MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016445	TGC	2	6	115457	115462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034503
2003	NC_016445	GAA	2	6	115476	115481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034503
2004	NC_016445	AACT	2	8	115486	115493	50 %	25 %	0 %	25 %	360034503
2005	NC_016445	AG	3	6	115555	115560	50 %	0 %	50 %	0 %	360034504
2006	NC_016445	GCC	2	6	115570	115575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034504
2007	NC_016445	GCC	2	6	115780	115785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034504
2008	NC_016445	CAGC	2	8	115802	115809	25 %	0 %	25 %	50 %	360034504
2009	NC_016445	TGA	2	6	115899	115904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034504
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2012	NC_016445	TCA	2	6	116074	116079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034504
2013	NC_016445	TGA	2	6	116100	116105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034504
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2123	NC_016445	TGGG	2	8	122708	122715	0 %	25 %	75 %	0 %	360034506
2124	NC_016445	ACT	2	6	122770	122775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034506
2125	NC_016445	TCG	2	6	122798	122803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034506
2126	NC_016445	TACA	2	8	122807	122814	50 %	25 %	0 %	25 %	360034506
2127	NC_016445	T	7	7	122832	122838	0 %	100 %	0 %	0 %	360034506
2128	NC_016445	AAC	2	6	122857	122862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034506
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2130	NC_016445	TTG	2	6	123073	123078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034506
2131	NC_016445	GCC	2	6	123125	123130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034506
2132	NC_016445	TCGT	2	8	123175	123182	0 %	50 %	25 %	25 %	360034506
2133	NC_016445	TAC	2	6	123194	123199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034506
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2135	NC_016445	A	6	6	123292	123297	100 %	0 %	0 %	0 %	360034506
2136	NC_016445	AGC	2	6	123310	123315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034506
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2143	NC_016445	GAT	2	6	123693	123698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034507
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2151	NC_016445	TCG	2	6	123979	123984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034507
2152	NC_016445	AGAT	2	8	123985	123992	50 %	25 %	25 %	0 %	360034507
2153	NC_016445	ACG	2	6	124096	124101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034507
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2156	NC_016445	CATC	2	8	124192	124199	25 %	25 %	0 %	50 %	360034507
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2164	NC_016445	AAG	2	6	125010	125015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034508
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2236	NC_016445	GATG	2	8	129186	129193	25 %	25 %	50 %	0 %	360034510
2237	NC_016445	GCA	2	6	129201	129206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034510
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2241	NC_016445	GGA	2	6	129324	129329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034510
2242	NC_016445	TTA	2	6	129355	129360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034510
2243	NC_016445	GCA	2	6	129451	129456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034510
2244	NC_016445	CAT	2	6	129472	129477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034511
2245	NC_016445	TCTG	3	12	129478	129489	0 %	50 %	25 %	25 %	360034511
2246	NC_016445	ACA	2	6	129496	129501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034511
2247	NC_016445	GCTC	2	8	129519	129526	0 %	25 %	25 %	50 %	360034511
2248	NC_016445	GCA	2	6	129531	129536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034511
2249	NC_016445	ACT	2	6	129620	129625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034511
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2254	NC_016445	ACG	2	6	129922	129927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034511
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2264	NC_016445	AGA	2	6	130321	130326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034512
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2273	NC_016445	CTT	2	6	130806	130811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034513
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2275	NC_016445	ATGA	2	8	130853	130860	50 %	25 %	25 %	0 %	360034513
2276	NC_016445	ATC	2	6	130864	130869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034513
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2281	NC_016445	CAG	2	6	131142	131147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034513
2282	NC_016445	TCA	2	6	131159	131164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034513
2283	NC_016445	GT	4	8	131174	131181	0 %	50 %	50 %	0 %	360034513
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2285	NC_016445	A	6	6	131326	131331	100 %	0 %	0 %	0 %	360034514
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2350	NC_016445	TGG	2	6	135522	135527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034520
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2355	NC_016445	CTGA	2	8	135947	135954	25 %	25 %	25 %	25 %	360034521
2356	NC_016445	GAA	2	6	136006	136011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034521
2357	NC_016445	GT	3	6	136023	136028	0 %	50 %	50 %	0 %	360034521
2358	NC_016445	AGC	2	6	136130	136135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2359	NC_016445	GTC	2	6	136207	136212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2360	NC_016445	AAAGAG	2	12	136316	136327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034521
2361	NC_016445	TGC	2	6	136351	136356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2362	NC_016445	ATT	2	6	136411	136416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034521
2363	NC_016445	AGC	2	6	136469	136474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034521
2364	NC_016445	ATTTCT	2	12	136495	136506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	360034521
2365	NC_016445	TAC	2	6	136514	136519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034521
2366	NC_016445	TGA	2	6	136603	136608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034521
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2368	NC_016445	AAC	2	6	136656	136661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034521
2369	NC_016445	ATTT	2	8	136771	136778	25 %	75 %	0 %	0 %	360034522
2370	NC_016445	GA	3	6	136781	136786	50 %	0 %	50 %	0 %	360034522
2371	NC_016445	ACAG	2	8	136884	136891	50 %	0 %	25 %	25 %	360034522
2372	NC_016445	ATA	2	6	136930	136935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034522
2373	NC_016445	TGA	2	6	136940	136945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034522
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2380	NC_016445	TGG	2	6	137206	137211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034522
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2384	NC_016445	TGA	2	6	137570	137575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034522
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2386	NC_016445	ATG	2	6	137934	137939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034523
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2475	NC_016445	GAC	2	6	143145	143150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034528
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2479	NC_016445	T	6	6	143345	143350	0 %	100 %	0 %	0 %	360034528
2480	NC_016445	GCT	2	6	143411	143416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034528
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2483	NC_016445	GCG	2	6	143540	143545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034528
2484	NC_016445	TTC	2	6	143663	143668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034528
2485	NC_016445	CCGGTG	2	12	143742	143753	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	360034528
2486	NC_016445	CTG	2	6	143788	143793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034528
2487	NC_016445	T	6	6	143824	143829	0 %	100 %	0 %	0 %	360034529
2488	NC_016445	TATC	2	8	143852	143859	25 %	50 %	0 %	25 %	360034529
2489	NC_016445	ACA	2	6	143925	143930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034529
2490	NC_016445	TGC	2	6	143945	143950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2491	NC_016445	AG	3	6	144126	144131	50 %	0 %	50 %	0 %	360034529
2492	NC_016445	TCGC	2	8	144168	144175	0 %	25 %	25 %	50 %	360034529
2493	NC_016445	GGCA	2	8	144378	144385	25 %	0 %	50 %	25 %	360034529
2494	NC_016445	TTGGA	2	10	144447	144456	20 %	40 %	40 %	0 %	360034529
2495	NC_016445	ACT	2	6	144470	144475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034529
2496	NC_016445	GTCTG	2	10	144607	144616	0 %	40 %	40 %	20 %	360034529
2497	NC_016445	CCA	2	6	144634	144639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034529
2498	NC_016445	GTG	2	6	144770	144775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
2499	NC_016445	CCAA	2	8	144808	144815	50 %	0 %	0 %	50 %	360034529
2500	NC_016445	GGT	2	6	144816	144821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529

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