MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 2261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	TGGG	2	8	2026	2033	0 %	25 %	75 %	0 %	360037215
2	NC_016446	GGCT	2	8	2364	2371	0 %	25 %	50 %	25 %	360037215
3	NC_016446	TGGG	2	8	2649	2656	0 %	25 %	75 %	0 %	360037215
4	NC_016446	GCAT	2	8	3313	3320	25 %	25 %	25 %	25 %	360037216
5	NC_016446	GAGT	2	8	3517	3524	25 %	25 %	50 %	0 %	360037217
6	NC_016446	GCAA	2	8	4063	4070	50 %	0 %	25 %	25 %	360037217
7	NC_016446	ATTG	2	8	4676	4683	25 %	50 %	25 %	0 %	360037217
8	NC_016446	CAGG	2	8	4760	4767	25 %	0 %	50 %	25 %	360037217
9	NC_016446	CCAG	2	8	5222	5229	25 %	0 %	25 %	50 %	360037218
10	NC_016446	TTTG	2	8	5987	5994	0 %	75 %	25 %	0 %	360037220
11	NC_016446	GTAG	2	8	6364	6371	25 %	25 %	50 %	0 %	360037221
12	NC_016446	CATC	2	8	6521	6528	25 %	25 %	0 %	50 %	360037221
13	NC_016446	ATTC	2	8	7329	7336	25 %	50 %	0 %	25 %	360037222
14	NC_016446	ATAG	2	8	7405	7412	50 %	25 %	25 %	0 %	360037223
15	NC_016446	CAGC	2	8	7914	7921	25 %	0 %	25 %	50 %	360037223
16	NC_016446	TTCA	2	8	8083	8090	25 %	50 %	0 %	25 %	360037223
17	NC_016446	TAAG	2	8	8158	8165	50 %	25 %	25 %	0 %	360037223
18	NC_016446	ATCA	2	8	9579	9586	50 %	25 %	0 %	25 %	360037225
19	NC_016446	GTGA	2	8	10130	10137	25 %	25 %	50 %	0 %	360037226
20	NC_016446	CAGA	2	8	10286	10293	50 %	0 %	25 %	25 %	360037226
21	NC_016446	TTGC	2	8	10802	10809	0 %	50 %	25 %	25 %	360037226
22	NC_016446	GCTC	2	8	11129	11136	0 %	25 %	25 %	50 %	360037226
23	NC_016446	TGAT	2	8	11571	11578	25 %	50 %	25 %	0 %	360037227
24	NC_016446	ATCA	2	8	12371	12378	50 %	25 %	0 %	25 %	360037227
25	NC_016446	GAAC	2	8	12604	12611	50 %	0 %	25 %	25 %	360037227
26	NC_016446	TGAG	2	8	12669	12676	25 %	25 %	50 %	0 %	360037227
27	NC_016446	CAAA	2	8	12849	12856	75 %	0 %	0 %	25 %	360037227
28	NC_016446	GTGC	2	8	12983	12990	0 %	25 %	50 %	25 %	360037227
29	NC_016446	AGAC	2	8	13292	13299	50 %	0 %	25 %	25 %	360037227
30	NC_016446	TTAA	2	8	13372	13379	50 %	50 %	0 %	0 %	360037227
31	NC_016446	TCGT	2	8	13519	13526	0 %	50 %	25 %	25 %	360037228
32	NC_016446	CTCG	2	8	13698	13705	0 %	25 %	25 %	50 %	360037228
33	NC_016446	TTGA	2	8	14105	14112	25 %	50 %	25 %	0 %	360037228
34	NC_016446	TGCG	2	8	14694	14701	0 %	25 %	50 %	25 %	360037228
35	NC_016446	TTAC	2	8	15842	15849	25 %	50 %	0 %	25 %	360037229
36	NC_016446	TGGT	2	8	16386	16393	0 %	50 %	50 %	0 %	360037229
37	NC_016446	TGAG	2	8	17504	17511	25 %	25 %	50 %	0 %	360037232
38	NC_016446	CAAT	2	8	19549	19556	50 %	25 %	0 %	25 %	360037235
39	NC_016446	GTCA	2	8	21470	21477	25 %	25 %	25 %	25 %	360037235
40	NC_016446	GGCA	2	8	22013	22020	25 %	0 %	50 %	25 %	360037235
41	NC_016446	GTGA	2	8	22243	22250	25 %	25 %	50 %	0 %	360037236
42	NC_016446	CAGC	2	8	23088	23095	25 %	0 %	25 %	50 %	360037238
43	NC_016446	AGCA	2	8	23659	23666	50 %	0 %	25 %	25 %	360037238
44	NC_016446	CATC	2	8	24440	24447	25 %	25 %	0 %	50 %	360037239
45	NC_016446	TCGC	2	8	24566	24573	0 %	25 %	25 %	50 %	360037239
46	NC_016446	CGTG	2	8	24816	24823	0 %	25 %	50 %	25 %	360037239
47	NC_016446	AGTG	2	8	24990	24997	25 %	25 %	50 %	0 %	360037239
48	NC_016446	CTGC	2	8	25678	25685	0 %	25 %	25 %	50 %	360037240
49	NC_016446	AAGC	2	8	26033	26040	50 %	0 %	25 %	25 %	360037240
50	NC_016446	AGTT	2	8	27105	27112	25 %	50 %	25 %	0 %	360037241
51	NC_016446	CAAG	2	8	27385	27392	50 %	0 %	25 %	25 %	360037241
52	NC_016446	GGCT	2	8	27612	27619	0 %	25 %	50 %	25 %	360037241
53	NC_016446	ATCA	2	8	28451	28458	50 %	25 %	0 %	25 %	360037242
54	NC_016446	AGCG	2	8	28466	28473	25 %	0 %	50 %	25 %	360037242
55	NC_016446	ACCA	2	8	28547	28554	50 %	0 %	0 %	50 %	360037242
56	NC_016446	CTCA	2	8	28643	28650	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
57	NC_016446	CCAT	2	8	28860	28867	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
58	NC_016446	AGTT	2	8	30018	30025	25 %	50 %	25 %	0 %	360037243
59	NC_016446	GATG	2	8	30034	30041	25 %	25 %	50 %	0 %	360037243
60	NC_016446	GTAC	2	8	30081	30088	25 %	25 %	25 %	25 %	360037243
61	NC_016446	CAAA	2	8	31608	31615	75 %	0 %	0 %	25 %	360037244
62	NC_016446	TGAC	2	8	31646	31653	25 %	25 %	25 %	25 %	360037245
63	NC_016446	TTTC	2	8	31699	31706	0 %	75 %	0 %	25 %	360037245
64	NC_016446	CTAT	2	8	32499	32506	25 %	50 %	0 %	25 %	360037246
65	NC_016446	GCTA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	360037246
66	NC_016446	CTTG	2	8	33170	33177	0 %	50 %	25 %	25 %	360037247
67	NC_016446	AAAG	2	8	33347	33354	75 %	0 %	25 %	0 %	360037247
68	NC_016446	TGGT	2	8	33746	33753	0 %	50 %	50 %	0 %	360037247
69	NC_016446	CGTG	2	8	34365	34372	0 %	25 %	50 %	25 %	360037247
70	NC_016446	TTGG	2	8	34544	34551	0 %	50 %	50 %	0 %	360037247
71	NC_016446	GTAC	2	8	34761	34768	25 %	25 %	25 %	25 %	360037247
72	NC_016446	GATC	2	8	36026	36033	25 %	25 %	25 %	25 %	360037250
73	NC_016446	AATG	2	8	36340	36347	50 %	25 %	25 %	0 %	360037251
74	NC_016446	TGAG	2	8	36932	36939	25 %	25 %	50 %	0 %	360037251
75	NC_016446	AGCG	2	8	37676	37683	25 %	0 %	50 %	25 %	360037252
76	NC_016446	AACA	2	8	37696	37703	75 %	0 %	0 %	25 %	360037252
77	NC_016446	GTTT	2	8	38503	38510	0 %	75 %	25 %	0 %	360037254
78	NC_016446	CTTT	2	8	39022	39029	0 %	75 %	0 %	25 %	360037255
79	NC_016446	GGCG	2	8	39309	39316	0 %	0 %	75 %	25 %	360037256
80	NC_016446	TAAA	2	8	40223	40230	75 %	25 %	0 %	0 %	360037258
81	NC_016446	GCAC	2	8	40998	41005	25 %	0 %	25 %	50 %	360037259
82	NC_016446	AAAG	2	8	41357	41364	75 %	0 %	25 %	0 %	360037260
83	NC_016446	GAAT	2	8	41623	41630	50 %	25 %	25 %	0 %	360037260
84	NC_016446	GATT	2	8	41733	41740	25 %	50 %	25 %	0 %	360037260
85	NC_016446	GGCG	2	8	42034	42041	0 %	0 %	75 %	25 %	360037261
86	NC_016446	TACA	2	8	44756	44763	50 %	25 %	0 %	25 %	360037263
87	NC_016446	GGCG	2	8	44977	44984	0 %	0 %	75 %	25 %	360037264
88	NC_016446	GCTC	2	8	45275	45282	0 %	25 %	25 %	50 %	360037265
89	NC_016446	GTAC	2	8	45497	45504	25 %	25 %	25 %	25 %	360037265
90	NC_016446	TCGT	2	8	46462	46469	0 %	50 %	25 %	25 %	360037267
91	NC_016446	GGCG	2	8	47224	47231	0 %	0 %	75 %	25 %	360037269
92	NC_016446	TCAA	2	8	48085	48092	50 %	25 %	0 %	25 %	360037271
93	NC_016446	AGCA	2	8	48702	48709	50 %	0 %	25 %	25 %	360037272
94	NC_016446	AAAG	2	8	49819	49826	75 %	0 %	25 %	0 %	360037274
95	NC_016446	GGCC	2	8	50141	50148	0 %	0 %	50 %	50 %	360037274
96	NC_016446	GGAA	2	8	50532	50539	50 %	0 %	50 %	0 %	360037275
97	NC_016446	AATA	2	8	50802	50809	75 %	25 %	0 %	0 %	360037275
98	NC_016446	GTTT	2	8	50997	51004	0 %	75 %	25 %	0 %	360037276
99	NC_016446	TATC	2	8	51164	51171	25 %	50 %	0 %	25 %	360037276
100	NC_016446	CAAA	2	8	52913	52920	75 %	0 %	0 %	25 %	360037278
101	NC_016446	TCTT	2	8	53315	53322	0 %	75 %	0 %	25 %	360037279
102	NC_016446	TCTG	2	8	55170	55177	0 %	50 %	25 %	25 %	360037282
103	NC_016446	GGCG	2	8	55433	55440	0 %	0 %	75 %	25 %	360037283
104	NC_016446	AGAT	2	8	56156	56163	50 %	25 %	25 %	0 %	360037285
105	NC_016446	CTGT	2	8	57723	57730	0 %	50 %	25 %	25 %	360037288
106	NC_016446	CTGT	2	8	58297	58304	0 %	50 %	25 %	25 %	360037289
107	NC_016446	CAAG	2	8	58689	58696	50 %	0 %	25 %	25 %	360037289
108	NC_016446	GATT	2	8	58719	58726	25 %	50 %	25 %	0 %	360037289
109	NC_016446	TACC	2	8	59203	59210	25 %	25 %	0 %	50 %	360037290
110	NC_016446	TCAA	2	8	59447	59454	50 %	25 %	0 %	25 %	360037291
111	NC_016446	TGGC	2	8	59466	59473	0 %	25 %	50 %	25 %	360037291
112	NC_016446	TATT	2	8	59642	59649	25 %	75 %	0 %	0 %	360037292
113	NC_016446	TAAA	2	8	60400	60407	75 %	25 %	0 %	0 %	360037292
114	NC_016446	CTTT	2	8	60764	60771	0 %	75 %	0 %	25 %	360037293
115	NC_016446	AGTT	2	8	61223	61230	25 %	50 %	25 %	0 %	360037294
116	NC_016446	GAAT	2	8	61665	61672	50 %	25 %	25 %	0 %	360037294
117	NC_016446	GAGT	2	8	61868	61875	25 %	25 %	50 %	0 %	360037294
118	NC_016446	ATAA	2	8	63764	63771	75 %	25 %	0 %	0 %	360037297
119	NC_016446	TCTG	2	8	64282	64289	0 %	50 %	25 %	25 %	360037298
120	NC_016446	GGCG	2	8	64545	64552	0 %	0 %	75 %	25 %	360037299
121	NC_016446	GGCG	2	8	65005	65012	0 %	0 %	75 %	25 %	360037301
122	NC_016446	AGTG	2	8	66282	66289	25 %	25 %	50 %	0 %	360037304
123	NC_016446	ATCA	2	8	66521	66528	50 %	25 %	0 %	25 %	360037304
124	NC_016446	GGCG	2	8	66990	66997	0 %	0 %	75 %	25 %	360037305
125	NC_016446	ACAT	2	8	67253	67260	50 %	25 %	0 %	25 %	360037306
126	NC_016446	TTAC	2	8	67273	67280	25 %	50 %	0 %	25 %	360037306
127	NC_016446	GCTC	2	8	67311	67318	0 %	25 %	25 %	50 %	360037306
128	NC_016446	GAAC	2	8	67910	67917	50 %	0 %	25 %	25 %	360037307
129	NC_016446	CAAG	2	8	67930	67937	50 %	0 %	25 %	25 %	360037307
130	NC_016446	GGAA	2	8	69303	69310	50 %	0 %	50 %	0 %	360037310
131	NC_016446	AATA	2	8	69573	69580	75 %	25 %	0 %	0 %	360037310
132	NC_016446	CTTT	2	8	70696	70703	0 %	75 %	0 %	25 %	360037311
133	NC_016446	GGCG	2	8	70983	70990	0 %	0 %	75 %	25 %	360037312
134	NC_016446	AGTT	2	8	71376	71383	25 %	50 %	25 %	0 %	360037312
135	NC_016446	GGCA	2	8	71475	71482	25 %	0 %	50 %	25 %	360037312
136	NC_016446	AAGT	2	8	71938	71945	50 %	25 %	25 %	0 %	360037313
137	NC_016446	GTAG	2	8	72144	72151	25 %	25 %	50 %	0 %	360037313
138	NC_016446	AGCA	2	8	72230	72237	50 %	0 %	25 %	25 %	360037313
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