MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 147263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012791	GCG	2	6	19391	19396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
502	NC_012791	AGC	2	6	19508	19513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
503	NC_012791	CGCC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	239813038
504	NC_012791	GAAT	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	239813038
505	NC_012791	GAC	2	6	19609	19614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
506	NC_012791	CCG	2	6	19628	19633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
507	NC_012791	GGCC	2	8	19661	19668	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
508	NC_012791	GTG	2	6	19675	19680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813038
509	NC_012791	CAG	2	6	19758	19763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
510	NC_012791	TCA	2	6	19804	19809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813039
511	NC_012791	GCC	3	9	19862	19870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
512	NC_012791	CGA	2	6	19914	19919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
513	NC_012791	CAA	2	6	19962	19967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813039
514	NC_012791	GCC	2	6	20048	20053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
515	NC_012791	GCA	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
516	NC_012791	CG	3	6	20083	20088	0 %	0 %	50 %	50 %	239813039
517	NC_012791	GCT	2	6	20154	20159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813039
518	NC_012791	GGCCAT	2	12	20224	20235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813039
519	NC_012791	GCG	2	6	20247	20252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813039
520	NC_012791	GCC	2	6	20261	20266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
521	NC_012791	CAG	2	6	20287	20292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
522	NC_012791	TGA	2	6	20331	20336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813039
523	NC_012791	GGC	2	6	20377	20382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
524	NC_012791	GTG	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813040
525	NC_012791	GGCG	2	8	20455	20462	0 %	0 %	75 %	25 %	239813040
526	NC_012791	GCC	2	6	20465	20470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
527	NC_012791	GCC	2	6	20576	20581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
528	NC_012791	GCG	2	6	20633	20638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
529	NC_012791	CGA	2	6	20710	20715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
530	NC_012791	ACC	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813040
531	NC_012791	GCT	2	6	20741	20746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813040
532	NC_012791	CG	3	6	20752	20757	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
533	NC_012791	CAG	2	6	20777	20782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
534	NC_012791	CGA	2	6	20840	20845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
535	NC_012791	CAG	2	6	20846	20851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
536	NC_012791	GGCC	2	8	20872	20879	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
537	NC_012791	GCG	2	6	20889	20894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
538	NC_012791	CGC	2	6	20898	20903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
539	NC_012791	CAG	2	6	20915	20920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
540	NC_012791	GCCAGC	2	12	20928	20939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813040
541	NC_012791	CCA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813040
542	NC_012791	GCG	2	6	20962	20967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
543	NC_012791	TGCCAG	2	12	21029	21040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813040
544	NC_012791	CCAGC	2	10	21041	21050	20 %	0 %	20 %	60 %	239813040
545	NC_012791	GCG	2	6	21052	21057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
546	NC_012791	GC	3	6	21060	21065	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
547	NC_012791	CAG	2	6	21113	21118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
548	NC_012791	TCG	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813040
549	NC_012791	GCC	2	6	21148	21153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
550	NC_012791	GCG	2	6	21183	21188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
551	NC_012791	AGCC	2	8	21201	21208	25 %	0 %	25 %	50 %	239813040
552	NC_012791	T	6	6	21286	21291	0 %	100 %	0 %	0 %	239813040
553	NC_012791	GCG	2	6	21317	21322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
554	NC_012791	GCG	2	6	21332	21337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
555	NC_012791	CG	4	8	21336	21343	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
556	NC_012791	GCG	3	9	21341	21349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
557	NC_012791	CAC	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
558	NC_012791	GCG	2	6	21490	21495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
559	NC_012791	CAC	2	6	21506	21511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
560	NC_012791	CAG	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
561	NC_012791	GCC	2	6	21596	21601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
562	NC_012791	GC	3	6	21641	21646	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
563	NC_012791	CGA	2	6	21736	21741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
564	NC_012791	TCCGCG	2	12	21765	21776	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813041
565	NC_012791	CGT	2	6	21841	21846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
566	NC_012791	CCG	2	6	21858	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
567	NC_012791	CCA	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
568	NC_012791	GCG	2	6	21905	21910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
569	NC_012791	GC	3	6	21914	21919	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
570	NC_012791	TGA	3	9	21949	21957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813041
571	NC_012791	GC	4	8	21975	21982	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
572	NC_012791	CGA	2	6	22010	22015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
573	NC_012791	CCGT	2	8	22098	22105	0 %	25 %	25 %	50 %	239813041
574	NC_012791	CAC	2	6	22112	22117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
575	NC_012791	TCC	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813041
576	NC_012791	TCGGC	2	10	22141	22150	0 %	20 %	40 %	40 %	239813041
577	NC_012791	TGC	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
578	NC_012791	GCC	2	6	22193	22198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
579	NC_012791	TGG	2	6	22210	22215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813041
580	NC_012791	GC	3	6	22236	22241	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
581	NC_012791	TTG	2	6	22272	22277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813041
582	NC_012791	CAG	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
583	NC_012791	GCC	2	6	22322	22327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
584	NC_012791	CG	3	6	22411	22416	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
585	NC_012791	GGC	2	6	22430	22435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
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588	NC_012791	GGCC	2	8	22578	22585	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
589	NC_012791	CTT	2	6	22628	22633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813041
590	NC_012791	GAG	2	6	22653	22658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813041
591	NC_012791	CCT	2	6	22663	22668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813041
592	NC_012791	CG	3	6	22730	22735	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
593	NC_012791	CCAC	2	8	22750	22757	25 %	0 %	0 %	75 %	239813041
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595	NC_012791	CAC	2	6	22802	22807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
596	NC_012791	CAG	2	6	22847	22852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
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598	NC_012791	TGC	2	6	22932	22937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
599	NC_012791	AGC	2	6	22941	22946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
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601	NC_012791	CCTT	2	8	22959	22966	0 %	50 %	0 %	50 %	239813041
602	NC_012791	CTG	2	6	22994	22999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
603	NC_012791	GCC	2	6	23061	23066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
604	NC_012791	GC	3	6	23103	23108	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
605	NC_012791	TCG	2	6	23214	23219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
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609	NC_012791	GAGCCA	2	12	23336	23347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
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611	NC_012791	CTG	2	6	23663	23668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
612	NC_012791	CAGC	2	8	23716	23723	25 %	0 %	25 %	50 %	239813042
613	NC_012791	GCT	3	9	23782	23790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
614	NC_012791	TGGA	2	8	23810	23817	25 %	25 %	50 %	0 %	239813042
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622	NC_012791	GAG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813042
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625	NC_012791	CGC	2	6	24390	24395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813042
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