MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_012583	CGA	2	6	87931	87936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119259
1503	NC_012583	ATG	2	6	87960	87965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119259
1504	NC_012583	ATG	2	6	88011	88016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119259
1505	NC_012583	ACC	2	6	88112	88117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119259
1506	NC_012583	AAT	2	6	88130	88135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119259
1507	NC_012583	GAT	2	6	88142	88147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119259
1508	NC_012583	CCA	2	6	88216	88221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119259
1509	NC_012583	CTG	2	6	88237	88242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119259
1510	NC_012583	TTG	2	6	88248	88253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119259
1511	NC_012583	GGTT	2	8	88612	88619	0 %	50 %	50 %	0 %	227119260
1512	NC_012583	T	6	6	88621	88626	0 %	100 %	0 %	0 %	227119260
1513	NC_012583	AAG	2	6	88656	88661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119260
1514	NC_012583	T	6	6	88745	88750	0 %	100 %	0 %	0 %	227119260
1515	NC_012583	A	6	6	88773	88778	100 %	0 %	0 %	0 %	227119260
1516	NC_012583	GAA	2	6	88914	88919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119260
1517	NC_012583	TGTT	2	8	88923	88930	0 %	75 %	25 %	0 %	227119260
1518	NC_012583	ACC	2	6	88932	88937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119260
1519	NC_012583	TAT	2	6	89152	89157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119261
1520	NC_012583	GAAA	2	8	89184	89191	75 %	0 %	25 %	0 %	227119261
1521	NC_012583	TAG	2	6	89199	89204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119261
1522	NC_012583	TCT	2	6	89234	89239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119261
1523	NC_012583	CAA	2	6	89261	89266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119261
1524	NC_012583	CAG	2	6	89313	89318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119261
1525	NC_012583	TATGAA	2	12	89357	89368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227119261
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1527	NC_012583	TC	4	8	89669	89676	0 %	50 %	0 %	50 %	227119261
1528	NC_012583	GCC	2	6	89699	89704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119261
1529	NC_012583	CTG	2	6	89726	89731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119261
1530	NC_012583	AATT	2	8	89740	89747	50 %	50 %	0 %	0 %	227119261
1531	NC_012583	CGT	2	6	89762	89767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119261
1532	NC_012583	TCG	2	6	89802	89807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119261
1533	NC_012583	TCA	2	6	89972	89977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119261
1534	NC_012583	CGTG	2	8	90283	90290	0 %	25 %	50 %	25 %	227119261
1535	NC_012583	GTC	2	6	90291	90296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119261
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1540	NC_012583	CGA	2	6	90684	90689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119262
1541	NC_012583	AAT	2	6	90718	90723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119262
1542	NC_012583	TGGT	2	8	90749	90756	0 %	50 %	50 %	0 %	227119262
1543	NC_012583	AAGT	2	8	90757	90764	50 %	25 %	25 %	0 %	227119262
1544	NC_012583	TGC	2	6	90775	90780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119262
1545	NC_012583	CAAT	2	8	90794	90801	50 %	25 %	0 %	25 %	227119262
1546	NC_012583	AG	3	6	90916	90921	50 %	0 %	50 %	0 %	227119262
1547	NC_012583	TCG	2	6	90953	90958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119262
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1553	NC_012583	TGA	2	6	91283	91288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119262
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1555	NC_012583	CAC	2	6	91455	91460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119262
1556	NC_012583	CGA	2	6	91499	91504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119262
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1558	NC_012583	TCA	2	6	91592	91597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119262
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1561	NC_012583	AGT	2	6	91680	91685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119262
1562	NC_012583	CGAA	2	8	91705	91712	50 %	0 %	25 %	25 %	227119262
1563	NC_012583	TCA	2	6	91715	91720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119262
1564	NC_012583	ATG	2	6	91744	91749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119262
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1567	NC_012583	GCGA	2	8	91860	91867	25 %	0 %	50 %	25 %	227119262
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1572	NC_012583	TG	3	6	92270	92275	0 %	50 %	50 %	0 %	227119262
1573	NC_012583	GTG	2	6	92314	92319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119262
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1581	NC_012583	AGCAC	2	10	92946	92955	40 %	0 %	20 %	40 %	227119263
1582	NC_012583	CGC	2	6	93028	93033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119263
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1599	NC_012583	GT	3	6	93982	93987	0 %	50 %	50 %	0 %	227119264
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1602	NC_012583	TC	3	6	94034	94039	0 %	50 %	0 %	50 %	227119264
1603	NC_012583	ATT	2	6	94062	94067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119264
1604	NC_012583	TGGC	2	8	94086	94093	0 %	25 %	50 %	25 %	227119264
1605	NC_012583	TGC	2	6	94129	94134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119264
1606	NC_012583	TGA	2	6	94165	94170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119264
1607	NC_012583	CAA	2	6	94254	94259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119264
1608	NC_012583	AGT	2	6	94266	94271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119264
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1616	NC_012583	A	6	6	94779	94784	100 %	0 %	0 %	0 %	227119264
1617	NC_012583	GTAA	2	8	94820	94827	50 %	25 %	25 %	0 %	227119264
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1624	NC_012583	T	6	6	95539	95544	0 %	100 %	0 %	0 %	227119266
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1626	NC_012583	GAT	2	6	95586	95591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119266
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1871	NC_012583	ATG	2	6	111721	111726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119284
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1874	NC_012583	TGG	2	6	111879	111884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119284
1875	NC_012583	TGG	2	6	111929	111934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119284
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1992	NC_012583	CTGC	2	8	119943	119950	0 %	25 %	25 %	50 %	227119290
1993	NC_012583	TGC	2	6	119992	119997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119290
1994	NC_012583	CTT	2	6	120068	120073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119290
1995	NC_012583	CTG	2	6	120157	120162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119290
1996	NC_012583	TCA	2	6	120208	120213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119290
1997	NC_012583	ATG	2	6	120226	120231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119290
1998	NC_012583	CCGAT	2	10	120232	120241	20 %	20 %	20 %	40 %	227119290
1999	NC_012583	CGT	2	6	120255	120260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119290
2000	NC_012583	CGTCC	2	10	120275	120284	0 %	20 %	20 %	60 %	227119290

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