MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016944	GTA	2	6	275839	275844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740158
4502	NC_016944	ATT	2	6	275878	275883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740158
4503	NC_016944	CAGT	2	8	275974	275981	25 %	25 %	25 %	25 %	379740158
4504	NC_016944	AAAG	2	8	276132	276139	75 %	0 %	25 %	0 %	379740158
4505	NC_016944	GTG	2	6	276229	276234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740158
4506	NC_016944	ATC	2	6	276262	276267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740158
4507	NC_016944	GCA	2	6	276282	276287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740158
4508	NC_016944	GA	3	6	276321	276326	50 %	0 %	50 %	0 %	379740158
4509	NC_016944	CAA	2	6	276414	276419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740158
4510	NC_016944	TGG	2	6	276518	276523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740158
4511	NC_016944	TGA	2	6	276539	276544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740158
4512	NC_016944	ACTGCA	2	12	276564	276575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379740158
4513	NC_016944	CAG	2	6	276632	276637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740158
4514	NC_016944	GTG	2	6	276646	276651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740158
4515	NC_016944	T	6	6	277009	277014	0 %	100 %	0 %	0 %	379740159
4516	NC_016944	TCG	2	6	277023	277028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740159
4517	NC_016944	TGC	2	6	277086	277091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740159
4518	NC_016944	TCT	2	6	277152	277157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740159
4519	NC_016944	CAT	2	6	277223	277228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740159
4520	NC_016944	CAC	2	6	277265	277270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740159
4521	NC_016944	CATCA	2	10	277283	277292	40 %	20 %	0 %	40 %	379740159
4522	NC_016944	TGC	2	6	277320	277325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740159
4523	NC_016944	AAC	2	6	277332	277337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740159
4524	NC_016944	TGT	2	6	277363	277368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740159
4525	NC_016944	TGC	2	6	277416	277421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740159
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4528	NC_016944	GTT	2	6	277520	277525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740159
4529	NC_016944	CATCGC	2	12	277574	277585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379740159
4530	NC_016944	GC	3	6	277622	277627	0 %	0 %	50 %	50 %	379740159
4531	NC_016944	GCA	2	6	277690	277695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740159
4532	NC_016944	GA	3	6	277697	277702	50 %	0 %	50 %	0 %	379740159
4533	NC_016944	CAG	2	6	277789	277794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740159
4534	NC_016944	ACC	2	6	277824	277829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740159
4535	NC_016944	GCA	2	6	277851	277856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740159
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4537	NC_016944	AT	4	8	278049	278056	50 %	50 %	0 %	0 %	379740159
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4542	NC_016944	CT	3	6	278791	278796	0 %	50 %	0 %	50 %	379740161
4543	NC_016944	ATCA	2	8	278845	278852	50 %	25 %	0 %	25 %	379740161
4544	NC_016944	TGG	2	6	278859	278864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740161
4545	NC_016944	AAG	2	6	279037	279042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740161
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4547	NC_016944	CAG	2	6	279097	279102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740161
4548	NC_016944	ATGA	2	8	279130	279137	50 %	25 %	25 %	0 %	379740161
4549	NC_016944	ACAA	2	8	279200	279207	75 %	0 %	0 %	25 %	379740161
4550	NC_016944	CGA	2	6	279384	279389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740161
4551	NC_016944	GCT	2	6	279390	279395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740161
4552	NC_016944	GAT	2	6	279403	279408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740161
4553	NC_016944	TG	3	6	279421	279426	0 %	50 %	50 %	0 %	379740161
4554	NC_016944	CG	3	6	279574	279579	0 %	0 %	50 %	50 %	379740162
4555	NC_016944	CGG	2	6	279593	279598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740162
4556	NC_016944	TGC	2	6	279647	279652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740162
4557	NC_016944	CA	3	6	279684	279689	50 %	0 %	0 %	50 %	379740162
4558	NC_016944	CAC	2	6	279709	279714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740162
4559	NC_016944	TCACC	2	10	279789	279798	20 %	20 %	0 %	60 %	379740162
4560	NC_016944	GCC	2	6	279820	279825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740162
4561	NC_016944	GCG	2	6	279827	279832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740162
4562	NC_016944	GCT	2	6	279899	279904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740162
4563	NC_016944	CAT	2	6	279937	279942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740162
4564	NC_016944	ATCA	2	8	280009	280016	50 %	25 %	0 %	25 %	379740162
4565	NC_016944	CAC	2	6	280123	280128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740162
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4568	NC_016944	TAGG	2	8	280215	280222	25 %	25 %	50 %	0 %	379740162
4569	NC_016944	TTC	2	6	280276	280281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740162
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4572	NC_016944	CGC	2	6	280387	280392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740162
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4574	NC_016944	TGCGC	2	10	280541	280550	0 %	20 %	40 %	40 %	379740162
4575	NC_016944	TTGGG	2	10	280552	280561	0 %	40 %	60 %	0 %	379740162
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4585	NC_016944	GCCGAT	2	12	281156	281167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379740163
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4589	NC_016944	CCA	2	6	281334	281339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
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4591	NC_016944	CAC	2	6	281383	281388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
4592	NC_016944	ACGT	2	8	281399	281406	25 %	25 %	25 %	25 %	379740163
4593	NC_016944	TGC	2	6	281414	281419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740163
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4598	NC_016944	GGCT	2	8	281642	281649	0 %	25 %	50 %	25 %	379740163
4599	NC_016944	TGT	3	9	281695	281703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740163
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4601	NC_016944	CTT	2	6	281749	281754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740163
4602	NC_016944	TGG	2	6	281787	281792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740163
4603	NC_016944	TGA	2	6	281824	281829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740163
4604	NC_016944	CT	3	6	281859	281864	0 %	50 %	0 %	50 %	379740163
4605	NC_016944	CTT	2	6	281872	281877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740163
4606	NC_016944	AAG	2	6	281890	281895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740163
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4614	NC_016944	CAC	3	9	282182	282190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740163
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4617	NC_016944	CAT	2	6	282299	282304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740163
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4619	NC_016944	CGC	2	6	282397	282402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740163
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4621	NC_016944	GTT	2	6	282482	282487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740163
4622	NC_016944	GCG	2	6	282810	282815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740164
4623	NC_016944	A	7	7	282843	282849	100 %	0 %	0 %	0 %	379740164
4624	NC_016944	CAA	2	6	282914	282919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740164
4625	NC_016944	GCT	2	6	282976	282981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740164
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4627	NC_016944	A	7	7	283100	283106	100 %	0 %	0 %	0 %	379740164
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4651	NC_016944	TGAG	2	8	284608	284615	25 %	25 %	50 %	0 %	379740165
4652	NC_016944	GCA	2	6	284621	284626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740165
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4655	NC_016944	TGC	2	6	284770	284775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740165
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4731	NC_016944	GC	3	6	289157	289162	0 %	0 %	50 %	50 %	379740167
4732	NC_016944	GGC	2	6	289426	289431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740168
4733	NC_016944	GTGCT	2	10	289463	289472	0 %	40 %	40 %	20 %	379740168
4734	NC_016944	TCG	2	6	289502	289507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740168
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4738	NC_016944	T	6	6	289678	289683	0 %	100 %	0 %	0 %	379740168
4739	NC_016944	CGC	2	6	289798	289803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740168
4740	NC_016944	CGC	2	6	289810	289815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379740168
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4985	NC_016944	CAT	2	6	305380	305385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740183
4986	NC_016944	CGG	2	6	305443	305448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379740183
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4988	NC_016944	AGT	2	6	305551	305556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740183
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4990	NC_016944	GCTG	2	8	305742	305749	0 %	25 %	50 %	25 %	379740183
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