MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016445	TGC	2	6	28583	28588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
502	NC_016445	GCG	2	6	28651	28656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034430
503	NC_016445	CGC	2	6	28688	28693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034430
504	NC_016445	CAA	2	6	28763	28768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034430
505	NC_016445	TCA	2	6	28796	28801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034430
506	NC_016445	CA	3	6	28808	28813	50 %	0 %	0 %	50 %	360034430
507	NC_016445	AGC	2	6	28846	28851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034430
508	NC_016445	TTG	2	6	28854	28859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034430
509	NC_016445	GC	3	6	29006	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	360034430
510	NC_016445	TGC	2	6	29068	29073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
511	NC_016445	GTC	2	6	29142	29147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
512	NC_016445	AACGC	2	10	29198	29207	40 %	0 %	20 %	40 %	360034430
513	NC_016445	ATG	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
514	NC_016445	CCG	2	6	29302	29307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034430
515	NC_016445	GTA	2	6	29322	29327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
516	NC_016445	TCC	2	6	29340	29345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034430
517	NC_016445	TGA	2	6	29374	29379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
518	NC_016445	GCA	2	6	29437	29442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
519	NC_016445	CTG	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
520	NC_016445	TCA	2	6	29487	29492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
521	NC_016445	AC	4	8	29513	29520	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
522	NC_016445	GTAA	2	8	29551	29558	50 %	25 %	25 %	0 %	360034431
523	NC_016445	ATT	2	6	29564	29569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034431
524	NC_016445	TGT	2	6	29596	29601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
525	NC_016445	CCA	2	6	29738	29743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034431
526	NC_016445	TTG	2	6	29843	29848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
527	NC_016445	TGG	2	6	30001	30006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034431
528	NC_016445	AGT	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
529	NC_016445	TCA	2	6	30144	30149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
530	NC_016445	ATG	2	6	30150	30155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
531	NC_016445	CAT	2	6	30166	30171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
532	NC_016445	TG	3	6	30240	30245	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
533	NC_016445	CG	3	6	30267	30272	0 %	0 %	50 %	50 %	360034431
534	NC_016445	ATC	2	6	30329	30334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
535	NC_016445	TTG	2	6	30347	30352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
536	NC_016445	GTT	2	6	30376	30381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
537	NC_016445	A	7	7	30418	30424	100 %	0 %	0 %	0 %	360034431
538	NC_016445	AAC	2	6	30465	30470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034431
539	NC_016445	TGT	2	6	30519	30524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
540	NC_016445	ACC	2	6	30555	30560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034431
541	NC_016445	TGT	2	6	30570	30575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
542	NC_016445	CGT	2	6	30634	30639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
543	NC_016445	CAG	2	6	30677	30682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
544	NC_016445	CTTG	2	8	30688	30695	0 %	50 %	25 %	25 %	360034431
545	NC_016445	TTG	2	6	30698	30703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
546	NC_016445	AGC	2	6	30718	30723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
547	NC_016445	AGT	2	6	30736	30741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
548	NC_016445	GCA	2	6	30742	30747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
549	NC_016445	GT	3	6	30807	30812	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
550	NC_016445	ATA	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034431
551	NC_016445	CGT	2	6	30839	30844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
552	NC_016445	CA	3	6	30959	30964	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
553	NC_016445	CA	3	6	30988	30993	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
554	NC_016445	TGGT	2	8	31035	31042	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
555	NC_016445	CATT	2	8	31052	31059	25 %	50 %	0 %	25 %	360034431
556	NC_016445	AAC	2	6	31128	31133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034432
557	NC_016445	TTG	2	6	31262	31267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034432
558	NC_016445	CCA	2	6	31377	31382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034432
559	NC_016445	AGCG	2	8	31422	31429	25 %	0 %	50 %	25 %	360034432
560	NC_016445	CGTG	2	8	31440	31447	0 %	25 %	50 %	25 %	360034432
561	NC_016445	TCA	2	6	31541	31546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
562	NC_016445	AAC	2	6	31552	31557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034432
563	NC_016445	CGCTGA	2	12	31595	31606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360034432
564	NC_016445	CCA	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034432
565	NC_016445	TGG	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
566	NC_016445	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	360034432
567	NC_016445	CAG	2	6	31735	31740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034432
568	NC_016445	TGG	2	6	31754	31759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
569	NC_016445	TGAG	2	8	31779	31786	25 %	25 %	50 %	0 %	360034432
570	NC_016445	GTC	2	6	31837	31842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034432
571	NC_016445	ATC	2	6	31916	31921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
572	NC_016445	GGT	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
573	NC_016445	CACC	2	8	31953	31960	25 %	0 %	0 %	75 %	360034432
574	NC_016445	CGT	2	6	31998	32003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034432
575	NC_016445	CAT	2	6	32014	32019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
576	NC_016445	GTT	2	6	32022	32027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034432
577	NC_016445	T	6	6	32066	32071	0 %	100 %	0 %	0 %	360034432
578	NC_016445	CGGT	2	8	32226	32233	0 %	25 %	50 %	25 %	360034433
579	NC_016445	GTTTT	2	10	32334	32343	0 %	80 %	20 %	0 %	360034433
580	NC_016445	TGG	2	6	32356	32361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034433
581	NC_016445	GGT	2	6	32391	32396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034433
582	NC_016445	TCAA	2	8	32432	32439	50 %	25 %	0 %	25 %	360034433
583	NC_016445	ATG	2	6	32453	32458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034433
584	NC_016445	CTT	2	6	32529	32534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034433
585	NC_016445	TCT	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034433
586	NC_016445	ACA	2	6	32573	32578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034433
587	NC_016445	GAGCGC	2	12	32623	32634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	360034433
588	NC_016445	ACC	2	6	32662	32667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034433
589	NC_016445	ACG	2	6	32737	32742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034433
590	NC_016445	TTTC	2	8	32856	32863	0 %	75 %	0 %	25 %	360034433
591	NC_016445	TCA	2	6	32885	32890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034433
592	NC_016445	CCA	2	6	32930	32935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034433
593	NC_016445	TGA	2	6	32937	32942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034433
594	NC_016445	GGC	2	6	32948	32953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034433
595	NC_016445	ATT	2	6	33134	33139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034434
596	NC_016445	TGG	2	6	33165	33170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034434
597	NC_016445	CTTG	2	8	33197	33204	0 %	50 %	25 %	25 %	360034434
598	NC_016445	CAG	2	6	33300	33305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034434
599	NC_016445	CAG	2	6	33327	33332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034434
600	NC_016445	CCA	2	6	33336	33341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034434
601	NC_016445	ATG	2	6	33385	33390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034434
602	NC_016445	AGGA	2	8	33424	33431	50 %	0 %	50 %	0 %	360034434
603	NC_016445	TCG	2	6	33434	33439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034434
604	NC_016445	CAT	2	6	33444	33449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034434
605	NC_016445	ACCGA	2	10	33463	33472	40 %	0 %	20 %	40 %	360034434
606	NC_016445	GAT	2	6	33522	33527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034434
607	NC_016445	GCGA	2	8	33596	33603	25 %	0 %	50 %	25 %	360034434
608	NC_016445	ACC	2	6	33604	33609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034434
609	NC_016445	AGG	2	6	33626	33631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034434
610	NC_016445	AAT	2	6	33639	33644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034434
611	NC_016445	CAG	2	6	33696	33701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034434
612	NC_016445	ATG	2	6	33724	33729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034434
613	NC_016445	GCG	2	6	33736	33741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034434
614	NC_016445	TCG	2	6	33751	33756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034434
615	NC_016445	CA	3	6	33874	33879	50 %	0 %	0 %	50 %	360034434
616	NC_016445	GTG	2	6	33895	33900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034434
617	NC_016445	T	6	6	33918	33923	0 %	100 %	0 %	0 %	360034434
618	NC_016445	GCG	2	6	33939	33944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034434
619	NC_016445	AAG	2	6	34059	34064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034434
620	NC_016445	GCG	2	6	34069	34074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034434
621	NC_016445	A	6	6	34086	34091	100 %	0 %	0 %	0 %	360034434
622	NC_016445	ATC	2	6	34114	34119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034434
623	NC_016445	ATT	2	6	34162	34167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034435
624	NC_016445	AAC	2	6	34196	34201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034435
625	NC_016445	CAG	2	6	34217	34222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034435
626	NC_016445	CAG	2	6	34253	34258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034435
627	NC_016445	ACAGT	2	10	34303	34312	40 %	20 %	20 %	20 %	360034435
628	NC_016445	GAT	2	6	34334	34339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034435
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731	NC_016445	AAAC	2	8	40215	40222	75 %	0 %	0 %	25 %	360034437
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739	NC_016445	TAA	2	6	40729	40734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034437
740	NC_016445	ACG	2	6	40772	40777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034437
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742	NC_016445	CAG	2	6	40825	40830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034437
743	NC_016445	TAAG	2	8	40834	40841	50 %	25 %	25 %	0 %	360034437
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748	NC_016445	CAT	2	6	41086	41091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034437
749	NC_016445	TAT	2	6	41115	41120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034437
750	NC_016445	AAG	2	6	41139	41144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034437
751	NC_016445	CTG	2	6	41149	41154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034437
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1000	NC_016445	TTTC	2	8	54649	54656	0 %	75 %	0 %	25 %	360034449

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