MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 11383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	AGC	2	6	155	160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605063
2	NC_012667	CAA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605063
3	NC_012667	CAA	2	6	256	261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605063
4	NC_012667	AGG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605063
5	NC_012667	GCC	2	6	576	581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605064
6	NC_012667	AGC	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605064
7	NC_012667	CAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605064
8	NC_012667	CAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605064
9	NC_012667	AGG	2	6	762	767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605064
10	NC_012667	CGC	2	6	779	784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605064
11	NC_012667	CAT	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605065
12	NC_012667	GCC	2	6	1014	1019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605065
13	NC_012667	CGG	2	6	1064	1069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605065
14	NC_012667	AGC	2	6	1092	1097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605065
15	NC_012667	GCC	2	6	1197	1202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605065
16	NC_012667	ATG	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605065
17	NC_012667	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605065
18	NC_012667	GCA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605065
19	NC_012667	ATC	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605066
20	NC_012667	TGT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605066
21	NC_012667	GCA	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
22	NC_012667	AGC	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
23	NC_012667	GCA	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
24	NC_012667	CGC	3	9	2121	2129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605066
25	NC_012667	CAA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605066
26	NC_012667	TTA	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605066
27	NC_012667	CAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605066
28	NC_012667	TCT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605066
29	NC_012667	TCA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605066
30	NC_012667	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605066
31	NC_012667	ATG	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
32	NC_012667	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605066
33	NC_012667	ATG	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
34	NC_012667	TGG	2	6	3021	3026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605066
35	NC_012667	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605066
36	NC_012667	TGC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605066
37	NC_012667	TAA	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605066
38	NC_012667	GAC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605066
39	NC_012667	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605067
40	NC_012667	AAG	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605067
41	NC_012667	TTG	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605067
42	NC_012667	CGG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605067
43	NC_012667	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605067
44	NC_012667	TGC	3	9	4014	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605067
45	NC_012667	CGG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605067
46	NC_012667	CAT	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605067
47	NC_012667	AGA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605068
48	NC_012667	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605068
49	NC_012667	TAG	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605068
50	NC_012667	AGT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605068
51	NC_012667	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605068
52	NC_012667	GCA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605068
53	NC_012667	GCA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605068
54	NC_012667	CAT	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605068
55	NC_012667	TCA	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605068
56	NC_012667	CCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605068
57	NC_012667	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
58	NC_012667	TGA	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605069
59	NC_012667	CCA	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
60	NC_012667	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605069
61	NC_012667	ATG	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605069
62	NC_012667	CAT	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605069
63	NC_012667	CTG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605069
64	NC_012667	CAC	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605069
65	NC_012667	TCA	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605069
66	NC_012667	AAT	2	6	6068	6073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605069
67	NC_012667	ACG	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605070
68	NC_012667	TGC	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
69	NC_012667	GCT	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
70	NC_012667	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
71	NC_012667	GAT	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
72	NC_012667	CCA	2	6	6785	6790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
73	NC_012667	TGC	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605070
74	NC_012667	CGC	2	6	6874	6879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605070
75	NC_012667	CAT	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
76	NC_012667	CAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
77	NC_012667	CAT	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
78	NC_012667	CGG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
79	NC_012667	TCT	2	6	7027	7032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
80	NC_012667	CAT	2	6	7035	7040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
81	NC_012667	AAG	2	6	7055	7060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605070
82	NC_012667	GGC	2	6	7066	7071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
83	NC_012667	CCA	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
84	NC_012667	CCA	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
85	NC_012667	TGA	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
86	NC_012667	TTC	2	6	7237	7242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
87	NC_012667	CAT	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
88	NC_012667	GCG	2	6	7456	7461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
89	NC_012667	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605070
90	NC_012667	ATC	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
91	NC_012667	TTC	2	6	7591	7596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
92	NC_012667	CGG	2	6	7632	7637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605070
93	NC_012667	TGA	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
94	NC_012667	CAA	2	6	7720	7725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605070
95	NC_012667	CTT	3	9	7812	7820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605070
96	NC_012667	GAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605070
97	NC_012667	GTA	2	6	7895	7900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
98	NC_012667	GAT	3	9	8016	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605070
99	NC_012667	ACC	2	6	8116	8121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605070
100	NC_012667	CAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605070
101	NC_012667	AAC	2	6	8396	8401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
102	NC_012667	ATC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605071
103	NC_012667	AGC	2	6	8523	8528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605071
104	NC_012667	TCC	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605071
105	NC_012667	GAT	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605071
106	NC_012667	CAA	2	6	8834	8839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
107	NC_012667	CAA	2	6	8849	8854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605071
108	NC_012667	AGG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605071
109	NC_012667	GCG	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605072
110	NC_012667	GTG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605072
111	NC_012667	CGG	2	6	9150	9155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605072
112	NC_012667	TCG	2	6	9326	9331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605072
113	NC_012667	GTG	2	6	9442	9447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605072
114	NC_012667	TAC	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605072
115	NC_012667	CAG	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605073
116	NC_012667	GTC	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
117	NC_012667	TAC	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605073
118	NC_012667	CAT	2	6	9761	9766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605073
119	NC_012667	CCG	2	6	9987	9992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
120	NC_012667	GTC	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
121	NC_012667	GCC	2	6	10158	10163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
122	NC_012667	CGC	2	6	10217	10222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605073
123	NC_012667	TGC	2	6	10267	10272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605073
124	NC_012667	AAC	2	6	10353	10358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605073
125	NC_012667	ACC	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605074
126	NC_012667	ACC	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605074
127	NC_012667	CGG	2	6	10915	10920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605074
128	NC_012667	AGA	2	6	10930	10935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605074
129	NC_012667	CAA	2	6	11006	11011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605074
130	NC_012667	CGG	2	6	11016	11021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605074
131	NC_012667	GGA	2	6	11136	11141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605075
132	NC_012667	GCC	2	6	11216	11221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605075
133	NC_012667	GAT	2	6	11230	11235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605075
134	NC_012667	CCA	2	6	11237	11242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605075
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143	NC_012667	CTG	2	6	12302	12307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605077
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248	NC_012667	CGA	2	6	21269	21274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605086
249	NC_012667	CAC	4	12	21315	21326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605086
250	NC_012667	TCG	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605086
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252	NC_012667	TGA	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605086
253	NC_012667	GCT	2	6	21704	21709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605086
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256	NC_012667	CAC	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605087
257	NC_012667	GGT	2	6	21965	21970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605087
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259	NC_012667	AGC	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
260	NC_012667	CAG	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
261	NC_012667	AGC	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605087
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273	NC_012667	ACC	2	6	22881	22886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605088
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498	NC_012667	TCA	2	6	44498	44503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605104
499	NC_012667	GTG	2	6	44516	44521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605104
500	NC_012667	AAT	2	6	44578	44583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605104

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