MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016445	CGGCG	2	10	327063	327072	0 %	0 %	60 %	40 %	360034700
5502	NC_016445	TGGT	2	8	327109	327116	0 %	50 %	50 %	0 %	360034700
5503	NC_016445	CAC	2	6	327165	327170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034700
5504	NC_016445	GTT	2	6	327180	327185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034700
5505	NC_016445	AC	3	6	327200	327205	50 %	0 %	0 %	50 %	360034700
5506	NC_016445	T	6	6	327233	327238	0 %	100 %	0 %	0 %	360034700
5507	NC_016445	GCG	2	6	327278	327283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034700
5508	NC_016445	CAT	2	6	327362	327367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034700
5509	NC_016445	TGC	2	6	327409	327414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034700
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5511	NC_016445	CAC	2	6	327600	327605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034700
5512	NC_016445	TTC	2	6	327669	327674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034700
5513	NC_016445	ACGT	2	8	327675	327682	25 %	25 %	25 %	25 %	360034700
5514	NC_016445	TGT	2	6	327727	327732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034700
5515	NC_016445	GCC	2	6	327762	327767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034700
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5517	NC_016445	GC	3	6	327789	327794	0 %	0 %	50 %	50 %	360034700
5518	NC_016445	TCA	2	6	327806	327811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034700
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5520	NC_016445	T	6	6	328077	328082	0 %	100 %	0 %	0 %	360034700
5521	NC_016445	TGC	2	6	328174	328179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034700
5522	NC_016445	GTG	2	6	328219	328224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034700
5523	NC_016445	GC	3	6	328247	328252	0 %	0 %	50 %	50 %	360034700
5524	NC_016445	CATCG	2	10	328302	328311	20 %	20 %	20 %	40 %	360034700
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5530	NC_016445	GTC	2	6	328578	328583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034700
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5533	NC_016445	T	6	6	328797	328802	0 %	100 %	0 %	0 %	360034701
5534	NC_016445	TGG	2	6	328805	328810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034701
5535	NC_016445	TGGC	2	8	328814	328821	0 %	25 %	50 %	25 %	360034701
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5539	NC_016445	A	7	7	329002	329008	100 %	0 %	0 %	0 %	360034701
5540	NC_016445	GC	3	6	329010	329015	0 %	0 %	50 %	50 %	360034701
5541	NC_016445	GC	3	6	329019	329024	0 %	0 %	50 %	50 %	360034701
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5544	NC_016445	ACG	2	6	329075	329080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034701
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5547	NC_016445	GGC	2	6	329158	329163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034702
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5549	NC_016445	CATA	2	8	329200	329207	50 %	25 %	0 %	25 %	360034702
5550	NC_016445	CTG	2	6	329211	329216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034702
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5554	NC_016445	CTT	2	6	329427	329432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034702
5555	NC_016445	TCA	2	6	329438	329443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034702
5556	NC_016445	CGC	2	6	329455	329460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034702
5557	NC_016445	GAT	2	6	329473	329478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034702
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5559	NC_016445	AC	3	6	329562	329567	50 %	0 %	0 %	50 %	360034702
5560	NC_016445	CTT	2	6	329625	329630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034702
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5570	NC_016445	CAG	2	6	329986	329991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034702
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5590	NC_016445	GTA	2	6	331274	331279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034703
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5593	NC_016445	CG	4	8	331328	331335	0 %	0 %	50 %	50 %	360034703
5594	NC_016445	TTATT	2	10	331347	331356	20 %	80 %	0 %	0 %	360034703
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5605	NC_016445	CG	5	10	332011	332020	0 %	0 %	50 %	50 %	360034704
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5610	NC_016445	TATC	2	8	332147	332154	25 %	50 %	0 %	25 %	360034705
5611	NC_016445	CG	3	6	332213	332218	0 %	0 %	50 %	50 %	360034705
5612	NC_016445	GCA	2	6	332240	332245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034705
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5622	NC_016445	GCG	2	6	332625	332630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034705
5623	NC_016445	TGC	2	6	332633	332638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034705
5624	NC_016445	AGC	2	6	332716	332721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034705
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5721	NC_016445	CA	4	8	337901	337908	50 %	0 %	0 %	50 %	360034711
5722	NC_016445	CA	3	6	337988	337993	50 %	0 %	0 %	50 %	360034711
5723	NC_016445	GAC	2	6	338027	338032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034711
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5728	NC_016445	TGC	2	6	338353	338358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034713
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5730	NC_016445	A	7	7	338426	338432	100 %	0 %	0 %	0 %	360034713
5731	NC_016445	ACCT	2	8	338568	338575	25 %	25 %	0 %	50 %	360034713
5732	NC_016445	ATC	2	6	338654	338659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034713
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5735	NC_016445	A	6	6	338925	338930	100 %	0 %	0 %	0 %	360034713
5736	NC_016445	GC	3	6	338932	338937	0 %	0 %	50 %	50 %	360034713
5737	NC_016445	ATC	2	6	338942	338947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034713
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5740	NC_016445	TGC	2	6	339102	339107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034713
5741	NC_016445	GTG	2	6	339114	339119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034713
5742	NC_016445	AAGCC	2	10	339129	339138	40 %	0 %	20 %	40 %	360034713
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5991	NC_016445	AAT	2	6	353681	353686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034727
5992	NC_016445	AAC	2	6	353735	353740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034727
5993	NC_016445	CTG	2	6	353749	353754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034727
5994	NC_016445	AGC	2	6	353777	353782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034727
5995	NC_016445	TAT	2	6	353807	353812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034727
5996	NC_016445	ACA	2	6	353820	353825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034727
5997	NC_016445	AGC	2	6	353876	353881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034727
5998	NC_016445	CTT	2	6	353884	353889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034727
5999	NC_016445	GCT	2	6	353946	353951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034727
6000	NC_016445	GATTC	2	10	354015	354024	20 %	40 %	20 %	20 %	360034727

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