MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014931	TCA	2	6	160117	160122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790851
4002	NC_014931	CTG	2	6	160145	160150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790851
4003	NC_014931	CGC	2	6	160153	160158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790851
4004	NC_014931	AAG	2	6	160206	160211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790851
4005	NC_014931	GCC	2	6	160235	160240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790851
4006	NC_014931	CG	3	6	160245	160250	0 %	0 %	50 %	50 %	319790851
4007	NC_014931	CCCAG	2	10	160309	160318	20 %	0 %	20 %	60 %	319790851
4008	NC_014931	CG	3	6	160322	160327	0 %	0 %	50 %	50 %	319790851
4009	NC_014931	AGC	2	6	160419	160424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790851
4010	NC_014931	CTG	2	6	160472	160477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790851
4011	NC_014931	CAC	2	6	160502	160507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790851
4012	NC_014931	CG	3	6	160592	160597	0 %	0 %	50 %	50 %	319790852
4013	NC_014931	CCA	2	6	160646	160651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790852
4014	NC_014931	GCG	2	6	160662	160667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790852
4015	NC_014931	CGC	2	6	160754	160759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790852
4016	NC_014931	TCG	2	6	160789	160794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790852
4017	NC_014931	AGG	2	6	160798	160803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790852
4018	NC_014931	CGCGAG	2	12	160818	160829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319790852
4019	NC_014931	CAG	2	6	160839	160844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790852
4020	NC_014931	GCT	2	6	160847	160852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790852
4021	NC_014931	AGC	2	6	160912	160917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790852
4022	NC_014931	TCG	2	6	160927	160932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790852
4023	NC_014931	GCC	2	6	160958	160963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790852
4024	NC_014931	CGCT	2	8	160987	160994	0 %	25 %	25 %	50 %	319790852
4025	NC_014931	CAC	2	6	161004	161009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790852
4026	NC_014931	GCG	2	6	161018	161023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790852
4027	NC_014931	GC	3	6	161058	161063	0 %	0 %	50 %	50 %	319790852
4028	NC_014931	GC	3	6	161077	161082	0 %	0 %	50 %	50 %	319790852
4029	NC_014931	TGA	2	6	161165	161170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790852
4030	NC_014931	CGAG	2	8	161225	161232	25 %	0 %	50 %	25 %	319790852
4031	NC_014931	GC	3	6	161350	161355	0 %	0 %	50 %	50 %	319790853
4032	NC_014931	CCG	2	6	161364	161369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790853
4033	NC_014931	CCG	2	6	161383	161388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790853
4034	NC_014931	ATC	2	6	161478	161483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790853
4035	NC_014931	CCG	2	6	161484	161489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790853
4036	NC_014931	GCC	2	6	161504	161509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790853
4037	NC_014931	GAT	2	6	161519	161524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790853
4038	NC_014931	CGA	2	6	161566	161571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790853
4039	NC_014931	AGC	2	6	161589	161594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790853
4040	NC_014931	GC	3	6	161593	161598	0 %	0 %	50 %	50 %	319790853
4041	NC_014931	GC	3	6	161645	161650	0 %	0 %	50 %	50 %	319790853
4042	NC_014931	GCA	2	6	161728	161733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790853
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4044	NC_014931	GAA	2	6	161813	161818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790853
4045	NC_014931	CAG	2	6	161900	161905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790853
4046	NC_014931	ATC	2	6	161925	161930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790853
4047	NC_014931	CAC	2	6	161954	161959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790853
4048	NC_014931	GAG	2	6	161981	161986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790853
4049	NC_014931	CGCGCC	2	12	162065	162076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790853
4050	NC_014931	GAA	2	6	162077	162082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790853
4051	NC_014931	TCA	2	6	162169	162174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790853
4052	NC_014931	GAA	2	6	162197	162202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790853
4053	NC_014931	CGCGAG	2	12	162209	162220	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319790853
4054	NC_014931	CTT	2	6	162286	162291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790854
4055	NC_014931	CGA	2	6	162294	162299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4056	NC_014931	CAG	2	6	162316	162321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4057	NC_014931	AGT	2	6	162369	162374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790854
4058	NC_014931	CGA	2	6	162390	162395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4059	NC_014931	CAG	2	6	162403	162408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4060	NC_014931	CGC	2	6	162409	162414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790854
4061	NC_014931	CAC	2	6	162454	162459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790854
4062	NC_014931	ACG	2	6	162492	162497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4063	NC_014931	AGAA	2	8	162569	162576	75 %	0 %	25 %	0 %	319790854
4064	NC_014931	GCC	2	6	162601	162606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790854
4065	NC_014931	CG	3	6	162631	162636	0 %	0 %	50 %	50 %	319790854
4066	NC_014931	CAG	2	6	162670	162675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4067	NC_014931	CGC	2	6	162696	162701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790854
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4069	NC_014931	CGG	2	6	162769	162774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790854
4070	NC_014931	TCG	2	6	162792	162797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790854
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4072	NC_014931	CAG	2	6	162850	162855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790854
4073	NC_014931	GC	3	6	162873	162878	0 %	0 %	50 %	50 %	319790854
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4083	NC_014931	CG	3	6	163316	163321	0 %	0 %	50 %	50 %	319790855
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4091	NC_014931	AGT	2	6	163523	163528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790855
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4099	NC_014931	GC	3	6	163893	163898	0 %	0 %	50 %	50 %	319790855
4100	NC_014931	ATCGG	2	10	163900	163909	20 %	20 %	40 %	20 %	319790855
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4102	NC_014931	CG	3	6	163936	163941	0 %	0 %	50 %	50 %	319790855
4103	NC_014931	GAG	2	6	163969	163974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790855
4104	NC_014931	TCA	2	6	163982	163987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790855
4105	NC_014931	TGG	2	6	163991	163996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790855
4106	NC_014931	GGC	2	6	164109	164114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790855
4107	NC_014931	CGG	2	6	164129	164134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790855
4108	NC_014931	TCTT	2	8	164137	164144	0 %	75 %	0 %	25 %	319790855
4109	NC_014931	GCCC	2	8	164162	164169	0 %	0 %	25 %	75 %	319790855
4110	NC_014931	GCC	2	6	164175	164180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790855
4111	NC_014931	GGC	2	6	164219	164224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790855
4112	NC_014931	TCG	2	6	164278	164283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790855
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4114	NC_014931	GA	3	6	164338	164343	50 %	0 %	50 %	0 %	319790855
4115	NC_014931	TCG	2	6	164360	164365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790855
4116	NC_014931	CGA	2	6	164516	164521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790856
4117	NC_014931	GTC	2	6	164544	164549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790856
4118	NC_014931	GGC	2	6	164554	164559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790856
4119	NC_014931	AGC	3	9	164609	164617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790856
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4121	NC_014931	CG	3	6	164697	164702	0 %	0 %	50 %	50 %	319790856
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4239	NC_014931	GCCA	2	8	170361	170368	25 %	0 %	25 %	50 %	319790862
4240	NC_014931	CGC	2	6	170369	170374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790862
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4242	NC_014931	CAC	2	6	170418	170423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790862
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4363	NC_014931	GCGT	2	8	181697	181704	0 %	25 %	50 %	25 %	319790867
4364	NC_014931	GC	3	6	181753	181758	0 %	0 %	50 %	50 %	319790867
4365	NC_014931	TTC	2	6	181764	181769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790867
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4367	NC_014931	GCT	2	6	181928	181933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790868
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4402	NC_014931	GC	3	6	183009	183014	0 %	0 %	50 %	50 %	319790868
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4474	NC_014931	GATC	2	8	185872	185879	25 %	25 %	25 %	25 %	319790869
4475	NC_014931	TCG	2	6	186106	186111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790870
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4481	NC_014931	TCA	2	6	186211	186216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790870
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4483	NC_014931	CGA	2	6	186242	186247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790870
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4485	NC_014931	GTCG	2	8	186365	186372	0 %	25 %	50 %	25 %	319790870
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