MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012583	TGT	2	6	59025	59030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119233
1002	NC_012583	GCA	2	6	59034	59039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1003	NC_012583	CAAT	2	8	59135	59142	50 %	25 %	0 %	25 %	227119233
1004	NC_012583	GTGG	2	8	59176	59183	0 %	25 %	75 %	0 %	227119233
1005	NC_012583	TTG	2	6	59296	59301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119233
1006	NC_012583	GTA	2	6	59308	59313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119233
1007	NC_012583	ATG	2	6	59329	59334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119233
1008	NC_012583	CAGG	2	8	59358	59365	25 %	0 %	50 %	25 %	227119233
1009	NC_012583	GCT	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1010	NC_012583	AAG	2	6	59596	59601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119233
1011	NC_012583	GTC	2	6	59626	59631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1012	NC_012583	TGC	2	6	59805	59810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119234
1013	NC_012583	CAG	2	6	59888	59893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119234
1014	NC_012583	CCCG	2	8	59903	59910	0 %	0 %	25 %	75 %	227119234
1015	NC_012583	ACG	2	6	59921	59926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119234
1016	NC_012583	TGA	2	6	59935	59940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119234
1017	NC_012583	TGC	2	6	60028	60033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119234
1018	NC_012583	CTTTGG	2	12	60052	60063	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227119234
1019	NC_012583	CCA	2	6	60095	60100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119234
1020	NC_012583	TGCC	2	8	60140	60147	0 %	25 %	25 %	50 %	227119234
1021	NC_012583	CGC	2	6	60218	60223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119234
1022	NC_012583	AGG	2	6	60310	60315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119234
1023	NC_012583	GGC	2	6	60321	60326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119234
1024	NC_012583	AGT	2	6	60559	60564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119234
1025	NC_012583	TG	3	6	60634	60639	0 %	50 %	50 %	0 %	227119234
1026	NC_012583	ATCA	2	8	60701	60708	50 %	25 %	0 %	25 %	227119234
1027	NC_012583	CGA	2	6	60720	60725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119234
1028	NC_012583	GATT	2	8	60769	60776	25 %	50 %	25 %	0 %	227119234
1029	NC_012583	GTTC	2	8	61045	61052	0 %	50 %	25 %	25 %	227119234
1030	NC_012583	TTA	2	6	61065	61070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119234
1031	NC_012583	G	7	7	61076	61082	0 %	0 %	100 %	0 %	227119234
1032	NC_012583	AGTTG	2	10	61195	61204	20 %	40 %	40 %	0 %	227119234
1033	NC_012583	GGT	2	6	61221	61226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119234
1034	NC_012583	TAA	2	6	61293	61298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119234
1035	NC_012583	AGAT	2	8	61301	61308	50 %	25 %	25 %	0 %	227119234
1036	NC_012583	TCA	2	6	61340	61345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119235
1037	NC_012583	TCT	2	6	61369	61374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119235
1038	NC_012583	CGC	2	6	61467	61472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119235
1039	NC_012583	T	6	6	61500	61505	0 %	100 %	0 %	0 %	227119235
1040	NC_012583	CAC	2	6	61704	61709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119235
1041	NC_012583	TCA	2	6	61726	61731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119235
1042	NC_012583	CAC	2	6	61739	61744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119235
1043	NC_012583	ATG	2	6	61759	61764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119235
1044	NC_012583	T	6	6	61765	61770	0 %	100 %	0 %	0 %	227119235
1045	NC_012583	CAAT	2	8	61784	61791	50 %	25 %	0 %	25 %	227119235
1046	NC_012583	TGC	2	6	61805	61810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119235
1047	NC_012583	AAG	2	6	61811	61816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119235
1048	NC_012583	CCATG	2	10	61823	61832	20 %	20 %	20 %	40 %	227119235
1049	NC_012583	T	6	6	61848	61853	0 %	100 %	0 %	0 %	227119235
1050	NC_012583	TAC	2	6	61883	61888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119235
1051	NC_012583	CTTG	2	8	61901	61908	0 %	50 %	25 %	25 %	227119235
1052	NC_012583	AAG	2	6	61918	61923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119235
1053	NC_012583	TG	3	6	62003	62008	0 %	50 %	50 %	0 %	227119235
1054	NC_012583	CAATT	2	10	62029	62038	40 %	40 %	0 %	20 %	227119235
1055	NC_012583	GA	3	6	62129	62134	50 %	0 %	50 %	0 %	227119236
1056	NC_012583	CT	3	6	62149	62154	0 %	50 %	0 %	50 %	227119236
1057	NC_012583	TGGT	2	8	62226	62233	0 %	50 %	50 %	0 %	227119236
1058	NC_012583	A	8	8	62254	62261	100 %	0 %	0 %	0 %	227119236
1059	NC_012583	GTACA	2	10	62267	62276	40 %	20 %	20 %	20 %	227119236
1060	NC_012583	GTTT	2	8	62459	62466	0 %	75 %	25 %	0 %	227119237
1061	NC_012583	AATGGG	2	12	62480	62491	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227119237
1062	NC_012583	TGG	2	6	62548	62553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119237
1063	NC_012583	AG	3	6	62591	62596	50 %	0 %	50 %	0 %	227119237
1064	NC_012583	CAG	2	6	62604	62609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119237
1065	NC_012583	ACA	2	6	62624	62629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119237
1066	NC_012583	TG	3	6	62638	62643	0 %	50 %	50 %	0 %	227119237
1067	NC_012583	GAA	2	6	62778	62783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119237
1068	NC_012583	A	7	7	62883	62889	100 %	0 %	0 %	0 %	227119237
1069	NC_012583	TCG	2	6	62890	62895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119237
1070	NC_012583	CG	3	6	62949	62954	0 %	0 %	50 %	50 %	227119237
1071	NC_012583	GGGT	2	8	63157	63164	0 %	25 %	75 %	0 %	227119237
1072	NC_012583	CAG	2	6	63237	63242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119237
1073	NC_012583	TGA	2	6	63291	63296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119237
1074	NC_012583	CGTG	2	8	63355	63362	0 %	25 %	50 %	25 %	227119238
1075	NC_012583	GTTG	2	8	63458	63465	0 %	50 %	50 %	0 %	227119238
1076	NC_012583	TAC	2	6	63500	63505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119238
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1079	NC_012583	ATT	2	6	63616	63621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119238
1080	NC_012583	GAT	2	6	63910	63915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119238
1081	NC_012583	CAG	2	6	64024	64029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119238
1082	NC_012583	GT	3	6	64041	64046	0 %	50 %	50 %	0 %	227119238
1083	NC_012583	ACA	2	6	64062	64067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119238
1084	NC_012583	TGGTT	2	10	64097	64106	0 %	60 %	40 %	0 %	227119239
1085	NC_012583	TCG	2	6	64107	64112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119239
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1087	NC_012583	CCG	2	6	64145	64150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119239
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1089	NC_012583	GATTT	2	10	64237	64246	20 %	60 %	20 %	0 %	227119239
1090	NC_012583	CAA	2	6	64267	64272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119239
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1092	NC_012583	T	6	6	64298	64303	0 %	100 %	0 %	0 %	227119239
1093	NC_012583	GCG	2	6	64327	64332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119239
1094	NC_012583	AGC	2	6	64409	64414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119239
1095	NC_012583	CAG	2	6	64432	64437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119239
1096	NC_012583	TGA	2	6	64473	64478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119239
1097	NC_012583	T	6	6	64525	64530	0 %	100 %	0 %	0 %	227119239
1098	NC_012583	GC	3	6	64551	64556	0 %	0 %	50 %	50 %	227119239
1099	NC_012583	GCC	2	6	64575	64580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119239
1100	NC_012583	A	6	6	64590	64595	100 %	0 %	0 %	0 %	227119239
1101	NC_012583	GC	3	6	64716	64721	0 %	0 %	50 %	50 %	227119239
1102	NC_012583	TG	3	6	64846	64851	0 %	50 %	50 %	0 %	227119239
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1105	NC_012583	GTG	2	6	65010	65015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119239
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1107	NC_012583	GGAT	2	8	65104	65111	25 %	25 %	50 %	0 %	227119239
1108	NC_012583	GAT	2	6	65127	65132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119239
1109	NC_012583	TGAT	2	8	65204	65211	25 %	50 %	25 %	0 %	227119239
1110	NC_012583	CAA	2	6	65226	65231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119239
1111	NC_012583	TGG	2	6	65232	65237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119239
1112	NC_012583	GTG	2	6	65244	65249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119239
1113	NC_012583	GTCA	2	8	65299	65306	25 %	25 %	25 %	25 %	227119239
1114	NC_012583	CCG	2	6	65340	65345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119239
1115	NC_012583	TTC	2	6	65370	65375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119239
1116	NC_012583	TCA	2	6	65385	65390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119239
1117	NC_012583	TGG	2	6	65511	65516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119240
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1123	NC_012583	GATT	2	8	65981	65988	25 %	50 %	25 %	0 %	227119240
1124	NC_012583	GCC	2	6	65990	65995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119240
1125	NC_012583	CAA	2	6	66083	66088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119240
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1127	NC_012583	GT	3	6	66235	66240	0 %	50 %	50 %	0 %	227119240
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1245	NC_012583	TCGA	2	8	72890	72897	25 %	25 %	25 %	25 %	227119245
1246	NC_012583	GCG	2	6	73066	73071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119246
1247	NC_012583	CCA	2	6	73088	73093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119246
1248	NC_012583	GCCA	2	8	73157	73164	25 %	0 %	25 %	50 %	227119246
1249	NC_012583	TTGAC	2	10	73211	73220	20 %	40 %	20 %	20 %	227119246
1250	NC_012583	A	6	6	73244	73249	100 %	0 %	0 %	0 %	227119246
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1375	NC_012583	CAA	2	6	80179	80184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119251
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