MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016446	TTA	2	6	243271	243276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037503
3502	NC_016446	GCT	2	6	243350	243355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037503
3503	NC_016446	ATG	2	6	243362	243367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037503
3504	NC_016446	AAT	2	6	243400	243405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037503
3505	NC_016446	GGTCAT	2	12	243418	243429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360037503
3506	NC_016446	A	6	6	243443	243448	100 %	0 %	0 %	0 %	360037503
3507	NC_016446	ACCTT	2	10	243466	243475	20 %	40 %	0 %	40 %	360037503
3508	NC_016446	CGG	2	6	243573	243578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
3509	NC_016446	GGC	2	6	243691	243696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
3510	NC_016446	TCC	2	6	243750	243755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037503
3511	NC_016446	GGC	2	6	243844	243849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037503
3512	NC_016446	TGA	2	6	243963	243968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037503
3513	NC_016446	GGGCT	2	10	244061	244070	0 %	20 %	60 %	20 %	360037503
3514	NC_016446	GCC	2	6	244081	244086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037503
3515	NC_016446	ACA	2	6	244106	244111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037503
3516	NC_016446	A	6	6	244148	244153	100 %	0 %	0 %	0 %	360037503
3517	NC_016446	GCTGC	2	10	244163	244172	0 %	20 %	40 %	40 %	360037503
3518	NC_016446	AGC	2	6	244199	244204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037503
3519	NC_016446	GCA	3	9	244266	244274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037503
3520	NC_016446	GATC	2	8	244332	244339	25 %	25 %	25 %	25 %	360037503
3521	NC_016446	ATG	2	6	244552	244557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
3522	NC_016446	TTG	2	6	244637	244642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037504
3523	NC_016446	CAAG	2	8	244650	244657	50 %	0 %	25 %	25 %	360037504
3524	NC_016446	GCA	2	6	244716	244721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037504
3525	NC_016446	CGC	2	6	244815	244820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037504
3526	NC_016446	CTCA	2	8	244871	244878	25 %	25 %	0 %	50 %	360037504
3527	NC_016446	CG	3	6	244904	244909	0 %	0 %	50 %	50 %	360037504
3528	NC_016446	GATG	2	8	244950	244957	25 %	25 %	50 %	0 %	360037504
3529	NC_016446	GAT	2	6	245014	245019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
3530	NC_016446	GCC	2	6	245033	245038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037504
3531	NC_016446	TG	3	6	245098	245103	0 %	50 %	50 %	0 %	360037504
3532	NC_016446	GAT	2	6	245110	245115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
3533	NC_016446	GGTT	2	8	245160	245167	0 %	50 %	50 %	0 %	360037504
3534	NC_016446	CTG	2	6	245170	245175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037504
3535	NC_016446	TGA	2	6	245220	245225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037504
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3537	NC_016446	CG	3	6	245243	245248	0 %	0 %	50 %	50 %	360037504
3538	NC_016446	ATT	2	6	245285	245290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037504
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3540	NC_016446	ATT	2	6	245343	245348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037504
3541	NC_016446	GTG	2	6	245553	245558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037505
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3545	NC_016446	AGC	2	6	245778	245783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037505
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3547	NC_016446	ATC	2	6	245889	245894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037505
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3550	NC_016446	TGA	2	6	246079	246084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037506
3551	NC_016446	GGTTG	2	10	246174	246183	0 %	40 %	60 %	0 %	360037506
3552	NC_016446	CTT	2	6	246239	246244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037506
3553	NC_016446	A	6	6	246264	246269	100 %	0 %	0 %	0 %	360037506
3554	NC_016446	GTCA	2	8	246270	246277	25 %	25 %	25 %	25 %	360037506
3555	NC_016446	AGCC	2	8	246288	246295	25 %	0 %	25 %	50 %	360037506
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3557	NC_016446	CCAC	2	8	246521	246528	25 %	0 %	0 %	75 %	360037506
3558	NC_016446	CTT	2	6	246542	246547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037506
3559	NC_016446	GC	3	6	246588	246593	0 %	0 %	50 %	50 %	360037506
3560	NC_016446	ATG	2	6	246673	246678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037506
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3565	NC_016446	GGA	2	6	247042	247047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037507
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3570	NC_016446	GC	3	6	247266	247271	0 %	0 %	50 %	50 %	360037508
3571	NC_016446	TGAA	2	8	247303	247310	50 %	25 %	25 %	0 %	360037508
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3578	NC_016446	CTTA	2	8	247982	247989	25 %	50 %	0 %	25 %	360037510
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3587	NC_016446	CCAA	2	8	248322	248329	50 %	0 %	0 %	50 %	360037510
3588	NC_016446	ATAA	2	8	248380	248387	75 %	25 %	0 %	0 %	360037510
3589	NC_016446	GC	3	6	248442	248447	0 %	0 %	50 %	50 %	360037511
3590	NC_016446	TCGC	2	8	248510	248517	0 %	25 %	25 %	50 %	360037511
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3593	NC_016446	ATTC	2	8	248782	248789	25 %	50 %	0 %	25 %	360037512
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3598	NC_016446	A	6	6	249214	249219	100 %	0 %	0 %	0 %	360037512
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3604	NC_016446	CAAAGC	2	12	249607	249618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360037512
3605	NC_016446	TGCC	2	8	249807	249814	0 %	25 %	25 %	50 %	360037512
3606	NC_016446	GAA	2	6	249851	249856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037512
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3614	NC_016446	ACCAA	2	10	250620	250629	60 %	0 %	0 %	40 %	360037513
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3619	NC_016446	CAG	2	6	251065	251070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037513
3620	NC_016446	ACT	2	6	251086	251091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037513
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3622	NC_016446	ACT	2	6	251116	251121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037513
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3624	NC_016446	AGA	2	6	251357	251362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037513
3625	NC_016446	CTCTT	2	10	251397	251406	0 %	60 %	0 %	40 %	360037513
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3744	NC_016446	TTGGG	2	10	259527	259536	0 %	40 %	60 %	0 %	360037521
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3844	NC_016446	TGAT	2	8	265997	266004	25 %	50 %	25 %	0 %	360037524
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3848	NC_016446	GTT	2	6	266096	266101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037524
3849	NC_016446	CATGAA	2	12	266235	266246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	360037524
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3852	NC_016446	A	6	6	266382	266387	100 %	0 %	0 %	0 %	360037524
3853	NC_016446	A	8	8	266394	266401	100 %	0 %	0 %	0 %	360037524
3854	NC_016446	TC	3	6	266402	266407	0 %	50 %	0 %	50 %	360037524
3855	NC_016446	TGC	2	6	266491	266496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037524
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3862	NC_016446	CCAT	2	8	267120	267127	25 %	25 %	0 %	50 %	360037525
3863	NC_016446	TGA	2	6	267177	267182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037525
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3989	NC_016446	GCC	2	6	273424	273429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037535
3990	NC_016446	TAA	2	6	273479	273484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037535
3991	NC_016446	CCA	2	6	273488	273493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037535
3992	NC_016446	ATC	2	6	273532	273537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037535
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