MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 27083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012792	AGG	2	6	20268	20273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820004
502	NC_012792	CTCAAG	2	12	20297	20308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239820004
503	NC_012792	GAC	2	6	20327	20332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820004
504	NC_012792	CCG	2	6	20335	20340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820004
505	NC_012792	GC	3	6	20351	20356	0 %	0 %	50 %	50 %	239820004
506	NC_012792	CCT	2	6	20377	20382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820004
507	NC_012792	GAT	2	6	20383	20388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820004
508	NC_012792	GGCCA	2	10	20414	20423	20 %	0 %	40 %	40 %	239820004
509	NC_012792	GAG	2	6	20468	20473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820004
510	NC_012792	CGA	2	6	20475	20480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820004
511	NC_012792	CGA	2	6	20485	20490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820004
512	NC_012792	CGG	2	6	20529	20534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820004
513	NC_012792	CAT	2	6	20569	20574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820004
514	NC_012792	TCA	2	6	20586	20591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820004
515	NC_012792	GCGCG	2	10	20593	20602	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
516	NC_012792	GTG	2	6	20609	20614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820004
517	NC_012792	ATGC	2	8	20622	20629	25 %	25 %	25 %	25 %	239820004
518	NC_012792	CGG	2	6	20635	20640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820004
519	NC_012792	GT	3	6	20693	20698	0 %	50 %	50 %	0 %	239820004
520	NC_012792	CGG	2	6	20707	20712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820004
521	NC_012792	GCA	2	6	20734	20739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820004
522	NC_012792	GAT	2	6	20746	20751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820004
523	NC_012792	CG	3	6	20775	20780	0 %	0 %	50 %	50 %	239820004
524	NC_012792	CGCGG	2	10	20843	20852	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
525	NC_012792	GCC	2	6	20860	20865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820004
526	NC_012792	CTCG	2	8	20902	20909	0 %	25 %	25 %	50 %	239820004
527	NC_012792	GGT	2	6	20985	20990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820005
528	NC_012792	CGG	3	9	21000	21008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820005
529	NC_012792	CG	4	8	21042	21049	0 %	0 %	50 %	50 %	239820005
530	NC_012792	GAA	2	6	21075	21080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820005
531	NC_012792	GCC	2	6	21163	21168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
532	NC_012792	CCG	2	6	21191	21196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
533	NC_012792	CAA	2	6	21225	21230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820005
534	NC_012792	CATCG	2	10	21279	21288	20 %	20 %	20 %	40 %	239820005
535	NC_012792	ACT	2	6	21308	21313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820005
536	NC_012792	CTGC	2	8	21330	21337	0 %	25 %	25 %	50 %	239820005
537	NC_012792	GGGCA	2	10	21397	21406	20 %	0 %	60 %	20 %	239820005
538	NC_012792	GC	3	6	21434	21439	0 %	0 %	50 %	50 %	239820005
539	NC_012792	CG	3	6	21452	21457	0 %	0 %	50 %	50 %	239820005
540	NC_012792	CCT	2	6	21467	21472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820005
541	NC_012792	GGA	2	6	21477	21482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820005
542	NC_012792	TGA	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820005
543	NC_012792	CGC	2	6	21524	21529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
544	NC_012792	CGA	2	6	21555	21560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820005
545	NC_012792	CGC	2	6	21576	21581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
546	NC_012792	GCC	2	6	21605	21610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
547	NC_012792	CGC	2	6	21620	21625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820005
548	NC_012792	GTG	2	6	21643	21648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820005
549	NC_012792	ACG	2	6	21676	21681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820005
550	NC_012792	CGG	2	6	21702	21707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820005
551	NC_012792	GAC	2	6	21817	21822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820006
552	NC_012792	GC	4	8	21876	21883	0 %	0 %	50 %	50 %	239820006
553	NC_012792	CGA	2	6	21957	21962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820006
554	NC_012792	CG	3	6	21963	21968	0 %	0 %	50 %	50 %	239820006
555	NC_012792	ACG	2	6	21971	21976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820006
556	NC_012792	GGC	2	6	21987	21992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820006
557	NC_012792	CG	3	6	22018	22023	0 %	0 %	50 %	50 %	239820006
558	NC_012792	GAA	2	6	22027	22032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820006
559	NC_012792	GGATC	2	10	22095	22104	20 %	20 %	40 %	20 %	239820006
560	NC_012792	GGT	2	6	22392	22397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820007
561	NC_012792	GGC	2	6	22404	22409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
562	NC_012792	GGC	2	6	22422	22427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
563	NC_012792	GCA	2	6	22453	22458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820007
564	NC_012792	GGC	2	6	22461	22466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
565	NC_012792	CGG	2	6	22478	22483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
566	NC_012792	GCG	3	9	22489	22497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
567	NC_012792	TGC	2	6	22505	22510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820007
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569	NC_012792	TGG	2	6	22600	22605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820007
570	NC_012792	CG	4	8	22622	22629	0 %	0 %	50 %	50 %	239820007
571	NC_012792	TGC	2	6	22630	22635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820007
572	NC_012792	CATC	2	8	22682	22689	25 %	25 %	0 %	50 %	239820007
573	NC_012792	CAT	2	6	22694	22699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820007
574	NC_012792	CGTGGG	2	12	22712	22723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	239820007
575	NC_012792	TCACCG	2	12	22768	22779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820007
576	NC_012792	GCC	2	6	22785	22790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820007
577	NC_012792	GCG	2	6	22840	22845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
578	NC_012792	CAT	2	6	22859	22864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820007
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580	NC_012792	GCG	2	6	22983	22988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820007
581	NC_012792	CAGC	2	8	23033	23040	25 %	0 %	25 %	50 %	239820007
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583	NC_012792	GCAG	2	8	23101	23108	25 %	0 %	50 %	25 %	239820007
584	NC_012792	GCT	2	6	23123	23128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820007
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587	NC_012792	GC	3	6	23183	23188	0 %	0 %	50 %	50 %	239820007
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591	NC_012792	TGG	2	6	23400	23405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820007
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597	NC_012792	AAGT	2	8	23631	23638	50 %	25 %	25 %	0 %	239820007
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621	NC_012792	CG	3	6	25096	25101	0 %	0 %	50 %	50 %	239820009
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755	NC_012792	GACCAT	2	12	30638	30649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239820014
756	NC_012792	GCT	2	6	30668	30673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820015
757	NC_012792	ATG	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820015
758	NC_012792	TAC	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820015
759	NC_012792	CTT	2	6	30821	30826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820015
760	NC_012792	GGC	2	6	30855	30860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820015
761	NC_012792	GGGCT	2	10	30915	30924	0 %	20 %	60 %	20 %	239820015
762	NC_012792	GGC	3	9	30935	30943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820015
763	NC_012792	ATC	2	6	30945	30950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820015
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767	NC_012792	CAT	2	6	31073	31078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820015
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770	NC_012792	TGA	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820015
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772	NC_012792	CTGGC	2	10	31200	31209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820015
773	NC_012792	CG	3	6	31279	31284	0 %	0 %	50 %	50 %	239820015
774	NC_012792	TGC	2	6	31303	31308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820015
775	NC_012792	GATCGT	2	12	31310	31321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239820015
776	NC_012792	CGG	2	6	31322	31327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820015
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779	NC_012792	CGC	2	6	31451	31456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820015
780	NC_012792	ATC	2	6	31470	31475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820015
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783	NC_012792	GCA	2	6	31535	31540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820015
784	NC_012792	TCG	2	6	31552	31557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820015
785	NC_012792	CAA	2	6	31571	31576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820015
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787	NC_012792	TGC	2	6	31600	31605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820015
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793	NC_012792	CGT	2	6	31778	31783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820015
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864	NC_012792	GCC	2	6	34648	34653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820017
865	NC_012792	CCG	2	6	34677	34682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820017
866	NC_012792	ACC	2	6	34734	34739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820017
867	NC_012792	GTG	2	6	34797	34802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820017
868	NC_012792	CGA	2	6	34814	34819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820017
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870	NC_012792	TGC	2	6	34945	34950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820017
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872	NC_012792	AAC	2	6	35016	35021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820017
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874	NC_012792	CTA	2	6	35045	35050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820017
875	NC_012792	CCTGG	2	10	35081	35090	0 %	20 %	40 %	40 %	239820017
876	NC_012792	GC	3	6	35109	35114	0 %	0 %	50 %	50 %	239820017
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