MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014931	GCG	2	6	205866	205871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790887
5002	NC_014931	GC	3	6	205899	205904	0 %	0 %	50 %	50 %	319790887
5003	NC_014931	GGCG	2	8	205907	205914	0 %	0 %	75 %	25 %	319790887
5004	NC_014931	TCA	2	6	205921	205926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790887
5005	NC_014931	GCT	2	6	205927	205932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5006	NC_014931	CGA	2	6	205976	205981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5007	NC_014931	TGC	2	6	206005	206010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5008	NC_014931	GCT	2	6	206050	206055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5009	NC_014931	ACG	2	6	206061	206066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5010	NC_014931	CTG	2	6	206118	206123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790887
5011	NC_014931	AAC	2	6	206124	206129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790887
5012	NC_014931	CCG	2	6	206131	206136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790887
5013	NC_014931	GCC	2	6	206151	206156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790887
5014	NC_014931	CGG	2	6	206228	206233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790888
5015	NC_014931	GCC	2	6	206253	206258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790888
5016	NC_014931	GCT	2	6	206271	206276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790888
5017	NC_014931	GC	3	6	206296	206301	0 %	0 %	50 %	50 %	319790888
5018	NC_014931	GCC	2	6	206392	206397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790888
5019	NC_014931	CG	3	6	206414	206419	0 %	0 %	50 %	50 %	319790888
5020	NC_014931	TGC	2	6	206585	206590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5021	NC_014931	CG	3	6	206601	206606	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5022	NC_014931	GC	3	6	206626	206631	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5023	NC_014931	ACCAC	2	10	206656	206665	40 %	0 %	0 %	60 %	319790889
5024	NC_014931	GC	3	6	206719	206724	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5025	NC_014931	CCG	2	6	206725	206730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790889
5026	NC_014931	CG	3	6	206742	206747	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5027	NC_014931	CAGC	2	8	206759	206766	25 %	0 %	25 %	50 %	319790889
5028	NC_014931	CGG	2	6	206779	206784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790889
5029	NC_014931	GCC	2	6	206799	206804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790889
5030	NC_014931	GC	3	6	206831	206836	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5031	NC_014931	TGG	2	6	206857	206862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790889
5032	NC_014931	CGGC	2	8	206871	206878	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5033	NC_014931	ACG	2	6	206880	206885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5034	NC_014931	GCC	2	6	206931	206936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790889
5035	NC_014931	CGA	2	6	206938	206943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5036	NC_014931	GGT	2	6	206950	206955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790889
5037	NC_014931	CCA	2	6	206971	206976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790889
5038	NC_014931	GC	3	6	207049	207054	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5039	NC_014931	GCA	2	6	207064	207069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5040	NC_014931	GCA	2	6	207112	207117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5041	NC_014931	AGCG	2	8	207140	207147	25 %	0 %	50 %	25 %	319790889
5042	NC_014931	CAG	2	6	207167	207172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790889
5043	NC_014931	GAGCGC	2	12	207218	207229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319790889
5044	NC_014931	GCG	3	9	207291	207299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790889
5045	NC_014931	CCG	2	6	207379	207384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790889
5046	NC_014931	CG	3	6	207405	207410	0 %	0 %	50 %	50 %	319790889
5047	NC_014931	CGT	2	6	207593	207598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790890
5048	NC_014931	GTC	2	6	207599	207604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790890
5049	NC_014931	TGA	2	6	207660	207665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790890
5050	NC_014931	GGT	2	6	207712	207717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790890
5051	NC_014931	CGTG	2	8	207778	207785	0 %	25 %	50 %	25 %	319790890
5052	NC_014931	GCC	2	6	207798	207803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790890
5053	NC_014931	GGGC	2	8	207829	207836	0 %	0 %	75 %	25 %	319790890
5054	NC_014931	TTC	2	6	207923	207928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790890
5055	NC_014931	CTG	2	6	208074	208079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790891
5056	NC_014931	GGC	2	6	208109	208114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790891
5057	NC_014931	GCC	2	6	208159	208164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790891
5058	NC_014931	TGC	2	6	208181	208186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790891
5059	NC_014931	CG	4	8	208217	208224	0 %	0 %	50 %	50 %	319790891
5060	NC_014931	GC	3	6	208270	208275	0 %	0 %	50 %	50 %	319790891
5061	NC_014931	GCT	2	6	208277	208282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790891
5062	NC_014931	GCT	2	6	208286	208291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790891
5063	NC_014931	GGC	3	9	208323	208331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790891
5064	NC_014931	TCG	2	6	208408	208413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790891
5065	NC_014931	GC	4	8	208465	208472	0 %	0 %	50 %	50 %	319790891
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5068	NC_014931	GCGA	2	8	208575	208582	25 %	0 %	50 %	25 %	319790891
5069	NC_014931	CGGC	2	8	208589	208596	0 %	0 %	50 %	50 %	319790891
5070	NC_014931	GGC	2	6	208635	208640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790891
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5072	NC_014931	GCGGG	2	10	208717	208726	0 %	0 %	80 %	20 %	319790891
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5091	NC_014931	GCCGC	2	10	209312	209321	0 %	0 %	40 %	60 %	319790892
5092	NC_014931	GGT	2	6	209326	209331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790892
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5103	NC_014931	GCACGA	2	12	209790	209801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790892
5104	NC_014931	CTTCG	2	10	209815	209824	0 %	40 %	20 %	40 %	319790892
5105	NC_014931	GCC	2	6	209870	209875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790892
5106	NC_014931	GTC	2	6	209888	209893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790892
5107	NC_014931	CCA	2	6	209895	209900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790892
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5109	NC_014931	CGGG	2	8	209926	209933	0 %	0 %	75 %	25 %	319790892
5110	NC_014931	GCA	2	6	209943	209948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790892
5111	NC_014931	C	6	6	210273	210278	0 %	0 %	0 %	100 %	319790893
5112	NC_014931	CG	3	6	210374	210379	0 %	0 %	50 %	50 %	319790893
5113	NC_014931	GAT	2	6	210380	210385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790893
5114	NC_014931	GC	3	6	210420	210425	0 %	0 %	50 %	50 %	319790893
5115	NC_014931	CAG	2	6	210426	210431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790893
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5117	NC_014931	CG	4	8	210539	210546	0 %	0 %	50 %	50 %	319790893
5118	NC_014931	AGGGCA	2	12	210607	210618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319790893
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5122	NC_014931	GC	3	6	210767	210772	0 %	0 %	50 %	50 %	319790893
5123	NC_014931	TGG	2	6	210784	210789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790893
5124	NC_014931	CAT	2	6	210815	210820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790893
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5126	NC_014931	TCA	2	6	210886	210891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790893
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5231	NC_014931	GCC	2	6	215028	215033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790895
5232	NC_014931	CG	5	10	215036	215045	0 %	0 %	50 %	50 %	319790895
5233	NC_014931	CACG	2	8	215060	215067	25 %	0 %	25 %	50 %	319790895
5234	NC_014931	GGC	2	6	215069	215074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790895
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5239	NC_014931	CGA	2	6	215234	215239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790895
5240	NC_014931	GGT	2	6	215303	215308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790895
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5242	NC_014931	GCG	2	6	215363	215368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790895
5243	NC_014931	CG	3	6	215395	215400	0 %	0 %	50 %	50 %	319790895
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5363	NC_014931	CGG	2	6	220051	220056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790900
5364	NC_014931	AAG	2	6	220061	220066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790900
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5366	NC_014931	CGG	2	6	220135	220140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790900
5367	NC_014931	AGC	2	6	220194	220199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790900
5368	NC_014931	CGG	2	6	220224	220229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790900
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5382	NC_014931	TGC	2	6	220698	220703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790900
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5392	NC_014931	GC	3	6	220965	220970	0 %	0 %	50 %	50 %	319790900
5393	NC_014931	CG	3	6	220975	220980	0 %	0 %	50 %	50 %	319790900
5394	NC_014931	GC	3	6	221064	221069	0 %	0 %	50 %	50 %	319790901
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5468	NC_014931	CTCGG	2	10	224224	224233	0 %	20 %	40 %	40 %	319790904
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5473	NC_014931	CCA	2	6	224381	224386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790904
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5478	NC_014931	TCG	2	6	224758	224763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790905
5479	NC_014931	GC	3	6	224833	224838	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5480	NC_014931	TGC	2	6	224848	224853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790905
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5482	NC_014931	CG	4	8	224971	224978	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5483	NC_014931	TCGA	2	8	224994	225001	25 %	25 %	25 %	25 %	319790905
5484	NC_014931	TCGG	2	8	225007	225014	0 %	25 %	50 %	25 %	319790905
5485	NC_014931	TCCT	2	8	225020	225027	0 %	50 %	0 %	50 %	319790905
5486	NC_014931	TCG	3	9	225043	225051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790905
5487	NC_014931	GCT	3	9	225077	225085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790905
5488	NC_014931	GC	3	6	225113	225118	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5489	NC_014931	GC	3	6	225145	225150	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5490	NC_014931	CG	3	6	225235	225240	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5491	NC_014931	GTG	4	12	225288	225299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790905
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5497	NC_014931	GCCG	2	8	225541	225548	0 %	0 %	50 %	50 %	319790905
5498	NC_014931	CGC	2	6	225566	225571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790905
5499	NC_014931	TGA	2	6	225640	225645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790905
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