MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012580	GCG	2	6	122552	122557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811738
2003	NC_012580	CCT	2	6	122568	122573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811738
2004	NC_012580	GAT	2	6	122579	122584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811738
2005	NC_012580	AGC	2	6	122595	122600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811738
2006	NC_012580	TGC	2	6	122643	122648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811738
2007	NC_012580	AGA	2	6	122869	122874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811738
2008	NC_012580	CA	3	6	122930	122935	50 %	0 %	0 %	50 %	227811738
2009	NC_012580	TG	3	6	123068	123073	0 %	50 %	50 %	0 %	227811738
2010	NC_012580	CAA	2	6	123095	123100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811738
2011	NC_012580	GTGA	2	8	123101	123108	25 %	25 %	50 %	0 %	227811738
2012	NC_012580	TC	3	6	123172	123177	0 %	50 %	0 %	50 %	227811738
2013	NC_012580	CGT	2	6	123220	123225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811738
2014	NC_012580	GCG	2	6	123242	123247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811738
2015	NC_012580	CAC	2	6	123339	123344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811738
2016	NC_012580	TGC	2	6	123351	123356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811738
2017	NC_012580	CCA	2	6	123364	123369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811738
2018	NC_012580	CA	3	6	123391	123396	50 %	0 %	0 %	50 %	227811738
2019	NC_012580	CTA	2	6	123436	123441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811738
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2021	NC_012580	TCG	2	6	123604	123609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811739
2022	NC_012580	GTC	2	6	123750	123755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811739
2023	NC_012580	A	6	6	123784	123789	100 %	0 %	0 %	0 %	227811739
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2032	NC_012580	CGT	2	6	124411	124416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811740
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2043	NC_012580	ATC	2	6	125068	125073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811740
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2050	NC_012580	ACT	2	6	125446	125451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811741
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2053	NC_012580	TTTA	2	8	125832	125839	25 %	75 %	0 %	0 %	227811741
2054	NC_012580	GCC	2	6	125917	125922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811741
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2057	NC_012580	AG	3	6	125948	125953	50 %	0 %	50 %	0 %	227811741
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2059	NC_012580	GTGC	2	8	125991	125998	0 %	25 %	50 %	25 %	227811741
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2061	NC_012580	TCAA	2	8	126118	126125	50 %	25 %	0 %	25 %	227811741
2062	NC_012580	TCAA	2	8	126127	126134	50 %	25 %	0 %	25 %	227811741
2063	NC_012580	CT	4	8	126243	126250	0 %	50 %	0 %	50 %	227811742
2064	NC_012580	CT	3	6	126316	126321	0 %	50 %	0 %	50 %	227811742
2065	NC_012580	CAAG	2	8	126339	126346	50 %	0 %	25 %	25 %	227811742
2066	NC_012580	CTG	2	6	126436	126441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
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2070	NC_012580	A	6	6	126601	126606	100 %	0 %	0 %	0 %	227811742
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2109	NC_012580	CTGCT	2	10	128447	128456	0 %	40 %	20 %	40 %	227811742
2110	NC_012580	TACC	2	8	128479	128486	25 %	25 %	0 %	50 %	227811742
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2117	NC_012580	TGGC	2	8	128790	128797	0 %	25 %	50 %	25 %	227811743
2118	NC_012580	TGG	2	6	128812	128817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811743
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2122	NC_012580	TCG	2	6	128907	128912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
2123	NC_012580	CAATC	2	10	129048	129057	40 %	20 %	0 %	40 %	227811743
2124	NC_012580	T	6	6	129223	129228	0 %	100 %	0 %	0 %	227811743
2125	NC_012580	AGC	2	6	129268	129273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811743
2126	NC_012580	CGC	2	6	129470	129475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811743
2127	NC_012580	TTG	2	6	129514	129519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811743
2128	NC_012580	GCG	2	6	129531	129536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811743
2129	NC_012580	TGG	2	6	129635	129640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811743
2130	NC_012580	ATT	2	6	129692	129697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811743
2131	NC_012580	GGT	2	6	129732	129737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811743
2132	NC_012580	CA	3	6	129776	129781	50 %	0 %	0 %	50 %	227811743
2133	NC_012580	CTG	2	6	129789	129794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
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2135	NC_012580	GGC	2	6	129872	129877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811743
2136	NC_012580	GCT	2	6	129896	129901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
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2138	NC_012580	GC	3	6	130042	130047	0 %	0 %	50 %	50 %	227811743
2139	NC_012580	ACCCT	2	10	130101	130110	20 %	20 %	0 %	60 %	227811743
2140	NC_012580	GCTG	2	8	130184	130191	0 %	25 %	50 %	25 %	227811743
2141	NC_012580	GTCA	2	8	130233	130240	25 %	25 %	25 %	25 %	227811743
2142	NC_012580	ATC	2	6	130254	130259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811743
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2144	NC_012580	GCG	2	6	130299	130304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811743
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2146	NC_012580	AGCTG	2	10	130468	130477	20 %	20 %	40 %	20 %	227811744
2147	NC_012580	GGC	2	6	130600	130605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811744
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2151	NC_012580	ATG	2	6	130895	130900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811744
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2153	NC_012580	TGC	2	6	130929	130934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811744
2154	NC_012580	TGGT	2	8	131017	131024	0 %	50 %	50 %	0 %	227811744
2155	NC_012580	GT	3	6	131059	131064	0 %	50 %	50 %	0 %	227811745
2156	NC_012580	CAG	2	6	131077	131082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
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2158	NC_012580	CT	5	10	131158	131167	0 %	50 %	0 %	50 %	227811745
2159	NC_012580	CAGTG	2	10	131175	131184	20 %	20 %	40 %	20 %	227811745
2160	NC_012580	AGCAC	2	10	131196	131205	40 %	0 %	20 %	40 %	227811745
2161	NC_012580	CTG	2	6	131255	131260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
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2165	NC_012580	TCA	2	6	131446	131451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811745
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2227	NC_012580	CT	3	6	133826	133831	0 %	50 %	0 %	50 %	227811746
2228	NC_012580	AG	3	6	133979	133984	50 %	0 %	50 %	0 %	227811746
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2231	NC_012580	CTT	2	6	134137	134142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811746
2232	NC_012580	TTG	2	6	134166	134171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811746
2233	NC_012580	TCAA	2	8	134175	134182	50 %	25 %	0 %	25 %	227811746
2234	NC_012580	GAA	2	6	134195	134200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811746
2235	NC_012580	TGC	2	6	134211	134216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2237	NC_012580	ATT	2	6	134271	134276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811746
2238	NC_012580	GCT	2	6	134329	134334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2240	NC_012580	AGC	2	6	134597	134602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2243	NC_012580	GC	3	6	134800	134805	0 %	0 %	50 %	50 %	227811746
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2359	NC_012580	ATA	2	6	140980	140985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811750
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2364	NC_012580	AGCGTA	2	12	141358	141369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227811751
2365	NC_012580	ATC	2	6	141376	141381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811751
2366	NC_012580	TCA	2	6	141395	141400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811751
2367	NC_012580	TCA	2	6	141408	141413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811752
2368	NC_012580	TGC	2	6	141427	141432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811752
2369	NC_012580	TCA	2	6	141503	141508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811752
2370	NC_012580	CAT	2	6	141525	141530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811752
2371	NC_012580	A	7	7	141685	141691	100 %	0 %	0 %	0 %	227811753
2372	NC_012580	CTA	2	6	141697	141702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811753
2373	NC_012580	CT	3	6	141712	141717	0 %	50 %	0 %	50 %	227811753
2374	NC_012580	TGG	2	6	141722	141727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811753
2375	NC_012580	TGA	2	6	141783	141788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811753
2376	NC_012580	CTT	2	6	141827	141832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811753
2377	NC_012580	T	6	6	141831	141836	0 %	100 %	0 %	0 %	227811753
2378	NC_012580	AGA	2	6	141951	141956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811753
2379	NC_012580	ACGC	2	8	142014	142021	25 %	0 %	25 %	50 %	227811753
2380	NC_012580	CG	3	6	142030	142035	0 %	0 %	50 %	50 %	227811753
2381	NC_012580	TGA	2	6	142267	142272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811754
2382	NC_012580	GCA	2	6	142306	142311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
2383	NC_012580	ATT	2	6	142377	142382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811754
2384	NC_012580	GAGCT	2	10	142551	142560	20 %	20 %	40 %	20 %	227811754
2385	NC_012580	AGC	2	6	142567	142572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
2386	NC_012580	TGG	2	6	142576	142581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811754
2387	NC_012580	ATC	2	6	142617	142622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811754
2388	NC_012580	ACCG	2	8	142631	142638	25 %	0 %	25 %	50 %	227811754
2389	NC_012580	ACCGAA	2	12	142653	142664	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227811754
2390	NC_012580	GAAA	2	8	142733	142740	75 %	0 %	25 %	0 %	227811754
2391	NC_012580	GAC	2	6	142755	142760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
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2393	NC_012580	GAT	2	6	142835	142840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811754
2394	NC_012580	GCA	2	6	142883	142888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
2395	NC_012580	A	6	6	142956	142961	100 %	0 %	0 %	0 %	227811754
2396	NC_012580	ACTGA	2	10	143004	143013	40 %	20 %	20 %	20 %	227811754
2397	NC_012580	GC	3	6	143029	143034	0 %	0 %	50 %	50 %	227811754
2398	NC_012580	GCGTG	2	10	143045	143054	0 %	20 %	60 %	20 %	227811754
2399	NC_012580	GC	3	6	143191	143196	0 %	0 %	50 %	50 %	227811754
2400	NC_012580	CAG	2	6	143328	143333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
2401	NC_012580	TGA	2	6	143356	143361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811754
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2403	NC_012580	CAT	2	6	143468	143473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811754
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2406	NC_012580	GCA	2	6	143622	143627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
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2432	NC_012580	A	6	6	144692	144697	100 %	0 %	0 %	0 %	227811756
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2485	NC_012580	ACC	2	6	147495	147500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811758
2486	NC_012580	GTG	2	6	147609	147614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811758
2487	NC_012580	TGA	2	6	147774	147779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811759
2488	NC_012580	T	7	7	147781	147787	0 %	100 %	0 %	0 %	227811759
2489	NC_012580	GTTTG	2	10	147865	147874	0 %	60 %	40 %	0 %	227811759
2490	NC_012580	A	6	6	147900	147905	100 %	0 %	0 %	0 %	227811759
2491	NC_012580	ACT	2	6	147912	147917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811759
2492	NC_012580	TTG	2	6	147983	147988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811759
2493	NC_012580	TCT	2	6	148002	148007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811759
2494	NC_012580	TCG	2	6	148065	148070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811759
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2497	NC_012580	GCAT	2	8	148106	148113	25 %	25 %	25 %	25 %	227811759
2498	NC_012580	TGA	2	6	148134	148139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811759
2499	NC_012580	TTCTT	2	10	148160	148169	0 %	80 %	0 %	20 %	227811759
2500	NC_012580	CGA	2	6	148260	148265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811759

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