MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 6811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012668	GCTT	2	8	1208	1215	0 %	50 %	25 %	25 %	229606124
2	NC_012668	ATCA	2	8	1441	1448	50 %	25 %	0 %	25 %	229606124
3	NC_012668	TGCG	2	8	1470	1477	0 %	25 %	50 %	25 %	229606124
4	NC_012668	GCAC	2	8	1514	1521	25 %	0 %	25 %	50 %	229606124
5	NC_012668	AAGC	2	8	1547	1554	50 %	0 %	25 %	25 %	229606124
6	NC_012668	TGAT	2	8	1593	1600	25 %	50 %	25 %	0 %	229606124
7	NC_012668	AATC	2	8	2012	2019	50 %	25 %	0 %	25 %	229606125
8	NC_012668	ACAA	2	8	2094	2101	75 %	0 %	0 %	25 %	229606125
9	NC_012668	AAAG	2	8	2237	2244	75 %	0 %	25 %	0 %	229606125
10	NC_012668	AGTG	2	8	2832	2839	25 %	25 %	50 %	0 %	229606126
11	NC_012668	ATCA	2	8	3993	4000	50 %	25 %	0 %	25 %	229606127
12	NC_012668	ATCA	2	8	4704	4711	50 %	25 %	0 %	25 %	229606127
13	NC_012668	CTTG	2	8	4862	4869	0 %	50 %	25 %	25 %	229606127
14	NC_012668	TGCC	2	8	5998	6005	0 %	25 %	25 %	50 %	229606128
15	NC_012668	AGGT	2	8	6365	6372	25 %	25 %	50 %	0 %	229606129
16	NC_012668	CCAA	2	8	6750	6757	50 %	0 %	0 %	50 %	229606129
17	NC_012668	TCAA	2	8	7126	7133	50 %	25 %	0 %	25 %	229606130
18	NC_012668	AACC	2	8	7433	7440	50 %	0 %	0 %	50 %	229606130
19	NC_012668	TGTT	2	8	7546	7553	0 %	75 %	25 %	0 %	229606130
20	NC_012668	ACTC	2	8	8957	8964	25 %	25 %	0 %	50 %	229606132
21	NC_012668	GCCA	2	8	9081	9088	25 %	0 %	25 %	50 %	229606132
22	NC_012668	TGGC	2	8	9527	9534	0 %	25 %	50 %	25 %	229606132
23	NC_012668	TGGC	2	8	9603	9610	0 %	25 %	50 %	25 %	229606132
24	NC_012668	CAAA	2	8	9792	9799	75 %	0 %	0 %	25 %	229606132
25	NC_012668	CAAA	2	8	9866	9873	75 %	0 %	0 %	25 %	229606132
26	NC_012668	CAGC	2	8	10497	10504	25 %	0 %	25 %	50 %	229606132
27	NC_012668	GATG	2	8	10580	10587	25 %	25 %	50 %	0 %	229606132
28	NC_012668	ATTG	2	8	11047	11054	25 %	50 %	25 %	0 %	229606133
29	NC_012668	ATGC	2	8	11167	11174	25 %	25 %	25 %	25 %	229606134
30	NC_012668	CTTG	2	8	11421	11428	0 %	50 %	25 %	25 %	229606134
31	NC_012668	ATTT	2	8	12310	12317	25 %	75 %	0 %	0 %	229606136
32	NC_012668	TCAA	2	8	12398	12405	50 %	25 %	0 %	25 %	229606136
33	NC_012668	AATC	2	8	12417	12424	50 %	25 %	0 %	25 %	229606136
34	NC_012668	TCAG	2	8	12823	12830	25 %	25 %	25 %	25 %	229606137
35	NC_012668	GAAT	2	8	12840	12847	50 %	25 %	25 %	0 %	229606137
36	NC_012668	TTTC	2	8	13102	13109	0 %	75 %	0 %	25 %	229606137
37	NC_012668	CAAA	2	8	14237	14244	75 %	0 %	0 %	25 %	229606138
38	NC_012668	GAAC	2	8	14478	14485	50 %	0 %	25 %	25 %	229606139
39	NC_012668	CGCA	2	8	14570	14577	25 %	0 %	25 %	50 %	229606139
40	NC_012668	GTTG	2	8	15382	15389	0 %	50 %	50 %	0 %	229606139
41	NC_012668	CCGA	2	8	19567	19574	25 %	0 %	25 %	50 %	229606145
42	NC_012668	ACTA	2	8	19648	19655	50 %	25 %	0 %	25 %	229606145
43	NC_012668	TGCG	2	8	20615	20622	0 %	25 %	50 %	25 %	229606145
44	NC_012668	CATC	2	8	21409	21416	25 %	25 %	0 %	50 %	229606146
45	NC_012668	CAAT	2	8	21457	21464	50 %	25 %	0 %	25 %	229606146
46	NC_012668	GAGT	2	8	22177	22184	25 %	25 %	50 %	0 %	229606147
47	NC_012668	GTCA	2	8	22502	22509	25 %	25 %	25 %	25 %	229606148
48	NC_012668	AATC	2	8	22744	22751	50 %	25 %	0 %	25 %	229606148
49	NC_012668	CCAC	2	8	23602	23609	25 %	0 %	0 %	75 %	229606149
50	NC_012668	AGCC	2	8	23685	23692	25 %	0 %	25 %	50 %	229606149
51	NC_012668	TGCT	2	8	23742	23749	0 %	50 %	25 %	25 %	229606149
52	NC_012668	CAGA	2	8	23848	23855	50 %	0 %	25 %	25 %	229606150
53	NC_012668	GCAG	2	8	24589	24596	25 %	0 %	50 %	25 %	229606151
54	NC_012668	ACGA	2	8	25527	25534	50 %	0 %	25 %	25 %	229606151
55	NC_012668	ATCG	2	8	25649	25656	25 %	25 %	25 %	25 %	229606151
56	NC_012668	TCAA	2	8	25959	25966	50 %	25 %	0 %	25 %	229606152
57	NC_012668	GCTT	2	8	26323	26330	0 %	50 %	25 %	25 %	229606152
58	NC_012668	TTGA	2	8	27810	27817	25 %	50 %	25 %	0 %	229606153
59	NC_012668	TGCC	2	8	28181	28188	0 %	25 %	25 %	50 %	229606154
60	NC_012668	CGAG	2	8	28223	28230	25 %	0 %	50 %	25 %	229606154
61	NC_012668	TTTG	2	8	28497	28504	0 %	75 %	25 %	0 %	229606154
62	NC_012668	GTAG	2	8	28694	28701	25 %	25 %	50 %	0 %	229606155
63	NC_012668	CCAT	2	8	29161	29168	25 %	25 %	0 %	50 %	229606155
64	NC_012668	CGAG	2	8	29264	29271	25 %	0 %	50 %	25 %	229606155
65	NC_012668	TTCA	2	8	29466	29473	25 %	50 %	0 %	25 %	229606155
66	NC_012668	CCAA	2	8	29682	29689	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
67	NC_012668	GTTT	2	8	30212	30219	0 %	75 %	25 %	0 %	229606155
68	NC_012668	CAAA	2	8	31205	31212	75 %	0 %	0 %	25 %	229606156
69	NC_012668	GCGA	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	229606156
70	NC_012668	GCTG	2	8	32398	32405	0 %	25 %	50 %	25 %	229606156
71	NC_012668	GTTT	2	8	32473	32480	0 %	75 %	25 %	0 %	229606156
72	NC_012668	ATTG	2	8	32792	32799	25 %	50 %	25 %	0 %	229606156
73	NC_012668	GAGC	2	8	32850	32857	25 %	0 %	50 %	25 %	229606156
74	NC_012668	AAAC	2	8	33234	33241	75 %	0 %	0 %	25 %	229606157
75	NC_012668	CAAC	2	8	33366	33373	50 %	0 %	0 %	50 %	229606157
76	NC_012668	GAGC	2	8	33542	33549	25 %	0 %	50 %	25 %	229606157
77	NC_012668	GATC	2	8	33991	33998	25 %	25 %	25 %	25 %	229606158
78	NC_012668	ACTG	2	8	34318	34325	25 %	25 %	25 %	25 %	229606158
79	NC_012668	CCCG	2	8	34485	34492	0 %	0 %	25 %	75 %	229606158
80	NC_012668	GTTT	2	8	34624	34631	0 %	75 %	25 %	0 %	229606158
81	NC_012668	GCAT	2	8	34832	34839	25 %	25 %	25 %	25 %	229606159
82	NC_012668	CTGG	2	8	35416	35423	0 %	25 %	50 %	25 %	229606159
83	NC_012668	TAAT	2	8	35874	35881	50 %	50 %	0 %	0 %	229606159
84	NC_012668	GTTT	2	8	39854	39861	0 %	75 %	25 %	0 %	229606163
85	NC_012668	TTAA	2	8	40301	40308	50 %	50 %	0 %	0 %	229606163
86	NC_012668	GCAC	2	8	40374	40381	25 %	0 %	25 %	50 %	229606163
87	NC_012668	GGAA	2	8	40426	40433	50 %	0 %	50 %	0 %	229606163
88	NC_012668	AATC	2	8	40434	40441	50 %	25 %	0 %	25 %	229606163
89	NC_012668	GCGG	2	8	40744	40751	0 %	0 %	75 %	25 %	229606163
90	NC_012668	TTCT	2	8	40968	40975	0 %	75 %	0 %	25 %	229606163
91	NC_012668	TCAA	2	8	41190	41197	50 %	25 %	0 %	25 %	229606164
92	NC_012668	TGCT	2	8	41682	41689	0 %	50 %	25 %	25 %	229606165
93	NC_012668	GCAC	2	8	42046	42053	25 %	0 %	25 %	50 %	229606165
94	NC_012668	GTCA	2	8	43464	43471	25 %	25 %	25 %	25 %	229606165
95	NC_012668	CCGC	2	8	43597	43604	0 %	0 %	25 %	75 %	229606165
96	NC_012668	TTTC	2	8	44712	44719	0 %	75 %	0 %	25 %	229606167
97	NC_012668	GATC	2	8	44817	44824	25 %	25 %	25 %	25 %	229606167
98	NC_012668	TTGC	2	8	45123	45130	0 %	50 %	25 %	25 %	229606167
99	NC_012668	TGCT	2	8	45271	45278	0 %	50 %	25 %	25 %	229606167
100	NC_012668	GTGC	2	8	45351	45358	0 %	25 %	50 %	25 %	229606167
101	NC_012668	CATC	2	8	45537	45544	25 %	25 %	0 %	50 %	229606167
102	NC_012668	TCAA	2	8	45813	45820	50 %	25 %	0 %	25 %	229606168
103	NC_012668	TTGC	2	8	46078	46085	0 %	50 %	25 %	25 %	229606168
104	NC_012668	CTCA	2	8	46256	46263	25 %	25 %	0 %	50 %	229606168
105	NC_012668	AATC	2	8	46922	46929	50 %	25 %	0 %	25 %	229606169
106	NC_012668	ATCA	2	8	48128	48135	50 %	25 %	0 %	25 %	229606170
107	NC_012668	GATT	2	8	48208	48215	25 %	50 %	25 %	0 %	229606170
108	NC_012668	CAAG	2	8	49036	49043	50 %	0 %	25 %	25 %	229606171
109	NC_012668	GGCA	2	8	49188	49195	25 %	0 %	50 %	25 %	229606171
110	NC_012668	GCAA	2	8	49544	49551	50 %	0 %	25 %	25 %	229606172
111	NC_012668	TCAA	2	8	50584	50591	50 %	25 %	0 %	25 %	229606173
112	NC_012668	AGTG	2	8	50637	50644	25 %	25 %	50 %	0 %	229606173
113	NC_012668	ATAG	2	8	50658	50665	50 %	25 %	25 %	0 %	229606173
114	NC_012668	TTAT	2	8	51623	51630	25 %	75 %	0 %	0 %	229606174
115	NC_012668	CGAG	2	8	51940	51947	25 %	0 %	50 %	25 %	229606175
116	NC_012668	AGCA	2	8	52615	52622	50 %	0 %	25 %	25 %	229606175
117	NC_012668	ACTC	2	8	52766	52773	25 %	25 %	0 %	50 %	229606175
118	NC_012668	GAGC	2	8	53084	53091	25 %	0 %	50 %	25 %	229606175
119	NC_012668	ACCC	2	8	53179	53186	25 %	0 %	0 %	75 %	229606175
120	NC_012668	AATG	2	8	53711	53718	50 %	25 %	25 %	0 %	229606175
121	NC_012668	GATG	2	8	54011	54018	25 %	25 %	50 %	0 %	229606175
122	NC_012668	CTCG	2	8	54053	54060	0 %	25 %	25 %	50 %	229606175
123	NC_012668	CTGG	2	8	54270	54277	0 %	25 %	50 %	25 %	229606175
124	NC_012668	CGTT	2	8	54951	54958	0 %	50 %	25 %	25 %	229606176
125	NC_012668	GGTC	2	8	54990	54997	0 %	25 %	50 %	25 %	229606176
126	NC_012668	AAAT	2	8	55068	55075	75 %	25 %	0 %	0 %	229606176
127	NC_012668	GTAG	2	8	55169	55176	25 %	25 %	50 %	0 %	229606176
128	NC_012668	TCCT	2	8	55803	55810	0 %	50 %	0 %	50 %	229606177
129	NC_012668	GCCA	2	8	56842	56849	25 %	0 %	25 %	50 %	229606178
130	NC_012668	AATA	2	8	57395	57402	75 %	25 %	0 %	0 %	229606179
131	NC_012668	TAAG	2	8	57518	57525	50 %	25 %	25 %	0 %	229606179
132	NC_012668	TGAT	2	8	57709	57716	25 %	50 %	25 %	0 %	229606179
133	NC_012668	CGCC	2	8	58290	58297	0 %	0 %	25 %	75 %	229606180
134	NC_012668	ACGA	2	8	58464	58471	50 %	0 %	25 %	25 %	229606180
135	NC_012668	CAGA	2	8	58476	58483	50 %	0 %	25 %	25 %	229606180
136	NC_012668	CCGC	2	8	60028	60035	0 %	0 %	25 %	75 %	229606182
137	NC_012668	GTGA	2	8	61516	61523	25 %	25 %	50 %	0 %	229606185
138	NC_012668	GATA	2	8	61631	61638	50 %	25 %	25 %	0 %	229606185
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