MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012668	ATC	2	6	121019	121024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606237
2003	NC_012668	GGCAA	2	10	121058	121067	40 %	0 %	40 %	20 %	229606237
2004	NC_012668	A	6	6	121066	121071	100 %	0 %	0 %	0 %	229606237
2005	NC_012668	TCA	2	6	121173	121178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606237
2006	NC_012668	CAA	2	6	121192	121197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606237
2007	NC_012668	GTGAA	2	10	121280	121289	40 %	20 %	40 %	0 %	229606237
2008	NC_012668	TTCAGT	2	12	121306	121317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229606237
2009	NC_012668	GCC	2	6	121392	121397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606237
2010	NC_012668	TGAG	2	8	121439	121446	25 %	25 %	50 %	0 %	229606237
2011	NC_012668	TG	3	6	121528	121533	0 %	50 %	50 %	0 %	229606237
2012	NC_012668	ATC	2	6	121759	121764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606238
2013	NC_012668	CCA	2	6	121775	121780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606238
2014	NC_012668	AAG	2	6	121852	121857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606238
2015	NC_012668	TGC	2	6	121858	121863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606238
2016	NC_012668	A	6	6	121914	121919	100 %	0 %	0 %	0 %	229606238
2017	NC_012668	CGC	2	6	121966	121971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606238
2018	NC_012668	GAA	2	6	122114	122119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606238
2019	NC_012668	CAG	2	6	122124	122129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606238
2020	NC_012668	ACCC	2	8	122285	122292	25 %	0 %	0 %	75 %	229606238
2021	NC_012668	GGT	2	6	122328	122333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606238
2022	NC_012668	GAA	2	6	122343	122348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606238
2023	NC_012668	GAA	2	6	122376	122381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606238
2024	NC_012668	TAC	2	6	122401	122406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606238
2025	NC_012668	CGG	2	6	122416	122421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606238
2026	NC_012668	A	6	6	122533	122538	100 %	0 %	0 %	0 %	229606239
2027	NC_012668	ATG	2	6	122554	122559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606239
2028	NC_012668	ATGA	2	8	122602	122609	50 %	25 %	25 %	0 %	229606239
2029	NC_012668	AGA	2	6	122664	122669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606239
2030	NC_012668	CCG	2	6	122749	122754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606239
2031	NC_012668	GC	3	6	122793	122798	0 %	0 %	50 %	50 %	229606239
2032	NC_012668	GTG	2	6	122818	122823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606239
2033	NC_012668	ATC	2	6	123031	123036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606239
2034	NC_012668	AACC	2	8	123045	123052	50 %	0 %	0 %	50 %	229606239
2035	NC_012668	TGG	2	6	123119	123124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606239
2036	NC_012668	GGC	2	6	123192	123197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606239
2037	NC_012668	GTG	2	6	123206	123211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606239
2038	NC_012668	GCT	2	6	123282	123287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606239
2039	NC_012668	GA	3	6	123356	123361	50 %	0 %	50 %	0 %	229606239
2040	NC_012668	GATG	2	8	123399	123406	25 %	25 %	50 %	0 %	229606239
2041	NC_012668	TGCCA	2	10	123503	123512	20 %	20 %	20 %	40 %	229606240
2042	NC_012668	CGAT	2	8	123601	123608	25 %	25 %	25 %	25 %	229606240
2043	NC_012668	CGG	2	6	123617	123622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606240
2044	NC_012668	CG	3	6	123742	123747	0 %	0 %	50 %	50 %	229606240
2045	NC_012668	CAC	2	6	123791	123796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606240
2046	NC_012668	CTG	2	6	123877	123882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606240
2047	NC_012668	TAA	2	6	124038	124043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606240
2048	NC_012668	ATG	2	6	124227	124232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606241
2049	NC_012668	ATTG	2	8	124288	124295	25 %	50 %	25 %	0 %	229606241
2050	NC_012668	GCCT	2	8	124299	124306	0 %	25 %	25 %	50 %	229606241
2051	NC_012668	ATG	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606241
2052	NC_012668	CCA	2	6	124419	124424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606241
2053	NC_012668	GC	4	8	124430	124437	0 %	0 %	50 %	50 %	229606241
2054	NC_012668	CGG	2	6	124497	124502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606241
2055	NC_012668	CTT	2	6	124620	124625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606242
2056	NC_012668	TAG	2	6	124642	124647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606242
2057	NC_012668	ACCC	2	8	124673	124680	25 %	0 %	0 %	75 %	229606242
2058	NC_012668	CG	3	6	124733	124738	0 %	0 %	50 %	50 %	229606242
2059	NC_012668	AGC	2	6	124771	124776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2060	NC_012668	GCC	2	6	124804	124809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606242
2061	NC_012668	CTG	2	6	124959	124964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2062	NC_012668	AAG	2	6	125047	125052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606242
2063	NC_012668	CAT	2	6	125066	125071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606242
2064	NC_012668	TGC	2	6	125114	125119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2065	NC_012668	CAC	2	6	125135	125140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606242
2066	NC_012668	CA	3	6	125198	125203	50 %	0 %	0 %	50 %	229606242
2067	NC_012668	CCA	2	6	125269	125274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606242
2068	NC_012668	GCA	2	6	125327	125332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2069	NC_012668	GCT	2	6	125384	125389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2070	NC_012668	A	6	6	125446	125451	100 %	0 %	0 %	0 %	229606242
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2074	NC_012668	CTG	2	6	125568	125573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2075	NC_012668	C	7	7	125642	125648	0 %	0 %	0 %	100 %	229606242
2076	NC_012668	CTGC	2	8	125728	125735	0 %	25 %	25 %	50 %	229606242
2077	NC_012668	GCT	2	6	125825	125830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
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2080	NC_012668	CCT	2	6	125866	125871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606242
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2082	NC_012668	GAT	2	6	126062	126067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606243
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2084	NC_012668	CTTGG	2	10	126218	126227	0 %	40 %	40 %	20 %	229606243
2085	NC_012668	GCT	3	9	126254	126262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606243
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2089	NC_012668	TGC	2	6	126514	126519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606243
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2093	NC_012668	CGC	2	6	126717	126722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606243
2094	NC_012668	TACC	2	8	128000	128007	25 %	25 %	0 %	50 %	229606244
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2110	NC_012668	TGA	2	6	128782	128787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606244
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2119	NC_012668	GCA	2	6	129630	129635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606245
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2122	NC_012668	CAT	2	6	129883	129888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606246
2123	NC_012668	GATT	2	8	129894	129901	25 %	50 %	25 %	0 %	229606246
2124	NC_012668	CGC	2	6	129913	129918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606246
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2151	NC_012668	CT	4	8	131005	131012	0 %	50 %	0 %	50 %	229606247
2152	NC_012668	GGC	2	6	131026	131031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606247
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2156	NC_012668	CAT	2	6	131148	131153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606247
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2241	NC_012668	AATC	2	8	135700	135707	50 %	25 %	0 %	25 %	229606253
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2365	NC_012668	CAA	2	6	143388	143393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606259
2366	NC_012668	GTTCA	2	10	143421	143430	20 %	40 %	20 %	20 %	229606259
2367	NC_012668	AC	3	6	143448	143453	50 %	0 %	0 %	50 %	229606259
2368	NC_012668	CCA	2	6	143455	143460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606259
2369	NC_012668	ACCA	2	8	143466	143473	50 %	0 %	0 %	50 %	229606259
2370	NC_012668	TG	3	6	143521	143526	0 %	50 %	50 %	0 %	229606259
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2374	NC_012668	TCAAA	2	10	143942	143951	60 %	20 %	0 %	20 %	229606259
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2385	NC_012668	TGA	2	6	144569	144574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606259
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2394	NC_012668	TTG	2	6	145238	145243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606259
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2469	NC_012668	TG	4	8	149811	149818	0 %	50 %	50 %	0 %	229606264
2470	NC_012668	TGC	2	6	149836	149841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606264
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2474	NC_012668	T	7	7	150092	150098	0 %	100 %	0 %	0 %	229606265
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2479	NC_012668	CAC	2	6	150304	150309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606265
2480	NC_012668	GCC	2	6	150360	150365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606265
2481	NC_012668	CGAT	2	8	150381	150388	25 %	25 %	25 %	25 %	229606265
2482	NC_012668	AAT	2	6	150490	150495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606265
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2485	NC_012668	GCG	2	6	150562	150567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606266
2486	NC_012668	TAA	2	6	150643	150648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606266
2487	NC_012668	GCA	2	6	150746	150751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606266
2488	NC_012668	ACG	2	6	150781	150786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606266
2489	NC_012668	ACCA	2	8	150799	150806	50 %	0 %	0 %	50 %	229606266
2490	NC_012668	A	7	7	150826	150832	100 %	0 %	0 %	0 %	229606266
2491	NC_012668	CAT	2	6	150862	150867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606266
2492	NC_012668	CAC	2	6	150894	150899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606266
2493	NC_012668	GGCACA	2	12	150923	150934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606266
2494	NC_012668	CCG	2	6	150957	150962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606266
2495	NC_012668	A	6	6	150973	150978	100 %	0 %	0 %	0 %	229606266
2496	NC_012668	AGT	2	6	150989	150994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606266
2497	NC_012668	ACC	2	6	151022	151027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606266
2498	NC_012668	ATTA	2	8	151152	151159	50 %	50 %	0 %	0 %	229606267
2499	NC_012668	TCG	2	6	151205	151210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606267
2500	NC_012668	TTG	2	6	151213	151218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606267

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