MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016446	T	6	6	111067	111072	0 %	100 %	0 %	0 %	360037373
1502	NC_016446	AGT	2	6	111082	111087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037373
1503	NC_016446	TCGCAA	2	12	111115	111126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360037373
1504	NC_016446	TGA	2	6	112913	112918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037374
1505	NC_016446	CAA	3	9	112964	112972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037374
1506	NC_016446	AGA	2	6	113051	113056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037374
1507	NC_016446	TCA	2	6	113064	113069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037374
1508	NC_016446	TTA	2	6	113132	113137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037374
1509	NC_016446	TCTG	2	8	113148	113155	0 %	50 %	25 %	25 %	360037374
1510	NC_016446	CAT	2	6	113237	113242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037374
1511	NC_016446	AT	3	6	115190	115195	50 %	50 %	0 %	0 %	360037375
1512	NC_016446	ATG	2	6	115224	115229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037375
1513	NC_016446	AC	4	8	115301	115308	50 %	0 %	0 %	50 %	360037375
1514	NC_016446	CAA	2	6	115512	115517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037376
1515	NC_016446	TGA	2	6	115549	115554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037376
1516	NC_016446	GTGAT	2	10	115602	115611	20 %	40 %	40 %	0 %	360037376
1517	NC_016446	GTG	2	6	115668	115673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037376
1518	NC_016446	AAATG	2	10	115741	115750	60 %	20 %	20 %	0 %	360037376
1519	NC_016446	AAC	2	6	115776	115781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037376
1520	NC_016446	ATTT	2	8	115822	115829	25 %	75 %	0 %	0 %	360037376
1521	NC_016446	AGCTC	2	10	115839	115848	20 %	20 %	20 %	40 %	360037377
1522	NC_016446	TTG	2	6	115849	115854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037377
1523	NC_016446	AGC	2	6	115861	115866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037377
1524	NC_016446	CAT	2	6	115896	115901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037377
1525	NC_016446	ATG	2	6	115906	115911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037377
1526	NC_016446	CG	3	6	115985	115990	0 %	0 %	50 %	50 %	360037377
1527	NC_016446	CA	3	6	116104	116109	50 %	0 %	0 %	50 %	360037377
1528	NC_016446	CTA	2	6	116318	116323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037378
1529	NC_016446	TGGT	2	8	116441	116448	0 %	50 %	50 %	0 %	360037378
1530	NC_016446	ACA	2	6	116472	116477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037378
1531	NC_016446	TTTG	2	8	116577	116584	0 %	75 %	25 %	0 %	360037378
1532	NC_016446	TTGA	2	8	116587	116594	25 %	50 %	25 %	0 %	360037378
1533	NC_016446	TGT	2	6	116598	116603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037378
1534	NC_016446	GA	3	6	116640	116645	50 %	0 %	50 %	0 %	360037378
1535	NC_016446	ACA	2	6	116666	116671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037378
1536	NC_016446	GTC	2	6	117159	117164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037379
1537	NC_016446	TCA	2	6	117231	117236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037379
1538	NC_016446	ATG	2	6	117278	117283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037379
1539	NC_016446	ATGG	2	8	117334	117341	25 %	25 %	50 %	0 %	360037379
1540	NC_016446	TCG	2	6	117431	117436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037379
1541	NC_016446	TG	3	6	117441	117446	0 %	50 %	50 %	0 %	360037379
1542	NC_016446	TTC	2	6	117478	117483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037379
1543	NC_016446	AGT	2	6	117535	117540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037379
1544	NC_016446	TGAG	2	8	117551	117558	25 %	25 %	50 %	0 %	360037379
1545	NC_016446	GTTG	2	8	117645	117652	0 %	50 %	50 %	0 %	360037379
1546	NC_016446	TCG	2	6	117687	117692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037379
1547	NC_016446	TCA	2	6	117714	117719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037379
1548	NC_016446	CGC	2	6	117723	117728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037379
1549	NC_016446	ATTG	2	8	117741	117748	25 %	50 %	25 %	0 %	360037379
1550	NC_016446	AC	3	6	117759	117764	50 %	0 %	0 %	50 %	360037379
1551	NC_016446	TGC	2	6	117779	117784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037379
1552	NC_016446	ATG	2	6	117806	117811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037379
1553	NC_016446	CTG	2	6	117919	117924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037379
1554	NC_016446	GCG	2	6	117964	117969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037379
1555	NC_016446	TGA	2	6	118112	118117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037379
1556	NC_016446	TAT	2	6	118246	118251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037380
1557	NC_016446	AGT	2	6	118297	118302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037380
1558	NC_016446	GCC	2	6	118315	118320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037380
1559	NC_016446	TTG	2	6	118329	118334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037380
1560	NC_016446	TGG	2	6	118406	118411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037380
1561	NC_016446	AGA	2	6	118641	118646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037381
1562	NC_016446	TTG	2	6	118823	118828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037381
1563	NC_016446	GATGTT	2	12	118914	118925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	360037381
1564	NC_016446	AGCTT	2	10	118964	118973	20 %	40 %	20 %	20 %	360037381
1565	NC_016446	GAACA	2	10	118984	118993	60 %	0 %	20 %	20 %	360037381
1566	NC_016446	GTT	2	6	119041	119046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037381
1567	NC_016446	GGCG	2	8	119084	119091	0 %	0 %	75 %	25 %	360037381
1568	NC_016446	T	6	6	119097	119102	0 %	100 %	0 %	0 %	360037381
1569	NC_016446	TAG	2	6	119142	119147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037381
1570	NC_016446	GTC	2	6	119246	119251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037381
1571	NC_016446	AAACT	2	10	119267	119276	60 %	20 %	0 %	20 %	360037381
1572	NC_016446	TCA	2	6	119289	119294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037381
1573	NC_016446	ATC	2	6	119331	119336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037382
1574	NC_016446	GAT	2	6	119475	119480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037382
1575	NC_016446	GCT	2	6	119493	119498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037382
1576	NC_016446	CT	3	6	119719	119724	0 %	50 %	0 %	50 %	360037382
1577	NC_016446	GAT	2	6	119971	119976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037383
1578	NC_016446	A	6	6	119994	119999	100 %	0 %	0 %	0 %	360037383
1579	NC_016446	TTCAG	2	10	120002	120011	20 %	40 %	20 %	20 %	360037383
1580	NC_016446	GTG	2	6	120035	120040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037383
1581	NC_016446	CGC	2	6	120062	120067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037383
1582	NC_016446	GAAC	2	8	120080	120087	50 %	0 %	25 %	25 %	360037383
1583	NC_016446	CTT	2	6	120091	120096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037383
1584	NC_016446	CAAG	2	8	120100	120107	50 %	0 %	25 %	25 %	360037383
1585	NC_016446	GAA	2	6	120112	120117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037383
1586	NC_016446	GAA	2	6	120229	120234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037383
1587	NC_016446	GTT	2	6	120259	120264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037383
1588	NC_016446	AGA	2	6	120587	120592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037384
1589	NC_016446	TTG	2	6	120604	120609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037384
1590	NC_016446	TGCAAT	2	12	120627	120638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	360037384
1591	NC_016446	CAA	2	6	120648	120653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037384
1592	NC_016446	GAT	2	6	120709	120714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037384
1593	NC_016446	TGA	2	6	120780	120785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037384
1594	NC_016446	AAG	3	9	120860	120868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037385
1595	NC_016446	ACG	2	6	120921	120926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037385
1596	NC_016446	CGG	2	6	120951	120956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037385
1597	NC_016446	A	6	6	121043	121048	100 %	0 %	0 %	0 %	360037385
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1599	NC_016446	TGT	2	6	121259	121264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037386
1600	NC_016446	TTGG	2	8	121300	121307	0 %	50 %	50 %	0 %	360037386
1601	NC_016446	ACA	2	6	121370	121375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037386
1602	NC_016446	AGG	2	6	121376	121381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360037386
1603	NC_016446	TGT	2	6	121396	121401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037386
1604	NC_016446	TTG	2	6	121441	121446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037386
1605	NC_016446	CAT	2	6	121992	121997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037387
1606	NC_016446	GT	3	6	122100	122105	0 %	50 %	50 %	0 %	360037387
1607	NC_016446	GTT	2	6	122252	122257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037388
1608	NC_016446	TGA	2	6	122360	122365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037389
1609	NC_016446	GTTT	2	8	122369	122376	0 %	75 %	25 %	0 %	360037389
1610	NC_016446	CAA	2	6	122441	122446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037389
1611	NC_016446	ACA	2	6	122449	122454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037389
1612	NC_016446	TATC	2	8	122536	122543	25 %	50 %	0 %	25 %	360037389
1613	NC_016446	CTT	2	6	122592	122597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037389
1614	NC_016446	GAT	2	6	122658	122663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037389
1615	NC_016446	T	6	6	122712	122717	0 %	100 %	0 %	0 %	360037389
1616	NC_016446	TTG	2	6	122749	122754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037389
1617	NC_016446	TCA	2	6	122819	122824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037389
1618	NC_016446	TAC	2	6	122873	122878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037390
1619	NC_016446	TGC	2	6	122975	122980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037390
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1621	NC_016446	GGCG	2	8	123298	123305	0 %	0 %	75 %	25 %	360037391
1622	NC_016446	AGA	2	6	123345	123350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037391
1623	NC_016446	TTA	2	6	123391	123396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037391
1624	NC_016446	GGT	3	9	123532	123540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037391
1625	NC_016446	AAT	2	6	123558	123563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037391
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1634	NC_016446	GTTT	2	8	123861	123868	0 %	75 %	25 %	0 %	360037391
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1639	NC_016446	TTC	2	6	124256	124261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037392
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1646	NC_016446	AAT	2	6	124630	124635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037393
1647	NC_016446	AAG	2	6	124679	124684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037393
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1732	NC_016446	A	6	6	131945	131950	100 %	0 %	0 %	0 %	360037404
1733	NC_016446	TCA	2	6	132114	132119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037404
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1737	NC_016446	A	6	6	133037	133042	100 %	0 %	0 %	0 %	360037405
1738	NC_016446	GAT	2	6	133105	133110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037405
1739	NC_016446	TC	4	8	133149	133156	0 %	50 %	0 %	50 %	360037405
1740	NC_016446	TAC	2	6	133243	133248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037405
1741	NC_016446	ATT	2	6	133345	133350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037405
1742	NC_016446	GTA	2	6	133605	133610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037406
1743	NC_016446	ATT	2	6	133616	133621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037406
1744	NC_016446	ATA	2	6	133673	133678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037406
1745	NC_016446	T	7	7	133767	133773	0 %	100 %	0 %	0 %	360037406
1746	NC_016446	GCT	2	6	133778	133783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037406
1747	NC_016446	GA	3	6	133828	133833	50 %	0 %	50 %	0 %	360037406
1748	NC_016446	CTT	2	6	133836	133841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037406
1749	NC_016446	TGC	2	6	134008	134013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037407
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1753	NC_016446	GTT	2	6	134260	134265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037408
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1756	NC_016446	TGC	2	6	134423	134428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037408
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1762	NC_016446	ATG	2	6	134525	134530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037408
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1767	NC_016446	TTCAG	2	10	135116	135125	20 %	40 %	20 %	20 %	360037409
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1773	NC_016446	TGA	2	6	135314	135319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037409
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1803	NC_016446	GTTT	2	8	137914	137921	0 %	75 %	25 %	0 %	360037414
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1853	NC_016446	TAG	2	6	141022	141027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037415
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1860	NC_016446	TGA	2	6	141515	141520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037415
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1862	NC_016446	TTTGGT	2	12	141708	141719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037415
1863	NC_016446	ATCGC	2	10	141769	141778	20 %	20 %	20 %	40 %	360037415
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1866	NC_016446	AGC	2	6	141880	141885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037415
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1868	NC_016446	TAA	2	6	142037	142042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037415
1869	NC_016446	CGC	2	6	142143	142148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037415
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1871	NC_016446	GTGTG	2	10	142223	142232	0 %	40 %	60 %	0 %	360037415
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1889	NC_016446	GTG	2	6	143711	143716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037417
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1983	NC_016446	TTG	2	6	148940	148945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037422
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1986	NC_016446	CAA	2	6	149102	149107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037422
1987	NC_016446	C	6	6	149109	149114	0 %	0 %	0 %	100 %	360037422
1988	NC_016446	CTGG	2	8	149142	149149	0 %	25 %	50 %	25 %	360037422
1989	NC_016446	TTG	2	6	149222	149227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037422
1990	NC_016446	GCT	2	6	149287	149292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037422
1991	NC_016446	GCG	2	6	149322	149327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037422
1992	NC_016446	CTGT	2	8	149401	149408	0 %	50 %	25 %	25 %	360037422
1993	NC_016446	GCTT	2	8	149565	149572	0 %	50 %	25 %	25 %	360037422
1994	NC_016446	TGC	2	6	149586	149591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037422
1995	NC_016446	GATGT	2	10	149653	149662	20 %	40 %	40 %	0 %	360037422
1996	NC_016446	TCAT	2	8	149697	149704	25 %	50 %	0 %	25 %	360037422
1997	NC_016446	GCA	2	6	150063	150068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037423
1998	NC_016446	TGG	2	6	150083	150088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037423
1999	NC_016446	CCGG	2	8	150102	150109	0 %	0 %	50 %	50 %	360037423
2000	NC_016446	GAT	3	9	150259	150267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037423

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