MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	239819986
2	NC_012792	C	6	6	2880	2885	0 %	0 %	0 %	100 %	239819989
3	NC_012792	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	239819989
4	NC_012792	G	6	6	9089	9094	0 %	0 %	100 %	0 %	239819995
5	NC_012792	G	6	6	11454	11459	0 %	0 %	100 %	0 %	239819997
6	NC_012792	G	6	6	15013	15018	0 %	0 %	100 %	0 %	239819999
7	NC_012792	T	6	6	54134	54139	0 %	100 %	0 %	0 %	239820032
8	NC_012792	A	6	6	71885	71890	100 %	0 %	0 %	0 %	239820047
9	NC_012792	A	6	6	81378	81383	100 %	0 %	0 %	0 %	239820058
10	NC_012792	A	6	6	87326	87331	100 %	0 %	0 %	0 %	239820063
11	NC_012792	C	7	7	108476	108482	0 %	0 %	0 %	100 %	239820081
12	NC_012792	C	7	7	115269	115275	0 %	0 %	0 %	100 %	239820086
13	NC_012792	C	6	6	122414	122419	0 %	0 %	0 %	100 %	239820092
14	NC_012792	G	6	6	127252	127257	0 %	0 %	100 %	0 %	239820098
15	NC_012792	A	7	7	145450	145456	100 %	0 %	0 %	0 %	239820119
16	NC_012792	C	6	6	148033	148038	0 %	0 %	0 %	100 %	239820121
17	NC_012792	A	6	6	150146	150151	100 %	0 %	0 %	0 %	239820123
18	NC_012792	G	6	6	173065	173070	0 %	0 %	100 %	0 %	239820146
19	NC_012792	C	6	6	188269	188274	0 %	0 %	0 %	100 %	239820160
20	NC_012792	C	6	6	188415	188420	0 %	0 %	0 %	100 %	239820160
21	NC_012792	C	6	6	189445	189450	0 %	0 %	0 %	100 %	239820163
22	NC_012792	T	6	6	189565	189570	0 %	100 %	0 %	0 %	239820163
23	NC_012792	G	6	6	208363	208368	0 %	0 %	100 %	0 %	239820180
24	NC_012792	C	6	6	243069	243074	0 %	0 %	0 %	100 %	239820213
25	NC_012792	A	6	6	243757	243762	100 %	0 %	0 %	0 %	239820214
26	NC_012792	C	6	6	278310	278315	0 %	0 %	0 %	100 %	239820243
27	NC_012792	C	7	7	278436	278442	0 %	0 %	0 %	100 %	239820243
28	NC_012792	T	8	8	290123	290130	0 %	100 %	0 %	0 %	239820256
29	NC_012792	A	6	6	296924	296929	100 %	0 %	0 %	0 %	239820261
30	NC_012792	C	6	6	319289	319294	0 %	0 %	0 %	100 %	239820285
31	NC_012792	C	6	6	322456	322461	0 %	0 %	0 %	100 %	239820288
32	NC_012792	C	6	6	323878	323883	0 %	0 %	0 %	100 %	239820290
33	NC_012792	C	8	8	324666	324673	0 %	0 %	0 %	100 %	239820291
34	NC_012792	G	6	6	326582	326587	0 %	0 %	100 %	0 %	239820294
35	NC_012792	T	6	6	334478	334483	0 %	100 %	0 %	0 %	239820302
36	NC_012792	C	6	6	336384	336389	0 %	0 %	0 %	100 %	239820304
37	NC_012792	A	6	6	360930	360935	100 %	0 %	0 %	0 %	239820328
38	NC_012792	C	6	6	365283	365288	0 %	0 %	0 %	100 %	239820331
39	NC_012792	C	6	6	372457	372462	0 %	0 %	0 %	100 %	239820337
40	NC_012792	T	6	6	376303	376308	0 %	100 %	0 %	0 %	239820340
41	NC_012792	C	6	6	390091	390096	0 %	0 %	0 %	100 %	239820353
42	NC_012792	A	6	6	390614	390619	100 %	0 %	0 %	0 %	239820353
43	NC_012792	C	6	6	391189	391194	0 %	0 %	0 %	100 %	239820353
44	NC_012792	A	7	7	395045	395051	100 %	0 %	0 %	0 %	239820354
45	NC_012792	A	6	6	395078	395083	100 %	0 %	0 %	0 %	239820354
46	NC_012792	T	6	6	411374	411379	0 %	100 %	0 %	0 %	239820368
47	NC_012792	G	6	6	428750	428755	0 %	0 %	100 %	0 %	239820384
48	NC_012792	A	7	7	439333	439339	100 %	0 %	0 %	0 %	239820397
49	NC_012792	T	6	6	457083	457088	0 %	100 %	0 %	0 %	239820420
50	NC_012792	C	6	6	485117	485122	0 %	0 %	0 %	100 %	239820450
51	NC_012792	G	6	6	509937	509942	0 %	0 %	100 %	0 %	239820474
52	NC_012792	G	6	6	511404	511409	0 %	0 %	100 %	0 %	239820476
53	NC_012792	T	6	6	520648	520653	0 %	100 %	0 %	0 %	239820486
54	NC_012792	C	6	6	520720	520725	0 %	0 %	0 %	100 %	239820486
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60	NC_012792	T	6	6	564985	564990	0 %	100 %	0 %	0 %	239820519
61	NC_012792	T	6	6	565676	565681	0 %	100 %	0 %	0 %	239820520
62	NC_012792	A	6	6	571321	571326	100 %	0 %	0 %	0 %	239820523
63	NC_012792	A	6	6	575561	575566	100 %	0 %	0 %	0 %	239820532
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65	NC_012792	G	6	6	583638	583643	0 %	0 %	100 %	0 %	239820539
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92	NC_012792	G	6	6	728669	728674	0 %	0 %	100 %	0 %	239820654
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103	NC_012792	G	7	7	830386	830392	0 %	0 %	100 %	0 %	239820755
104	NC_012792	A	6	6	833001	833006	100 %	0 %	0 %	0 %	239820757
105	NC_012792	C	6	6	857047	857052	0 %	0 %	0 %	100 %	239820780
106	NC_012792	C	6	6	877668	877673	0 %	0 %	0 %	100 %	239820797
107	NC_012792	C	6	6	894949	894954	0 %	0 %	0 %	100 %	239820811
108	NC_012792	C	6	6	922097	922102	0 %	0 %	0 %	100 %	239820832
109	NC_012792	A	6	6	922825	922830	100 %	0 %	0 %	0 %	239820832
110	NC_012792	A	6	6	939450	939455	100 %	0 %	0 %	0 %	239820853
111	NC_012792	G	6	6	978589	978594	0 %	0 %	100 %	0 %	239820886
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114	NC_012792	A	6	6	1002515	1002520	100 %	0 %	0 %	0 %	239820907
115	NC_012792	A	6	6	1022732	1022737	100 %	0 %	0 %	0 %	239820929
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121	NC_012792	G	6	6	1083817	1083822	0 %	0 %	100 %	0 %	239820989
122	NC_012792	G	6	6	1085543	1085548	0 %	0 %	100 %	0 %	239820991
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124	NC_012792	T	6	6	1103338	1103343	0 %	100 %	0 %	0 %	239820994
125	NC_012792	A	6	6	1104356	1104361	100 %	0 %	0 %	0 %	239820995
126	NC_012792	A	6	6	1104518	1104523	100 %	0 %	0 %	0 %	239820995
127	NC_012792	C	6	6	1105410	1105415	0 %	0 %	0 %	100 %	239820997

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.