MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016445	CAG	2	6	54712	54717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034449
1003	NC_016445	AAG	2	6	54802	54807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034449
1004	NC_016445	CAGA	2	8	54892	54899	50 %	0 %	25 %	25 %	360034449
1005	NC_016445	GTTT	2	8	54938	54945	0 %	75 %	25 %	0 %	360034449
1006	NC_016445	ACA	2	6	54951	54956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034449
1007	NC_016445	GCTT	2	8	54998	55005	0 %	50 %	25 %	25 %	360034449
1008	NC_016445	TGT	2	6	55045	55050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034449
1009	NC_016445	T	6	6	55072	55077	0 %	100 %	0 %	0 %	360034449
1010	NC_016445	TGT	2	6	55213	55218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034449
1011	NC_016445	TAG	2	6	55243	55248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034449
1012	NC_016445	AAG	2	6	55308	55313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034449
1013	NC_016445	CCA	2	6	55380	55385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034449
1014	NC_016445	GCA	2	6	55479	55484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034449
1015	NC_016445	ATG	2	6	56071	56076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034450
1016	NC_016445	GTG	2	6	56099	56104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034450
1017	NC_016445	GAA	2	6	56119	56124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034450
1018	NC_016445	TGC	2	6	56217	56222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034450
1019	NC_016445	ACGGTG	2	12	56341	56352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360034450
1020	NC_016445	CGA	2	6	56367	56372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034450
1021	NC_016445	AGA	2	6	56375	56380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034450
1022	NC_016445	TGA	3	9	56397	56405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034450
1023	NC_016445	ATT	2	6	56623	56628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034451
1024	NC_016445	CAACA	2	10	56852	56861	60 %	0 %	0 %	40 %	360034451
1025	NC_016445	TG	3	6	56872	56877	0 %	50 %	50 %	0 %	360034451
1026	NC_016445	TGC	2	6	56892	56897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034451
1027	NC_016445	TGTT	2	8	56901	56908	0 %	75 %	25 %	0 %	360034451
1028	NC_016445	GAC	2	6	57094	57099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034452
1029	NC_016445	AGA	2	6	57119	57124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034452
1030	NC_016445	AGA	2	6	57156	57161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034452
1031	NC_016445	ACT	2	6	57180	57185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034452
1032	NC_016445	TGG	2	6	57225	57230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034452
1033	NC_016445	AGT	2	6	57252	57257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034452
1034	NC_016445	TCTT	2	8	57319	57326	0 %	75 %	0 %	25 %	360034452
1035	NC_016445	TCGA	2	8	57368	57375	25 %	25 %	25 %	25 %	360034452
1036	NC_016445	CCAG	2	8	57378	57385	25 %	0 %	25 %	50 %	360034452
1037	NC_016445	TGA	2	6	57552	57557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034452
1038	NC_016445	CTC	2	6	57612	57617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034452
1039	NC_016445	A	6	6	57784	57789	100 %	0 %	0 %	0 %	360034453
1040	NC_016445	CAA	2	6	57931	57936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034453
1041	NC_016445	CGT	2	6	57956	57961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034453
1042	NC_016445	GGC	2	6	57965	57970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034453
1043	NC_016445	CTC	2	6	58010	58015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034453
1044	NC_016445	ATCA	2	8	58025	58032	50 %	25 %	0 %	25 %	360034453
1045	NC_016445	CCT	2	6	58055	58060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034453
1046	NC_016445	ATTG	2	8	58114	58121	25 %	50 %	25 %	0 %	360034453
1047	NC_016445	TCT	2	6	58131	58136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034453
1048	NC_016445	GGTGGC	2	12	58154	58165	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	360034453
1049	NC_016445	ATG	2	6	58202	58207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1050	NC_016445	TGA	2	6	58252	58257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1051	NC_016445	AGA	2	6	58264	58269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034453
1052	NC_016445	GGT	2	6	58322	58327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034453
1053	NC_016445	TGGT	2	8	58350	58357	0 %	50 %	50 %	0 %	360034453
1054	NC_016445	CCT	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034453
1055	NC_016445	CTTG	2	8	58378	58385	0 %	50 %	25 %	25 %	360034453
1056	NC_016445	TGTCGG	2	12	58456	58467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360034453
1057	NC_016445	GAA	2	6	58501	58506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034453
1058	NC_016445	TAT	2	6	58519	58524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034453
1059	NC_016445	TGA	2	6	58531	58536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1060	NC_016445	GTC	2	6	58551	58556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034453
1061	NC_016445	TGG	3	9	58573	58581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034453
1062	NC_016445	GATG	2	8	58624	58631	25 %	25 %	50 %	0 %	360034453
1063	NC_016445	ATT	2	6	58652	58657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034453
1064	NC_016445	CAAC	2	8	58668	58675	50 %	0 %	0 %	50 %	360034453
1065	NC_016445	TGC	2	6	58701	58706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034453
1066	NC_016445	ATG	2	6	58806	58811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1067	NC_016445	CAT	2	6	58818	58823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034453
1068	NC_016445	GCG	2	6	58883	58888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034453
1069	NC_016445	TGC	2	6	58894	58899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034453
1070	NC_016445	CAA	2	6	58906	58911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034453
1071	NC_016445	ATG	2	6	58958	58963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1072	NC_016445	GTA	2	6	59039	59044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
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1074	NC_016445	TGT	2	6	59328	59333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034453
1075	NC_016445	TGA	2	6	59395	59400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
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1078	NC_016445	ATA	2	6	59478	59483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034453
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1080	NC_016445	TGA	2	6	59514	59519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
1081	NC_016445	TGA	2	6	59548	59553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
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1084	NC_016445	CAG	2	6	59667	59672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034453
1085	NC_016445	A	6	6	59708	59713	100 %	0 %	0 %	0 %	360034453
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1089	NC_016445	ATT	2	6	59954	59959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034454
1090	NC_016445	AGA	2	6	60007	60012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034454
1091	NC_016445	ATG	2	6	60141	60146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034454
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1093	NC_016445	TAT	2	6	60208	60213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034454
1094	NC_016445	ACT	2	6	60255	60260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034454
1095	NC_016445	ATT	2	6	60266	60271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034454
1096	NC_016445	GGTTTT	2	12	60356	60367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034454
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1098	NC_016445	ATG	2	6	60567	60572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034454
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1102	NC_016445	TAC	2	6	60972	60977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034455
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1104	NC_016445	TGG	2	6	61108	61113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034455
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1110	NC_016445	ATT	2	6	61449	61454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034455
1111	NC_016445	GTT	2	6	61494	61499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034455
1112	NC_016445	TGA	2	6	61507	61512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034455
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1124	NC_016445	AAGT	2	8	63177	63184	50 %	25 %	25 %	0 %	360034457
1125	NC_016445	AGTG	2	8	63190	63197	25 %	25 %	50 %	0 %	360034457
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1153	NC_016445	GCT	2	6	64663	64668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034458
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1229	NC_016445	ATG	2	6	68035	68040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034460
1230	NC_016445	CTA	2	6	68085	68090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034460
1231	NC_016445	ACA	2	6	68093	68098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034460
1232	NC_016445	TGA	2	6	68181	68186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034460
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1236	NC_016445	GCT	2	6	68516	68521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034461
1237	NC_016445	TCCA	2	8	68561	68568	25 %	25 %	0 %	50 %	360034461
1238	NC_016445	GTC	2	6	68593	68598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034461
1239	NC_016445	GC	3	6	68643	68648	0 %	0 %	50 %	50 %	360034461
1240	NC_016445	TGA	2	6	68690	68695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034461
1241	NC_016445	GAT	2	6	68748	68753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034461
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1243	NC_016445	TGA	2	6	68974	68979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034461
1244	NC_016445	GGC	2	6	69048	69053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034461
1245	NC_016445	TTGGCG	2	12	69070	69081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360034461
1246	NC_016445	TGG	2	6	69118	69123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034461
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1248	NC_016445	ACTG	2	8	69371	69378	25 %	25 %	25 %	25 %	360034462
1249	NC_016445	ACC	2	6	69388	69393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034462
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1499	NC_016445	TGAG	2	8	82735	82742	25 %	25 %	50 %	0 %	360034474
1500	NC_016445	GA	3	6	82774	82779	50 %	0 %	50 %	0 %	360034474

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