MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014931	CTG	2	6	41466	41471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1002	NC_014931	GAT	2	6	41555	41560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790732
1003	NC_014931	AGC	2	6	41576	41581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1004	NC_014931	CG	4	8	41583	41590	0 %	0 %	50 %	50 %	319790732
1005	NC_014931	GC	3	6	41626	41631	0 %	0 %	50 %	50 %	319790732
1006	NC_014931	CGTT	2	8	41635	41642	0 %	50 %	25 %	25 %	319790732
1007	NC_014931	GGC	2	6	41656	41661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790732
1008	NC_014931	GCG	2	6	41690	41695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790732
1009	NC_014931	GCA	2	6	41711	41716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1010	NC_014931	TGCG	2	8	41722	41729	0 %	25 %	50 %	25 %	319790732
1011	NC_014931	GCGA	2	8	41818	41825	25 %	0 %	50 %	25 %	319790732
1012	NC_014931	CGG	2	6	41831	41836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790732
1013	NC_014931	TGC	2	6	41863	41868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1014	NC_014931	ATCG	2	8	41964	41971	25 %	25 %	25 %	25 %	319790732
1015	NC_014931	GC	3	6	41998	42003	0 %	0 %	50 %	50 %	319790732
1016	NC_014931	CAG	2	6	42021	42026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1017	NC_014931	TGC	2	6	42038	42043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790732
1018	NC_014931	AGG	2	6	42055	42060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319790732
1019	NC_014931	ACC	2	6	42061	42066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790732
1020	NC_014931	G	6	6	42084	42089	0 %	0 %	100 %	0 %	319790732
1021	NC_014931	TGC	2	6	42313	42318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1022	NC_014931	TGC	2	6	42409	42414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1023	NC_014931	GGCA	2	8	42481	42488	25 %	0 %	50 %	25 %	319790733
1024	NC_014931	GC	3	6	42492	42497	0 %	0 %	50 %	50 %	319790733
1025	NC_014931	GTGCTC	2	12	42513	42524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1026	NC_014931	CG	4	8	42527	42534	0 %	0 %	50 %	50 %	319790733
1027	NC_014931	CGA	2	6	42575	42580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1028	NC_014931	GC	3	6	42618	42623	0 %	0 %	50 %	50 %	319790733
1029	NC_014931	TGCG	2	8	42625	42632	0 %	25 %	50 %	25 %	319790733
1030	NC_014931	TGC	2	6	42667	42672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1031	NC_014931	GC	3	6	42699	42704	0 %	0 %	50 %	50 %	319790733
1032	NC_014931	CG	4	8	42740	42747	0 %	0 %	50 %	50 %	319790733
1033	NC_014931	TGA	2	6	42769	42774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790733
1034	NC_014931	GCCC	2	8	42775	42782	0 %	0 %	25 %	75 %	319790733
1035	NC_014931	TC	3	6	42868	42873	0 %	50 %	0 %	50 %	319790733
1036	NC_014931	AAG	2	6	42882	42887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790733
1037	NC_014931	CTG	2	6	42888	42893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790733
1038	NC_014931	CTG	2	6	42966	42971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1039	NC_014931	CGG	2	6	42995	43000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790734
1040	NC_014931	CGGTG	2	10	43045	43054	0 %	20 %	60 %	20 %	319790734
1041	NC_014931	ACT	2	6	43074	43079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790734
1042	NC_014931	CGA	2	6	43111	43116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1043	NC_014931	GGCG	2	8	43144	43151	0 %	0 %	75 %	25 %	319790734
1044	NC_014931	TGC	2	6	43167	43172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1045	NC_014931	CGC	2	6	43176	43181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790734
1046	NC_014931	GC	4	8	43299	43306	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1047	NC_014931	GC	3	6	43345	43350	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1048	NC_014931	ACG	2	6	43365	43370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1049	NC_014931	GTG	2	6	43400	43405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790734
1050	NC_014931	CTG	3	9	43478	43486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1051	NC_014931	TGC	2	6	43488	43493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1052	NC_014931	GGT	3	9	43591	43599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790734
1053	NC_014931	CG	3	6	43611	43616	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1054	NC_014931	CGC	2	6	43722	43727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790734
1055	NC_014931	GCA	2	6	43765	43770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1056	NC_014931	ACC	2	6	43775	43780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790734
1057	NC_014931	AGC	2	6	43791	43796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1058	NC_014931	GC	4	8	43820	43827	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1059	NC_014931	GAA	2	6	43868	43873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790734
1060	NC_014931	GC	3	6	43874	43879	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1061	NC_014931	CTCG	2	8	43886	43893	0 %	25 %	25 %	50 %	319790734
1062	NC_014931	CG	3	6	43892	43897	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1063	NC_014931	TGC	2	6	43932	43937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1064	NC_014931	CG	3	6	43945	43950	0 %	0 %	50 %	50 %	319790734
1065	NC_014931	CGAA	2	8	44013	44020	50 %	0 %	25 %	25 %	319790734
1066	NC_014931	GGC	2	6	44072	44077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790734
1067	NC_014931	CGA	2	6	44122	44127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790734
1068	NC_014931	GGGGCT	2	12	44215	44226	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319790734
1069	NC_014931	GCG	2	6	44469	44474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790735
1070	NC_014931	GCCGC	2	10	44503	44512	0 %	0 %	40 %	60 %	319790735
1071	NC_014931	GCGAA	2	10	44530	44539	40 %	0 %	40 %	20 %	319790735
1072	NC_014931	GCA	2	6	44546	44551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790735
1073	NC_014931	GC	3	6	44574	44579	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
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1075	NC_014931	GAT	2	6	44671	44676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790735
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1077	NC_014931	AC	3	6	44703	44708	50 %	0 %	0 %	50 %	319790735
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1081	NC_014931	CTCG	2	8	44756	44763	0 %	25 %	25 %	50 %	319790735
1082	NC_014931	CAG	3	9	44797	44805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790735
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1089	NC_014931	GC	4	8	45092	45099	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
1090	NC_014931	CGA	2	6	45117	45122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790735
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1099	NC_014931	CTG	2	6	45513	45518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790736
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1103	NC_014931	GGCGC	2	10	45679	45688	0 %	0 %	60 %	40 %	319790736
1104	NC_014931	CCG	2	6	45832	45837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790737
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1107	NC_014931	TGC	2	6	46021	46026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790737
1108	NC_014931	CG	3	6	46061	46066	0 %	0 %	50 %	50 %	319790737
1109	NC_014931	GCA	2	6	46096	46101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790737
1110	NC_014931	GGC	2	6	46113	46118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790737
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1112	NC_014931	CGC	3	9	46282	46290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790738
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1114	NC_014931	CCTT	2	8	46398	46405	0 %	50 %	0 %	50 %	319790738
1115	NC_014931	TCG	2	6	46413	46418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790738
1116	NC_014931	GTT	2	6	46439	46444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790738
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1118	NC_014931	GCC	2	6	46463	46468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790738
1119	NC_014931	CG	3	6	46525	46530	0 %	0 %	50 %	50 %	319790738
1120	NC_014931	GCC	2	6	46532	46537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790738
1121	NC_014931	GAT	2	6	46550	46555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790738
1122	NC_014931	CGT	2	6	46633	46638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790738
1123	NC_014931	GGCG	2	8	46640	46647	0 %	0 %	75 %	25 %	319790738
1124	NC_014931	GCC	3	9	46676	46684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790738
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1126	NC_014931	TGGA	2	8	46737	46744	25 %	25 %	50 %	0 %	319790738
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