MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016944	CT	3	6	62486	62491	0 %	50 %	0 %	50 %	379739966
1003	NC_016944	ACC	2	6	62511	62516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739966
1004	NC_016944	GAT	2	6	62568	62573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739966
1005	NC_016944	TCT	2	6	62591	62596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739966
1006	NC_016944	TTA	2	6	62843	62848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739966
1007	NC_016944	GCC	2	6	62958	62963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739966
1008	NC_016944	GGTT	2	8	62971	62978	0 %	50 %	50 %	0 %	379739966
1009	NC_016944	ACA	2	6	62999	63004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739966
1010	NC_016944	TGG	2	6	63026	63031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739966
1011	NC_016944	ATTG	2	8	63033	63040	25 %	50 %	25 %	0 %	379739966
1012	NC_016944	CGG	2	6	63076	63081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739966
1013	NC_016944	GTG	2	6	63087	63092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739966
1014	NC_016944	GCCA	2	8	63185	63192	25 %	0 %	25 %	50 %	379739966
1015	NC_016944	TTC	2	6	63257	63262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739967
1016	NC_016944	GCA	2	6	63306	63311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739967
1017	NC_016944	GT	3	6	63329	63334	0 %	50 %	50 %	0 %	379739967
1018	NC_016944	G	6	6	63349	63354	0 %	0 %	100 %	0 %	379739967
1019	NC_016944	TGG	2	6	63365	63370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739967
1020	NC_016944	TTGG	2	8	63379	63386	0 %	50 %	50 %	0 %	379739967
1021	NC_016944	CTT	2	6	63496	63501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739967
1022	NC_016944	GCAGC	2	10	63661	63670	20 %	0 %	40 %	40 %	379739967
1023	NC_016944	TCA	2	6	63677	63682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739967
1024	NC_016944	TGGG	2	8	63696	63703	0 %	25 %	75 %	0 %	379739967
1025	NC_016944	GT	3	6	63753	63758	0 %	50 %	50 %	0 %	379739967
1026	NC_016944	TGT	2	6	63813	63818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739967
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1029	NC_016944	AAG	2	6	64139	64144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739968
1030	NC_016944	AC	3	6	64154	64159	50 %	0 %	0 %	50 %	379739968
1031	NC_016944	AGG	2	6	64205	64210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739968
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1033	NC_016944	GATT	2	8	64351	64358	25 %	50 %	25 %	0 %	379739969
1034	NC_016944	CGA	2	6	64369	64374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739969
1035	NC_016944	TGC	2	6	64441	64446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739969
1036	NC_016944	GCC	2	6	64460	64465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739969
1037	NC_016944	GCTGC	2	10	64650	64659	0 %	20 %	40 %	40 %	379739969
1038	NC_016944	GCA	2	6	64686	64691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739969
1039	NC_016944	ATC	2	6	64724	64729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739969
1040	NC_016944	CCAAG	2	10	64735	64744	40 %	0 %	20 %	40 %	379739969
1041	NC_016944	TGC	2	6	64786	64791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739969
1042	NC_016944	CAA	2	6	65008	65013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739970
1043	NC_016944	CAG	2	6	65129	65134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739970
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1046	NC_016944	GA	3	6	65318	65323	50 %	0 %	50 %	0 %	379739970
1047	NC_016944	ATC	2	6	65422	65427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739970
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1050	NC_016944	AGA	2	6	65475	65480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739970
1051	NC_016944	GCA	2	6	65556	65561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739970
1052	NC_016944	GC	3	6	65651	65656	0 %	0 %	50 %	50 %	379739970
1053	NC_016944	GCG	2	6	65698	65703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739970
1054	NC_016944	TGA	2	6	65801	65806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739970
1055	NC_016944	CTTT	2	8	65866	65873	0 %	75 %	0 %	25 %	379739970
1056	NC_016944	TGA	2	6	66006	66011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739970
1057	NC_016944	TTG	2	6	66351	66356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739971
1058	NC_016944	TGA	2	6	66415	66420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739971
1059	NC_016944	TAA	2	6	66595	66600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739971
1060	NC_016944	TGT	2	6	66780	66785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739971
1061	NC_016944	AGCG	2	8	66797	66804	25 %	0 %	50 %	25 %	379739971
1062	NC_016944	TTG	2	6	66843	66848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739971
1063	NC_016944	CCA	2	6	66919	66924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739971
1064	NC_016944	TGG	2	6	66979	66984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739971
1065	NC_016944	GCG	2	6	67000	67005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739971
1066	NC_016944	GCT	2	6	67015	67020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739971
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1068	NC_016944	AGG	2	6	67228	67233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739971
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1070	NC_016944	GAT	2	6	67367	67372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739971
1071	NC_016944	GC	3	6	67419	67424	0 %	0 %	50 %	50 %	379739971
1072	NC_016944	CTG	2	6	67447	67452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739971
1073	NC_016944	ACG	2	6	67552	67557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739971
1074	NC_016944	CGAT	2	8	67589	67596	25 %	25 %	25 %	25 %	379739971
1075	NC_016944	GCT	2	6	67611	67616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739971
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1081	NC_016944	GGC	2	6	67947	67952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739971
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1083	NC_016944	CAGCG	2	10	68293	68302	20 %	0 %	40 %	40 %	379739972
1084	NC_016944	TC	3	6	68312	68317	0 %	50 %	0 %	50 %	379739972
1085	NC_016944	GT	3	6	68336	68341	0 %	50 %	50 %	0 %	379739972
1086	NC_016944	GGTAAT	2	12	68365	68376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739972
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1088	NC_016944	CAC	2	6	68634	68639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739972
1089	NC_016944	CAG	2	6	68681	68686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739972
1090	NC_016944	CAT	2	6	68708	68713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739972
1091	NC_016944	CATG	2	8	68788	68795	25 %	25 %	25 %	25 %	379739972
1092	NC_016944	TCG	2	6	68831	68836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739972
1093	NC_016944	CCG	2	6	68876	68881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739972
1094	NC_016944	G	6	6	68909	68914	0 %	0 %	100 %	0 %	379739972
1095	NC_016944	TAG	2	6	68934	68939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739972
1096	NC_016944	AAG	2	6	68977	68982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739972
1097	NC_016944	AACA	2	8	69021	69028	75 %	0 %	0 %	25 %	379739972
1098	NC_016944	GTC	2	6	69033	69038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739972
1099	NC_016944	CG	4	8	69105	69112	0 %	0 %	50 %	50 %	379739972
1100	NC_016944	TCAA	2	8	69127	69134	50 %	25 %	0 %	25 %	379739972
1101	NC_016944	AGC	2	6	69327	69332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739973
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1103	NC_016944	CGAT	2	8	69375	69382	25 %	25 %	25 %	25 %	379739973
1104	NC_016944	TTTG	2	8	69463	69470	0 %	75 %	25 %	0 %	379739973
1105	NC_016944	CGA	2	6	69521	69526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739973
1106	NC_016944	AGC	2	6	69652	69657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739973
1107	NC_016944	ATTT	2	8	69675	69682	25 %	75 %	0 %	0 %	379739973
1108	NC_016944	GAT	2	6	69703	69708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739973
1109	NC_016944	GCT	2	6	69823	69828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739973
1110	NC_016944	CT	3	6	69902	69907	0 %	50 %	0 %	50 %	379739973
1111	NC_016944	GCC	2	6	69914	69919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739973
1112	NC_016944	CTG	2	6	69962	69967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739973
1113	NC_016944	ATGA	2	8	70037	70044	50 %	25 %	25 %	0 %	379739973
1114	NC_016944	TAC	2	6	70153	70158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739973
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1116	NC_016944	ATC	2	6	70237	70242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739973
1117	NC_016944	GCC	2	6	70271	70276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739973
1118	NC_016944	CGG	3	9	70314	70322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739973
1119	NC_016944	ACT	2	6	70399	70404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739973
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1122	NC_016944	TGA	2	6	70646	70651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739974
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1124	NC_016944	TTAC	2	8	70868	70875	25 %	50 %	0 %	25 %	379739974
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