MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	227119190
2	NC_012583	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	227119190
3	NC_012583	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	227119190
4	NC_012583	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	227119191
5	NC_012583	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	227119195
6	NC_012583	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	227119196
7	NC_012583	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	227119196
8	NC_012583	TTCAC	2	10	10194	10203	20 %	40 %	0 %	40 %	227119198
9	NC_012583	ACGCG	2	10	16436	16445	20 %	0 %	40 %	40 %	227119200
10	NC_012583	GTGGC	2	10	16692	16701	0 %	20 %	60 %	20 %	227119200
11	NC_012583	TGGTG	2	10	18195	18204	0 %	40 %	60 %	0 %	227119201
12	NC_012583	GGTTT	2	10	18632	18641	0 %	60 %	40 %	0 %	227119201
13	NC_012583	AGATG	2	10	19888	19897	40 %	20 %	40 %	0 %	227119202
14	NC_012583	ACCAC	2	10	21973	21982	40 %	0 %	0 %	60 %	227119203
15	NC_012583	GATCC	2	10	24331	24340	20 %	20 %	20 %	40 %	227119205
16	NC_012583	CCACC	2	10	27114	27123	20 %	0 %	0 %	80 %	227119206
17	NC_012583	AAAGA	2	10	27178	27187	80 %	0 %	20 %	0 %	227119206
18	NC_012583	CCAAT	2	10	29816	29825	40 %	20 %	0 %	40 %	227119209
19	NC_012583	CGCGA	2	10	30040	30049	20 %	0 %	40 %	40 %	227119209
20	NC_012583	AAGCG	2	10	33894	33903	40 %	0 %	40 %	20 %	227119212
21	NC_012583	AATGC	2	10	34775	34784	40 %	20 %	20 %	20 %	227119212
22	NC_012583	GCTTA	2	10	36701	36710	20 %	40 %	20 %	20 %	227119214
23	NC_012583	AAGCT	2	10	37138	37147	40 %	20 %	20 %	20 %	227119214
24	NC_012583	ACTCA	2	10	37257	37266	40 %	20 %	0 %	40 %	227119214
25	NC_012583	GCGGA	2	10	37696	37705	20 %	0 %	60 %	20 %	227119215
26	NC_012583	GAGCT	2	10	38262	38271	20 %	20 %	40 %	20 %	227119215
27	NC_012583	CCACT	2	10	40514	40523	20 %	20 %	0 %	60 %	227119217
28	NC_012583	GGTTG	2	10	41149	41158	0 %	40 %	60 %	0 %	227119217
29	NC_012583	GTGAA	2	10	41957	41966	40 %	20 %	40 %	0 %	227119217
30	NC_012583	GCTGA	2	10	42939	42948	20 %	20 %	40 %	20 %	227119218
31	NC_012583	TGGGT	2	10	43483	43492	0 %	40 %	60 %	0 %	227119219
32	NC_012583	CTTGG	2	10	43552	43561	0 %	40 %	40 %	20 %	227119219
33	NC_012583	ACTGA	2	10	43615	43624	40 %	20 %	20 %	20 %	227119219
34	NC_012583	TTCAA	2	10	45770	45779	40 %	40 %	0 %	20 %	227119221
35	NC_012583	GTTGC	2	10	47431	47440	0 %	40 %	40 %	20 %	227119224
36	NC_012583	CAATC	2	10	47602	47611	40 %	20 %	0 %	40 %	227119224
37	NC_012583	CATTT	2	10	49970	49979	20 %	60 %	0 %	20 %	227119225
38	NC_012583	TACCT	2	10	55193	55202	20 %	40 %	0 %	40 %	227119230
39	NC_012583	GAACA	2	10	55778	55787	60 %	0 %	20 %	20 %	227119230
40	NC_012583	TGGTT	2	10	55806	55815	0 %	60 %	40 %	0 %	227119230
41	NC_012583	GCTTG	2	10	57527	57536	0 %	40 %	40 %	20 %	227119232
42	NC_012583	CATGC	2	10	57807	57816	20 %	20 %	20 %	40 %	227119232
43	NC_012583	AGTTG	2	10	61195	61204	20 %	40 %	40 %	0 %	227119234
44	NC_012583	CCATG	2	10	61823	61832	20 %	20 %	20 %	40 %	227119235
45	NC_012583	CAATT	2	10	62029	62038	40 %	40 %	0 %	20 %	227119235
46	NC_012583	GTACA	2	10	62267	62276	40 %	20 %	20 %	20 %	227119236
47	NC_012583	TGGTT	2	10	64097	64106	0 %	60 %	40 %	0 %	227119239
48	NC_012583	GATTT	2	10	64237	64246	20 %	60 %	20 %	0 %	227119239
49	NC_012583	AATGG	2	10	69132	69141	40 %	20 %	40 %	0 %	227119244
50	NC_012583	GCAAG	2	10	71037	71046	40 %	0 %	40 %	20 %	227119245
51	NC_012583	GACAA	2	10	72083	72092	60 %	0 %	20 %	20 %	227119245
52	NC_012583	TTGAC	2	10	73211	73220	20 %	40 %	20 %	20 %	227119246
53	NC_012583	CGCTA	2	10	73772	73781	20 %	20 %	20 %	40 %	227119246
54	NC_012583	TGTGG	2	10	74622	74631	0 %	40 %	60 %	0 %	227119246
55	NC_012583	TGCGC	2	10	74901	74910	0 %	20 %	40 %	40 %	227119246
56	NC_012583	AACCA	2	10	74992	75001	60 %	0 %	0 %	40 %	227119246
57	NC_012583	GCACC	2	10	76836	76845	20 %	0 %	20 %	60 %	227119248
58	NC_012583	ACAGG	2	10	76958	76967	40 %	0 %	40 %	20 %	227119248
59	NC_012583	ATTGG	2	10	77757	77766	20 %	40 %	40 %	0 %	227119249
60	NC_012583	TGGCG	2	10	80606	80615	0 %	20 %	60 %	20 %	227119252
61	NC_012583	ACCCA	2	10	82457	82466	40 %	0 %	0 %	60 %	227119254
62	NC_012583	ATTTC	2	10	83007	83016	20 %	60 %	0 %	20 %	227119255
63	NC_012583	GATCA	2	10	83791	83800	40 %	20 %	20 %	20 %	227119255
64	NC_012583	CTTCA	2	10	87053	87062	20 %	40 %	0 %	40 %	227119259
65	NC_012583	GTTTT	2	10	92642	92651	0 %	80 %	20 %	0 %	227119263
66	NC_012583	AGCAC	2	10	92946	92955	40 %	0 %	20 %	40 %	227119263
67	NC_012583	CTAAG	2	10	96690	96699	40 %	20 %	20 %	20 %	227119266
68	NC_012583	TACCA	2	10	98789	98798	40 %	20 %	0 %	40 %	227119269
69	NC_012583	GCTTG	2	10	100370	100379	0 %	40 %	40 %	20 %	227119272
70	NC_012583	TGCAA	2	10	100913	100922	40 %	20 %	20 %	20 %	227119273
71	NC_012583	AACCA	2	10	101282	101291	60 %	0 %	0 %	40 %	227119273
72	NC_012583	GGATT	2	10	109276	109285	20 %	40 %	40 %	0 %	227119282
73	NC_012583	CAATG	2	10	113499	113508	40 %	20 %	20 %	20 %	227119285
74	NC_012583	GCTCA	2	10	113928	113937	20 %	20 %	20 %	40 %	227119285
75	NC_012583	TTTCA	2	10	117988	117997	20 %	60 %	0 %	20 %	227119288
76	NC_012583	TGAAC	2	10	118687	118696	40 %	20 %	20 %	20 %	227119288
77	NC_012583	CCGAT	2	10	120232	120241	20 %	20 %	20 %	40 %	227119290
78	NC_012583	CGTCC	2	10	120275	120284	0 %	20 %	20 %	60 %	227119290
79	NC_012583	TGGGG	2	10	120599	120608	0 %	20 %	80 %	0 %	227119290
80	NC_012583	GGTAC	2	10	120975	120984	20 %	20 %	40 %	20 %	227119290
81	NC_012583	GTGAT	2	10	121284	121293	20 %	40 %	40 %	0 %	227119291
82	NC_012583	TCCTG	2	10	126787	126796	0 %	40 %	20 %	40 %	227119295
83	NC_012583	GCTGA	2	10	127691	127700	20 %	20 %	40 %	20 %	227119295
84	NC_012583	CTGCT	2	10	128478	128487	0 %	40 %	20 %	40 %	227119295
85	NC_012583	CAATC	2	10	129079	129088	40 %	20 %	0 %	40 %	227119296
86	NC_012583	ACCCT	2	10	130132	130141	20 %	20 %	0 %	60 %	227119296
87	NC_012583	AGCTG	2	10	130499	130508	20 %	20 %	40 %	20 %	227119297
88	NC_012583	CAGTG	2	10	131206	131215	20 %	20 %	40 %	20 %	227119298
89	NC_012583	AGCAC	2	10	131227	131236	40 %	0 %	20 %	40 %	227119298
90	NC_012583	CGATG	2	10	132359	132368	20 %	20 %	40 %	20 %	227119298
91	NC_012583	TGATC	2	10	136868	136877	20 %	40 %	20 %	20 %	227119299
92	NC_012583	AGCCA	2	10	138188	138197	40 %	0 %	20 %	40 %	227119301
93	NC_012583	TGCTT	2	10	138464	138473	0 %	60 %	20 %	20 %	227119301
94	NC_012583	CGGAG	2	10	139373	139382	20 %	0 %	60 %	20 %	227119301
95	NC_012583	GGCGC	2	10	139590	139599	0 %	0 %	60 %	40 %	227119301
96	NC_012583	GAGCT	2	10	142574	142583	20 %	20 %	40 %	20 %	227119306
97	NC_012583	ACTGA	2	10	143027	143036	40 %	20 %	20 %	20 %	227119306
98	NC_012583	GCGTG	2	10	143068	143077	0 %	20 %	60 %	20 %	227119306
99	NC_012583	GATTG	2	10	147296	147305	20 %	40 %	40 %	0 %	227119310
100	NC_012583	GTTTG	2	10	147888	147897	0 %	60 %	40 %	0 %	227119311
101	NC_012583	TTCTT	2	10	148183	148192	0 %	80 %	0 %	20 %	227119311
102	NC_012583	GCGAT	2	10	154492	154501	20 %	20 %	40 %	20 %	227119318
103	NC_012583	TTGCC	2	10	154729	154738	0 %	40 %	20 %	40 %	227119318
104	NC_012583	GCGCT	2	10	157152	157161	0 %	20 %	40 %	40 %	227119319
105	NC_012583	CGGTG	2	10	158220	158229	0 %	20 %	60 %	20 %	227119320
106	NC_012583	AGTGA	2	10	158803	158812	40 %	20 %	40 %	0 %	227119320
107	NC_012583	GTTTG	2	10	158862	158871	0 %	60 %	40 %	0 %	227119320
108	NC_012583	AAACG	2	10	164670	164679	60 %	0 %	20 %	20 %	227119325
109	NC_012583	GGTGT	2	10	165481	165490	0 %	40 %	60 %	0 %	227119325
110	NC_012583	CGTTT	2	10	165953	165962	0 %	60 %	20 %	20 %	227119325
111	NC_012583	AACCA	2	10	172348	172357	60 %	0 %	0 %	40 %	227119332
112	NC_012583	AATCC	2	10	174269	174278	40 %	20 %	0 %	40 %	227119334
113	NC_012583	ATGGA	2	10	175007	175016	40 %	20 %	40 %	0 %	227119334
114	NC_012583	TGGCT	2	10	176568	176577	0 %	40 %	40 %	20 %	227119336
115	NC_012583	CTGAA	2	10	177508	177517	40 %	20 %	20 %	20 %	227119337
116	NC_012583	TCTGC	2	10	179615	179624	0 %	40 %	20 %	40 %	227119338
117	NC_012583	CGCTT	2	10	180667	180676	0 %	40 %	20 %	40 %	227119339
118	NC_012583	AGAGA	2	10	185274	185283	60 %	0 %	40 %	0 %	227119344
119	NC_012583	AATTG	2	10	185304	185313	40 %	40 %	20 %	0 %	227119344
120	NC_012583	GCTGC	2	10	185676	185685	0 %	20 %	40 %	40 %	227119345
121	NC_012583	CCAAG	2	10	185988	185997	40 %	0 %	20 %	40 %	227119345
122	NC_012583	ATGGC	2	10	186400	186409	20 %	20 %	40 %	20 %	227119345
123	NC_012583	GATTG	2	10	189326	189335	20 %	40 %	40 %	0 %	227119347
124	NC_012583	GAGCT	2	10	192075	192084	20 %	20 %	40 %	20 %	227119350
125	NC_012583	CGGCA	2	10	195416	195425	20 %	0 %	40 %	40 %	227119353
126	NC_012583	GTTCA	2	10	195827	195836	20 %	40 %	20 %	20 %	227119353
127	NC_012583	AAACG	2	10	198797	198806	60 %	0 %	20 %	20 %	227119355
128	NC_012583	TTTGC	2	10	201008	201017	0 %	60 %	20 %	20 %	227119357
129	NC_012583	GCATC	2	10	204664	204673	20 %	20 %	20 %	40 %	227119361
130	NC_012583	TGGCT	2	10	205137	205146	0 %	40 %	40 %	20 %	227119362
131	NC_012583	AAACC	2	10	206819	206828	60 %	0 %	0 %	40 %	227119365
132	NC_012583	ATCAC	2	10	208953	208962	40 %	20 %	0 %	40 %	227119367
133	NC_012583	CATTC	2	10	214929	214938	20 %	40 %	0 %	40 %	227119373
134	NC_012583	ATCAC	2	10	215153	215162	40 %	20 %	0 %	40 %	227119373
135	NC_012583	ATGCA	2	10	218212	218221	40 %	20 %	20 %	20 %	227119378
136	NC_012583	AACCA	2	10	219716	219725	60 %	0 %	0 %	40 %	227119381
137	NC_012583	AAACC	2	10	222086	222095	60 %	0 %	0 %	40 %	227119386
138	NC_012583	TTGGT	2	10	222879	222888	0 %	60 %	40 %	0 %	227119386
139	NC_012583	AGCGA	2	10	223786	223795	40 %	0 %	40 %	20 %	227119386
140	NC_012583	TCAAA	2	10	227805	227814	60 %	20 %	0 %	20 %	227119394
141	NC_012583	GAGTG	2	10	228842	228851	20 %	20 %	60 %	0 %	227119395
142	NC_012583	CATCG	2	10	233735	233744	20 %	20 %	20 %	40 %	227119399
143	NC_012583	CAGAG	2	10	234214	234223	40 %	0 %	40 %	20 %	227119400
144	NC_012583	AAGAA	2	10	234945	234954	80 %	0 %	20 %	0 %	227119401
145	NC_012583	CATGG	2	10	235180	235189	20 %	20 %	40 %	20 %	227119402
146	NC_012583	ACTCA	2	10	236062	236071	40 %	20 %	0 %	40 %	227119402
147	NC_012583	CAAAT	2	10	236180	236189	60 %	20 %	0 %	20 %	227119402
148	NC_012583	AAGCG	2	10	236385	236394	40 %	0 %	40 %	20 %	227119403
149	NC_012583	CGGTA	2	10	238521	238530	20 %	20 %	40 %	20 %	227119409
150	NC_012583	TTCGG	2	10	239618	239627	0 %	40 %	40 %	20 %	227119411
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152	NC_012583	CACTG	2	10	239899	239908	20 %	20 %	20 %	40 %	227119411
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174	NC_012583	TGGCT	2	10	280199	280208	0 %	40 %	40 %	20 %	227119442
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263	NC_012583	TTCAC	2	10	473155	473164	20 %	40 %	0 %	40 %	227119704
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