MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 17641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012583	CGA	2	6	28387	28392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119208
502	NC_012583	AAC	2	6	28422	28427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119208
503	NC_012583	ACAA	2	8	28482	28489	75 %	0 %	0 %	25 %	227119208
504	NC_012583	GC	3	6	28525	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	227119208
505	NC_012583	GAC	2	6	28541	28546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119208
506	NC_012583	GCT	2	6	28550	28555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119208
507	NC_012583	GT	3	6	28607	28612	0 %	50 %	50 %	0 %	227119208
508	NC_012583	T	6	6	28612	28617	0 %	100 %	0 %	0 %	227119208
509	NC_012583	ATG	2	6	28638	28643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119208
510	NC_012583	ATC	2	6	28653	28658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119208
511	NC_012583	GCA	2	6	28720	28725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119208
512	NC_012583	TTGA	2	8	28763	28770	25 %	50 %	25 %	0 %	227119208
513	NC_012583	TAAA	2	8	28948	28955	75 %	25 %	0 %	0 %	227119208
514	NC_012583	TCA	2	6	28971	28976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119208
515	NC_012583	AAT	2	6	29018	29023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119208
516	NC_012583	GGT	2	6	29277	29282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119209
517	NC_012583	ATA	2	6	29290	29295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119209
518	NC_012583	TCA	2	6	29369	29374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119209
519	NC_012583	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	227119209
520	NC_012583	GCC	2	6	29517	29522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119209
521	NC_012583	AGT	2	6	29561	29566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119209
522	NC_012583	GAT	2	6	29637	29642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119209
523	NC_012583	GTG	2	6	29708	29713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119209
524	NC_012583	CCAAT	2	10	29816	29825	40 %	20 %	0 %	40 %	227119209
525	NC_012583	AG	3	6	29906	29911	50 %	0 %	50 %	0 %	227119209
526	NC_012583	A	6	6	29919	29924	100 %	0 %	0 %	0 %	227119209
527	NC_012583	A	7	7	30001	30007	100 %	0 %	0 %	0 %	227119209
528	NC_012583	CGCGA	2	10	30040	30049	20 %	0 %	40 %	40 %	227119209
529	NC_012583	TGG	2	6	30131	30136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119209
530	NC_012583	ATG	2	6	30157	30162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119209
531	NC_012583	TTC	2	6	30206	30211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119209
532	NC_012583	CCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119210
533	NC_012583	T	7	7	30716	30722	0 %	100 %	0 %	0 %	227119210
534	NC_012583	GCG	2	6	30742	30747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119210
535	NC_012583	GGT	2	6	30787	30792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
536	NC_012583	GCA	2	6	30802	30807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119210
537	NC_012583	GCT	2	6	30912	30917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119210
538	NC_012583	GCC	2	6	30946	30951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119210
539	NC_012583	ATG	2	6	30952	30957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119210
540	NC_012583	GCA	2	6	31007	31012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119210
541	NC_012583	TGGT	2	8	31073	31080	0 %	50 %	50 %	0 %	227119210
542	NC_012583	TCC	2	6	31083	31088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119210
543	NC_012583	GCG	2	6	31099	31104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119210
544	NC_012583	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	227119210
545	NC_012583	GAT	3	9	31158	31166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119210
546	NC_012583	GGT	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
547	NC_012583	TGG	2	6	31364	31369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
548	NC_012583	TGC	2	6	31451	31456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119210
549	NC_012583	TGG	3	9	31461	31469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
550	NC_012583	GTG	2	6	31561	31566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
551	NC_012583	GTG	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119210
552	NC_012583	CTG	2	6	31633	31638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119210
553	NC_012583	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	227119210
554	NC_012583	CCT	2	6	31715	31720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119210
555	NC_012583	TGC	2	6	31730	31735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119210
556	NC_012583	CCG	2	6	31747	31752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119210
557	NC_012583	GAT	2	6	31794	31799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119210
558	NC_012583	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	227119211
559	NC_012583	GCA	2	6	32036	32041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119211
560	NC_012583	TTC	2	6	32043	32048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119211
561	NC_012583	GCC	2	6	32122	32127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119211
562	NC_012583	TTA	2	6	32140	32145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119211
563	NC_012583	CTT	2	6	32189	32194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119211
564	NC_012583	TTG	2	6	32232	32237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119211
565	NC_012583	AGT	2	6	32242	32247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119211
566	NC_012583	GAG	2	6	32282	32287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119211
567	NC_012583	TTGG	2	8	32322	32329	0 %	50 %	50 %	0 %	227119211
568	NC_012583	CAC	2	6	32349	32354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119211
569	NC_012583	GAT	3	9	32364	32372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119211
570	NC_012583	A	6	6	32460	32465	100 %	0 %	0 %	0 %	227119211
571	NC_012583	GCC	2	6	32466	32471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119211
572	NC_012583	AGC	2	6	32553	32558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119211
573	NC_012583	GCAA	2	8	32569	32576	50 %	0 %	25 %	25 %	227119211
574	NC_012583	CGC	2	6	33055	33060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119212
575	NC_012583	GCA	2	6	33095	33100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119212
576	NC_012583	ACC	2	6	33173	33178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119212
577	NC_012583	GTG	2	6	33246	33251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
578	NC_012583	GGT	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
579	NC_012583	TTG	2	6	33528	33533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119212
580	NC_012583	GCT	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119212
581	NC_012583	TCA	2	6	33760	33765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119212
582	NC_012583	A	7	7	33812	33818	100 %	0 %	0 %	0 %	227119212
583	NC_012583	ATC	2	6	33836	33841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119212
584	NC_012583	ATCG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
585	NC_012583	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	227119212
586	NC_012583	CTT	2	6	33874	33879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119212
587	NC_012583	AAGCG	2	10	33894	33903	40 %	0 %	40 %	20 %	227119212
588	NC_012583	GCG	3	9	33987	33995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119212
589	NC_012583	GC	3	6	34063	34068	0 %	0 %	50 %	50 %	227119212
590	NC_012583	TGA	2	6	34075	34080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119212
591	NC_012583	CGG	2	6	34216	34221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119212
592	NC_012583	CCA	2	6	34240	34245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119212
593	NC_012583	CTG	2	6	34361	34366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119212
594	NC_012583	TATG	2	8	34411	34418	25 %	50 %	25 %	0 %	227119212
595	NC_012583	TAC	2	6	34648	34653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119212
596	NC_012583	TGA	3	9	34672	34680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119212
597	NC_012583	TACG	2	8	34706	34713	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
598	NC_012583	AATGC	2	10	34775	34784	40 %	20 %	20 %	20 %	227119212
599	NC_012583	GCC	2	6	34874	34879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119212
600	NC_012583	CTG	2	6	34956	34961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119212
601	NC_012583	TGG	2	6	35085	35090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
602	NC_012583	CCA	2	6	35109	35114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119212
603	NC_012583	GTG	2	6	35180	35185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
604	NC_012583	CAGT	2	8	35337	35344	25 %	25 %	25 %	25 %	227119212
605	NC_012583	A	6	6	35390	35395	100 %	0 %	0 %	0 %	227119212
606	NC_012583	GGT	2	6	35402	35407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
607	NC_012583	TGG	2	6	35449	35454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
608	NC_012583	GGCA	2	8	35470	35477	25 %	0 %	50 %	25 %	227119212
609	NC_012583	TGG	2	6	35495	35500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
610	NC_012583	AAGT	2	8	35518	35525	50 %	25 %	25 %	0 %	227119212
611	NC_012583	GTT	2	6	35565	35570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119212
612	NC_012583	CA	3	6	35953	35958	50 %	0 %	0 %	50 %	227119213
613	NC_012583	AAC	2	6	36064	36069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119213
614	NC_012583	GCT	2	6	36107	36112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119213
615	NC_012583	TTGA	2	8	36126	36133	25 %	50 %	25 %	0 %	227119213
616	NC_012583	AG	3	6	36134	36139	50 %	0 %	50 %	0 %	227119213
617	NC_012583	ATC	2	6	36159	36164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119213
618	NC_012583	TGC	2	6	36178	36183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119213
619	NC_012583	TGA	2	6	36184	36189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119213
620	NC_012583	GTC	2	6	36241	36246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119213
621	NC_012583	A	6	6	36490	36495	100 %	0 %	0 %	0 %	227119213
622	NC_012583	CGT	2	6	36498	36503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119213
623	NC_012583	TGA	2	6	36565	36570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119213
624	NC_012583	CAA	2	6	36629	36634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119213
625	NC_012583	CCA	2	6	36678	36683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119213
626	NC_012583	GCTTA	2	10	36701	36710	20 %	40 %	20 %	20 %	227119214
627	NC_012583	GT	3	6	36774	36779	0 %	50 %	50 %	0 %	227119214
628	NC_012583	AGTTTG	2	12	36808	36819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227119214
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760	NC_012583	GCA	2	6	44509	44514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119220
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