MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2123	NC_016446	AGA	2	6	156627	156632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037426
2124	NC_016446	GCA	2	6	156660	156665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037426
2125	NC_016446	TGAGTT	2	12	156687	156698	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360037426
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2151	NC_016446	A	6	6	158342	158347	100 %	0 %	0 %	0 %	360037427
2152	NC_016446	TAA	2	6	158386	158391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037427
2153	NC_016446	ATA	2	6	158421	158426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037427
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2156	NC_016446	TGT	2	6	158522	158527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037427
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2162	NC_016446	AAT	2	6	158955	158960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037428
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2227	NC_016446	CTT	2	6	163000	163005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037431
2228	NC_016446	TCA	2	6	163038	163043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037431
2229	NC_016446	TTG	2	6	163052	163057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037431
2230	NC_016446	CG	3	6	163161	163166	0 %	0 %	50 %	50 %	360037431
2231	NC_016446	GC	3	6	163177	163182	0 %	0 %	50 %	50 %	360037431
2232	NC_016446	GCC	2	6	163347	163352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037431
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2234	NC_016446	GAC	2	6	163447	163452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037431
2235	NC_016446	GGTT	2	8	163464	163471	0 %	50 %	50 %	0 %	360037431
2236	NC_016446	GAGC	2	8	163585	163592	25 %	0 %	50 %	25 %	360037431
2237	NC_016446	CA	3	6	163739	163744	50 %	0 %	0 %	50 %	360037431
2238	NC_016446	CAC	2	6	163753	163758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037431
2239	NC_016446	CTT	2	6	163843	163848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037431
2240	NC_016446	GTT	2	6	163898	163903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037431
2241	NC_016446	CAGC	2	8	164254	164261	25 %	0 %	25 %	50 %	360037432
2242	NC_016446	TTC	2	6	164334	164339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037432
2243	NC_016446	TCA	2	6	164342	164347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037432
2244	NC_016446	TTG	2	6	164436	164441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037432
2245	NC_016446	CAA	2	6	164499	164504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037432
2246	NC_016446	ATG	2	6	164670	164675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037432
2247	NC_016446	ATT	2	6	164676	164681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037432
2248	NC_016446	TGC	2	6	164992	164997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037432
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2352	NC_016446	GCTTG	2	10	170886	170895	0 %	40 %	40 %	20 %	360037434
2353	NC_016446	TTG	2	6	170912	170917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037434
2354	NC_016446	TTCGA	2	10	170931	170940	20 %	40 %	20 %	20 %	360037434
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2359	NC_016446	GA	3	6	171217	171222	50 %	0 %	50 %	0 %	360037435
2360	NC_016446	AAG	2	6	171273	171278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037435
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2362	NC_016446	A	6	6	171520	171525	100 %	0 %	0 %	0 %	360037435
2363	NC_016446	AAG	2	6	171561	171566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037435
2364	NC_016446	GGC	2	6	171572	171577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037435
2365	NC_016446	CAT	2	6	171590	171595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037435
2366	NC_016446	CTGA	2	8	171668	171675	25 %	25 %	25 %	25 %	360037435
2367	NC_016446	ACA	2	6	171904	171909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037436
2368	NC_016446	TTG	2	6	171952	171957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037436
2369	NC_016446	GAC	2	6	172052	172057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037436
2370	NC_016446	TCA	2	6	172062	172067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037436
2371	NC_016446	GTC	2	6	172109	172114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037436
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2373	NC_016446	TCT	2	6	172365	172370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037437
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2375	NC_016446	GGC	2	6	172415	172420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037437
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2379	NC_016446	TAC	2	6	172634	172639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037437
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2441	NC_016446	GC	3	6	176560	176565	0 %	0 %	50 %	50 %	360037442
2442	NC_016446	TCAA	2	8	176571	176578	50 %	25 %	0 %	25 %	360037442
2443	NC_016446	CGCAG	2	10	176742	176751	20 %	0 %	40 %	40 %	360037442
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2457	NC_016446	CTTGG	2	10	177469	177478	0 %	40 %	40 %	20 %	360037443
2458	NC_016446	AGT	2	6	177481	177486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037443
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2461	NC_016446	CCAA	2	8	177531	177538	50 %	0 %	0 %	50 %	360037443
2462	NC_016446	GCG	2	6	177564	177569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037443
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2468	NC_016446	GCG	2	6	177752	177757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037443
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2471	NC_016446	TG	3	6	177846	177851	0 %	50 %	50 %	0 %	360037443
2472	NC_016446	TGGC	2	8	177870	177877	0 %	25 %	50 %	25 %	360037443
2473	NC_016446	CA	3	6	177959	177964	50 %	0 %	0 %	50 %	360037443
2474	NC_016446	AAAC	2	8	177982	177989	75 %	0 %	0 %	25 %	360037443
2475	NC_016446	ATG	2	6	178002	178007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037443
2476	NC_016446	CTGAA	2	10	178036	178045	40 %	20 %	20 %	20 %	360037443
2477	NC_016446	CAAA	2	8	178061	178068	75 %	0 %	0 %	25 %	360037443
2478	NC_016446	TGA	2	6	178116	178121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037443
2479	NC_016446	TGC	2	6	178128	178133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037443
2480	NC_016446	TCA	2	6	178167	178172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037443
2481	NC_016446	AG	3	6	178256	178261	50 %	0 %	50 %	0 %	360037443
2482	NC_016446	AAC	2	6	178323	178328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037443
2483	NC_016446	ACC	2	6	178376	178381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037443
2484	NC_016446	T	7	7	178504	178510	0 %	100 %	0 %	0 %	360037443
2485	NC_016446	CAT	2	6	178544	178549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037443
2486	NC_016446	TGAA	2	8	178790	178797	50 %	25 %	25 %	0 %	360037444
2487	NC_016446	GTCA	2	8	178871	178878	25 %	25 %	25 %	25 %	360037445
2488	NC_016446	CTCA	2	8	178898	178905	25 %	25 %	0 %	50 %	360037445
2489	NC_016446	A	6	6	178938	178943	100 %	0 %	0 %	0 %	360037445
2490	NC_016446	AAAGC	2	10	179018	179027	60 %	0 %	20 %	20 %	360037445
2491	NC_016446	CAG	2	6	179045	179050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037445
2492	NC_016446	GTG	2	6	179085	179090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037445
2493	NC_016446	CGG	2	6	179118	179123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037445
2494	NC_016446	TCA	2	6	179142	179147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037445
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2497	NC_016446	CAT	2	6	179330	179335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037445
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2499	NC_016446	TGG	2	6	179505	179510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037445
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