MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012668	CCG	2	6	89226	89231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606210
1502	NC_012668	AACTC	2	10	89316	89325	40 %	20 %	0 %	40 %	229606210
1503	NC_012668	TTG	2	6	89332	89337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606210
1504	NC_012668	TCCA	2	8	89402	89409	25 %	25 %	0 %	50 %	229606210
1505	NC_012668	CA	3	6	89425	89430	50 %	0 %	0 %	50 %	229606210
1506	NC_012668	TCT	2	6	89462	89467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606210
1507	NC_012668	AGT	2	6	89495	89500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606210
1508	NC_012668	CT	3	6	89540	89545	0 %	50 %	0 %	50 %	229606210
1509	NC_012668	ACC	2	6	89576	89581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606210
1510	NC_012668	ACC	2	6	89590	89595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606210
1511	NC_012668	GTT	2	6	89614	89619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606210
1512	NC_012668	T	7	7	89655	89661	0 %	100 %	0 %	0 %	229606210
1513	NC_012668	TCCA	2	8	89780	89787	25 %	25 %	0 %	50 %	229606211
1514	NC_012668	CTT	2	6	90033	90038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606212
1515	NC_012668	GTT	2	6	90136	90141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606212
1516	NC_012668	TGAT	2	8	90150	90157	25 %	50 %	25 %	0 %	229606212
1517	NC_012668	CT	3	6	90158	90163	0 %	50 %	0 %	50 %	229606212
1518	NC_012668	CTTC	2	8	90189	90196	0 %	50 %	0 %	50 %	229606212
1519	NC_012668	GAT	2	6	90210	90215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606212
1520	NC_012668	CAA	2	6	90239	90244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606212
1521	NC_012668	ATC	2	6	90268	90273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606212
1522	NC_012668	CATA	2	8	90329	90336	50 %	25 %	0 %	25 %	229606212
1523	NC_012668	TGA	2	6	90410	90415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606212
1524	NC_012668	TGAG	2	8	90464	90471	25 %	25 %	50 %	0 %	229606212
1525	NC_012668	T	6	6	90650	90655	0 %	100 %	0 %	0 %	229606213
1526	NC_012668	TTG	2	6	90685	90690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606213
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1529	NC_012668	TAA	2	6	90841	90846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606213
1530	NC_012668	ACC	2	6	90853	90858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606213
1531	NC_012668	T	6	6	90879	90884	0 %	100 %	0 %	0 %	229606213
1532	NC_012668	GAT	2	6	90959	90964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606213
1533	NC_012668	TGCT	2	8	90967	90974	0 %	50 %	25 %	25 %	229606213
1534	NC_012668	GAAA	2	8	91088	91095	75 %	0 %	25 %	0 %	229606213
1535	NC_012668	TAGGTT	2	12	91137	91148	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229606213
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1537	NC_012668	AGT	2	6	91244	91249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606213
1538	NC_012668	TGA	2	6	91300	91305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606213
1539	NC_012668	GTTGA	2	10	91311	91320	20 %	40 %	40 %	0 %	229606213
1540	NC_012668	ATC	2	6	92509	92514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606214
1541	NC_012668	GAA	2	6	92569	92574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606214
1542	NC_012668	TGA	2	6	92601	92606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606214
1543	NC_012668	AGA	2	6	92637	92642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606214
1544	NC_012668	A	7	7	92700	92706	100 %	0 %	0 %	0 %	229606214
1545	NC_012668	ATT	2	6	92716	92721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606214
1546	NC_012668	TTC	2	6	92733	92738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606214
1547	NC_012668	GA	5	10	92776	92785	50 %	0 %	50 %	0 %	229606214
1548	NC_012668	ATC	2	6	92800	92805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606214
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1551	NC_012668	A	6	6	93099	93104	100 %	0 %	0 %	0 %	229606214
1552	NC_012668	C	6	6	93162	93167	0 %	0 %	0 %	100 %	229606214
1553	NC_012668	ATT	2	6	93176	93181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606214
1554	NC_012668	GAA	2	6	93244	93249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606214
1555	NC_012668	CCT	2	6	93256	93261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606214
1556	NC_012668	GTC	2	6	93262	93267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606214
1557	NC_012668	CAG	2	6	93271	93276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606214
1558	NC_012668	TGAA	2	8	93547	93554	50 %	25 %	25 %	0 %	229606215
1559	NC_012668	ACA	2	6	93557	93562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606215
1560	NC_012668	TCT	2	6	93577	93582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606215
1561	NC_012668	GAC	2	6	93670	93675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606215
1562	NC_012668	GAA	2	6	93679	93684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606215
1563	NC_012668	CA	3	6	93685	93690	50 %	0 %	0 %	50 %	229606215
1564	NC_012668	GTA	2	6	93692	93697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606215
1565	NC_012668	CAA	2	6	93725	93730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606215
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1572	NC_012668	AT	3	6	94032	94037	50 %	50 %	0 %	0 %	229606215
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1589	NC_012668	T	6	6	95225	95230	0 %	100 %	0 %	0 %	229606216
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1598	NC_012668	AAAAC	2	10	95444	95453	80 %	0 %	0 %	20 %	229606216
1599	NC_012668	T	7	7	95512	95518	0 %	100 %	0 %	0 %	229606216
1600	NC_012668	A	6	6	95584	95589	100 %	0 %	0 %	0 %	229606216
1601	NC_012668	A	7	7	95657	95663	100 %	0 %	0 %	0 %	229606216
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1609	NC_012668	GCC	2	6	96144	96149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606216
1610	NC_012668	ACTC	2	8	96185	96192	25 %	25 %	0 %	50 %	229606216
1611	NC_012668	CTT	2	6	96239	96244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606216
1612	NC_012668	CTCTT	2	10	96262	96271	0 %	60 %	0 %	40 %	229606216
1613	NC_012668	T	6	6	96270	96275	0 %	100 %	0 %	0 %	229606216
1614	NC_012668	CTAG	2	8	96314	96321	25 %	25 %	25 %	25 %	229606216
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1630	NC_012668	AGT	2	6	98124	98129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606217
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1734	NC_012668	TTTCG	2	10	103754	103763	0 %	60 %	20 %	20 %	229606221
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1874	NC_012668	CGT	2	6	112817	112822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606230
1875	NC_012668	ATCA	2	8	112840	112847	50 %	25 %	0 %	25 %	229606230
1876	NC_012668	TTG	2	6	112849	112854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606230
1877	NC_012668	ATGG	2	8	112870	112877	25 %	25 %	50 %	0 %	229606230
1878	NC_012668	TGA	2	6	112923	112928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606230
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1883	NC_012668	AC	3	6	113109	113114	50 %	0 %	0 %	50 %	229606230
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1993	NC_012668	TGA	2	6	120583	120588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606236
1994	NC_012668	TCG	2	6	120698	120703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606236
1995	NC_012668	TGC	2	6	120715	120720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606236
1996	NC_012668	GTG	2	6	120721	120726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606236
1997	NC_012668	CAA	2	6	120753	120758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606236
1998	NC_012668	ATG	2	6	120907	120912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606237
1999	NC_012668	TCGTT	2	10	120918	120927	0 %	60 %	20 %	20 %	229606237
2000	NC_012668	TGC	2	6	120936	120941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606237

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