MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 11287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	GCA	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037215
2	NC_016446	CAG	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037215
3	NC_016446	GCT	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037215
4	NC_016446	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037215
5	NC_016446	GTG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037215
6	NC_016446	GGC	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037215
7	NC_016446	CGC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037216
8	NC_016446	AGC	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037216
9	NC_016446	TCA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037216
10	NC_016446	CAG	3	9	2935	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037216
11	NC_016446	GCA	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037216
12	NC_016446	TGG	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037216
13	NC_016446	GAC	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037217
14	NC_016446	GCC	2	6	3447	3452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037217
15	NC_016446	TGA	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037217
16	NC_016446	GGC	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037217
17	NC_016446	TGC	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037217
18	NC_016446	TAA	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037217
19	NC_016446	AGT	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037217
20	NC_016446	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037217
21	NC_016446	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037217
22	NC_016446	CAG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037217
23	NC_016446	CTT	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037217
24	NC_016446	CTG	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037217
25	NC_016446	GTG	2	6	4193	4198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037217
26	NC_016446	GCT	2	6	4248	4253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037217
27	NC_016446	TCA	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037217
28	NC_016446	GAT	2	6	4352	4357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037217
29	NC_016446	CCG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037217
30	NC_016446	GCG	2	6	4502	4507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037217
31	NC_016446	GGC	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037217
32	NC_016446	CCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037217
33	NC_016446	TGC	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037217
34	NC_016446	TGC	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037217
35	NC_016446	CAG	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037217
36	NC_016446	GTT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037218
37	NC_016446	CAT	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037218
38	NC_016446	TCT	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037218
39	NC_016446	ACA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037218
40	NC_016446	TTG	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037218
41	NC_016446	AGT	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037218
42	NC_016446	CAA	2	6	5550	5555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037219
43	NC_016446	AGG	2	6	5565	5570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037219
44	NC_016446	GCA	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037219
45	NC_016446	TGC	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037219
46	NC_016446	CAC	2	6	5628	5633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037219
47	NC_016446	CAG	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037220
48	NC_016446	TGC	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037220
49	NC_016446	CAT	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037220
50	NC_016446	CGG	2	6	5851	5856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037220
51	NC_016446	TCA	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037220
52	NC_016446	TCA	2	6	5961	5966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037220
53	NC_016446	CAC	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037220
54	NC_016446	CAT	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037220
55	NC_016446	TGC	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037221
56	NC_016446	GGT	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037221
57	NC_016446	GCG	2	6	6415	6420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037221
58	NC_016446	ACA	2	6	6423	6428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037221
59	NC_016446	TGG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037221
60	NC_016446	AGA	2	6	6659	6664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037221
61	NC_016446	AGA	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037221
62	NC_016446	GAA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037222
63	NC_016446	TGC	2	6	7136	7141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037222
64	NC_016446	TGG	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037222
65	NC_016446	TCA	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037222
66	NC_016446	ATC	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037222
67	NC_016446	CTT	2	6	7244	7249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037222
68	NC_016446	GCA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037223
69	NC_016446	AGT	2	6	7497	7502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037223
70	NC_016446	ATG	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037223
71	NC_016446	TGC	2	6	7964	7969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037223
72	NC_016446	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037223
73	NC_016446	TCA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037223
74	NC_016446	TGC	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037223
75	NC_016446	GTA	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037223
76	NC_016446	TCA	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037224
77	NC_016446	CGG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037224
78	NC_016446	AGA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037224
79	NC_016446	TTA	2	6	8908	8913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037224
80	NC_016446	AGA	3	9	8934	8942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037224
81	NC_016446	AAG	2	6	8975	8980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037224
82	NC_016446	TAA	2	6	9291	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037225
83	NC_016446	TTG	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037225
84	NC_016446	CGA	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037225
85	NC_016446	TTG	2	6	9461	9466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037225
86	NC_016446	GGT	3	9	9522	9530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037225
87	NC_016446	ATG	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037225
88	NC_016446	CGG	2	6	9735	9740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037225
89	NC_016446	GAG	2	6	9785	9790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037225
90	NC_016446	AAT	2	6	9909	9914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037225
91	NC_016446	TCG	2	6	10077	10082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037226
92	NC_016446	GTG	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037226
93	NC_016446	CTA	2	6	10233	10238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037226
94	NC_016446	TGG	2	6	10242	10247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037226
95	NC_016446	TGG	2	6	10465	10470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037226
96	NC_016446	GTT	2	6	10599	10604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037226
97	NC_016446	TGC	2	6	10635	10640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037226
98	NC_016446	TTA	2	6	10684	10689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037226
99	NC_016446	GCT	2	6	10831	10836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037226
100	NC_016446	GCA	2	6	10844	10849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037226
101	NC_016446	TTA	2	6	10853	10858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037226
102	NC_016446	TAT	2	6	11027	11032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037226
103	NC_016446	TTG	2	6	11114	11119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037226
104	NC_016446	GAA	2	6	11484	11489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037227
105	NC_016446	GTG	2	6	11667	11672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037227
106	NC_016446	GCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037227
107	NC_016446	GAC	2	6	11815	11820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037227
108	NC_016446	GTC	2	6	11868	11873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037227
109	NC_016446	TTC	2	6	11946	11951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037227
110	NC_016446	TGA	2	6	11995	12000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
111	NC_016446	CAT	2	6	12001	12006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037227
112	NC_016446	TGA	2	6	12082	12087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
113	NC_016446	TAC	2	6	12212	12217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037227
114	NC_016446	GAT	2	6	12236	12241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
115	NC_016446	TTG	2	6	12264	12269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037227
116	NC_016446	TGC	2	6	12393	12398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037227
117	NC_016446	TCG	2	6	12448	12453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037227
118	NC_016446	ATG	2	6	12471	12476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
119	NC_016446	ATG	2	6	12530	12535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
120	NC_016446	AGC	2	6	12569	12574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037227
121	NC_016446	GGT	2	6	12646	12651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037227
122	NC_016446	GCA	2	6	12745	12750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037227
123	NC_016446	AAT	2	6	12767	12772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037227
124	NC_016446	CTT	2	6	12789	12794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037227
125	NC_016446	CTG	2	6	12905	12910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037227
126	NC_016446	GCG	2	6	12932	12937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037227
127	NC_016446	GGT	2	6	12967	12972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037227
128	NC_016446	CAC	2	6	13015	13020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037227
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132	NC_016446	ATG	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
133	NC_016446	TGA	2	6	13174	13179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037227
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251	NC_016446	GCA	2	6	23652	23657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037238
252	NC_016446	CCG	2	6	23783	23788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037238
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255	NC_016446	CGC	2	6	23953	23958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037238
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368	NC_016446	AGA	2	6	35234	35239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037248
369	NC_016446	CAA	2	6	35243	35248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037248
370	NC_016446	GAT	2	6	35387	35392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037248
371	NC_016446	AAG	2	6	35412	35417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037248
372	NC_016446	TCA	2	6	35519	35524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037249
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499	NC_016446	GGT	2	6	48671	48676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037272
500	NC_016446	GGA	2	6	48727	48732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037272

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