MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016445	CAG	2	6	82796	82801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034474
1502	NC_016445	GTC	2	6	82809	82814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034474
1503	NC_016445	ACC	2	6	82917	82922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034474
1504	NC_016445	TCA	2	6	83038	83043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034474
1505	NC_016445	GGT	2	6	83099	83104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034474
1506	NC_016445	ATT	2	6	83126	83131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034474
1507	NC_016445	TGCTC	2	10	83203	83212	0 %	40 %	20 %	40 %	360034474
1508	NC_016445	GCTT	2	8	83289	83296	0 %	50 %	25 %	25 %	360034474
1509	NC_016445	GAAT	2	8	83307	83314	50 %	25 %	25 %	0 %	360034474
1510	NC_016445	TTG	2	6	83536	83541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034475
1511	NC_016445	ATC	2	6	83593	83598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034475
1512	NC_016445	GCC	2	6	83611	83616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034475
1513	NC_016445	CAG	2	6	84077	84082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034476
1514	NC_016445	ACG	2	6	84148	84153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034476
1515	NC_016445	GAA	2	6	84161	84166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034476
1516	NC_016445	GGA	2	6	84240	84245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034476
1517	NC_016445	GAA	2	6	84252	84257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034476
1518	NC_016445	GAC	2	6	84409	84414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1519	NC_016445	ACA	2	6	84428	84433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034477
1520	NC_016445	A	7	7	84454	84460	100 %	0 %	0 %	0 %	360034477
1521	NC_016445	AT	3	6	84499	84504	50 %	50 %	0 %	0 %	360034477
1522	NC_016445	ATT	2	6	84545	84550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034477
1523	NC_016445	CGG	2	6	84565	84570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034477
1524	NC_016445	A	6	6	84659	84664	100 %	0 %	0 %	0 %	360034477
1525	NC_016445	TTCAT	2	10	84703	84712	20 %	60 %	0 %	20 %	360034477
1526	NC_016445	TGC	2	6	84718	84723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1527	NC_016445	CTCGT	2	10	84778	84787	0 %	40 %	20 %	40 %	360034477
1528	NC_016445	AGTTG	2	10	84802	84811	20 %	40 %	40 %	0 %	360034477
1529	NC_016445	CGA	2	6	84814	84819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1530	NC_016445	TAG	2	6	84832	84837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034477
1531	NC_016445	A	6	6	84900	84905	100 %	0 %	0 %	0 %	360034477
1532	NC_016445	GGA	2	6	84928	84933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034477
1533	NC_016445	TTGG	2	8	84948	84955	0 %	50 %	50 %	0 %	360034477
1534	NC_016445	T	6	6	84966	84971	0 %	100 %	0 %	0 %	360034477
1535	NC_016445	GTT	2	6	85024	85029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034477
1536	NC_016445	AT	3	6	85056	85061	50 %	50 %	0 %	0 %	360034477
1537	NC_016445	A	7	7	85087	85093	100 %	0 %	0 %	0 %	360034477
1538	NC_016445	ATT	2	6	85116	85121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034477
1539	NC_016445	T	6	6	85183	85188	0 %	100 %	0 %	0 %	360034477
1540	NC_016445	AT	3	6	85198	85203	50 %	50 %	0 %	0 %	360034477
1541	NC_016445	TGC	2	6	85299	85304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1542	NC_016445	CAA	2	6	85318	85323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034477
1543	NC_016445	GAA	2	6	85385	85390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034477
1544	NC_016445	GAA	2	6	85456	85461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034477
1545	NC_016445	CAG	2	6	85491	85496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1546	NC_016445	CAAA	2	8	85520	85527	75 %	0 %	0 %	25 %	360034477
1547	NC_016445	GATA	2	8	85582	85589	50 %	25 %	25 %	0 %	360034477
1548	NC_016445	TA	3	6	85667	85672	50 %	50 %	0 %	0 %	360034477
1549	NC_016445	AAG	2	6	85749	85754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034477
1550	NC_016445	TAT	2	6	85780	85785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034477
1551	NC_016445	GTT	2	6	85801	85806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034477
1552	NC_016445	AAG	2	6	86010	86015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034477
1553	NC_016445	TTA	2	6	86019	86024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034477
1554	NC_016445	ATG	2	6	86130	86135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034477
1555	NC_016445	TGT	2	6	86152	86157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034477
1556	NC_016445	TTG	2	6	86160	86165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034477
1557	NC_016445	GCG	2	6	86229	86234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034477
1558	NC_016445	TTA	2	6	86327	86332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034477
1559	NC_016445	CT	4	8	86406	86413	0 %	50 %	0 %	50 %	360034477
1560	NC_016445	CGT	2	6	86418	86423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034477
1561	NC_016445	GAT	2	6	86597	86602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034478
1562	NC_016445	GTT	2	6	86611	86616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034478
1563	NC_016445	CGT	2	6	86626	86631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034478
1564	NC_016445	T	6	6	86687	86692	0 %	100 %	0 %	0 %	360034478
1565	NC_016445	ATC	2	6	86703	86708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034478
1566	NC_016445	CTT	2	6	86719	86724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034478
1567	NC_016445	CGT	2	6	86726	86731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034478
1568	NC_016445	CTT	2	6	86869	86874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034478
1569	NC_016445	AAGT	2	8	86892	86899	50 %	25 %	25 %	0 %	360034478
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1572	NC_016445	T	6	6	87210	87215	0 %	100 %	0 %	0 %	360034478
1573	NC_016445	TCA	2	6	87255	87260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034478
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1585	NC_016445	GCA	2	6	88278	88283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034480
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1588	NC_016445	GAC	3	9	88520	88528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034480
1589	NC_016445	CTT	2	6	88534	88539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034480
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1591	NC_016445	GTA	2	6	88600	88605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034480
1592	NC_016445	TGC	2	6	88627	88632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034480
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1594	NC_016445	TGG	2	6	88795	88800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034480
1595	NC_016445	CAG	2	6	88843	88848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034480
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1599	NC_016445	TTGGT	2	10	89522	89531	0 %	60 %	40 %	0 %	360034481
1600	NC_016445	TGA	2	6	89622	89627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034481
1601	NC_016445	GA	3	6	89654	89659	50 %	0 %	50 %	0 %	360034481
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1608	NC_016445	CT	3	6	90545	90550	0 %	50 %	0 %	50 %	360034482
1609	NC_016445	TTCT	2	8	90556	90563	0 %	75 %	0 %	25 %	360034482
1610	NC_016445	CAT	2	6	90679	90684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034482
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1620	NC_016445	AAAG	2	8	91661	91668	75 %	0 %	25 %	0 %	360034483
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1624	NC_016445	TTAA	2	8	91821	91828	50 %	50 %	0 %	0 %	360034483
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1751	NC_016445	GGA	2	6	99559	99564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034488
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1753	NC_016445	CGG	2	6	99648	99653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034488
1754	NC_016445	GGC	2	6	99817	99822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034489
1755	NC_016445	CGGGAT	2	12	99836	99847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360034489
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1991	NC_016445	TTA	2	6	114953	114958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034503
1992	NC_016445	AGTT	2	8	114961	114968	25 %	50 %	25 %	0 %	360034503
1993	NC_016445	GCT	2	6	115026	115031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034503
1994	NC_016445	AGT	2	6	115118	115123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034503
1995	NC_016445	TC	4	8	115173	115180	0 %	50 %	0 %	50 %	360034503
1996	NC_016445	GCT	2	6	115226	115231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034503
1997	NC_016445	AGT	2	6	115242	115247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034503
1998	NC_016445	AGA	2	6	115256	115261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034503
1999	NC_016445	TGG	2	6	115316	115321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034503
2000	NC_016445	AAC	2	6	115366	115371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034503

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