MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

< Previous12...313314315316317318319320321322323324325Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
162001	NC_014931	CAG	2	6	6547769	6547774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162002	NC_014931	CAC	2	6	6547775	6547780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319796643
162003	NC_014931	CAG	2	6	6547832	6547837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162004	NC_014931	GAT	2	6	6547856	6547861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319796643
162005	NC_014931	CTT	2	6	6547916	6547921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319796643
162006	NC_014931	TTC	2	6	6547922	6547927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319796643
162007	NC_014931	GCT	2	6	6547949	6547954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162008	NC_014931	CCA	2	6	6547996	6548001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319796643
162009	NC_014931	AGC	2	6	6548082	6548087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162010	NC_014931	AGT	2	6	6548101	6548106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319796643
162011	NC_014931	CGT	2	6	6548128	6548133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162012	NC_014931	GGCG	2	8	6548135	6548142	0 %	0 %	75 %	25 %	319796643
162013	NC_014931	GCG	3	9	6548140	6548148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162014	NC_014931	CTT	2	6	6548195	6548200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319796643
162015	NC_014931	CGG	2	6	6548215	6548220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162016	NC_014931	CCGTG	2	10	6548263	6548272	0 %	20 %	40 %	40 %	319796643
162017	NC_014931	GCA	2	6	6548275	6548280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162018	NC_014931	CG	3	6	6548302	6548307	0 %	0 %	50 %	50 %	319796643
162019	NC_014931	CGC	2	6	6548356	6548361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319796643
162020	NC_014931	GCC	2	6	6548393	6548398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319796643
162021	NC_014931	CGG	2	6	6548440	6548445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162022	NC_014931	CG	3	6	6548452	6548457	0 %	0 %	50 %	50 %	319796643
162023	NC_014931	GGCC	2	8	6548458	6548465	0 %	0 %	50 %	50 %	319796643
162024	NC_014931	GGT	2	6	6548485	6548490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319796643
162025	NC_014931	CAG	2	6	6548522	6548527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162026	NC_014931	GGCG	2	8	6548552	6548559	0 %	0 %	75 %	25 %	319796643
162027	NC_014931	ACG	2	6	6548577	6548582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162028	NC_014931	TCG	2	6	6548601	6548606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162029	NC_014931	GGT	2	6	6548623	6548628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319796643
162030	NC_014931	GCC	2	6	6548636	6548641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319796643
162031	NC_014931	GGT	2	6	6548672	6548677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319796643
162032	NC_014931	ACG	2	6	6548679	6548684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796643
162033	NC_014931	CG	3	6	6548692	6548697	0 %	0 %	50 %	50 %	319796643
162034	NC_014931	GCG	2	6	6548700	6548705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162035	NC_014931	AGGC	2	8	6548776	6548783	25 %	0 %	50 %	25 %	319796643
162036	NC_014931	GTG	2	6	6548784	6548789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319796643
162037	NC_014931	CCGG	2	8	6548790	6548797	0 %	0 %	50 %	50 %	319796643
162038	NC_014931	CGG	3	9	6548809	6548817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162039	NC_014931	TTG	2	6	6548844	6548849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319796643
162040	NC_014931	GCG	2	6	6548918	6548923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796643
162041	NC_014931	CTT	2	6	6548944	6548949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319796644
162042	NC_014931	GGA	2	6	6548953	6548958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319796644
162043	NC_014931	GA	3	6	6548957	6548962	50 %	0 %	50 %	0 %	319796644
162044	NC_014931	GCC	2	6	6549028	6549033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319796644
162045	NC_014931	GC	3	6	6549052	6549057	0 %	0 %	50 %	50 %	319796644
162046	NC_014931	GC	3	6	6549090	6549095	0 %	0 %	50 %	50 %	319796644
162047	NC_014931	TCGA	2	8	6549113	6549120	25 %	25 %	25 %	25 %	319796644
162048	NC_014931	CAG	3	9	6549172	6549180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796644
162049	NC_014931	CAG	2	6	6549205	6549210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796644
162050	NC_014931	GAG	3	9	6549220	6549228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319796645
162051	NC_014931	GAA	2	6	6549232	6549237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319796645
162052	NC_014931	CG	3	6	6549262	6549267	0 %	0 %	50 %	50 %	319796645
162053	NC_014931	CTG	2	6	6549282	6549287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319796645
162054	NC_014931	GC	3	6	6549295	6549300	0 %	0 %	50 %	50 %	319796645
162055	NC_014931	CCCG	2	8	6549355	6549362	0 %	0 %	25 %	75 %	319796645
162056	NC_014931	CAC	2	6	6549369	6549374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319796645
162057	NC_014931	GCA	2	6	6549379	6549384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319796645
162058	NC_014931	GCG	2	6	6549406	6549411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796645
162059	NC_014931	ACGGC	2	10	6549451	6549460	20 %	0 %	40 %	40 %	319796645
162060	NC_014931	GC	3	6	6549459	6549464	0 %	0 %	50 %	50 %	319796645
162061	NC_014931	CCAG	2	8	6549488	6549495	25 %	0 %	25 %	50 %	319796645
162062	NC_014931	GC	3	6	6549573	6549578	0 %	0 %	50 %	50 %	319796645
162063	NC_014931	GC	3	6	6549611	6549616	0 %	0 %	50 %	50 %	319796645
162064	NC_014931	GCG	2	6	6549752	6549757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796646
162065	NC_014931	TGA	2	6	6549763	6549768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319796646
162066	NC_014931	GCC	2	6	6549776	6549781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319796646
162067	NC_014931	GCG	2	6	6549821	6549826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319796646
162068	NC_014931	ATG	2	6	6549855	6549860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319796646

< Previous12...313314315316317318319320321322323324325Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.