016944	CTG	2	6	160225	160230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740055

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