MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012583	GGATGT	2	12	186335	186346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227119345
3002	NC_012583	TTG	3	9	186354	186362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119345
3003	NC_012583	ATGGC	2	10	186400	186409	20 %	20 %	40 %	20 %	227119345
3004	NC_012583	TTG	2	6	186447	186452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119345
3005	NC_012583	AGT	2	6	186542	186547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3006	NC_012583	GCCT	2	8	186648	186655	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3007	NC_012583	GCTC	2	8	186731	186738	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3008	NC_012583	CGA	2	6	186796	186801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3009	NC_012583	GTTC	2	8	186862	186869	0 %	50 %	25 %	25 %	227119345
3010	NC_012583	AGT	2	6	187037	187042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3011	NC_012583	TGA	2	6	187049	187054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3012	NC_012583	GAG	2	6	187063	187068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119345
3013	NC_012583	CAA	2	6	187085	187090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119345
3014	NC_012583	A	6	6	187089	187094	100 %	0 %	0 %	0 %	227119345
3015	NC_012583	CAG	2	6	187127	187132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3016	NC_012583	TGAC	2	8	187144	187151	25 %	25 %	25 %	25 %	227119345
3017	NC_012583	CAG	2	6	187248	187253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3018	NC_012583	A	6	6	187262	187267	100 %	0 %	0 %	0 %	227119345
3019	NC_012583	GC	4	8	187354	187361	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3020	NC_012583	AGT	2	6	187362	187367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3021	NC_012583	AGA	2	6	187433	187438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119346
3022	NC_012583	GGT	2	6	187439	187444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119346
3023	NC_012583	GC	3	6	187549	187554	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3024	NC_012583	CAT	2	6	187573	187578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119346
3025	NC_012583	CT	3	6	187629	187634	0 %	50 %	0 %	50 %	227119346
3026	NC_012583	CTG	2	6	187643	187648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3027	NC_012583	TTTG	2	8	187671	187678	0 %	75 %	25 %	0 %	227119346
3028	NC_012583	TGA	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3029	NC_012583	TCT	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3030	NC_012583	CTT	2	6	187738	187743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3031	NC_012583	GGA	2	6	187748	187753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119346
3032	NC_012583	CTG	2	6	187769	187774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3033	NC_012583	TTGCTG	22	132	187775	187906	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227119346
3034	NC_012583	TGA	2	6	187944	187949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3035	NC_012583	CTTG	2	8	187957	187964	0 %	50 %	25 %	25 %	227119346
3036	NC_012583	TTG	2	6	188169	188174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119346
3037	NC_012583	CTG	2	6	188225	188230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3038	NC_012583	ACTC	2	8	188240	188247	25 %	25 %	0 %	50 %	227119346
3039	NC_012583	AGC	2	6	188253	188258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3040	NC_012583	GCG	2	6	188298	188303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3041	NC_012583	GCT	2	6	188389	188394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3042	NC_012583	GCT	2	6	188473	188478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3043	NC_012583	GC	3	6	188560	188565	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3044	NC_012583	AAC	2	6	188616	188621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3045	NC_012583	ATC	2	6	188654	188659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119346
3046	NC_012583	TGA	2	6	188685	188690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3047	NC_012583	GCGGCA	2	12	188727	188738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227119346
3048	NC_012583	ATG	2	6	188757	188762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3049	NC_012583	GA	3	6	188769	188774	50 %	0 %	50 %	0 %	227119346
3050	NC_012583	GCA	2	6	188779	188784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3051	NC_012583	CAC	2	6	188822	188827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119346
3052	NC_012583	CTT	2	6	188866	188871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3053	NC_012583	AGG	2	6	188883	188888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119346
3054	NC_012583	AC	3	6	188971	188976	50 %	0 %	0 %	50 %	227119346
3055	NC_012583	GCG	2	6	188979	188984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3056	NC_012583	CGA	2	6	189046	189051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3057	NC_012583	TAA	2	6	189065	189070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119346
3058	NC_012583	CGC	2	6	189084	189089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119346
3059	NC_012583	CAAT	2	8	189130	189137	50 %	25 %	0 %	25 %	227119346
3060	NC_012583	GCG	2	6	189168	189173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3061	NC_012583	CAA	2	6	189176	189181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3062	NC_012583	CAA	2	6	189191	189196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3063	NC_012583	AGC	2	6	189268	189273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3064	NC_012583	GATTG	2	10	189326	189335	20 %	40 %	40 %	0 %	227119347
3065	NC_012583	TTG	2	6	189384	189389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119347
3066	NC_012583	TGG	2	6	189419	189424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119347
3067	NC_012583	ACC	2	6	189499	189504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3068	NC_012583	GTG	2	6	189538	189543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119347
3069	NC_012583	GGC	2	6	189564	189569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119347
3070	NC_012583	TGC	2	6	189599	189604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3071	NC_012583	ATC	2	6	189619	189624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119347
3072	NC_012583	GCG	2	6	189632	189637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119347
3073	NC_012583	CCA	2	6	189869	189874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3074	NC_012583	CTG	2	6	189876	189881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3075	NC_012583	ACC	2	6	189925	189930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3076	NC_012583	AGC	2	6	190003	190008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3077	NC_012583	CGC	2	6	190095	190100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119347
3078	NC_012583	A	7	7	190122	190128	100 %	0 %	0 %	0 %	227119347
3079	NC_012583	A	6	6	190152	190157	100 %	0 %	0 %	0 %	227119347
3080	NC_012583	CCA	3	9	190164	190172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3081	NC_012583	CGG	2	6	190216	190221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119348
3082	NC_012583	GTG	2	6	190249	190254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119348
3083	NC_012583	TCA	2	6	190262	190267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119348
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3085	NC_012583	GTA	2	6	190405	190410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119348
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3087	NC_012583	AGA	2	6	190444	190449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119348
3088	NC_012583	T	7	7	190494	190500	0 %	100 %	0 %	0 %	227119348
3089	NC_012583	ATA	2	6	190541	190546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119348
3090	NC_012583	CCA	2	6	190579	190584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119348
3091	NC_012583	TTG	2	6	190686	190691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119349
3092	NC_012583	AAT	2	6	190735	190740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119349
3093	NC_012583	T	6	6	190782	190787	0 %	100 %	0 %	0 %	227119349
3094	NC_012583	CAC	2	6	190992	190997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119349
3095	NC_012583	CAT	2	6	191039	191044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119349
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3098	NC_012583	TGC	2	6	191086	191091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119349
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3101	NC_012583	ATCA	2	8	191172	191179	50 %	25 %	0 %	25 %	227119349
3102	NC_012583	TTG	2	6	191196	191201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119349
3103	NC_012583	CAG	2	6	191256	191261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119349
3104	NC_012583	CAC	2	6	191307	191312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119349
3105	NC_012583	CAAT	2	8	191377	191384	50 %	25 %	0 %	25 %	227119349
3106	NC_012583	CGAA	2	8	191385	191392	50 %	0 %	25 %	25 %	227119349
3107	NC_012583	TCA	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119349
3108	NC_012583	ATCC	2	8	191430	191437	25 %	25 %	0 %	50 %	227119349
3109	NC_012583	A	6	6	191503	191508	100 %	0 %	0 %	0 %	227119349
3110	NC_012583	CTG	2	6	191517	191522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119349
3111	NC_012583	CTC	2	6	191538	191543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119349
3112	NC_012583	ACCA	2	8	191610	191617	50 %	0 %	0 %	50 %	227119350
3113	NC_012583	ACA	2	6	191621	191626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119350
3114	NC_012583	GAT	2	6	191634	191639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119350
3115	NC_012583	TTCC	2	8	191654	191661	0 %	50 %	0 %	50 %	227119350
3116	NC_012583	GCA	2	6	191696	191701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119350
3117	NC_012583	CAT	2	6	191723	191728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119350
3118	NC_012583	TCG	2	6	191792	191797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119350
3119	NC_012583	CG	3	6	191796	191801	0 %	0 %	50 %	50 %	227119350
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3121	NC_012583	TTG	2	6	191979	191984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119350
3122	NC_012583	TCT	2	6	192028	192033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119350
3123	NC_012583	GAGCT	2	10	192075	192084	20 %	20 %	40 %	20 %	227119350
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3235	NC_012583	TCA	2	6	199585	199590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119356
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3239	NC_012583	GT	4	8	199822	199829	0 %	50 %	50 %	0 %	227119356
3240	NC_012583	TC	3	6	199942	199947	0 %	50 %	0 %	50 %	227119356
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3242	NC_012583	CAG	2	6	200165	200170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119356
3243	NC_012583	TCA	2	6	200172	200177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119356
3244	NC_012583	GTG	2	6	200190	200195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119356
3245	NC_012583	TGA	2	6	200200	200205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119356
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3247	NC_012583	AAC	2	6	200239	200244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119356
3248	NC_012583	GTGCCT	2	12	200310	200321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119356
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3251	NC_012583	GCT	2	6	200571	200576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119357
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3255	NC_012583	GGC	2	6	200832	200837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119357
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3265	NC_012583	TGC	2	6	201452	201457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119357
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3267	NC_012583	AGC	2	6	201615	201620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119357
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3270	NC_012583	CGG	2	6	201720	201725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119357
3271	NC_012583	ACG	2	6	201795	201800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119357
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3300	NC_012583	TGA	2	6	204859	204864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119361
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3316	NC_012583	GC	3	6	206078	206083	0 %	0 %	50 %	50 %	227119364
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3352	NC_012583	TG	3	6	207588	207593	0 %	50 %	50 %	0 %	227119366
3353	NC_012583	GCA	2	6	207631	207636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119366
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3356	NC_012583	TG	3	6	207888	207893	0 %	50 %	50 %	0 %	227119366
3357	NC_012583	TGA	2	6	207984	207989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119366
3358	NC_012583	ATTT	2	8	208011	208018	25 %	75 %	0 %	0 %	227119366
3359	NC_012583	GCA	2	6	208084	208089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119366
3360	NC_012583	GGATGC	2	12	208132	208143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227119366
3361	NC_012583	ATG	2	6	208173	208178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119366
3362	NC_012583	GCG	2	6	208211	208216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119366
3363	NC_012583	GCG	2	6	208262	208267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119366
3364	NC_012583	GAT	2	6	208331	208336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119366
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3366	NC_012583	TACT	2	8	208401	208408	25 %	50 %	0 %	25 %	227119366
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3485	NC_012583	TCA	2	6	214910	214915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119373
3486	NC_012583	CATTC	2	10	214929	214938	20 %	40 %	0 %	40 %	227119373
3487	NC_012583	CAA	2	6	215034	215039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119373
3488	NC_012583	ATCAC	2	10	215153	215162	40 %	20 %	0 %	40 %	227119373
3489	NC_012583	CAA	2	6	215202	215207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119373
3490	NC_012583	GCC	2	6	215217	215222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119373
3491	NC_012583	TAT	2	6	215223	215228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119373
3492	NC_012583	ATC	2	6	215254	215259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119373
3493	NC_012583	ATG	2	6	215270	215275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119373
3494	NC_012583	TGG	2	6	215304	215309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119373
3495	NC_012583	ACGC	2	8	215320	215327	25 %	0 %	25 %	50 %	227119373
3496	NC_012583	T	6	6	215371	215376	0 %	100 %	0 %	0 %	227119373
3497	NC_012583	GATT	2	8	215421	215428	25 %	50 %	25 %	0 %	227119374
3498	NC_012583	AAC	2	6	215439	215444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119374
3499	NC_012583	CAT	2	6	215538	215543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119374
3500	NC_012583	TGA	2	6	215618	215623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119374

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