MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 50518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012582	CAG	2	6	63385	63390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116430
1002	NC_012582	TGCC	2	8	63422	63429	0 %	25 %	25 %	50 %	227116430
1003	NC_012582	CAAGC	2	10	63443	63452	40 %	0 %	20 %	40 %	227116430
1004	NC_012582	AACC	2	8	63480	63487	50 %	0 %	0 %	50 %	227116430
1005	NC_012582	TCA	2	6	63521	63526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116430
1006	NC_012582	TC	4	8	63561	63568	0 %	50 %	0 %	50 %	227116430
1007	NC_012582	GA	3	6	63590	63595	50 %	0 %	50 %	0 %	227116430
1008	NC_012582	AAC	2	6	63641	63646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116430
1009	NC_012582	ATCGC	2	10	63656	63665	20 %	20 %	20 %	40 %	227116430
1010	NC_012582	GCC	2	6	63676	63681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116430
1011	NC_012582	TTC	2	6	63697	63702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116430
1012	NC_012582	AGC	2	6	63758	63763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116430
1013	NC_012582	AACG	2	8	63823	63830	50 %	0 %	25 %	25 %	227116430
1014	NC_012582	CAC	2	6	63848	63853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116430
1015	NC_012582	TGT	2	6	63896	63901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116431
1016	NC_012582	CAA	2	6	63942	63947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116431
1017	NC_012582	CAC	2	6	63995	64000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116431
1018	NC_012582	A	7	7	64059	64065	100 %	0 %	0 %	0 %	227116431
1019	NC_012582	GCGT	2	8	64102	64109	0 %	25 %	50 %	25 %	227116431
1020	NC_012582	AGC	2	6	64111	64116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1021	NC_012582	ATC	2	6	64146	64151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116431
1022	NC_012582	CTG	2	6	64155	64160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1023	NC_012582	GAA	2	6	64184	64189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116431
1024	NC_012582	CAC	2	6	64209	64214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116431
1025	NC_012582	GCT	2	6	64223	64228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1026	NC_012582	GCC	2	6	64251	64256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116431
1027	NC_012582	ACA	2	6	64352	64357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116431
1028	NC_012582	GGT	2	6	64430	64435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116431
1029	NC_012582	TGC	2	6	64495	64500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1030	NC_012582	GCA	2	6	64541	64546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1031	NC_012582	AG	3	6	64730	64735	50 %	0 %	50 %	0 %	227116431
1032	NC_012582	GAA	2	6	64739	64744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116431
1033	NC_012582	TGC	2	6	64816	64821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116431
1034	NC_012582	AAG	2	6	64822	64827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116431
1035	NC_012582	AAT	2	6	64845	64850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116431
1036	NC_012582	CT	3	6	65031	65036	0 %	50 %	0 %	50 %	227116431
1037	NC_012582	CTG	3	9	65151	65159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1038	NC_012582	TCG	2	6	65269	65274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1039	NC_012582	AGT	2	6	65309	65314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116432
1040	NC_012582	GCT	2	6	65378	65383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1041	NC_012582	ATC	2	6	65406	65411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116432
1042	NC_012582	T	6	6	65472	65477	0 %	100 %	0 %	0 %	227116432
1043	NC_012582	CCA	2	6	65510	65515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116432
1044	NC_012582	GGT	2	6	65562	65567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116432
1045	NC_012582	TCA	2	6	65620	65625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116432
1046	NC_012582	GGCAA	2	10	65629	65638	40 %	0 %	40 %	20 %	227116432
1047	NC_012582	GTG	2	6	65680	65685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116432
1048	NC_012582	CTG	2	6	65691	65696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1049	NC_012582	CGG	2	6	65717	65722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116432
1050	NC_012582	CTT	2	6	65735	65740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116432
1051	NC_012582	TGCGC	2	10	65747	65756	0 %	20 %	40 %	40 %	227116432
1052	NC_012582	TTG	2	6	65823	65828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116432
1053	NC_012582	CGAA	2	8	65892	65899	50 %	0 %	25 %	25 %	227116432
1054	NC_012582	CTT	2	6	65975	65980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116432
1055	NC_012582	CTT	2	6	66020	66025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116432
1056	NC_012582	GCA	2	6	66116	66121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1057	NC_012582	TCA	2	6	66125	66130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116432
1058	NC_012582	ACC	3	9	66168	66176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116432
1059	NC_012582	TTC	2	6	66197	66202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116432
1060	NC_012582	AGT	2	6	66302	66307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116432
1061	NC_012582	AGT	2	6	66452	66457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116432
1062	NC_012582	ACG	2	6	66512	66517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116432
1063	NC_012582	ATT	2	6	66684	66689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116433
1064	NC_012582	GCT	2	6	66704	66709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116433
1065	NC_012582	GAC	2	6	66746	66751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116433
1066	NC_012582	CTTG	2	8	66791	66798	0 %	50 %	25 %	25 %	227116433
1067	NC_012582	GTT	2	6	66803	66808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116433
1068	NC_012582	GC	3	6	66810	66815	0 %	0 %	50 %	50 %	227116433
1069	NC_012582	CAC	2	6	66818	66823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116433
1070	NC_012582	CAC	2	6	66837	66842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116433
1071	NC_012582	GCT	2	6	66890	66895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116433
1072	NC_012582	AG	3	6	66942	66947	50 %	0 %	50 %	0 %	227116433
1073	NC_012582	CTGTTG	2	12	67029	67040	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227116433
1074	NC_012582	CTG	2	6	67053	67058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116433
1075	NC_012582	TCA	2	6	67145	67150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116433
1076	NC_012582	GCT	2	6	67184	67189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116434
1077	NC_012582	TCG	2	6	67270	67275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116434
1078	NC_012582	GTCG	2	8	67370	67377	0 %	25 %	50 %	25 %	227116434
1079	NC_012582	AGC	2	6	67378	67383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116434
1080	NC_012582	GCC	2	6	67429	67434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116434
1081	NC_012582	CTT	2	6	67458	67463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116434
1082	NC_012582	CAAT	2	8	67475	67482	50 %	25 %	0 %	25 %	227116434
1083	NC_012582	GGC	2	6	67562	67567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116434
1084	NC_012582	T	6	6	67599	67604	0 %	100 %	0 %	0 %	227116434
1085	NC_012582	GGC	2	6	67610	67615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116434
1086	NC_012582	GTAC	2	8	67639	67646	25 %	25 %	25 %	25 %	227116434
1087	NC_012582	T	7	7	67689	67695	0 %	100 %	0 %	0 %	227116434
1088	NC_012582	CAT	2	6	67732	67737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116435
1089	NC_012582	A	6	6	67799	67804	100 %	0 %	0 %	0 %	227116435
1090	NC_012582	TCA	2	6	67873	67878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116435
1091	NC_012582	GCC	2	6	67889	67894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116435
1092	NC_012582	TGC	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116435
1093	NC_012582	GAT	2	6	68008	68013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116435
1094	NC_012582	GA	3	6	68060	68065	50 %	0 %	50 %	0 %	227116435
1095	NC_012582	CT	3	6	68119	68124	0 %	50 %	0 %	50 %	227116435
1096	NC_012582	TCA	2	6	68169	68174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116435
1097	NC_012582	TACA	2	8	68243	68250	50 %	25 %	0 %	25 %	227116435
1098	NC_012582	CTG	2	6	68261	68266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116435
1099	NC_012582	GCT	2	6	68284	68289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116435
1100	NC_012582	ATGC	2	8	68339	68346	25 %	25 %	25 %	25 %	227116435
1101	NC_012582	CCT	2	6	68350	68355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116435
1102	NC_012582	GGATA	2	10	68570	68579	40 %	20 %	40 %	0 %	227116436
1103	NC_012582	CAT	2	6	68618	68623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116436
1104	NC_012582	CGGAA	2	10	68650	68659	40 %	0 %	40 %	20 %	227116436
1105	NC_012582	CG	3	6	68737	68742	0 %	0 %	50 %	50 %	227116436
1106	NC_012582	TGC	2	6	68867	68872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116436
1107	NC_012582	TCA	2	6	68917	68922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116436
1108	NC_012582	CCG	2	6	68946	68951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116436
1109	NC_012582	GTT	2	6	68980	68985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116436
1110	NC_012582	GGCA	2	8	69058	69065	25 %	0 %	50 %	25 %	227116436
1111	NC_012582	TAC	2	6	69100	69105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116436
1112	NC_012582	AGC	2	6	69121	69126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116436
1113	NC_012582	TTC	2	6	69156	69161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116436
1114	NC_012582	ACCA	2	8	69456	69463	50 %	0 %	0 %	50 %	227116437
1115	NC_012582	TCG	2	6	69544	69549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116437
1116	NC_012582	ATC	2	6	69705	69710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116437
1117	NC_012582	TGG	2	6	69824	69829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116437
1118	NC_012582	GC	3	6	69884	69889	0 %	0 %	50 %	50 %	227116437
1119	NC_012582	AAG	3	9	69937	69945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116437
1120	NC_012582	AGC	2	6	69949	69954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116437
1121	NC_012582	AATC	2	8	70351	70358	50 %	25 %	0 %	25 %	227116438
1122	NC_012582	CGAC	2	8	70376	70383	25 %	0 %	25 %	50 %	227116438
1123	NC_012582	A	6	6	70444	70449	100 %	0 %	0 %	0 %	227116438
1124	NC_012582	A	7	7	70663	70669	100 %	0 %	0 %	0 %	227116439
1125	NC_012582	TTC	2	6	70698	70703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116439
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1255	NC_012582	AATG	2	8	79615	79622	50 %	25 %	25 %	0 %	227116450
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