MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 27083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012792	GCA	3	9	142697	142705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3502	NC_012792	ACA	2	6	142717	142722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820116
3503	NC_012792	GC	4	8	142725	142732	0 %	0 %	50 %	50 %	239820116
3504	NC_012792	TCA	2	6	142753	142758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820116
3505	NC_012792	GCC	2	6	142762	142767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820116
3506	NC_012792	GCG	2	6	142794	142799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820116
3507	NC_012792	GAC	2	6	142852	142857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3508	NC_012792	CCG	2	6	142868	142873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820117
3509	NC_012792	GCA	2	6	142967	142972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3510	NC_012792	GCCG	2	8	142982	142989	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3511	NC_012792	GTC	2	6	142998	143003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3512	NC_012792	TGT	2	6	143072	143077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820117
3513	NC_012792	GCCG	2	8	143091	143098	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3514	NC_012792	GCC	2	6	143142	143147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820117
3515	NC_012792	TCGA	2	8	143185	143192	25 %	25 %	25 %	25 %	239820117
3516	NC_012792	GC	3	6	143208	143213	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3517	NC_012792	CCA	2	6	143231	143236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820117
3518	NC_012792	GCGCC	2	10	143259	143268	0 %	0 %	40 %	60 %	239820117
3519	NC_012792	CG	3	6	143295	143300	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3520	NC_012792	CAG	2	6	143409	143414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3521	NC_012792	GCA	2	6	143447	143452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3522	NC_012792	CGG	2	6	143468	143473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820117
3523	NC_012792	GC	4	8	143501	143508	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3524	NC_012792	AGC	2	6	143509	143514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820117
3525	NC_012792	GTA	2	6	143529	143534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820117
3526	NC_012792	CCT	2	6	143543	143548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820117
3527	NC_012792	CCG	2	6	143630	143635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820117
3528	NC_012792	CG	3	6	143656	143661	0 %	0 %	50 %	50 %	239820117
3529	NC_012792	CCA	2	6	143702	143707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820117
3530	NC_012792	CATT	2	8	143729	143736	25 %	50 %	0 %	25 %	239820117
3531	NC_012792	CAT	2	6	143836	143841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820118
3532	NC_012792	CT	3	6	143849	143854	0 %	50 %	0 %	50 %	239820118
3533	NC_012792	CGG	2	6	143919	143924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820118
3534	NC_012792	CGT	4	12	143935	143946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820118
3535	NC_012792	CGC	2	6	143951	143956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820118
3536	NC_012792	GC	3	6	143981	143986	0 %	0 %	50 %	50 %	239820118
3537	NC_012792	TCG	2	6	144009	144014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820118
3538	NC_012792	CGC	2	6	144052	144057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820118
3539	NC_012792	ACG	2	6	144150	144155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820118
3540	NC_012792	CCA	2	6	144165	144170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820118
3541	NC_012792	CG	3	6	144176	144181	0 %	0 %	50 %	50 %	239820118
3542	NC_012792	TTC	2	6	144185	144190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820118
3543	NC_012792	CGG	2	6	144223	144228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820118
3544	NC_012792	ATC	2	6	144233	144238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820118
3545	NC_012792	GCA	2	6	144258	144263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820118
3546	NC_012792	GCA	2	6	144294	144299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820118
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3548	NC_012792	CCCGG	2	10	144377	144386	0 %	0 %	40 %	60 %	239820118
3549	NC_012792	GGC	2	6	144454	144459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820118
3550	NC_012792	GCG	2	6	144506	144511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820118
3551	NC_012792	GCGA	2	8	144521	144528	25 %	0 %	50 %	25 %	239820118
3552	NC_012792	CCA	2	6	144629	144634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820119
3553	NC_012792	GCAG	2	8	144638	144645	25 %	0 %	50 %	25 %	239820119
3554	NC_012792	CGC	2	6	144648	144653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820119
3555	NC_012792	GCA	3	9	144713	144721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3556	NC_012792	AGAT	2	8	144742	144749	50 %	25 %	25 %	0 %	239820119
3557	NC_012792	CGCGA	2	10	144784	144793	20 %	0 %	40 %	40 %	239820119
3558	NC_012792	CCG	2	6	144851	144856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820119
3559	NC_012792	TCG	2	6	144893	144898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3560	NC_012792	CAG	2	6	144924	144929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3561	NC_012792	CTG	2	6	145038	145043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3562	NC_012792	CGC	2	6	145120	145125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820119
3563	NC_012792	GCA	2	6	145142	145147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3564	NC_012792	CAG	2	6	145158	145163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820119
3565	NC_012792	TTC	2	6	145173	145178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820119
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3567	NC_012792	CGTAGA	2	12	145241	145252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239820119
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3569	NC_012792	CGG	2	6	145265	145270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820119
3570	NC_012792	CAGC	2	8	145272	145279	25 %	0 %	25 %	50 %	239820119
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3581	NC_012792	GC	3	6	145529	145534	0 %	0 %	50 %	50 %	239820119
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3589	NC_012792	GCA	2	6	145863	145868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820120
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3593	NC_012792	CAGC	2	8	145954	145961	25 %	0 %	25 %	50 %	239820120
3594	NC_012792	CCGG	2	8	145989	145996	0 %	0 %	50 %	50 %	239820120
3595	NC_012792	CGCCGG	2	12	146028	146039	0 %	0 %	50 %	50 %	239820120
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3602	NC_012792	GGT	2	6	146383	146388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820120
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3605	NC_012792	GCCG	2	8	146490	146497	0 %	0 %	50 %	50 %	239820120
3606	NC_012792	GTA	2	6	146542	146547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820120
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3622	NC_012792	CGT	2	6	147186	147191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820120
3623	NC_012792	GGC	2	6	147344	147349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820120
3624	NC_012792	GGC	3	9	147436	147444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820120
3625	NC_012792	CTT	2	6	147451	147456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820120
3626	NC_012792	GAC	2	6	147771	147776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820121
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3654	NC_012792	CCG	2	6	148796	148801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820121
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3740	NC_012792	CGA	2	6	153285	153290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820126
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3983	NC_012792	GAG	2	6	163933	163938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820138
3984	NC_012792	GCCG	2	8	165013	165020	0 %	0 %	50 %	50 %	239820139
3985	NC_012792	CGA	2	6	165046	165051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3986	NC_012792	AGC	2	6	165123	165128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3987	NC_012792	TGC	2	6	165151	165156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3988	NC_012792	GCC	3	9	165165	165173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820139
3989	NC_012792	GCG	2	6	165235	165240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820139
3990	NC_012792	TCC	2	6	165269	165274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820139
3991	NC_012792	GTA	2	6	165290	165295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820139
3992	NC_012792	GCGG	2	8	165305	165312	0 %	0 %	75 %	25 %	239820139
3993	NC_012792	GTG	2	6	165389	165394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820139
3994	NC_012792	CAG	2	6	165431	165436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3995	NC_012792	GCA	2	6	165445	165450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3996	NC_012792	AGT	2	6	165523	165528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820139
3997	NC_012792	CGA	2	6	165565	165570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3998	NC_012792	CTG	2	6	165581	165586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820139
3999	NC_012792	GCTGC	2	10	165625	165634	0 %	20 %	40 %	40 %	239820139
4000	NC_012792	TCA	2	6	165646	165651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820139

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