MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_016445	GCGCC	2	10	2002277	2002286	0 %	0 %	40 %	60 %	360036245
34003	NC_016445	CGTC	2	8	2002392	2002399	0 %	25 %	25 %	50 %	360036245
34004	NC_016445	CGT	2	6	2002451	2002456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036245
34005	NC_016445	GTC	2	6	2002489	2002494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036245
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34010	NC_016445	TCC	2	6	2002675	2002680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036245
34011	NC_016445	CAA	2	6	2002686	2002691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036245
34012	NC_016445	CAT	2	6	2002724	2002729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036245
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34019	NC_016445	GCTG	2	8	2003204	2003211	0 %	25 %	50 %	25 %	360036245
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34041	NC_016445	CGTCAA	2	12	2004347	2004358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036245
34042	NC_016445	CATCG	2	10	2004386	2004395	20 %	20 %	20 %	40 %	360036245
34043	NC_016445	GTA	2	6	2004420	2004425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036245
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34220	NC_016445	TCG	2	6	2014264	2014269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036250
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34226	NC_016445	GCGG	2	8	2014643	2014650	0 %	0 %	75 %	25 %	360036251
34227	NC_016445	TGGC	2	8	2014749	2014756	0 %	25 %	50 %	25 %	360036251
34228	NC_016445	CGC	2	6	2014762	2014767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036251
34229	NC_016445	CGA	2	6	2014777	2014782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036251
34230	NC_016445	TGA	2	6	2014788	2014793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036251
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34232	NC_016445	GTT	2	6	2014919	2014924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036251
34233	NC_016445	TGG	2	6	2014986	2014991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036251
34234	NC_016445	CG	3	6	2014994	2014999	0 %	0 %	50 %	50 %	360036251
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34239	NC_016445	CTG	2	6	2015255	2015260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036252
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34244	NC_016445	GCT	3	9	2015404	2015412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036252
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34312	NC_016445	GA	3	6	2019889	2019894	50 %	0 %	50 %	0 %	360036257
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34333	NC_016445	A	6	6	2020745	2020750	100 %	0 %	0 %	0 %	360036257
34334	NC_016445	ATGA	2	8	2020771	2020778	50 %	25 %	25 %	0 %	360036258
34335	NC_016445	TAC	2	6	2020867	2020872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036258
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34340	NC_016445	ATT	2	6	2021038	2021043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036258
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34342	NC_016445	TTTC	2	8	2021101	2021108	0 %	75 %	0 %	25 %	360036258
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34468	NC_016445	ATC	2	6	2027671	2027676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036263
34469	NC_016445	AC	3	6	2027882	2027887	50 %	0 %	0 %	50 %	360036263
34470	NC_016445	TCT	2	6	2027911	2027916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036263
34471	NC_016445	CCA	2	6	2027960	2027965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036263
34472	NC_016445	GCC	2	6	2028051	2028056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036263
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34474	NC_016445	TGG	2	6	2028098	2028103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036263
34475	NC_016445	CTTTCG	2	12	2028146	2028157	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	360036263
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34480	NC_016445	TAAG	2	8	2028421	2028428	50 %	25 %	25 %	0 %	360036263
34481	NC_016445	AAG	2	6	2028449	2028454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036263
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34483	NC_016445	A	7	7	2028872	2028878	100 %	0 %	0 %	0 %	360036264
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34487	NC_016445	AGCTT	2	10	2028979	2028988	20 %	40 %	20 %	20 %	360036264
34488	NC_016445	CGG	2	6	2029116	2029121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036265
34489	NC_016445	GGC	2	6	2029141	2029146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036265
34490	NC_016445	ATG	2	6	2029244	2029249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036265
34491	NC_016445	CG	3	6	2029313	2029318	0 %	0 %	50 %	50 %	360036265
34492	NC_016445	GAT	2	6	2029413	2029418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036265
34493	NC_016445	AGT	2	6	2029443	2029448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036265
34494	NC_016445	GGC	2	6	2029462	2029467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036265
34495	NC_016445	CAG	2	6	2029474	2029479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036265
34496	NC_016445	TCT	2	6	2029533	2029538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036265
34497	NC_016445	TGC	2	6	2029540	2029545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036265
34498	NC_016445	T	6	6	2029600	2029605	0 %	100 %	0 %	0 %	360036265
34499	NC_016445	TGC	2	6	2029610	2029615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036265
34500	NC_016445	CA	3	6	2029617	2029622	50 %	0 %	0 %	50 %	360036265

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