MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 147263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012791	TGC	2	6	38134	38139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813055
1002	NC_012791	ACC	2	6	38197	38202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813055
1003	NC_012791	TGC	2	6	38230	38235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813055
1004	NC_012791	CGGCCA	2	12	38251	38262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813055
1005	NC_012791	CCA	2	6	38266	38271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813055
1006	NC_012791	GC	4	8	38307	38314	0 %	0 %	50 %	50 %	239813055
1007	NC_012791	GGTGCT	2	12	38333	38344	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239813055
1008	NC_012791	CG	4	8	38348	38355	0 %	0 %	50 %	50 %	239813055
1009	NC_012791	GAG	2	6	38364	38369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813055
1010	NC_012791	CGA	2	6	38396	38401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813055
1011	NC_012791	GC	3	6	38447	38452	0 %	0 %	50 %	50 %	239813055
1012	NC_012791	GCG	2	6	38459	38464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813055
1013	NC_012791	TGC	2	6	38488	38493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813055
1014	NC_012791	GC	3	6	38520	38525	0 %	0 %	50 %	50 %	239813055
1015	NC_012791	GC	3	6	38562	38567	0 %	0 %	50 %	50 %	239813055
1016	NC_012791	TGA	2	6	38590	38595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813055
1017	NC_012791	CCG	2	6	38598	38603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813055
1018	NC_012791	CGA	2	6	38651	38656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813055
1019	NC_012791	AAG	2	6	38703	38708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813055
1020	NC_012791	CGCA	2	8	38780	38787	25 %	0 %	25 %	50 %	239813056
1021	NC_012791	GCCG	2	8	38788	38795	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1022	NC_012791	TGC	2	6	38838	38843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1023	NC_012791	TGG	2	6	38877	38882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813056
1024	NC_012791	CG	3	6	38936	38941	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1025	NC_012791	CGA	2	6	38947	38952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1026	NC_012791	GGCG	2	8	38980	38987	0 %	0 %	75 %	25 %	239813056
1027	NC_012791	GCT	3	9	39001	39009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1028	NC_012791	CGC	2	6	39012	39017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813056
1029	NC_012791	GC	3	6	39137	39142	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1030	NC_012791	GC	3	6	39181	39186	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1031	NC_012791	GGT	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813056
1032	NC_012791	GTG	2	6	39236	39241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813056
1033	NC_012791	CG	3	6	39263	39268	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1034	NC_012791	GCT	2	6	39283	39288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1035	NC_012791	TGC	3	9	39312	39320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1036	NC_012791	TGGCA	2	10	39344	39353	20 %	20 %	40 %	20 %	239813056
1037	NC_012791	CAG	2	6	39386	39391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1038	NC_012791	GGT	2	6	39433	39438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813056
1039	NC_012791	CG	3	6	39447	39452	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1040	NC_012791	GCGT	2	8	39507	39514	0 %	25 %	50 %	25 %	239813056
1041	NC_012791	CGC	2	6	39558	39563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813056
1042	NC_012791	GCA	2	6	39601	39606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1043	NC_012791	AGC	2	6	39627	39632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
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1045	NC_012791	GC	4	8	39656	39663	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1046	NC_012791	GCT	2	6	39682	39687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1047	NC_012791	GCGCTC	2	12	39689	39700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813056
1048	NC_012791	GC	3	6	39710	39715	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1049	NC_012791	CG	4	8	39724	39731	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1050	NC_012791	TGC	2	6	39768	39773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1051	NC_012791	GC	4	8	39813	39820	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1052	NC_012791	CGA	2	6	39826	39831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1053	NC_012791	CGG	2	6	39907	39912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813056
1054	NC_012791	CGA	2	6	39958	39963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1055	NC_012791	AGCGC	2	10	39985	39994	20 %	0 %	40 %	40 %	239813056
1056	NC_012791	CGG	2	6	40023	40028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813056
1057	NC_012791	GGGCCT	2	12	40051	40062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239813056
1058	NC_012791	TCG	2	6	40068	40073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1059	NC_012791	CG	3	6	40072	40077	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
1060	NC_012791	GCT	2	6	40087	40092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813056
1061	NC_012791	GGC	3	9	40168	40176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813056
1062	NC_012791	TGCG	3	12	40257	40268	0 %	25 %	50 %	25 %	239813057
1063	NC_012791	TGA	2	6	40317	40322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813057
1064	NC_012791	CGG	2	6	40323	40328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813057
1065	NC_012791	CCA	2	6	40356	40361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813057
1066	NC_012791	CG	3	6	40371	40376	0 %	0 %	50 %	50 %	239813057
1067	NC_012791	GC	4	8	40407	40414	0 %	0 %	50 %	50 %	239813057
1068	NC_012791	GCCGC	2	10	40446	40455	0 %	0 %	40 %	60 %	239813057
1069	NC_012791	GCG	2	6	40500	40505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813057
1070	NC_012791	GAT	2	6	40546	40551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813057
1071	NC_012791	GGCGC	2	10	40552	40561	0 %	0 %	60 %	40 %	239813057
1072	NC_012791	GCA	2	6	40587	40592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813057
1073	NC_012791	GCG	3	9	40602	40610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813057
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1075	NC_012791	GCC	3	9	40727	40735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813058
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1079	NC_012791	CGA	2	6	40828	40833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813058
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1081	NC_012791	GTT	2	6	40883	40888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813058
1082	NC_012791	CCAT	2	8	40891	40898	25 %	25 %	0 %	50 %	239813058
1083	NC_012791	GCC	2	6	40907	40912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813058
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1086	NC_012791	GCC	2	6	40976	40981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813058
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1088	NC_012791	GCT	2	6	41029	41034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813058
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1092	NC_012791	GC	3	6	41145	41150	0 %	0 %	50 %	50 %	239813058
1093	NC_012791	CAG	3	9	41159	41167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813058
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1095	NC_012791	GTC	2	6	41198	41203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813058
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1098	NC_012791	GC	3	6	41303	41308	0 %	0 %	50 %	50 %	239813058
1099	NC_012791	GGC	2	6	41309	41314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813058
1100	NC_012791	GC	3	6	41358	41363	0 %	0 %	50 %	50 %	239813058
1101	NC_012791	CGA	2	6	41377	41382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813058
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1104	NC_012791	CAC	2	6	41507	41512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813058
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1106	NC_012791	GCT	2	6	41566	41571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813058
1107	NC_012791	GCCCTG	2	12	41603	41614	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813058
1108	NC_012791	TGA	2	6	41638	41643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813058
1109	NC_012791	GC	3	6	41658	41663	0 %	0 %	50 %	50 %	239813058
1110	NC_012791	GTA	2	6	41669	41674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813058
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1121	NC_012791	CAGGC	2	10	42213	42222	20 %	0 %	40 %	40 %	239813059
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1124	NC_012791	CG	3	6	42331	42336	0 %	0 %	50 %	50 %	239813059
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1126	NC_012791	CGC	2	6	42419	42424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813059
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1242	NC_012791	ACT	2	6	47037	47042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813064
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1248	NC_012791	GAG	2	6	47192	47197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813064
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