MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016446	TTC	2	6	72021	72026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037313
1003	NC_016446	CAT	2	6	72055	72060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037313
1004	NC_016446	ATT	2	6	72080	72085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037313
1005	NC_016446	GTAG	2	8	72144	72151	25 %	25 %	50 %	0 %	360037313
1006	NC_016446	AGCA	2	8	72230	72237	50 %	0 %	25 %	25 %	360037313
1007	NC_016446	CCT	2	6	72452	72457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360037314
1008	NC_016446	ATA	2	6	72543	72548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037314
1009	NC_016446	AGC	2	6	72589	72594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037314
1010	NC_016446	TGT	2	6	72598	72603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037314
1011	NC_016446	CTG	2	6	72741	72746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037314
1012	NC_016446	TGC	2	6	72775	72780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037314
1013	NC_016446	TGCAT	2	10	72799	72808	20 %	40 %	20 %	20 %	360037314
1014	NC_016446	GA	3	6	72822	72827	50 %	0 %	50 %	0 %	360037314
1015	NC_016446	TTA	2	6	72849	72854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037314
1016	NC_016446	TGG	2	6	72864	72869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037314
1017	NC_016446	TGA	2	6	72931	72936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037314
1018	NC_016446	TCA	2	6	73012	73017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037314
1019	NC_016446	TGG	2	6	73042	73047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037314
1020	NC_016446	AAT	2	6	73303	73308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037315
1021	NC_016446	AAC	2	6	73334	73339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037315
1022	NC_016446	T	6	6	73369	73374	0 %	100 %	0 %	0 %	360037315
1023	NC_016446	AGAGT	2	10	73416	73425	40 %	20 %	40 %	0 %	360037315
1024	NC_016446	GTT	2	6	73778	73783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037317
1025	NC_016446	CTTT	2	8	73842	73849	0 %	75 %	0 %	25 %	360037316
1026	NC_016446	GT	3	6	73932	73937	0 %	50 %	50 %	0 %	360037316
1027	NC_016446	TG	3	6	73939	73944	0 %	50 %	50 %	0 %	360037316
1028	NC_016446	T	7	7	74211	74217	0 %	100 %	0 %	0 %	360037318
1029	NC_016446	ACA	2	6	74249	74254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037318
1030	NC_016446	CAA	2	6	74268	74273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037318
1031	NC_016446	TGA	2	6	74321	74326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037318
1032	NC_016446	ATG	2	6	74329	74334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037318
1033	NC_016446	TTC	2	6	74488	74493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037318
1034	NC_016446	TGGT	2	8	74531	74538	0 %	50 %	50 %	0 %	360037318
1035	NC_016446	GAA	2	6	74733	74738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037319
1036	NC_016446	TTG	2	6	74755	74760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037319
1037	NC_016446	ATC	2	6	74878	74883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037319
1038	NC_016446	TAAA	2	8	74893	74900	75 %	25 %	0 %	0 %	360037319
1039	NC_016446	GCT	2	6	74907	74912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037319
1040	NC_016446	CGT	2	6	74924	74929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037319
1041	NC_016446	GGC	2	6	74965	74970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037319
1042	NC_016446	TGA	2	6	75020	75025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037320
1043	NC_016446	CAC	2	6	75050	75055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037320
1044	NC_016446	AGT	2	6	75073	75078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037320
1045	NC_016446	TAA	2	6	75182	75187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037320
1046	NC_016446	CTG	2	6	75481	75486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037321
1047	NC_016446	AAC	2	6	75519	75524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037321
1048	NC_016446	ATC	2	6	75537	75542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037321
1049	NC_016446	ATG	2	6	75562	75567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037321
1050	NC_016446	GAT	2	6	75617	75622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037321
1051	NC_016446	TGC	2	6	75630	75635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037321
1052	NC_016446	T	6	6	75741	75746	0 %	100 %	0 %	0 %	360037321
1053	NC_016446	TAGG	2	8	75781	75788	25 %	25 %	50 %	0 %	360037321
1054	NC_016446	GGTG	2	8	75840	75847	0 %	25 %	75 %	0 %	360037321
1055	NC_016446	AGA	2	6	75855	75860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037321
1056	NC_016446	TTG	2	6	75871	75876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037321
1057	NC_016446	ATA	2	6	75891	75896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037321
1058	NC_016446	TGAAT	2	10	75929	75938	40 %	40 %	20 %	0 %	360037321
1059	NC_016446	AGA	2	6	75962	75967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037321
1060	NC_016446	TGCGT	2	10	76091	76100	0 %	40 %	40 %	20 %	360037322
1061	NC_016446	GGT	2	6	76112	76117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037322
1062	NC_016446	AAT	2	6	76256	76261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037323
1063	NC_016446	AGAGT	2	10	76369	76378	40 %	20 %	40 %	0 %	360037323
1064	NC_016446	TCT	2	6	76381	76386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037323
1065	NC_016446	A	6	6	76620	76625	100 %	0 %	0 %	0 %	360037324
1066	NC_016446	AAAG	2	8	76650	76657	75 %	0 %	25 %	0 %	360037324
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1068	NC_016446	TTATTT	2	12	76690	76701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	360037324
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1071	NC_016446	AAT	3	9	76752	76760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037324
1072	NC_016446	TAC	2	6	76770	76775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037324
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1077	NC_016446	CAA	2	6	77086	77091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037324
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1085	NC_016446	AAT	2	6	77642	77647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037325
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1091	NC_016446	TG	3	6	78086	78091	0 %	50 %	50 %	0 %	360037326
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1099	NC_016446	GAT	2	6	78397	78402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037326
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1109	NC_016446	A	6	6	79015	79020	100 %	0 %	0 %	0 %	360037328
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1112	NC_016446	CG	3	6	79105	79110	0 %	0 %	50 %	50 %	360037328
1113	NC_016446	GCT	2	6	79238	79243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037328
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1121	NC_016446	AACA	2	8	79710	79717	75 %	0 %	0 %	25 %	360037328
1122	NC_016446	GGC	2	6	80045	80050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037330
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1124	NC_016446	A	6	6	80056	80061	100 %	0 %	0 %	0 %	360037330
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1126	NC_016446	TGA	2	6	80120	80125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037330
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1500	NC_016446	CTGG	2	8	111056	111063	0 %	25 %	50 %	25 %	360037373

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