MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 15364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	CTCG	2	8	744	751	0 %	25 %	25 %	50 %	319790695
2	NC_014931	CGCA	2	8	796	803	25 %	0 %	25 %	50 %	319790695
3	NC_014931	GCCG	2	8	1804	1811	0 %	0 %	50 %	50 %	319790696
4	NC_014931	GCAA	2	8	2052	2059	50 %	0 %	25 %	25 %	319790696
5	NC_014931	ACCT	2	8	2525	2532	25 %	25 %	0 %	50 %	319790696
6	NC_014931	GGCC	2	8	3043	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
7	NC_014931	GCCG	2	8	3676	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
8	NC_014931	GCAC	2	8	3705	3712	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
9	NC_014931	CCAG	2	8	3963	3970	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
10	NC_014931	CGCC	2	8	4857	4864	0 %	0 %	25 %	75 %	319790697
11	NC_014931	GCGG	2	8	5395	5402	0 %	0 %	75 %	25 %	319790697
12	NC_014931	GAGC	2	8	5418	5425	25 %	0 %	50 %	25 %	319790697
13	NC_014931	GCTG	2	8	6210	6217	0 %	25 %	50 %	25 %	319790698
14	NC_014931	GCCA	2	8	6620	6627	25 %	0 %	25 %	50 %	319790698
15	NC_014931	CCCG	2	8	6839	6846	0 %	0 %	25 %	75 %	319790699
16	NC_014931	GCCC	2	8	6858	6865	0 %	0 %	25 %	75 %	319790699
17	NC_014931	GCCG	2	8	6878	6885	0 %	0 %	50 %	50 %	319790699
18	NC_014931	GATG	2	8	7637	7644	25 %	25 %	50 %	0 %	319790700
19	NC_014931	TGGG	2	8	7711	7718	0 %	25 %	75 %	0 %	319790700
20	NC_014931	GGCA	2	8	8449	8456	25 %	0 %	50 %	25 %	319790701
21	NC_014931	CGGC	2	8	8469	8476	0 %	0 %	50 %	50 %	319790701
22	NC_014931	CTGG	2	8	8966	8973	0 %	25 %	50 %	25 %	319790702
23	NC_014931	GCGA	2	8	9558	9565	25 %	0 %	50 %	25 %	319790702
24	NC_014931	GCTG	2	8	9992	9999	0 %	25 %	50 %	25 %	319790703
25	NC_014931	TCGC	2	8	10183	10190	0 %	25 %	25 %	50 %	319790703
26	NC_014931	GGCC	2	8	10253	10260	0 %	0 %	50 %	50 %	319790703
27	NC_014931	CGTG	2	8	11383	11390	0 %	25 %	50 %	25 %	319790705
28	NC_014931	CCAG	2	8	11728	11735	25 %	0 %	25 %	50 %	319790705
29	NC_014931	GCGA	2	8	12125	12132	25 %	0 %	50 %	25 %	319790705
30	NC_014931	CGGC	2	8	12251	12258	0 %	0 %	50 %	50 %	319790706
31	NC_014931	CTCG	2	8	12360	12367	0 %	25 %	25 %	50 %	319790706
32	NC_014931	GAAA	2	8	12731	12738	75 %	0 %	25 %	0 %	319790706
33	NC_014931	ACCG	2	8	13167	13174	25 %	0 %	25 %	50 %	319790706
34	NC_014931	CGGC	2	8	13716	13723	0 %	0 %	50 %	50 %	319790707
35	NC_014931	CGGC	2	8	14516	14523	0 %	0 %	50 %	50 %	319790708
36	NC_014931	GCCG	2	8	14598	14605	0 %	0 %	50 %	50 %	319790708
37	NC_014931	GCGG	2	8	15243	15250	0 %	0 %	75 %	25 %	319790709
38	NC_014931	CCGG	2	8	15254	15261	0 %	0 %	50 %	50 %	319790709
39	NC_014931	CGGC	2	8	15474	15481	0 %	0 %	50 %	50 %	319790709
40	NC_014931	CGTG	2	8	16082	16089	0 %	25 %	50 %	25 %	319790710
41	NC_014931	CGAT	2	8	16129	16136	25 %	25 %	25 %	25 %	319790710
42	NC_014931	GCCG	2	8	16334	16341	0 %	0 %	50 %	50 %	319790710
43	NC_014931	CGGC	2	8	16979	16986	0 %	0 %	50 %	50 %	319790711
44	NC_014931	TGGT	2	8	17016	17023	0 %	50 %	50 %	0 %	319790711
45	NC_014931	CGGC	2	8	17436	17443	0 %	0 %	50 %	50 %	319790711
46	NC_014931	CCAG	2	8	18338	18345	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
47	NC_014931	GGCG	2	8	18366	18373	0 %	0 %	75 %	25 %	319790712
48	NC_014931	CGGT	2	8	18634	18641	0 %	25 %	50 %	25 %	319790712
49	NC_014931	CGGC	2	8	18919	18926	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
50	NC_014931	CAGC	2	8	19053	19060	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
51	NC_014931	GAGC	2	8	19549	19556	25 %	0 %	50 %	25 %	319790713
52	NC_014931	CAGC	2	8	19960	19967	25 %	0 %	25 %	50 %	319790713
53	NC_014931	CCTT	2	8	20639	20646	0 %	50 %	0 %	50 %	319790714
54	NC_014931	TCGA	2	8	20657	20664	25 %	25 %	25 %	25 %	319790714
55	NC_014931	CGTG	2	8	20694	20701	0 %	25 %	50 %	25 %	319790714
56	NC_014931	CAGC	2	8	20740	20747	25 %	0 %	25 %	50 %	319790714
57	NC_014931	GGCC	2	8	21192	21199	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
58	NC_014931	CGCC	2	8	21354	21361	0 %	0 %	25 %	75 %	319790714
59	NC_014931	TGCC	2	8	22685	22692	0 %	25 %	25 %	50 %	319790716
60	NC_014931	GCCA	2	8	22702	22709	25 %	0 %	25 %	50 %	319790716
61	NC_014931	AGCC	2	8	22867	22874	25 %	0 %	25 %	50 %	319790716
62	NC_014931	GTGG	2	8	24303	24310	0 %	25 %	75 %	0 %	319790717
63	NC_014931	CTTC	2	8	24320	24327	0 %	50 %	0 %	50 %	319790717
64	NC_014931	GGCC	2	8	25292	25299	0 %	0 %	50 %	50 %	319790718
65	NC_014931	TGGA	2	8	25464	25471	25 %	25 %	50 %	0 %	319790718
66	NC_014931	TCGC	2	8	26217	26224	0 %	25 %	25 %	50 %	319790718
67	NC_014931	CAGC	2	8	26443	26450	25 %	0 %	25 %	50 %	319790718
68	NC_014931	GCTG	2	8	26739	26746	0 %	25 %	50 %	25 %	319790719
69	NC_014931	GCCT	2	8	27174	27181	0 %	25 %	25 %	50 %	319790719
70	NC_014931	AGCG	2	8	27303	27310	25 %	0 %	50 %	25 %	319790719
71	NC_014931	CGCT	2	8	27335	27342	0 %	25 %	25 %	50 %	319790719
72	NC_014931	CATC	2	8	28139	28146	25 %	25 %	0 %	50 %	319790720
73	NC_014931	CCGA	2	8	29050	29057	25 %	0 %	25 %	50 %	319790720
74	NC_014931	GAAG	2	8	29061	29068	50 %	0 %	50 %	0 %	319790720
75	NC_014931	GAAA	2	8	29151	29158	75 %	0 %	25 %	0 %	319790720
76	NC_014931	CACG	2	8	30858	30865	25 %	0 %	25 %	50 %	319790721
77	NC_014931	ATCG	2	8	31376	31383	25 %	25 %	25 %	25 %	319790722
78	NC_014931	CGTG	2	8	31732	31739	0 %	25 %	50 %	25 %	319790722
79	NC_014931	CCAG	2	8	31909	31916	25 %	0 %	25 %	50 %	319790722
80	NC_014931	CCCA	2	8	31965	31972	25 %	0 %	0 %	75 %	319790722
81	NC_014931	TGCC	2	8	32193	32200	0 %	25 %	25 %	50 %	319790722
82	NC_014931	CGGT	2	8	32229	32236	0 %	25 %	50 %	25 %	319790722
83	NC_014931	TGGC	2	8	32535	32542	0 %	25 %	50 %	25 %	319790723
84	NC_014931	TCGC	2	8	32666	32673	0 %	25 %	25 %	50 %	319790723
85	NC_014931	GCCG	2	8	32778	32785	0 %	0 %	50 %	50 %	319790723
86	NC_014931	GCCC	2	8	33081	33088	0 %	0 %	25 %	75 %	319790723
87	NC_014931	GCGG	2	8	33170	33177	0 %	0 %	75 %	25 %	319790723
88	NC_014931	CTCG	2	8	34196	34203	0 %	25 %	25 %	50 %	319790724
89	NC_014931	AAGG	2	8	34731	34738	50 %	0 %	50 %	0 %	319790724
90	NC_014931	TCGG	2	8	35635	35642	0 %	25 %	50 %	25 %	319790727
91	NC_014931	GCCG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
92	NC_014931	GGCC	2	8	36904	36911	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
93	NC_014931	TGCG	2	8	37319	37326	0 %	25 %	50 %	25 %	319790727
94	NC_014931	GCCG	2	8	37431	37438	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
95	NC_014931	CGGC	2	8	37589	37596	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
96	NC_014931	GCCG	2	8	38115	38122	0 %	0 %	50 %	50 %	319790728
97	NC_014931	AAGC	2	8	38654	38661	50 %	0 %	25 %	25 %	319790729
98	NC_014931	ATCC	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	319790729
99	NC_014931	CGAG	2	8	38750	38757	25 %	0 %	50 %	25 %	319790729
100	NC_014931	CGGC	2	8	38789	38796	0 %	0 %	50 %	50 %	319790729
101	NC_014931	CGTT	2	8	38944	38951	0 %	50 %	25 %	25 %	319790729
102	NC_014931	GCCG	2	8	39974	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	319790730
103	NC_014931	CGGC	2	8	40264	40271	0 %	0 %	50 %	50 %	319790730
104	NC_014931	GCAG	2	8	40736	40743	25 %	0 %	50 %	25 %	319790730
105	NC_014931	GCGA	2	8	40749	40756	25 %	0 %	50 %	25 %	319790730
106	NC_014931	GCAC	2	8	40791	40798	25 %	0 %	25 %	50 %	319790730
107	NC_014931	CAGC	2	8	40915	40922	25 %	0 %	25 %	50 %	319790730
108	NC_014931	GCGA	2	8	41111	41118	25 %	0 %	50 %	25 %	319790731
109	NC_014931	GGTC	2	8	41130	41137	0 %	25 %	50 %	25 %	319790731
110	NC_014931	GGCG	2	8	41146	41153	0 %	0 %	75 %	25 %	319790731
111	NC_014931	CGTT	2	8	41635	41642	0 %	50 %	25 %	25 %	319790732
112	NC_014931	TGCG	2	8	41722	41729	0 %	25 %	50 %	25 %	319790732
113	NC_014931	GCGA	2	8	41818	41825	25 %	0 %	50 %	25 %	319790732
114	NC_014931	ATCG	2	8	41964	41971	25 %	25 %	25 %	25 %	319790732
115	NC_014931	GGCA	2	8	42481	42488	25 %	0 %	50 %	25 %	319790733
116	NC_014931	TGCG	2	8	42625	42632	0 %	25 %	50 %	25 %	319790733
117	NC_014931	GCCC	2	8	42775	42782	0 %	0 %	25 %	75 %	319790733
118	NC_014931	GGCG	2	8	43144	43151	0 %	0 %	75 %	25 %	319790734
119	NC_014931	CTCG	2	8	43886	43893	0 %	25 %	25 %	50 %	319790734
120	NC_014931	CGAA	2	8	44013	44020	50 %	0 %	25 %	25 %	319790734
121	NC_014931	CTCG	2	8	44756	44763	0 %	25 %	25 %	50 %	319790735
122	NC_014931	CGGC	2	8	44820	44827	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
123	NC_014931	GCCG	2	8	44883	44890	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
124	NC_014931	GCGT	2	8	45160	45167	0 %	25 %	50 %	25 %	319790735
125	NC_014931	GAAG	2	8	45248	45255	50 %	0 %	50 %	0 %	319790736
126	NC_014931	TCGC	2	8	45649	45656	0 %	25 %	25 %	50 %	319790736
127	NC_014931	CCTT	2	8	46398	46405	0 %	50 %	0 %	50 %	319790738
128	NC_014931	CCAT	2	8	46447	46454	25 %	25 %	0 %	50 %	319790738
129	NC_014931	GGCG	2	8	46640	46647	0 %	0 %	75 %	25 %	319790738
130	NC_014931	TGGA	2	8	46737	46744	25 %	25 %	50 %	0 %	319790738
131	NC_014931	CGCC	3	12	47972	47983	0 %	0 %	25 %	75 %	319790739
132	NC_014931	GCCG	2	8	48017	48024	0 %	0 %	50 %	50 %	319790739
133	NC_014931	GTCG	2	8	49073	49080	0 %	25 %	50 %	25 %	319790739
134	NC_014931	CGTT	2	8	49248	49255	0 %	50 %	25 %	25 %	319790739
135	NC_014931	CAGG	2	8	49647	49654	25 %	0 %	50 %	25 %	319790740
136	NC_014931	CATG	2	8	49720	49727	25 %	25 %	25 %	25 %	319790740
137	NC_014931	CTGC	2	8	54156	54163	0 %	25 %	25 %	50 %	319790744
138	NC_014931	GGGC	2	8	54311	54318	0 %	0 %	75 %	25 %	319790744
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