MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 27083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012792	CGG	2	6	121585	121590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820092
3002	NC_012792	GTC	2	6	121622	121627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3003	NC_012792	CG	3	6	121659	121664	0 %	0 %	50 %	50 %	239820092
3004	NC_012792	ACC	2	6	121692	121697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820092
3005	NC_012792	CGA	2	6	121720	121725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3006	NC_012792	GCT	2	6	121732	121737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3007	NC_012792	GGCG	2	8	121738	121745	0 %	0 %	75 %	25 %	239820092
3008	NC_012792	GCA	2	6	121765	121770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3009	NC_012792	CGC	2	6	121771	121776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3010	NC_012792	GC	3	6	121787	121792	0 %	0 %	50 %	50 %	239820092
3011	NC_012792	GTG	2	6	121799	121804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820092
3012	NC_012792	GCC	2	6	121822	121827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3013	NC_012792	GCG	2	6	121962	121967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820092
3014	NC_012792	CCG	2	6	121978	121983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3015	NC_012792	ATCGC	2	10	121995	122004	20 %	20 %	20 %	40 %	239820092
3016	NC_012792	GC	3	6	122041	122046	0 %	0 %	50 %	50 %	239820092
3017	NC_012792	CG	5	10	122071	122080	0 %	0 %	50 %	50 %	239820092
3018	NC_012792	CAG	2	6	122081	122086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3019	NC_012792	GCGCG	2	10	122087	122096	0 %	0 %	60 %	40 %	239820092
3020	NC_012792	TGC	2	6	122145	122150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3021	NC_012792	CGC	2	6	122169	122174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3022	NC_012792	ATCG	2	8	122188	122195	25 %	25 %	25 %	25 %	239820092
3023	NC_012792	TGA	2	6	122232	122237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820092
3024	NC_012792	GCC	2	6	122291	122296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3025	NC_012792	GCC	2	6	122304	122309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3026	NC_012792	CCG	2	6	122313	122318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820092
3027	NC_012792	CTG	2	6	122357	122362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3028	NC_012792	CAG	2	6	122372	122377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820092
3029	NC_012792	C	6	6	122414	122419	0 %	0 %	0 %	100 %	239820092
3030	NC_012792	ACC	2	6	122420	122425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820092
3031	NC_012792	ACC	2	6	122549	122554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820093
3032	NC_012792	TCA	3	9	122609	122617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820093
3033	NC_012792	CGA	2	6	122652	122657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3034	NC_012792	CGT	2	6	122688	122693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3035	NC_012792	TCGA	2	8	122728	122735	25 %	25 %	25 %	25 %	239820093
3036	NC_012792	CG	3	6	122773	122778	0 %	0 %	50 %	50 %	239820093
3037	NC_012792	CACG	2	8	122784	122791	25 %	0 %	25 %	50 %	239820093
3038	NC_012792	CTG	2	6	122839	122844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3039	NC_012792	GCA	2	6	122868	122873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3040	NC_012792	AGCCCC	2	12	122879	122890	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239820093
3041	NC_012792	CAA	2	6	122907	122912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820093
3042	NC_012792	ACG	3	9	122936	122944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3043	NC_012792	TCC	2	6	122954	122959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820093
3044	NC_012792	GCCG	2	8	122979	122986	0 %	0 %	50 %	50 %	239820093
3045	NC_012792	GC	3	6	122995	123000	0 %	0 %	50 %	50 %	239820093
3046	NC_012792	AGG	2	6	123029	123034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820093
3047	NC_012792	CAG	2	6	123088	123093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820093
3048	NC_012792	CGGC	2	8	123181	123188	0 %	0 %	50 %	50 %	239820093
3049	NC_012792	GC	3	6	123262	123267	0 %	0 %	50 %	50 %	239820093
3050	NC_012792	CGC	2	6	123284	123289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820093
3051	NC_012792	AATG	2	8	123492	123499	50 %	25 %	25 %	0 %	239820094
3052	NC_012792	GCA	2	6	123536	123541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3053	NC_012792	GCT	2	6	123641	123646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3054	NC_012792	CG	3	6	123665	123670	0 %	0 %	50 %	50 %	239820094
3055	NC_012792	CTT	2	6	123738	123743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820094
3056	NC_012792	GGCC	2	8	123834	123841	0 %	0 %	50 %	50 %	239820094
3057	NC_012792	TTC	2	6	123871	123876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820094
3058	NC_012792	ATC	2	6	123892	123897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820094
3059	NC_012792	CCG	2	6	123909	123914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820094
3060	NC_012792	CTA	2	6	123936	123941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820094
3061	NC_012792	GCT	2	6	123944	123949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3062	NC_012792	GCC	2	6	123970	123975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820094
3063	NC_012792	GCA	2	6	124002	124007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3064	NC_012792	GCA	2	6	124020	124025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3065	NC_012792	TGC	2	6	124031	124036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3066	NC_012792	GC	3	6	124035	124040	0 %	0 %	50 %	50 %	239820094
3067	NC_012792	TGGGC	2	10	124088	124097	0 %	20 %	60 %	20 %	239820094
3068	NC_012792	CAA	2	6	124098	124103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820094
3069	NC_012792	CGT	2	6	124157	124162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820094
3070	NC_012792	ACC	2	6	124173	124178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820094
3071	NC_012792	ATC	2	6	124211	124216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
3072	NC_012792	GCG	2	6	124248	124253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820095
3073	NC_012792	GCT	2	6	124282	124287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3074	NC_012792	CTG	2	6	124316	124321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3075	NC_012792	CGA	2	6	124327	124332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3076	NC_012792	ACC	2	6	124341	124346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820095
3077	NC_012792	CTA	2	6	124348	124353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
3078	NC_012792	TCA	2	6	124449	124454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
3079	NC_012792	ACT	2	6	124455	124460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
3080	NC_012792	AGC	2	6	124551	124556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3081	NC_012792	TGG	2	6	124596	124601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820095
3082	NC_012792	CGG	2	6	124647	124652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820095
3083	NC_012792	CAT	2	6	124711	124716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
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3085	NC_012792	CAC	2	6	124766	124771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820095
3086	NC_012792	GCC	2	6	124781	124786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820095
3087	NC_012792	TCG	2	6	124806	124811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3088	NC_012792	TCG	2	6	124844	124849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3089	NC_012792	CCA	2	6	124870	124875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820095
3090	NC_012792	AGC	2	6	124902	124907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820095
3091	NC_012792	ACT	2	6	124974	124979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820095
3092	NC_012792	GCG	2	6	125007	125012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820095
3093	NC_012792	GGC	2	6	125023	125028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820095
3094	NC_012792	CAC	2	6	125029	125034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820095
3095	NC_012792	CGA	2	6	125053	125058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820095
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3098	NC_012792	CTT	2	6	125259	125264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820096
3099	NC_012792	CGC	2	6	125316	125321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820096
3100	NC_012792	GC	3	6	125320	125325	0 %	0 %	50 %	50 %	239820096
3101	NC_012792	TCG	2	6	125332	125337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820096
3102	NC_012792	CCGA	2	8	125409	125416	25 %	0 %	25 %	50 %	239820096
3103	NC_012792	GCC	2	6	125478	125483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820096
3104	NC_012792	CGG	2	6	125510	125515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820096
3105	NC_012792	CGG	2	6	125582	125587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820096
3106	NC_012792	GCT	2	6	125600	125605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820096
3107	NC_012792	ATC	2	6	125640	125645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820096
3108	NC_012792	CGG	2	6	125680	125685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820096
3109	NC_012792	GCC	2	6	125826	125831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820096
3110	NC_012792	TCT	2	6	125952	125957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820097
3111	NC_012792	GTC	2	6	125969	125974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820097
3112	NC_012792	GCC	2	6	125993	125998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820097
3113	NC_012792	TGC	2	6	126147	126152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820097
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3115	NC_012792	GCG	2	6	126204	126209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820097
3116	NC_012792	TTC	2	6	126261	126266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820097
3117	NC_012792	TCG	2	6	126300	126305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820097
3118	NC_012792	CGAC	2	8	126312	126319	25 %	0 %	25 %	50 %	239820097
3119	NC_012792	TGG	2	6	126333	126338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820097
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3121	NC_012792	CAA	2	6	126598	126603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820097
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3229	NC_012792	CTGCG	2	10	131200	131209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820102
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3235	NC_012792	GC	3	6	131305	131310	0 %	0 %	50 %	50 %	239820102
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3241	NC_012792	CCG	2	6	131490	131495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820102
3242	NC_012792	CGG	2	6	131673	131678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820102
3243	NC_012792	CG	3	6	131682	131687	0 %	0 %	50 %	50 %	239820102
3244	NC_012792	CGCGC	2	10	131880	131889	0 %	0 %	40 %	60 %	239820103
3245	NC_012792	CAGC	2	8	131917	131924	25 %	0 %	25 %	50 %	239820103
3246	NC_012792	CAC	2	6	131939	131944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820103
3247	NC_012792	CTG	2	6	132006	132011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
3248	NC_012792	ACC	2	6	132012	132017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820103
3249	NC_012792	CTC	2	6	132024	132029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820103
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3251	NC_012792	GGC	2	6	132053	132058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820103
3252	NC_012792	GCT	2	6	132110	132115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
3253	NC_012792	CGG	2	6	132182	132187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820103
3254	NC_012792	TGC	3	9	132208	132216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
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3257	NC_012792	GCATC	2	10	132298	132307	20 %	20 %	20 %	40 %	239820103
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3265	NC_012792	GCT	3	9	132641	132649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
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3267	NC_012792	CTG	2	6	132732	132737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
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3272	NC_012792	CGC	2	6	132848	132853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820103
3273	NC_012792	CTG	2	6	132888	132893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820103
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3328	NC_012792	CTG	2	6	135235	135240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820106
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3332	NC_012792	CGG	2	6	135376	135381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820106
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3338	NC_012792	CTG	2	6	135672	135677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820107
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3345	NC_012792	TGA	2	6	135793	135798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820107
3346	NC_012792	CCG	2	6	135813	135818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820107
3347	NC_012792	ACG	2	6	135844	135849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820107
3348	NC_012792	CTACGT	2	12	135857	135868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239820107
3349	NC_012792	GGC	2	6	135900	135905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820107
3350	NC_012792	CGA	2	6	135950	135955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820107
3351	NC_012792	TCG	2	6	136003	136008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820107
3352	NC_012792	GAA	2	6	136019	136024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820107
3353	NC_012792	TTC	2	6	136038	136043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820107
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3355	NC_012792	CGGC	2	8	136415	136422	0 %	0 %	50 %	50 %	239820108
3356	NC_012792	GTG	2	6	136423	136428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820108
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3358	NC_012792	GGCG	2	8	136515	136522	0 %	0 %	75 %	25 %	239820108
3359	NC_012792	CGC	2	6	136529	136534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820108
3360	NC_012792	GC	4	8	136533	136540	0 %	0 %	50 %	50 %	239820108
3361	NC_012792	TCT	2	6	136604	136609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820108
3362	NC_012792	CGG	2	6	136632	136637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820108
3363	NC_012792	GGC	2	6	136641	136646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820108
3364	NC_012792	GCC	2	6	136654	136659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820108
3365	NC_012792	GGC	2	6	136691	136696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820108
3366	NC_012792	TGC	2	6	136769	136774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820108
3367	NC_012792	TTCG	2	8	136828	136835	0 %	50 %	25 %	25 %	239820108
3368	NC_012792	ATGC	2	8	136840	136847	25 %	25 %	25 %	25 %	239820108
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3372	NC_012792	GC	3	6	136916	136921	0 %	0 %	50 %	50 %	239820108
3373	NC_012792	GAAC	2	8	136941	136948	50 %	0 %	25 %	25 %	239820108
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3385	NC_012792	CGG	2	6	137666	137671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820110
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3391	NC_012792	AACGGC	2	12	137931	137942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820110
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3394	NC_012792	GCCG	2	8	138038	138045	0 %	0 %	50 %	50 %	239820110
3395	NC_012792	TGC	2	6	138049	138054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820110
3396	NC_012792	GC	3	6	138053	138058	0 %	0 %	50 %	50 %	239820110
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3453	NC_012792	GC	3	6	140949	140954	0 %	0 %	50 %	50 %	239820115
3454	NC_012792	CGA	2	6	140957	140962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820115
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3461	NC_012792	CCG	2	6	141178	141183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820115
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3472	NC_012792	CAC	2	6	141674	141679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820116
3473	NC_012792	GCGCG	2	10	141692	141701	0 %	0 %	60 %	40 %	239820116
3474	NC_012792	GAA	2	6	141750	141755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820116
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3479	NC_012792	GCT	2	6	141896	141901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3480	NC_012792	TGA	2	6	141931	141936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820116
3481	NC_012792	GCA	2	6	142049	142054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3482	NC_012792	CGG	2	6	142097	142102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820116
3483	NC_012792	CCA	2	6	142115	142120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820116
3484	NC_012792	GCG	2	6	142147	142152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820116
3485	NC_012792	ACC	2	6	142216	142221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820116
3486	NC_012792	AAG	2	6	142248	142253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820116
3487	NC_012792	CTT	2	6	142307	142312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820116
3488	NC_012792	TGC	2	6	142384	142389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3489	NC_012792	GC	3	6	142392	142397	0 %	0 %	50 %	50 %	239820116
3490	NC_012792	ACC	3	9	142441	142449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820116
3491	NC_012792	CGC	2	6	142463	142468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820116
3492	NC_012792	GC	3	6	142467	142472	0 %	0 %	50 %	50 %	239820116
3493	NC_012792	ACC	2	6	142489	142494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820116
3494	NC_012792	GCGCC	2	10	142528	142537	0 %	0 %	40 %	60 %	239820116
3495	NC_012792	AGC	2	6	142573	142578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3496	NC_012792	GCC	2	6	142592	142597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820116
3497	NC_012792	GCG	2	6	142609	142614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820116
3498	NC_012792	ACT	2	6	142651	142656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820116
3499	NC_012792	AGC	2	6	142660	142665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820116
3500	NC_012792	TGA	2	6	142684	142689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820116

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