MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016446	ATC	2	6	304029	304034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037562
4502	NC_016446	ATG	2	6	304141	304146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037563
4503	NC_016446	CAA	2	6	304179	304184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037563
4504	NC_016446	TCG	2	6	304199	304204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037563
4505	NC_016446	CAC	2	6	304281	304286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
4506	NC_016446	CGG	2	6	304364	304369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037563
4507	NC_016446	TGC	2	6	304382	304387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037563
4508	NC_016446	A	6	6	304421	304426	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4509	NC_016446	CAA	2	6	304457	304462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037563
4510	NC_016446	CAC	2	6	304530	304535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
4511	NC_016446	CCA	2	6	304547	304552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
4512	NC_016446	TCG	2	6	304599	304604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037563
4513	NC_016446	GCC	2	6	304678	304683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037563
4514	NC_016446	AAT	2	6	304698	304703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037563
4515	NC_016446	A	6	6	304787	304792	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4516	NC_016446	TAAA	2	8	304828	304835	75 %	25 %	0 %	0 %	360037563
4517	NC_016446	A	7	7	304833	304839	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4518	NC_016446	T	6	6	304877	304882	0 %	100 %	0 %	0 %	360037563
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4520	NC_016446	ATTG	2	8	304916	304923	25 %	50 %	25 %	0 %	360037563
4521	NC_016446	AC	3	6	304931	304936	50 %	0 %	0 %	50 %	360037563
4522	NC_016446	CCA	2	6	304958	304963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
4523	NC_016446	TGA	2	6	305009	305014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037563
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4525	NC_016446	CTG	2	6	305102	305107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037563
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4528	NC_016446	CAA	2	6	305195	305200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037563
4529	NC_016446	A	6	6	305363	305368	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4530	NC_016446	A	6	6	305376	305381	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4531	NC_016446	A	7	7	305392	305398	100 %	0 %	0 %	0 %	360037563
4532	NC_016446	ATGT	2	8	305488	305495	25 %	50 %	25 %	0 %	360037563
4533	NC_016446	ACC	2	6	305522	305527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
4534	NC_016446	CCA	2	6	305539	305544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037563
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4541	NC_016446	GCC	2	6	306038	306043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037565
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4544	NC_016446	TACG	2	8	306101	306108	25 %	25 %	25 %	25 %	360037565
4545	NC_016446	CGG	2	6	306268	306273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037565
4546	NC_016446	ATG	2	6	306290	306295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037565
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4549	NC_016446	TAATGG	2	12	306453	306464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037565
4550	NC_016446	TGG	2	6	306523	306528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037565
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4553	NC_016446	A	6	6	306644	306649	100 %	0 %	0 %	0 %	360037565
4554	NC_016446	CAC	2	6	306757	306762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037565
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4557	NC_016446	TCT	2	6	306810	306815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037565
4558	NC_016446	CAT	2	6	306916	306921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037565
4559	NC_016446	TGA	2	6	306954	306959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037565
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4561	NC_016446	TGC	2	6	307078	307083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037565
4562	NC_016446	CGG	2	6	307093	307098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037565
4563	NC_016446	ATT	2	6	307103	307108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037565
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4565	NC_016446	TGGC	2	8	307197	307204	0 %	25 %	50 %	25 %	360037565
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4574	NC_016446	CGT	2	6	307595	307600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037566
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4593	NC_016446	A	6	6	308765	308770	100 %	0 %	0 %	0 %	360037568
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4605	NC_016446	CGAC	2	8	309956	309963	25 %	0 %	25 %	50 %	360037569
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4620	NC_016446	TGAT	2	8	310472	310479	25 %	50 %	25 %	0 %	360037570
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4623	NC_016446	TGA	2	6	310637	310642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037570
4624	NC_016446	GGT	2	6	310768	310773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037570
4625	NC_016446	AGT	2	6	310775	310780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037570
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4653	NC_016446	TGAT	2	8	312074	312081	25 %	50 %	25 %	0 %	360037570
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4731	NC_016446	AGC	2	6	316585	316590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037576
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4733	NC_016446	TG	3	6	316631	316636	0 %	50 %	50 %	0 %	360037576
4734	NC_016446	CA	3	6	316656	316661	50 %	0 %	0 %	50 %	360037576
4735	NC_016446	CATG	2	8	316672	316679	25 %	25 %	25 %	25 %	360037576
4736	NC_016446	T	6	6	316730	316735	0 %	100 %	0 %	0 %	360037577
4737	NC_016446	TCA	2	6	316766	316771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037577
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4740	NC_016446	ATA	2	6	316998	317003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037578
4741	NC_016446	TCA	2	6	317005	317010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037578
4742	NC_016446	TGC	2	6	317026	317031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037578
4743	NC_016446	CTTG	2	8	317043	317050	0 %	50 %	25 %	25 %	360037578
4744	NC_016446	CGCAAT	2	12	317072	317083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360037578
4745	NC_016446	CGC	2	6	317105	317110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037578
4746	NC_016446	TGG	2	6	317154	317159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037578
4747	NC_016446	CA	3	6	317173	317178	50 %	0 %	0 %	50 %	360037578
4748	NC_016446	TCT	2	6	317286	317291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037578
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4751	NC_016446	ATG	3	9	317543	317551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037578
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4753	NC_016446	CGC	2	6	317747	317752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037578
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4755	NC_016446	TGG	2	6	317808	317813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037578
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4757	NC_016446	TGC	2	6	317883	317888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037578
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4760	NC_016446	CTCCA	2	10	318000	318009	20 %	20 %	0 %	60 %	360037578
4761	NC_016446	TGAT	2	8	318054	318061	25 %	50 %	25 %	0 %	360037578
4762	NC_016446	ATC	2	6	318062	318067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037578
4763	NC_016446	ACCG	2	8	318071	318078	25 %	0 %	25 %	50 %	360037578
4764	NC_016446	A	7	7	318100	318106	100 %	0 %	0 %	0 %	360037578
4765	NC_016446	TGCC	2	8	318107	318114	0 %	25 %	25 %	50 %	360037578
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4778	NC_016446	GTTTGG	2	12	319131	319142	0 %	50 %	50 %	0 %	360037580
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4987	NC_016446	GTT	2	6	330338	330343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037588
4988	NC_016446	ACC	2	6	330345	330350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037588
4989	NC_016446	CTT	3	9	330364	330372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037588
4990	NC_016446	GTA	2	6	330500	330505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037588
4991	NC_016446	TGC	2	6	331278	331283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037589
4992	NC_016446	AATCGA	2	12	331347	331358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	360037589
4993	NC_016446	ATGGCG	2	12	331390	331401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360037589
4994	NC_016446	TCA	2	6	331448	331453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037589
4995	NC_016446	AAT	2	6	331494	331499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360037589
4996	NC_016446	CTG	2	6	331530	331535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037589
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4998	NC_016446	GCA	2	6	331615	331620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037589
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