MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 16955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012667	TCA	2	6	1011762	1011767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605974
16002	NC_012667	CGC	2	6	1011816	1011821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605975
16003	NC_012667	ACG	2	6	1011858	1011863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605975
16004	NC_012667	AGC	2	6	1011875	1011880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605975
16005	NC_012667	TTTA	2	8	1011887	1011894	25 %	75 %	0 %	0 %	229605975
16006	NC_012667	GAT	2	6	1011904	1011909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605975
16007	NC_012667	CAA	2	6	1012027	1012032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605975
16008	NC_012667	TTC	2	6	1012049	1012054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605975
16009	NC_012667	ACC	2	6	1012149	1012154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605976
16010	NC_012667	CAAC	2	8	1012247	1012254	50 %	0 %	0 %	50 %	229605976
16011	NC_012667	GAA	2	6	1012294	1012299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605977
16012	NC_012667	CAT	2	6	1012453	1012458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605977
16013	NC_012667	TCA	2	6	1012461	1012466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605977
16014	NC_012667	TTG	2	6	1012514	1012519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605977
16015	NC_012667	TTG	2	6	1012532	1012537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605977
16016	NC_012667	CCGA	2	8	1012563	1012570	25 %	0 %	25 %	50 %	229605977
16017	NC_012667	A	7	7	1012570	1012576	100 %	0 %	0 %	0 %	229605977
16018	NC_012667	CA	3	6	1012843	1012848	50 %	0 %	0 %	50 %	229605978
16019	NC_012667	AC	3	6	1012850	1012855	50 %	0 %	0 %	50 %	229605978
16020	NC_012667	AAAG	2	8	1012938	1012945	75 %	0 %	25 %	0 %	229605978
16021	NC_012667	CAA	2	6	1013003	1013008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605978
16022	NC_012667	ACC	2	6	1013739	1013744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605980
16023	NC_012667	TGA	2	6	1013770	1013775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605980
16024	NC_012667	TCA	2	6	1013851	1013856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605980
16025	NC_012667	CCA	2	6	1013918	1013923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605980
16026	NC_012667	TAA	2	6	1013933	1013938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605980
16027	NC_012667	TC	3	6	1013960	1013965	0 %	50 %	0 %	50 %	229605980
16028	NC_012667	AATGC	2	10	1013978	1013987	40 %	20 %	20 %	20 %	229605980
16029	NC_012667	GCA	2	6	1014007	1014012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605980
16030	NC_012667	GCA	2	6	1014040	1014045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605980
16031	NC_012667	ACA	2	6	1014184	1014189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605980
16032	NC_012667	GCT	2	6	1014193	1014198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605980
16033	NC_012667	TAT	2	6	1014239	1014244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605980
16034	NC_012667	AGG	2	6	1014330	1014335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605980
16035	NC_012667	TGCT	2	8	1014550	1014557	0 %	50 %	25 %	25 %	229605981
16036	NC_012667	CTAC	2	8	1014636	1014643	25 %	25 %	0 %	50 %	229605981
16037	NC_012667	AAT	2	6	1014702	1014707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605981
16038	NC_012667	TGA	2	6	1014725	1014730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605981
16039	NC_012667	GAA	2	6	1014761	1014766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605981
16040	NC_012667	ACTT	2	8	1014842	1014849	25 %	50 %	0 %	25 %	229605981
16041	NC_012667	AGC	2	6	1014911	1014916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605981
16042	NC_012667	GCTGA	2	10	1014948	1014957	20 %	20 %	40 %	20 %	229605981
16043	NC_012667	GCT	2	6	1014984	1014989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605981
16044	NC_012667	AGT	3	9	1015131	1015139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605981
16045	NC_012667	TGCC	2	8	1015305	1015312	0 %	25 %	25 %	50 %	229605982
16046	NC_012667	T	6	6	1015338	1015343	0 %	100 %	0 %	0 %	229605982
16047	NC_012667	CGA	2	6	1015345	1015350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605982
16048	NC_012667	AACT	2	8	1015404	1015411	50 %	25 %	0 %	25 %	229605982
16049	NC_012667	A	6	6	1015446	1015451	100 %	0 %	0 %	0 %	229605982
16050	NC_012667	CAA	2	6	1015613	1015618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605982
16051	NC_012667	AGC	2	6	1015698	1015703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605982
16052	NC_012667	CGCC	2	8	1015797	1015804	0 %	0 %	25 %	75 %	229605982
16053	NC_012667	AAC	2	6	1015824	1015829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605982
16054	NC_012667	ACC	2	6	1015845	1015850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605982
16055	NC_012667	ACC	2	6	1015854	1015859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605982
16056	NC_012667	AAAG	2	8	1016084	1016091	75 %	0 %	25 %	0 %	229605983
16057	NC_012667	GAT	2	6	1016104	1016109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605983
16058	NC_012667	CAA	2	6	1016149	1016154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605983
16059	NC_012667	TATT	2	8	1017207	1017214	25 %	75 %	0 %	0 %	229605984
16060	NC_012667	GCT	2	6	1017215	1017220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605984
16061	NC_012667	A	6	6	1017414	1017419	100 %	0 %	0 %	0 %	229605984
16062	NC_012667	CTTC	2	8	1017476	1017483	0 %	50 %	0 %	50 %	229605984
16063	NC_012667	CCA	2	6	1017529	1017534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605984
16064	NC_012667	TCGAG	2	10	1017592	1017601	20 %	20 %	40 %	20 %	229605984
16065	NC_012667	GTT	2	6	1017627	1017632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605984
16066	NC_012667	AGC	2	6	1017677	1017682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605984
16067	NC_012667	TAA	2	6	1017687	1017692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605984
16068	NC_012667	AC	3	6	1017898	1017903	50 %	0 %	0 %	50 %	229605985
16069	NC_012667	GAA	2	6	1017950	1017955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605985
16070	NC_012667	CAA	2	6	1017971	1017976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605985
16071	NC_012667	AGC	2	6	1018041	1018046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605985
16072	NC_012667	GAA	2	6	1018213	1018218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605986
16073	NC_012667	TC	3	6	1018222	1018227	0 %	50 %	0 %	50 %	229605986
16074	NC_012667	CAG	2	6	1018271	1018276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605986
16075	NC_012667	A	7	7	1018282	1018288	100 %	0 %	0 %	0 %	229605986
16076	NC_012667	TTA	2	6	1018376	1018381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605986
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16082	NC_012667	TCA	2	6	1018752	1018757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605987
16083	NC_012667	CTTG	2	8	1018850	1018857	0 %	50 %	25 %	25 %	229605987
16084	NC_012667	AAG	2	6	1018861	1018866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605987
16085	NC_012667	GTTC	2	8	1018870	1018877	0 %	50 %	25 %	25 %	229605987
16086	NC_012667	GGC	2	6	1018889	1018894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605987
16087	NC_012667	ACC	3	9	1018915	1018923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605987
16088	NC_012667	ACTGA	2	10	1018945	1018954	40 %	20 %	20 %	20 %	229605987
16089	NC_012667	T	6	6	1018958	1018963	0 %	100 %	0 %	0 %	229605987
16090	NC_012667	CAT	2	6	1018980	1018985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605987
16091	NC_012667	T	6	6	1019234	1019239	0 %	100 %	0 %	0 %	229605988
16092	NC_012667	CAC	2	6	1019287	1019292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605988
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16095	NC_012667	ATGT	2	8	1019527	1019534	25 %	50 %	25 %	0 %	229605988
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16102	NC_012667	TGT	2	6	1020559	1020564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605989
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16104	NC_012667	TCAGT	2	10	1020766	1020775	20 %	40 %	20 %	20 %	229605990
16105	NC_012667	CAA	2	6	1020813	1020818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605990
16106	NC_012667	A	7	7	1020929	1020935	100 %	0 %	0 %	0 %	229605990
16107	NC_012667	GCT	2	6	1020963	1020968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605990
16108	NC_012667	TGT	2	6	1020986	1020991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605990
16109	NC_012667	CT	3	6	1021062	1021067	0 %	50 %	0 %	50 %	229605990
16110	NC_012667	T	6	6	1021067	1021072	0 %	100 %	0 %	0 %	229605990
16111	NC_012667	T	6	6	1021168	1021173	0 %	100 %	0 %	0 %	229605990
16112	NC_012667	CTA	2	6	1021480	1021485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605991
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16117	NC_012667	TGA	2	6	1022584	1022589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605992
16118	NC_012667	TCT	2	6	1022597	1022602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605992
16119	NC_012667	GTT	3	9	1022680	1022688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605992
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16229	NC_012667	ATC	2	6	1035497	1035502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606012
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16231	NC_012667	CGA	2	6	1035613	1035618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606012
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16233	NC_012667	TTG	2	6	1035714	1035719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606012
16234	NC_012667	TCA	2	6	1035795	1035800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606012
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16351	NC_012667	ATG	2	6	1044915	1044920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606029
16352	NC_012667	TCA	2	6	1044959	1044964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606029
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16466	NC_012667	ACA	3	9	1054563	1054571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606039
16467	NC_012667	TAT	2	6	1054672	1054677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606039
16468	NC_012667	CCT	2	6	1054756	1054761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606039
16469	NC_012667	CTT	2	6	1054780	1054785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606039
16470	NC_012667	ATA	2	6	1054907	1054912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606039
16471	NC_012667	TTTTTA	2	12	1054987	1054998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229606039
16472	NC_012667	TAC	2	6	1055054	1055059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606039
16473	NC_012667	A	6	6	1055067	1055072	100 %	0 %	0 %	0 %	229606039
16474	NC_012667	GAAA	2	8	1055085	1055092	75 %	0 %	25 %	0 %	229606039
16475	NC_012667	TGA	2	6	1055126	1055131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606039
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16479	NC_012667	T	6	6	1055197	1055202	0 %	100 %	0 %	0 %	229606040
16480	NC_012667	TCA	2	6	1055253	1055258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606040
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16482	NC_012667	TGA	2	6	1055407	1055412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606040
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16484	NC_012667	TAC	2	6	1055442	1055447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606040
16485	NC_012667	TTG	2	6	1055616	1055621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606040
16486	NC_012667	CAT	2	6	1055631	1055636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606040
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16488	NC_012667	CT	3	6	1056253	1056258	0 %	50 %	0 %	50 %	229606041
16489	NC_012667	TTCTGG	19	114	1056323	1056436	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	229606041
16490	NC_012667	CAA	2	6	1056469	1056474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606041
16491	NC_012667	GAG	2	6	1056492	1056497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606041
16492	NC_012667	ATA	2	6	1056544	1056549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606041
16493	NC_012667	CTTGT	2	10	1056620	1056629	0 %	60 %	20 %	20 %	229606041
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16495	NC_012667	CGTA	2	8	1056696	1056703	25 %	25 %	25 %	25 %	229606041
16496	NC_012667	TCCA	2	8	1056742	1056749	25 %	25 %	0 %	50 %	229606041
16497	NC_012667	AACT	2	8	1056760	1056767	50 %	25 %	0 %	25 %	229606041
16498	NC_012667	TAA	2	6	1056944	1056949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606041
16499	NC_012667	T	6	6	1057029	1057034	0 %	100 %	0 %	0 %	229606041
16500	NC_012667	ACC	2	6	1057067	1057072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606041

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